Resumen Prueba IV Bioqumica En la clula hay distintos tipos de RNA:

1. rRNA= Componente de los ribosomas, los cuales llevan a cabo la sntesis de protenas. 2. mRNA= Intermediario, transporta la info. desde uno o pocos genes hasta el ribosoma donde
se sintetizan las protenas.

3. tRNA= Traduce con fidelidad la informacin contenida en el mRNA a secuencias especficas

de aminocidos. Conformacin de los Nucletidos

Conformados por una PENTOSA, BASE NITROGENADA, GRUPO FOSFATO. NUCLESIDO = SIN GRUPO FOSFATO Bases y pentosas en nucletidos comunes son compuestos heterocclicos. A los C y N de las bases se numeran de forma convencional, pero los C de las pentosas de los nucletidos se le aade signo (). La base est unida (N1: Pirimidinas y N9: Pricas) al C1 de la Pentosa. El fosfato se une al C5 de la pentosa. Es poco frecuente encontrar Timina en el RNA o Uracilo en el DNA. Los cidos nucleicos contienen 2 tipos de pentosas:

1. DNA contiene 2-Desoxi-D-Ribosa 2. RNA contiene D-Ribosa

Tanto en el DNA como en el RNA, la pentosa se encuentra como Beta Furanosa (Anillo pentagonal cerrado) La mayora de los nucletidos contienen solo las 4 conocidas bases, pero tambin existen otras secundarias. En el DNA, las ms comunes son las metiladas de las bases principales, mientras que en DNA vricos, las bases estn hidoximetiladas o glucosiladas. Las bases poco comunes del DNA sirven como seales especficas para la regulacin o la proteccin de la informacin gentica. En el tRNA tambin se encuentran muchas bases secundarias. Las clulas contienen nucletidos con grupos fosfato en posiciones diferentes del Carbono 5. Los Ribonuclesidos 2,3 monofosfato cclicos son intermediarios aislables y los Ribonucletidos 3-monofosfato son productos finales de la hidrlisis del RNA, Adenosina 3,5 monofosfato cclico o AMPc y Guanosina 3, 5 monofosfato cclico o CMPC.

Desoxirribonucletidos Ribonucletidos

Nomenclatura de cidos Nucleicos Y Nucletidos

Enlace Fosfodister Grupo OH en 5 de un nucletido est unido al OH en 3 del nucletido siguiente. Por lo tanto el esqueleto covalente de los cidos Nucleicos son residuos alternados de fosfato y pentosa, con bases o grupos laterales unidos en forma regular. Los esqueletos covalentes de los DNA y RNA son hidroflicos Los OH de las pentosas forman puentes de hidrogeno con el agua. Los grupos fosfato tienen una pKa cercana a 0 y se encuentran completamente ionizados y cargados negativamente a pH 7. Las cargas negativas estn generalmente neutralizadas por interacciones inicas con cargas positivas de protenas, iones metlicos o poliaminas. El esqueleto covalente del DNA y RNA experimenta una lenta hidrlisis no enzimtica de los enlaces Fosfodister. Pero el DNA y RNA en el tubo de ensayo se hidroliza rpidamente en condiciones alcalinas, estando los OH 2 directamente implicados en el proceso. Los primeros productos del alcali sobre el RNA son 2, 3- monofosfatos cclicos, los cuales son rpidamente hidrolizados para producir una mezcla de 2 y 3 nuclesidos monofosfato.

Generalidades Oligonucletido: cido nucleico de cadena corta; hasta 50 nucletidos.

Propiedades de las bases nitrogenadas

Polinucletidos: Mayor a 50 nucletidos

Pirimidinas y Pricas son dbilmente bsicas. Tambin son altamente conjugadas, propiedad que influye en la estructura, distribucin electrnica y capacidad de absorcin de luz de los cidos nucleicos.

