Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Centro de Bioci\u00eancias
Departamento de Biof\u00edsica e Farmacologia

A bioinform\u00e1tica \u00e9 um campo das ci\u00eancias biol\u00f3gicas que est\u00e1 em r\u00e1pido crescimento e est\u00e1 sendo desenvolvida para atender \u00e0 necessidade de manipular-se com grandes quantidades de dados gen\u00e9ticos e bioqu\u00edmicos. Estes dados, originados a partir do esfor\u00e7o individual de v\u00e1rios pesquisadores, est\u00e3o relacionados entre si atrav\u00e9s de uma origem comum: as c\u00e9lulas dos organismos vivos. Para compreender a rela\u00e7\u00e3o entre estas informa\u00e7\u00f5es fragmentadas oriundas das diversas \u00e1reas da Biologia (tais como Biologia molecular, bioqu\u00edmica estrutural, enzimologia, Biologia molecular, fisiologia e patologia), a bioinform\u00e1tica usa o poder computacional para catalogar, organizar e estruturar estas informa\u00e7\u00f5es em uma entidade compreensiva e extremamente importante para a Biologia. Estas entidades s\u00e3o reflex\u00f5es da organiza\u00e7\u00e3o celular da vida e seu denominador comum que \u00e9 a evolu\u00e7\u00e3o dos seres vivos a partir de uma forma ancestral comum.

Devido o fato da bioinform\u00e1tica ser ainda uma ci\u00eancia recente ainda n\u00e3o se fez outra defini\u00e7\u00e3o diferente ou mais precisa. Geralmente ela \u00e9 referida como tendo a tarefa de organizar e analisar dados incrivelmente complexos resultantes de modernas t\u00e9cnicas de Biologia molecular e bioqu\u00edmica. Para muitos a bioinform\u00e1tica \u00e9 uma importante ferramenta para a compreens\u00e3o de como as informa\u00e7\u00f5es contidas nos genes s\u00e3o refletidas em caracter\u00edsticas fisiol\u00f3gicas, como intelig\u00eancia, crescimento dos cabelos ou susceptibilidade ao c\u00e2ncer. De uma forma geral, a bioinform\u00e1tica \u00e9 apresentada como sendo a ci\u00eancia da cria\u00e7\u00e3o e manuten\u00e7\u00e3o de base de dados (ou Bancos de Dados) e eventualmente a simula\u00e7\u00e3o de fen\u00f4menos dos organismos vivos. A Bioinform\u00e1tica se baseia na premissa de que existe um relacionamento hier\u00e1rquico entre as estruturas dos genes, seu arranjo em rela\u00e7\u00e3o ao genoma, a

fun\u00e7\u00e3o das prote\u00ednas e as intera\u00e7\u00f5es entre as prote\u00ednas em um organismo resultando em energia, metabolismo, reprodu\u00e7\u00e3o e forma.

Os genes s\u00e3o as unidades heredit\u00e1rias dos seres vivos. Sendo assim, a fidelidade das c\u00f3pias das informa\u00e7\u00f5es moleculares contidas nos genes \u00e9 crucial para a viabilidade dos organismos. Contudo, n\u00edveis residuais de muta\u00e7\u00f5es s\u00e3o igualmente necess\u00e1rios para sua evolu\u00e7\u00e3o e enriquecimento dos conjuntos de genes em popula\u00e7\u00f5es. A partir da manipula\u00e7\u00e3o gen\u00e9tica \u00e9 poss\u00edvel expressar as informa\u00e7\u00f5es contidas nas seq\u00fc\u00eancias de bases de um ou mais genes e da\u00ed se comparar \u00e0s propriedades esperadas com aquelas apresentadas pelas prote\u00ednas em rela\u00e7\u00e3o \u00e0 forma e fun\u00e7\u00e3o. A tecnologia do DNA recombinante pode ent\u00e3o ser utilizada para sintetizar grandes quantidades de prote\u00ednas para posterior an\u00e1lise bioqu\u00edmica e assim se confirmar \u00e0s formas e fun\u00e7\u00f5es previstas a partir das seq\u00fc\u00eancias nos genes. A clonagem, o sequenciamento e a localiza\u00e7\u00e3o cromoss\u00f4mica s\u00e3o 3 aspectos bastante inter-relacionados necess\u00e1rios para a compreens\u00e3o da Biologia molecular de um gene e seu produto, a prote\u00edna. A Biologia molecular proporciona a base para a investiga\u00e7\u00e3o do gen\u00f3tipo atrav\u00e9s da Bioinform\u00e1tica.

Durante os primeiros anos do s\u00e9culo 20, os bioqu\u00edmicos utilizaram a qu\u00edmica org\u00e2nica para descobrir e montar vias metab\u00f3licas, estudar a cin\u00e9tica das enzimas e determinar as rela\u00e7\u00f5es entre estas vias e as doen\u00e7as heredit\u00e1rias. Vale ressaltar que tudo isto foi realizado sem nenhuma t\u00e9cnica de Biologia molecular, sem nenhuma informa\u00e7\u00e3o sobre a estrutura das prote\u00ednas e em muitos casos sequer se sabia que eram os \u00e1cidos nucl\u00e9icos as unidades heredit\u00e1rias da vida e n\u00e3o as prote\u00ednas. Da mesma forma que a qu\u00edmica foi \u00fatil para os bioqu\u00edmicos no passado, e a Biologia molecular esta sendo hoje em dia, a bioinform\u00e1tica, atrav\u00e9s dos conhecimentos gerados a partir das bases de dados e das simula\u00e7\u00f5es tamb\u00e9m ser\u00e1 bastante \u00fatil para os biocientistas no futuro.

