wsommaire

03w horizons
Agreenium : porte entre lenseignement et la recherche et fentre sur le monde Le site inra.fr fait peau neuve

Chers lecteurs,

A
Inra / Christophe Matre

06w recherches
& innovations
Petit pois contre charanons Neurones in vitro La gnomique au service de llevage Des petits ARN difficiles digrer !

u moment de prendre mes fonctions, je veux tout dabord saluer Marion Guillou, auprs de qui jai eu le plaisir de travailler durant de nombreuses annes, et laquelle jai lhonneur de succder.

13w Dossier
Les champs du possible

En prenant ces fonctions, je prends la tte dun organisme qui est un acteur majeur de notre systme de recherche, reconnu et attendu en France comme dans le monde. Je mesure aussi limportance des enjeux qui nous concernent : lheure o notre plante doit faire face une conjonction sans prcdent de dfis et transitions, la fois nutritionnels, climatiques, cologiques, nergtiques, je souhaite que lInra contribue, dans le cadre dun dialogue accru avec toute la socit, lmergence de nouveaux systmes agricoles et alimentaires diversifis, performants et durables. Je poursuivrai linternationalisation de lInra, tout en maintenant son engagement dterminant dans lEurope de la recherche. Dans le respect de ses missions et de son statut, jimpliquerai lInstitut dans les dynamiques nationales et territoriales qui structurent notre systme de recherche et dinnovation. Au cur de ces priorits, je placerai le dialogue et linteraction avec nos partenaires, avec les acteurs socioprofessionnels et conomiques comme avec les associations et avec tous nos concitoyens. Merci toutes et tous pour votre soutien en attendant de nous retrouver dans nos laboratoires, sur le terrain ou entre partenaires!

25w reportages
Plongez dans le monde de leau ! Des puces chez les poulets Renouveau de la recherche agronomique au Kazakhstan Manger et sclairer

31w impressions 34w regarD

Marion Guillou et lInra, douze ans de vie commune

Franois Houllier
Franois Houllier est nomm Prsident-Directeur gnral de lInra compter du 27 juillet 2012.

INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE 147 rue de lUniversit 75338 Paris Cedex 07

www.inra.fr
Directeur de la publication : Franois Houllier. Directeur ditorial : Jean-Franois Launay. Directeur de la rdaction : Antoine Besse. Rdactrice en chef : Pascale Mollier. Rdaction : Laurent Cario, Brigitte Cauvin, Lidia Chavinskaia, Michelle Cussenot, Ccile Poulain. Photothque : Jean-Marie Bossennec, Julien Lanson, Christophe Matre. Couverture : Photo : Inra/Ccile Poulain. Maquette : Patricia Perrot. Conception initiale : Citizen Press - www.citizen-press.fr. Impression : Imprimerie CARACTERE. Imprim sur du papier issu de forts gres durablement. Dpt lgal : octobre 2012.

Renseignements et abonnement : inramagazine@paris.inra.fr

2 Inra magazIne n22 octobre 2012

ISSN : 1958-3923

porte entre lenseignement et la recherche et fentre sur le monde

La recherche internationale volue rapidement, de nouvelles alliances se tissent autour des grands dfis que sont lalimentation mondiale, lnergie et le changement climatique. Lenseignement doit se nourrir de cette volution et rciproquement, car les tudiants forms dans cette dynamique feront la recherche de demain ou interagiront avec elle. Cest lobjectif dAgreenium, qui runit des instituts de recherche et des coles suprieures agronomiques autour de projets de formation, de recherche et de dveloppement.

t enseignement, Agreenium, cest l Universit franaise en agrobiosciences , comme le rsume son directeur Stphane Guilbert, les agrobiosciences englobant les domaines de lagriculture, de lalimentation, de la sant animale et de lenvironnement. Donner lenseignement agronomique franais une visibilit internationale, tre en mesure de construire des formations avec dautres pays, telles sont les perspectives dAgreenium, qui propose des dispositifs spcifiques tout au long du cursus des futurs chercheurs.
L3 (bac + 3) Doctorat (bac + 8) EIR-A : Ecole internationale de recherche-Agreenium EIR-A propose - en partenariat avec 15 Ecoles doctorales - un complment la formation comprenant : 2 sminaires + 1 exprience de 3 mois minimum ltranger + le suivi du parcours par un scientifique rfrent + le label Agreenium en fin de doctorat. AgTraIn : Agricultural transformation by innovation. Sous le label Erasmus Mundus, dix sujets de thses sont proposs avec une bourse de 3 ans (2011-2013), et avec, pour chaque sujet : deux tablissements dinscription europens, associs avec un pays du Sud.
Exemple de sujet : Dynamique de linnovation : march du citrus et de lolive en Tunisie. (Montpellier SupAgro et Wageningen University).