Las bases son hidrofbicas y relativamente insolubles al agua a pH celular cercano a la neutralidad. A pH cido o alcalino, las bases adquieren carga y aumentan su solubilidad al agua. Las interacciones hidrofbicas de apilamiento, que sitan paralelamente los planos de los anillos e 2 o ms bases, son uno de los principales tipo de interaccin de bases (Modelo Watson y Crack). El apilamiento tambin conlleva el uso de Fuerzas de Van der Walls y Uniones dipolo-dipolo entre bases. El apilamiento ayuda a minimizar el contacto con el agua, lo que contribuye en gran medida a la estabilidad de la estructura. Los grupos funcionales ms importantes de las pricas y pirimdcas son los grupos carbonilo y los nitrgenos del anillo y de los grupos exocclicos. La formacin de enlaces de hidrgeno, en los que participa un grupo amino y carbonilo, constituye el 2 tipo de interaccin entre las bases. Los puentes de hidrgeno permiten asociaciones complementarias de 2, 3 o hasta 4 cadenas de cidos nucleicos.

Biosntesis y degradacin de nucletidos

Funciones de los nucletidos: Precursores del ADN y ARN ATP y GTP principales transportadores de energa qumica. Componentes de los cofactores NAD, FAD, S-adenosilmetionina y coenzima A. Componentes de los cofactores de intermediarios biosintticos de UDP-glucosa y CDP-diacilglicerol.

AMPc y GMPc segundos mensajeros.

Existen 2 tipos de vas para la formacin de nucletidos: Rutas del novo: A partir de aa, ribosa 5-fosfato, CO2 y NH3. Anillo de purina se construye a partir de tomos que se unen a la ribosa. En las pirimidinas se sintetiza orotato unido a ribosa fosfato. El aa glicina es importante para las purinas mientras que en las pirimidinas es importante el aspartato, aunque de igual forma este ltimo es fuente de dos grupos aminos de las purinas. Fuente ms importante de grupo amino en general: glutamina. Rutas de recuperacin: Reciclan bases libres y nuclesidos de la degradacin de ac. Nucleicos. A veces la sntesis de nucletidos o ac. Nucleicos puede ser limitante para la velocidad de replicacin y transcripcin de ADN. Sntesis de novo de las purinas (AMP y GMP) Origen de los tomos del anillo purico:

Formacin del anillo por pasos: 1. Grupo amino (de la glutamina) se une a C1 de el PRPP (Fosforribosil pirofosfato) y resulta 5fosforribosilamina (inestable dura 30 seg)

2. Se unen 3 tomos por la glicina ( 2C y 1N) se gasta 1ATP para activar la glicina
3. El anterior grupo amino incorporado (el de la glicina) se formila por la adicin de N10formiltetrahidrofolato. 4. Se suma un segundo N de la glutamina 5. Se forma por deshidratacin y cierre del anillo el imidazol (5-aminoimidazol ribonucletido)

6. Se aade un grupo carboxilo 7. Se une un carboxilato de un grupo amino exocclico al anillo de imidazol.

 6 y 7 ocurren solo en bacterias y plantas en eucariontes superiores desde el imidazol (paso 5) pasa aun carboxiaminoimidazol por adicin de CO2 8. Formacin de un enlace amida por ingreso de aspartato 9. Eliminacin de fumarato (se elimina el esqueleto del aspartato) 10. Ingresa el ltimo carbono suministrado por el N10- formiltetrahidrofolato 11.Formacin de 2do anillo, formacin de inisinato (IMP)

El IMP (inosinato) = HIPOXANTINA + RIBOSA-FOSFATO IMP se transforma en AMP por el ingreso de un grupo amino proveniente del aspartato (se utiliza GTP) IMP forma GMP por oxidacin de inosinato en C2 y se requiere de un NAD+ y un grupo amino de la glutamina. REGULACIN: Es por retroinhibicin

 La primera regulacin es sobre el PASO 1 que es cuando al PRPP le adicionamos un grupo amino de glicina para formar 5-fosforribosilamina gracias a la enzima alostrica glutamina-PRPP amidotransferasa que es inhibida por: IMP, GMP y AMP. La segunda regulacin es por el exceso de GMP en lo que es la formacin de xantilato por el inosinato, esto por la enzima IMP deshidrogenasa (no afecta la formacin de AMP y requiere ATP) y tambin ocurre regulacin en la formacin de AMP a partir de IMP por la adenilsuccinato sintetasa. (Requiere GTP)

Tercer mecanismo inhibicin de la sntesis de PRPP por la ribosa fosfato pirofosfoquinasa.