N\u00e3o s\u00f3 apenas as mudan\u00e7as nas t\u00e9cnicas bioqu\u00edmicas influenciaram na produtividade e no sucesso da bioqu\u00edmica mas, sobretudo, a intera\u00e7\u00e3o entre os cientistas que atrav\u00e9s de esfor\u00e7os coletivos ou cooperativos buscaram realmente superar o esmagador e ao mesmo tempo tentador trabalho que havia pela frente. Tradicionalmente a descoberta de vias metab\u00f3licas ou o sequenciamento de genes era conduzido por cientistas em trabalhos individuais usando uma abordagem clone ap\u00f3s clone.

A ampla divulga\u00e7\u00e3o das novas descobertas e desenvolvimento de novas t\u00e9cnicas envolvem o livre acesso a informa\u00e7\u00f5es que est\u00e3o sob forte press\u00e3o do poder econ\u00f4mico. Para que o fluxo destas informa\u00e7\u00f5es seja r\u00e1pido, a Internet aparece como uma ferramenta vital para os cientistas, porque ela permite a prolifera\u00e7\u00e3o e o compartilhamento de grande quantidade de informa\u00e7\u00f5es contidas em bancos de dados centralizados. O fluxo de informa\u00e7\u00f5es cient\u00edficas atrav\u00e9s da Internet proporciona 3 grandes vantagens para os cientistas: primeira, proporciona o acesso \u00e0 informa\u00e7\u00e3o para qualquer um que possua um computador conectado a Internet e um browser (navegador), sendo esta uma excelente forma de democratiza\u00e7\u00e3o da informa\u00e7\u00e3o. Em segundo lugar, as informa\u00e7\u00f5es armazenadas em bancos de dados centralizados apresentam redund\u00e2ncia em v\u00e1rios graus. Isto ocorre devido ao fato de que v\u00e1rios pesquisadores podem contribuir com a mesma informa\u00e7\u00e3o para o banco de dados. Por conseguinte o acesso a estas informa\u00e7\u00f5es pela Internet proporciona um amplo e eficiente controle de qualidade para as seq\u00fc\u00eancias armazenadas. Em terceiro lugar, as informa\u00e7\u00f5es armazenadas nos bancos de dados a respeito de um determinado organismo fornecem valiosas informa\u00e7\u00f5es que poder\u00e3o ajudar os cientistas a descobrirem e compreenderem v\u00e1rias vias metab\u00f3licas de outros organismos atrav\u00e9s da compara\u00e7\u00e3o de genes

hom\u00f3logos. Por exemplo, na tentativa de curar doen\u00e7as humanas, muitos genes envolvidos com v\u00e1rias vias metab\u00f3licas importantes para estas doen\u00e7as foram estudados em leveduras. Esta abordagem se fundamenta na rela\u00e7\u00e3o existente entre todos os seres vivos baseado na evolu\u00e7\u00e3o. Assim surge uma nova abordagem da Biologia, a gen\u00f4mica comparativa entre esp\u00e9cies lineares.

O lan\u00e7amento do Projeto Genoma Humano no final dos anos 80 (e muitos projetos genomas de outros organismos) foi um evento decisivo para o desenvolvimento da bioinform\u00e1tica. Os biologistas moleculares que participam do projeto genoma n\u00e3o conseguem ir muito longe na pesquisa em seq\u00fc\u00eancias lineares inteiras devido a limita\u00e7\u00f5es t\u00e9cnicas. Sendo assim, eles simplesmente produzem bits de milhares de peda\u00e7os pequenos das seq\u00fc\u00eancias de DNA que ser\u00e3o posteriormente montados como um gigantesco quebra-cabe\u00e7as, dando origem a seq\u00fc\u00eancia gen\u00f4mica completa. A bioinform\u00e1tica \u00e9 a ferramenta anal\u00edtica que eles precisam para ajud\u00e1-los a montar a seq\u00fc\u00eancia gen\u00f4mica e finalmente revelar a informa\u00e7\u00e3o biol\u00f3gica relacionada a esta seq\u00fc\u00eancia. A informa\u00e7\u00e3o gen\u00f4mica obtida \u00e9 bastante relevante , porque a fun\u00e7\u00e3o de um gene n\u00e3o est\u00e1 apenas na seq\u00fc\u00eancia de codifica\u00e7\u00e3o para uma prote\u00edna, mas tamb\u00e9m na organiza\u00e7\u00e3o destes genes nos genomas. Os organismos n\u00e3o usam os genes de forma isolada, mas sim em grupos. A compreens\u00e3o de como o padr\u00e3o de atividade destes genes \u00e9 controlado durante o ciclo de vida de um organismo ainda est\u00e1 longe de ser totalmente compreendida pelos biologistas. Cada uma das c\u00e9lulas de um organismo pluricelular cont\u00e9m um pacote completo de genes, mas apenas uma pequena parte \u00e9 utilizada pela c\u00e9lula (a maioria dos genes que nunca ser\u00e3o utilizados \u00e9 inativada). A combina\u00e7\u00e3o de genes ativados numa c\u00e9lula define seu destino biol\u00f3gico. Isto \u00e9 conhecido como diferencia\u00e7\u00e3o celular e, normalmente \u00e9 um processo irrevers\u00edvel durante a vida de uma c\u00e9lula. A gen\u00f4mica funcional \u00e9 uma conseq\u00fc\u00eancia direta da informa\u00e7\u00e3o