Post-Doctorat Le programme europen AgreenSkills (2012-2016) favorise la mobilit internationale de jeunes chercheurs confirms (1 6 ans aprs le doctorat), de tous pays et de toutes disciplines, en proposant 142 bourses de mobilit entrante (vers un laboratoire dun membre dAgreenium) ou sortante (vers un laboratoire ltranger), dune dure de 6 24 mois. Ce programme est fortement slectif et sappuie sur des expertises internationales. Cofinanc par la CE dans le cadre du programme COFUND du 7e PCRD. www.agreenskills.eu

Master (bac + 5) Un portail bilingue rpertorie loffre de masters en agrobiosciences : 79 masters nationaux + 8 masters europens Erasmus Mundus http://formations.agreenium.org

Ct recherche, en bref, Agreenium renforce les actions internationales portes par lInra et le Cirad et en dveloppe dautres plus spcifiques. Par exemple, la construction de programmes pour le Bassin mditerranen, avec des priorits sur la gestion de leau, la protection intgre, les maladies mergentes, llevage des petits ruminants ou encore laide la reconstruction du systme de recherche et de formation en Hati aprs le sisme de 2010.
Agreenium est un consortium, cr en 2009, regroupant lorigine six membres fondateurs sous un statut dEPCS (Etablissement public de coopration scientifique), dot dun conseil dadministration, dun conseil dorientation stratgique, et dune quipe de direction situe au sige de lInra Paris. Membres fondateurs : Inra, Cirad, AgroParisTech, Agrocampus Ouest, Montpellier SupAgro, INP-Ecole nationale vtrinaire de Toulouse, largi en juin 2011 lINP-Toulouse et, depuis juin 2012 AgroSup Dijon. Membre associ depuis juin 2012 : Bordeaux Sciences Agro. Agreenium bnficie de lensemble du dispositif de recherche et denseignement de ses membres, savoir : 12 000 personnes dont 6 200 chercheurs, ingnieurs et enseignants-chercheurs Un dispositif de 300 units de recherche labellises AERES (Inra et Cirad) 6 campus conjoints de formation et de recherche : Paris, Rennes-Angers, Montpellier, Toulouse, Dijon et Bordeaux. Agreenium assure et accueille : Plus de 80 formations de Master, dont une dizaine de parcours europens (5 000 tudiants) 2 000 doctorants Une vingtaine de reprsentations communes ltranger, notamment en Chine, au Brsil, en Afrique et en Asie du sud.

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www.agreenium.org

Pascale Mollier
Inra magazIne n22 octobre 2012 3

w horizons

Agreenium :

w recherches

Petit pois contre

charanons

& innovations

SILoS DuNe uNIt de collecte de grains.

w
Des chercheurs du laboratoire Biologie fonctionnelle, Insectes et Interactions , unit mixte Inra-Insa Lyon, ont lucid un mcanisme de toxicit par voie digestive chez certains insectes, permettant douvrir des perspectives de lutte contre les charanons ou les moustiques. Ce rsultat prend place dans une recherche conduite sur une protine extraite de la graine de petit pois, insecticide biologique dorigine vgtale connu depuis quelques annes.

emploi dinsecticides de synthse, moyen extrmement efficace, est de plus en plus contest alors mme que les mthodes alternatives sont difficiles mettre en uvre dans des conditions conomiques ou pdoclimatiques donnes. Employer une protine extraite de pois (Pisum sativum) comme produit insecticide est une voie prometteuse dont lexploration se poursuit. Manger tre mang Un insecte ne consomme pas les plantes qui contiennent ou scrtent des composs chimiques qui le repoussent, voire lintoxiquent. Cest un principe empiriquement mis en uvre lorsque lhomme utilise ou slectionne des plantes qui ont dvelopp, en elles-mmes, une facult de rsistance un ravageur. Ces substances actives servent galement les pratiques traditionnelles bases sur la connaissance des plantes et lobservation des insectes : par exemple, associer une plante qui en protge une autre contre un insecte par sa simple prsence en proximit ou utiliser des