Sntesis de novo de las pirimidinas (CMP y UMP)

En esta sntesis se forma un anillo de pirimidina de seis tomos y luego se une a la ribosa 5-fosfato, para la formacin se requiere de un carbamil fosfato proveniente del ciclo de la urea que se genera en las mitocondrias por la carbamil fosfato sintetasa I, pero el que es utilizado por las pirimidinas es generado en el citosol por una carbamil fosfato sintetasa II.

Formacin del anillo pimidico por pasos: 1. Cabamil fosfato reacciona con un aspartato formando N-carbamilaspartato catalizado por la aspartato transcarbamilasa. 2. El anillo de pirimidina luego se cierra por una deshidratacin que es catalizada por la dihidroorotasa, que forma la L-dihidroorotato. 3. Luego el L-dihidroorotato se oxida gracias a la acepcin de los electrones por parte del NAD+ formando el orotato.

 En los eucariontes las tres primeras enzimas de esta va descritas forman parte de una sola protena conocida con las siglas CAD con los sitios activos para las tres reacciones en cada cadena. 4. El orotato formado se une a una cadena lateral de la ribosa 5-fosfato que proviene de un PRPP formando orotilidato 5. El orotilidato se descarboxila formando uridilato 6. El uridilato fosforila a UTP 7. El CTP se forma a partir del UTP por la accin de la citidilato sintetasa.

REGULACIN: por retroinhibicin Gran parte de esta regulacin es por la enzima del PASO 1 la aspartato transcarbamilasa (ATCasa) inhibida por CDT.

Transformacin de nuclesidos monofosfato a nuclesidos trifosfato: Las vas de conversin son comunes en todas las clulas, la transformacin de AMP en ATP ocurre por una adenilato quinasa.

Las enzimas nuclesidos monofosfato quinasas son especficas para una base concreta pero no son especficas para la azcar, ya sea ribosa o desoxirribosa.

Las enzimas nuclesido difosfato quinasa no son especficas ni entre las purinas y pirimidinas como tampoco para el azcar.

Ribonucletidos precursores de los desoxirribonucletidos: De ADP pasa a dADP por la enzima ribonucletido reductasa, reduce la porcin D-ribosa a 2-desoxi-dribosa, este cambio necesita de dos hidrgenos del NADPH que son llevados por la tiorredoxina, la tiorredoxina oxidada lleva los H al NADPH por la accin de una tiorredoxina reductasa El timidilato (dTMP) se forma a partir de dCTP y dUMP, el precursor inmediato de dTMP es el dUMP con la formacin de dUTP ya sea por desaminacin de dCTP o por fosforilacin de dUDP: De dUMP a dTMP es catalizado por la timidilato sintetasa ocurriendo una reduccin a expensas de un tetrahidrofolato a dihidrofolato, luego este dihidrofolato vuelve a tetrahidrofolato por accin de la enzima dihidrofolato reductasa.

Degradacin de las purinas y pirimidinas produce cido rico y urea respectivamente: 1. 2. 3. 4. 5. Los nucletidos purinicos pierden su grupo fosfato por la accin de una 5-nucleotidasa. El adenilato se transforma en adenosina por una adenosina desaminasa. La vez la inosina se hidroliza a hipoxantina La hipoxantina se oxida a xantina. Y la xantina se transforma ac. rico por la xantina oxidasa.

En el caso de GMP que tambin va a formar ac. rico:

1. se va a formar guanosina por tambin una 5-nucleotidasa. 2. La guanosina se transforma en guanina libre 3. La hidrlisis de la guanina forma xantina por la guanina desaminasa 4. La xantina se transforma en ac. rico por la xantina oxidasa.

El c. rico es el producto final de la degradacin de las purinas, pero en la mayora de los mamferos posteriormente se degrada a alantona por accin de la urato oxidasa

La va de las pirimidinas produce NH4+ que tambin va a la sntesis de urea: La timina se transforma en metilmalonilsemialdehdo y luego llega a formar succinil-CoA a travs de propionil-CoA y de metilmalonil-CoA