dcoctions de plantes. Comment reconnatre et dvelopper des toxines dorigine naturelle capables de contrler des pullulations dinsectes ? Car le produit labor doit remplir une double condition : tre pandu sans risque et traiter avec efficacit des insectes dont les dgts sont reconnus comme majeurs. Les moustiques, notamment en pays chauds, et les insectes des graines, difficilement dcels, ainsi que certains pucerons, sont les trois cibles atteintes dans le cas de ce travail de recherche. Les chercheurs de Lyon, spcialistes de relations entre plantes et insectes, tudient certaines substances les empchant de salimenter correctement. Ils analysent galement quels mcanismes sont en jeu lorsque des plantes cultives rsistent naturellement aux attaques. Il y a quelques annes, ils ont identifi une protine extraite de la graine de pois, une albumine appele PA1b, pour sa proprit insecticide (1). Pour Frdric Gressent, chercheur du laboratoire, cette protine a les mmes potentialits que la toxine de Bacillus thurin-

giensis actuellement employe sous forme dinsecticide biologique ou de plantes transgniques rsistantes des insectes. PA1b prsente lavantage supplmentaire de driver de graines de lgumineuses cultives un peu partout sur la plante. Cependant, il tait primordial de comprendre le mcanisme de sa toxicit, pour moduler son efficacit ou prvenir lapparition de phnomnes de rsistance des insectes si cette molcule est pandue au champ . Une faim d...insecte Ainsi, lquipe de Lyon vient dlucider le mode daction de la protine PA1b (2) : lorsque linsecte lingre, elle se fixe sur une protine de lintestin, la V-ATPase, et inhibe son action. Or, la V-ATPase acidifie le tube digestif, apporte de lnergie la digestion, et favorise labsorption des nutriments par le tube digestif. Si cette fonction est dgrade, linsecte meurt de faim. Les rsultats obtenus ont permis dexpliquer la toxicit de la protine PA1b, et dorienter vers de nouveaux essais pour cibler plus prcisment cette inhibition de lactivit de la V-ATPase.

Inra magazIne n22 octobre 2012

Inra / Jean-Marie Bossennec

CuLtuRe De PLACoDe NASALe dembryon de souris transforme gntiquement avec des marqueurs qui permettent de visualiser des cellules gliales (en vert), situes proximit des neurones GnRh (flches).

w recherches

& innovations
w

Neurones in vitro

Delphine Pillon et Pascal Vaudin, enseignants-chercheurs lInra de tours, ont rcemment mis en vidence linfluence de perturbateurs endocriniens sur le dveloppement neuronal. Leur quipe labore actuellement un test in vitro pour mieux tudier leffet de ces molcules. Interview de ces deux chercheurs.

Quelles informations nouvelles apportent vos travaux sur les neurones GnRH (Gonadotropin Releasing Hormone) ?
Delphine Pillon : Jusqu prsent, les rsultats publis concernaient essentiellement les effets des perturbateurs endocriniens sur la production de spermatozodes ou sur lappareil gnital mle, avec la description de malformations de type cryptorchidie (1) et hypospadias (2). Nos travaux montrent que ces molcules ont aussi des effets sur les systmes neuroendocrines qui contrlent la fonction de reproduction. Nous nous sommes intresss en particulier aux effets de lEthynilstradiol (3), le principal strogne des pilules contraceptives, sur le systme GnRH.
8 Inra magazIne n22 octobre 2012

Quelle est limportance de ce systme ? D.P. : La GnRH est une hormone synthtise et scrte par un groupe de neurones localiss dans lhypothalamus. Cette scrtion dpend de nombreux paramtres : niveau des strodes sexuels, photopriode, phromones, etc... La GnRH contrle la scrtion par lhypophyse des hormones gonadotropes LH et FSH qui agissent leur tour sur les ovaires et les testicules, pour moduler la production des gamtes et des hormones sexuelles, parmi lesquelles lstradiol et la progestrone chez la femelle et la testostrone chez le mle. Quel est limpact des perturbateurs endocriniens sur ces neurones GnRH ?

D.P. : Quand on expose des souris lEthinylstradiol pendant la vie embryonnaire et postnatale jusqu la pubert, on observe chez ladulte un nombre suprieur de neurones GnRH par rapport aux individus contrles. Cela saccompagne chez le mle dun comportement sexuel exacerb, et ce, sur plusieurs gnrations, sans consquence sur la fertilit. Par contre, on ne sait pas si les perturbateurs endocriniens agissent directement sur les neurones GnRH, ou si dautres types cellulaires relaient cet effet. Comment tudiez-vous les neurones GnRH exprimentalement ? D.P. : Dans le cerveau adulte, les neurones GnRH sont disperss,

Inra / Pascal Vaudin

peu accessibles et peu nombreux. Ce qui en fait un sujet dtude difficile. Nous utilisons donc un systme de culture in vitro. Nous prlevons la placode nasale de lembryon de souris qui est le lieu de formation des neurones GnRH avant la migration dans le cerveau. Cette placode est mise en culture et de l drivent les neurones GnRH et leur environnement cellulaire, notamment les cellules gliales. Anne Duittoz, dans notre quipe, a mis au point la technique chez le mouton et la adapte chez la souris. La dissection est trs dlicate car il faut prendre peu de tissu, pour ne pas tre contamin par dautres types cellulaires. Les analyses prennent du temps car nous rcuprons peu de matriel biologique. A partir de ces recherches vous souhaitez dvelopper une entreprise prestataire de service en toxicologie ? Pascal Vaudin : Oui, car notre matrise de la culture in vitro de ces neurones GnRH nous permettrait de les utiliser pour raliser des tests toxicologiques. Notre dfi est de passer lchelle semi-industrielle pour disposer de systmes de culture fiables, trs reproductibles. Pour cela, il faut obtenir un grand nombre de cellules. Nous pourrons alors tester nimporte quel type de produits chimiques, par exemple pharmaceutiques ou phytosanitaires. Outre la prcision des observations, ces systmes in vitro permettront de rduire les prlvements sur les animaux.

LethINyLStRADIoL augmente le nombre de neurones GnRh dans le cerveau. Les neurones sont dtects par immuno-histochimie, coloration brune. B : cerveau de souris femelles adultes exposes lethinylstradiol pendant leur vie in utero et juvnile. A : cerveau de souris non exposes.

En quoi consiste le test ? P.V. : Il faut tout dabord construire des lignes cellulaires, partir de placodes olfactives, en transformant gntiquement les cellules prcurseurs du systme GnRH. Une fois ces lignes cellulaires obtenues, nous pourrons laborer les tests toxicologiques. Nous pourrons aussi regarder par exemple si lEthinylstradiol a un impact sur lexpression de certains gnes des cellules de ce systme GnRH. En effet, le perturbateur agit en se fixant sur les rcepteurs aux strognes, formant ainsi un facteur de transcription dont la fonction est de rguler lexpression des gnes. On pourra galement voir si lactivit des neurones est modifie par le produit test.

Quel est lavenir de vos travaux ? P.V. : La mise au point de ces lignes cellulaires est doublement motive, la fois par le rglement europen Reach et par le fait que lon ne pourra bientt plus faire de tests toxicologiques sur animaux vivants. Ces tests pourraient tre soumis lEcvam (European Centre for the Validation of Alternative Methods). Le projet de cration de lignes cellulaires est soutenu par le Conseil rgional de la rgion Centre. Il a t initi en 2011 pour trois ans en collaboration avec le BRGM (4) et la socit Le Net Pathology Consulting Amboise. l Propos recueillis par Laurent Cario
(1) La cryptorchidie est labsence dun ou des deux testicules dans le scrotum. (2) Lhypospadias est une malformation du ftus masculin, qui se manifeste par louverture de lurtre dans la face infrieure du pnis au lieu de son extrmit. (3) Lthinylestradiol est un driv de synthse de lstradiol. Cest lstrogne le plus utilis au monde, il est prsent dans toutes les pilules contraceptives. Il est relargu sous forme trs stable dans les urines et saccumule dans lenvironnement depuis une quarantaine dannes. Son traitement dans les stations dpuration est peu dvelopp. Ces molcules se fixent sur les rcepteurs de lhormone naturelle, prenant sa place et perturbant sa fonction. Do le terme de perturbateurs endocriniens. (4) BRGM : Bureau de recherches gologiques et minires, Orlans.