 Normalmente las bases purinicas y pirimidicas se reciclan de las rutas de recuperacin en el caso de las purinas la adenina libre se une al PRPP y forma AMP mediante la accin de la enzima adenosina fosforribosiltransferasa. La guanina y la hipoxantina libre son recuperadas por la enzima hipoxantinaguanina-fosforribosiltransferasa (una carencia de esta enzima produce el sndrome de Lesch-Nyhan, en ausencia de ella aumentas los niveles de PRPP lo que produce un aumento de la sntesis de novo de las purinas que da niveles elevados de ac- rico y esto muestra daos semejantes a los de la gota. La gota: Es una enfermedad de las articulaciones debido a una concentracin elevada de c. rico en la sangre y en los tejidos. Las articulaciones se inflaman, duelen y desarrollan artritis por una deposicin anormal de cristales de urato sdico, tambin el exceso de ac. rico se deposita en los tbulos renales. Esta enfermedad se trata con terapia nutricional y farmacolgica, suprimiendo los alimentos ricos en nucletidos y ac. Nucleicos, tambin se han obtenido mejoras con el frmaco alopurinol que es un inhibidor de la xantina oxidasa

Taller N 4:

Metabolismo de Nucletidos e Integraciones Metablicas

1) Un nio de 15 aos de edad, se despierta a las 7:30 hrs AM, se sienta a desayunar y exclama estoy muy hambriento. El nio termin su cena la tarde anterior a las 7:15 PM y no recuerda haber comido nada antes de ir a la cama. Si se le tomara una biopsia heptica, cul de los siguientes procesos respondera con una elevada velocidad si la comparamos con el estado de ayuno? A. Sntesis de protenas, no podra estars intetizando protenas ya que las protenas se forman cuando la persona no esta con necesidades energticas, por ende en este caso el nio, esta en ayuno y los aminocidos iran a desaminarse para forman piruvato en el hgado y as otorgar la glucosa necesaria para el funcionamiento del organismo. B. Glicgeno lisis, si bien la glicogenolisi es uno de los primeros procesos en ocurrir cuando una persona esta necesitando energa, esto ocurre en las primeras 3 a 4 horas, como vemos en el caso anterior a pasado mucho mas que eso por lo que el glicgeno ya se degrado C. Glicolisis, Este proceso estar ocurriendo en una elevada velocidad ya que el cuerpo esta necesitando ATP y todos sus reservas energticas capaces de ser convertidas a glucosa estn siendo degradadaspor este proceso: aminocidos a piruvato y de ah mediante a gluconeogenesis y esta a glucosa sangunea la cual ser utilizada en el musculo mediante la glicolisis D. Sntesis de cidos grasos, la sntesis de acidos grasos ocurre cuando tenemos excesode glucosa, lo cual no es el caso, ya uqe aqu ocurrir degradacin de TAG. E. Va de las pentosas fosfatos, la via de las pentosas fosfatos comienza a ocurrir cuando la relacin nadh/nad es alta por lo que ocurre en exceso de glucosa,noen ayuno.