Responsabiliser les acteurs du secteur chimique

par Marion Bougine-Renson*
Entr en vigueur le 1er juin 2007, le rglement europen REACH ((CE) n1907/2006) entend offrir un niveau lev de protection de la sant humaine et de lenvironnement. Pour ce faire, plusieurs actions sont mises en place : lenregistrement, lvaluation, lautorisation et la restriction des produits chimiques. Elles accentuent la responsabilit de divers acteurs du secteur chimique en leur imposant lvaluation et la gestion des risques inhrents aux produits chimiques. Ceci permet daccder une meilleure information sur le produit et, pour lUnion europenne, de prendre les mesures adquates, voire supplmentaires, pour les substances dites proccupantes (en particulier : les perturbateurs endocriniens).
* Doctorante en droit priv lUniversit de Limoges, collaboratrice du projet de cration dentreprise prestataire de service en toxicologie.

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Ces travaux sont raliss dans lquipe Microenvironnement et Dynamique des Rseaux Neuroendocrines (MiDyNNet) de lunit mixte de recherche Physiologie de la Reproduction et des Comportements , Inra/CNRS/ Universit Franois Rabelais de Tours/ Institut Franais du Cheval et de lEquitation.
Ocontacts :

Delphine.Pillon@tours.inra.fr Pascal.Vaudin@tours.inra.fr

Inra magazIne n22 octobre 2012

Inra / Delphine Pillon

w recherches

& innovations

La gnomique

au service de llevage

Mutualisant moyens, quipements et expertises entre les quipes de lInra, du Cirad et des diffrentes filires dlevage franaises, le Gis Agenae sest lanc depuis dix ans dans la course au squenage et a dvelopp des outils gnomiques de slection pour des levages comptitifs et durables.

une technologie de slection gnomique pressentie comme prometteuse en 2001, nous sommes passs en moins de dix ans la mise en march des semences du premier taureau choisi grce cette technologie ! LInra, au mme titre que de nombreuses units de recherche ltranger, a vcu une vritable rvolution entre 2001 et 2010, une rupture dans ses recherches en gnomique mais galement chez les professionnels des filires animales. Ensemble, nous avons gnr des marges de progrs normes et scuris le passage de linnovation au march. Trs peu de dcouvertes en recherche fondamentale ont t appliques aussi rapidement. LInra a t visionnaire en sy engageant rsolument , explique Christian Huyghe, directeur scientifique adjoint de lInra et prsident du Gis Agenae (Groupement dintrt scientifique Analyse du gnome des animaux dlevage). Au dbut des annes 2000, la gnomique - telle

quon la conoit aujourdhui -, nen est qu ses prmices : le gnome de lhomme et celui de la souris sont squencs mais ceux des espces dlevage ne le sont pas encore. Les travaux consistent alors essentiellement les cartographier aussi finement que possible et tirer profit des comparaisons avec celui de lhomme. LInra simplique donc ds les annes 2000 dans les squenages de gnomes. Pour mutualiser les moyens, les quipements et les expertises entre les quipes de lInra, du Cirad et les diffrentes filires dlevage piscicole, bovin, porcin et avicole, le Gis Agenae, est cr en 2002. Il mobilise au total 120 millions deuros, dont 50 millions apports par les membres fondateurs du Gis, le ministre, lAgence nationale de la recherche et lEurope, et 70 millions par lInra. Avec larrive des technologies de squenage haut puis trs haut dbit, le Gis se lance dans la course au squenage de la vache, de la poule,

du cheval, du cochon, de la chvre et de la truite. Didier Boichard, directeur de recherche en gntique animale et biologie intgrative, tmoigne : lInra a contribu plusieurs de ces consortiums internationaux de squenage et a jou un rle majeur dans ceux du porc et de la truite. Les chercheurs ont ralis un travail trs important sur lexploration du gnome et lidentification des fragments dADN impliqus dans de grandes fonctions agronomiques et a ainsi propos des outils gnomiques pour la slection des levages de chvres et de bovins . Cette analyse haut dbit du gnome rvolutionne la slection car elle permet de prdire la valeur gntique dun animal ds la naissance partir dun test ralis laide dune puce ADN contenant plusieurs dizaines de milliers de marqueurs, alors quauparavant la slection reposait sur lobservation de ses performances et de celles de sa descendance.

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Inra magazIne n22 octobre 2012

William Beaucardet

Le nombre de caractres sur lesquels porte cette valuation gntique senrichit progressivement et la prcision obtenue est proche de celle que lon observait pour un taureau partir de lenregistrement des performances de plusieurs dizaines de ses filles. Cette rvolution permet en outre de prserver la diversit gntique sur lensemble du gnome qui nest pas soumis la slection. Une recherche action Ce consortium a ainsi dcouvert des gnes ayant un impact majeur sur des caractres dintrt conomique. Les travaux ont permis dobtenir des rsultats tangibles utilisables par les professionnels, comme lidentification de nouveaux marqueurs biologiques de qualit (viande, gamte) et de gnes importants (syndactylie chez les bovins, conformation chez les ovins de race Texel). Grce ces recherches, il a galement t possible de comprendre le dterminisme gntique de la fertilit, de la sensibilit aux infections mammaires chez les ruminants et de la sensibilit aux infections chez les poissons et le porc. Les nouveaux marqueurs et gnes dcouverts enrichiront court terme les programmes de slection gnomique. Pour Maurice Barbezant, ancien directeur de lUNCEIA, la recherche action sest implique depuis le dbut, transfrant naturellement connaissances et technologies la filire levage. On peut aujourdhui slectionner les caractres de faible hritabilit, en relation directe avec les besoins socitaux, comme la qualit de la mamelle, la rusticit de lanimal On largit la diversit gntique des levages, en explorant des familles gntiques auparavant laisses de ct .
Inra / Bertrand Nicolas

Des avances majeures en gnomique fonctionnelle Le Gis Agenae a galement investi dans des plates-formes technologiques nationales comme Labogena, au service des biologistes voulant utiliser les technologies haut dbit. Elles ont t bties avec une volont douverture afin de servir une large communaut. Dix ans plus tard, cette organisation base sur des infrastructures nationales de haut dbit est largement adopte dans le monde de la recherche, et relaye par des infrastructures rgionales ddies au transcriptome, au protome et au mtabolome. Aujourdhui, en 2012, lInra renforce ses comptences en gnomique fonctionnelle. Nous cherchons expliquer au mieux le fonctionnement des gnes responsables des caractres dintrt pour llevage. Un dfi particulirement important sera de raliser le phnotypage le plus fin, prcis et exhaustif possible des animaux, afin davoir une infrence gnotype/phnotype la plus sre possible, et attribuer au plus grand nombre de caractres des variations gntiques cau-

sales. Lapprhension du mtabolisme des animaux dans sa globalit travers la mtabolomique sera galement une priorit. Dans tous les cas, lobjectif est de tendre vers une biologie prdictive de lanimal, afin den dterminer la valeur travers la mesure de quelques paramtres choisis, le plus tt au cours de sa vie , analyse Philippe Monget, directeur dAgenae. Le consortium souvre aujourdhui lpigntique, cest--dire ltude des modulations de fonctionnement du gnome sans modifications du patrimoine gntique. Lpigntique concerne par exemple limpact dun stress nutritionnel dune femelle gestante sur le mtabolisme de la descendance qui a subi ce stress in utero. Il sintresse galement la nutrignomique en gnral, et plus particulirement limpact du microbiote intestinal sur diffrentes fonctions comme la digestion ou le systme immunitaire. Ce champ souvre en 2012 avec labaissement des cots de squenage qui permet didentifier prcisment et de quantifier les microorganismes prsents dans le tractus digestif. Des travaux rcents chez lhomme montrent en particulier que ce microbiote impacte directement lobsit chez lhomme. La connaissance du metagnome des microbiotes intestinaux ouvre la voie lamlioration de lefficacit alimentaire, la diminution de lusage des antibiotiques et la baisse des rejets deffluents et de gaz effet de serre. l Ccile Poulain

Inra / Nathalie Iannuccelli

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GeL De SqueNCe chez le porc.