2) La Resistencia a la insulina, que es el sello de la diabetes mellitus tipo 2, se cree que surge de mltiples factores. De los posibles factores listados abajo, cul es probablemente el ms directo contribuyente a la enfermedad? A. Seales endocrinas desde el tejido adiposo es el mas directo ya que el tejido adiposo produce adiponectina la cual aumenta la captacin de glucosa, aumentala velocidad de la beta oxidacin, y aumenta l acaptacion de acidos grasos, por lo cual esta relacionada con la insulina en el metabolismo de los glcidos. LOS DIABETICOS TIENEN INDICES DE ADIPONECTINA MENORES UQE LAS PERSONAS NORMALES, YA QUE ESTA HORMONA ACTUANDO MEDIANTE LA AMPK LA QUE MODULA LA SENSIBILIDAD DE LOS TEJIDOS A LA INSULINA. B. Muerte de las clulas pancreticas, la muerte de las clulas pancreticas indica que no se esta produciendo insulina lo que no implica una falla en los receptores que la captan , esta caracterstica esta relacionada con la diabetes tipo I C. Aumento de la masa de los adipositos en muslos y glteos, el aumento de los adipocitos indica que hay mayor numero dehormonas lo cual tambin esta implicada en la aparicin de adiponectina y otras hormonas pero esta alternativa no se refier especficamente a esta accin del tejido adiposo D. Disfuncin del metabolismo lipdico en el hgado el metabolismo lipidico del hgado estar implicado en lso destinos que tendr la degradacin de los lpidos y tambin si se sintetizan TAG a partir de acidos grasos y glicerol,no esta en directa relacin con la insulino resistencia E. Estilo de vida sedentario, La insulino resistencia existe cuando no hay una respuesta correcta del receptor a insulina frente a esta porque se encuentra desensibilizado, la principal causa de este proceso es por el consumo de comida a cada rato y tambin la falta de ejercicio que provoca un aumento del tejido adiposo donde se introducen macrfagos y generan adipocitokinas que influyen de manera negativa en el reconocimiento del receptor de insulina. Tambin el comer a menudo impide que bajen los niveles de insulina ya que le administramos constantemente a nuestro organismo niveles altos de glucosa y por lo tanto se secreta alta cantidad de insulina, pero al no dejar que bajen estas concentraciones de insulina se genera una desensibilizacin de los receptores que provoca a la larga insulino resistencia. Por lo que podemos evaluar que en general se debe a un estilo de vida sedentaria que incluye comer en las horas que no corresponde y una falta de ejercicio. 3) Un estudiante termin de comer una bien balanceada comida de 750 kcal una hora atrs y est mirando televisin sentado tranquilamente, Cul de las siguientes sustancias no se elevar en la sangre del estudiante? A. Acidos grasos B. Insulina C. Aminocidos D. Glucagn, no se elevara ya uqe la glucosa que ha ingerido es sufieciente para mantenerse y el efecto de la alta concentracin de glucosa tarda 3 horas en desaparecer E. Glucosa TODO EL RESTO DE LAS ALTERNATIVAS NO SON PUES ESTARAN EN ALTA CANTIDAD DADA SU PRESENCIA EN LSO ALIMENTOS El estudiante se encuentra sentado sin realizar algn ejercicio por lo que los alimentos que el consumi sobre todo las carbohidratos se dirigir a la formacin de glucosa, mientras los TAG se introducirn por va del AcetilcoA como tambin los aa en las distintas etapas del ciclo del ac. Ctrico o producirn glucosa mediante aa glucognicos, pero todo esto con el fin de acumular glicgeno, ya que el individuo no necesita energa, por lo tanto no se necesita glucagn que es una hormona que aumenta la glicogenlisis y la gluconeognesis que es lo contrario a lo necesario en este caso. 4. La Inmunodeficiencia severa combinada se produce la inhibicin de la proliferacin de linfocitos ya que las clulas T y B son particularmente sensible a la inhibicin alostrica de cul de las siguientes enzimas del metabolismo de las purinas?. A. Xantina oxidasa B. Dihydrofolato reductasa C. Adenosina deaminasa D. Ribonucleotido reductasa E. Hypoxantina-guanina fosforibosiltransferasa R: La deficiencia de ADA, produce un aumento de dATP( desoxiadenosintrifosfato), que es un inhibidor de la ribonucleotido reductasa, por lo tanto inhibe la produccin de otros dNTP en los linfocitos T y B. por lo tanto

estos pacientes carecwen sde un sistema inmune eficaz y para sobrevivir deben hacerlo de forma aislada, en burbujas

5) Un hombre de 47 aos de edad se queja de dolor en las articulaciones de su dedo mayor del pie, el cual est inflamado y sensible. El dolor ha sido crnico pero lleg a ser intolerable el da despus del 19 de septiembre cuando el particip en un gran asado con algunos vasos de vino tinto. El est obeso, y su historia mdica reciente indica la eliminacin de clculos renales. Cul de las siguientes caractersticas est involucrada en la fisiopatologa de la condicin del paciente? A. Acido ortico elevado B. Acido rico elevado, debido al gran consumo de protenas las cuales en su degradacin producen acido rica causando gota acumulndose en articulaciones C. Deficiencia de cido flico D. Anemia E. Hipoglicemia 6) El Metotrexato es un potente agente anticancergeno que depriva a las clulas en divisin de deoxiribonucleotidos a travs de una inhibicin directa, de cul de las siguientes enzimas? A. Ribonucleotido reductasa B. Xantina oxidasa C. Carbamoil fosfato sintetasa II D. Timidilato sintetasa E. Dihidrofolato reductasa ya que esta enzima participa directamente en el metabolismo del acido flico el cual esta relacionado con la sntesis de timidinas monofosfato por lo que es necesario inhibirlo en tumores con el finde que cese la replicacin de DNA. Esta enzima convierte el dihifrofolato a tetrahidrofolato F. Adenosina deaminasa