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& innovations

Des petits ARN

Quelles nouveauts apporte cette tude ? herv Vaucheret : On savait dj que des ARN rgulateurs peuvent passer dun organisme lautre : plusieurs tudes dcrivent un passage des racines de plantes vers des nmatodes qui les colonisent ou des feuilles de plantes vers les insectes qui sen nourrissent. Les rsultats de lquipe chinoise ne sont donc pas vraiment tonnants. Ce qui est nouveau par contre, cest que les petits ARN rsistent la cuisson et que lon peut donc les assimiler partir daliments crus ou cuits. Parmi les milliers de petits ARN que nous ingrons tous les jours, il nest pas surprenant non plus, statistiquement parlant, que certains dentre eux prsentent des homologies avec certains de nos gnes. En effet, une complmentarit de six nuclotides suffit la reconnaissance dun gne animal par un petit ARN (5). Si lon identifie un petit ARN qui a une telle complmentarit et quon le met en prsence du gne humain dans un extrait cellulaire, le systme dextinction fonctionne, cest quasiment mcanique. Cest ce qui a t ralis dans ltude chinoise. Peut-on imaginer un impact sur la sant humaine ? h.V. : Il faut tre extrmement prudent en interprtant les rsultats des tests sur extraits cellulaires. On ne peut en aucun cas les extrapoler lchelle de lorganisme entier. Seules des tudes cliniques et pidmiologiques permettraient de mettre en vidence un effet en conditions physiologiques. On ne peut pas le prvoir a priori : toutes sortes de mcanismes et dinteractions peuvent gouverner laction dun petit ARN ingr et nos connaissances en ce domaine sont encore trs limites. Par exemple, les petits ARN les plus abondants ne sont pas forcment les plus actifs. A linverse, on connat des petits ARN trs peu abondants qui ont des effets trs importants. Cest un champ norme dinvestigation qui soffre nous. Il ne faut pas gnraliser partir dune seule tude, mais il ne faut pas pour autant passer ct de dcouvertes importantes. Qui sait si des petits ARN ne seraient pas

difficiles digrer !
lorigine de laction de certaines plantes mdicinales sur lorganisme ? Quen est-il du glissement du questionnement vers les plantes transgniques ? h.V. : Toute perturbation du gnome entrane la production par la cellule de nombreux petits ARN. Cest un mcanisme de dfense tout fait naturel qui vise stopper les effets dltres des remaniements gnomiques. Cest ce qui explique quun transgne qui sexprime dabord normalement puisse sinactiver au bout de quelques semaines ou de quelques gnrations. Au mme titre que la caractrisation fine de linsertion, ltude des petits ARN produits devrait faire partie du cahier des charges des PGM (6) puisque cela peut maintenant tre ralis en routine et moindre cot. Mais la question se pose aussi pou r l e s croisements : lorsque lon croise deux plantes, on provoque dnormes bouleversements au niveau de la chromatine. Des travaux chez la tomate montrent que dans un hybride, on ne retrouve pas la somme des petits ARN de chaque parent, mais une population profondment modifie, avec des ARN qui apparaissent et dautres qui disparaissent. Et videmment, on ne connat pas les consquences de chacune de ces modifications ! Les PGM ne doivent donc ni tre exonres, ni tre stigmatises. Il faut avant tout faire progresser les connaissances en se posant les vraies questions ! l Propos recueillis par Pascale Mollier
(1) L. Zhang et al. Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1 : evidence of crosskingdom regulation by microRNA, Cell Research 2012 Jan; 22(1):107-26. Parution en ligne en 2011. (2) Herv Vaucheret a observ au cours de sa thse, dans les annes 80, lextinction de transgnes chez le tabac et a isol plusieurs gnes impliqus dans ce mcanisme. Il dveloppe depuis avec son quipe des travaux sur les petits ARN endognes et exognes et est devenu une rfrence internationale dans ce domaine. (3) Comme Herv Vaucheret, Yves Chupeau est directeur de recherches lInstitut Jean-Pierre Bourgin de lInra de Versailles. (4) H. Vaucheret and Y. Chupeau. Ingested plant miRNAs regulate gene expression in animals, Cell Research 2012 : 22, 3-5. (5) Dans le processus de silencing (ou extinction de gnes), les petits ARN recrutent un complexe enzymatique de dgradation et lamnent sur lARN messager dtruire, au niveau des squences complmentaires. (6) PGM : plantes gntiquement modifies.

Inra / Corine Enard

une tude chinoise de 2011 a montr que des petits ARN provenant daliments vgtaux se retrouvaient intacts dans lorganisme du consommateur. elle pose la question de leurs impacts ventuels en tant qulments rgulateurs du gnome. Nous avons demand herv Vaucheret, spcialiste des petits ARN lInra, de commenter ces rsultats.

epuis les annes 90, laccumulation des connaissances confirme limportance des petits ARN dans la rgulation des gnomes. Produits directement par le gnome dun organisme, ou partir dlments gnomiques invasifs (virus, transgnes, etc.), ces petits ARN sont capables dempcher lexpression des gnes avec lesquels ils prsentent une complmentarit de squence. Ils interviennent dans de nombreux aspects du dveloppement et dans la rponse divers stress biotiques et abiotiques. Les rsultats de lquipe chinoise (1) ont cr un vif moi en montrant que des petits ARN vgtaux dorigine alimentaire se retrouvaient dans le sang et les cellules du consommateur et taient donc potentiellement susceptibles dinfluer sur sa physiologie. Herv Vaucheret (2) a cosign avec Yves Chupeau (3) un commentaire replaant ces rsultats dans le contexte gnral des connaissances sur les petits ARN (4). Il nous livre ici quelques-unes de ses rflexions.

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Inra magazIne n22 octobre 2012

 Inra / Christian Slagamulder

1 La protection intgre sous toutes les cultures

Lexprimentation systme en protection intgre des cultures Dijon-epoisses compare depuis dix ans quatre systmes innovants de production vgtale conomes en intrants. Sappuyant sur de nombreux outils qui analysent les rsultats agronomiques, environnementaux et conomiques des diffrents systmes, les chercheurs prouvent quil est possible de diviser par trois lusage des herbicides sans perdre la matrise des infestations.

ans lancienne table de la station exprimentale dEpoisses convertie en salle de confrence, directeurs scientifiques, directeurs de recherches et experts dorganismes agricoles se succdent la tribune pour restituer les rsultats des dix annes de lexprimentation systme protection intgre des cultures (PIC) Dijon-Epoisses... Depuis lt 2000, la station exprimentale et lUMR Agrocologie teste sur vingt hectares quatre prototypes de systmes de culture en protection intgre - conomes en produits phytosanitaires pour valuer leurs performances agronomiques, environnementales et conomiques. Lquipe prospecte et exprimente ces quatre systmes innovants qui combinent plusieurs leviers techniques et agronomiques pour rduire la quantit dherbicides utilise. Prenant comme rfrence un

systme de production en agriculture raisonne, les chercheurs examinent ainsi les techniques culturales simplifies, un systme en agriculture intgre sans dsherbage mcanique, un systme de protection intgre avec dsherbage mcanique, et un quatrime systme zro herbicide (voir le tableau). PIC Dijon-Epoisses reprsente pour lInra un dispositif de recherche important. Il est le premier essai systme de cette ampleur qui a pour objectif de quantifier et valuer aussi finement les relations entre la parcelle agricole et la flore adventice, conciliant sciences agronomiques et agriculture. Cest un challenge dautant plus difficile que la principale variable tudie, le stock semencier (graines dadventices dans le sol), est soumise des effets cumulatifs, modifi chaque anne par les vnements agronomiques de la campagne. Son volution

est encore trs peu connue et matrise, tant par les agriculteurs que par les agronomes. Innovante, lexprimentation systme de Dijon lest aussi dans les techniques agricoles quil teste et les critres de dcision retenus. Une valuation multicritre Dans les parcelles dessai o dpassent a et l quelques vulpins, sous une pluie fine et mouillante, les quipes prsentent ce jour-l, sans se dcourager, les diffrents dispositifs de mesures utiliss dans les parcelles pour valuer les diffrents systmes. Agronomes, malherbologues, hydrologues, cologues, gnticiens Les chercheurs qui y participent sont issus de nombreuses disciplines : 15 20 personnes, chercheurs, ingnieurs, techniciens, post-doc, stagiaires, gravitent rgulirement autour du dispositif. Un des points forts et dmonstratifs de ltude : lvaluation du stock semencier des diffrentes parcelles de lexprimen-

II

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Un dispositif denvergure pour la rduction des intrants Avec plus de dix ans de recul, lexprimentation PIC Dijon a dmontr quil est possible de rduire de 50 80 % les traitements utiliss par rapport au systme de rfrence. Nicolas MunierJolain dtaille : Le prototype de production 4 test depuis 2000, - en protection intgre sans contrainte, avec dsherbage mcanique - divise par trois lusage des herbicides, et rduit de 50 80 % lensemble des pesticides. Ces rductions nont pas entran daugmentation du stock semencier. Le bilan environnemental est par ailleurs trs positif : ce systme de production na ni alourdi le bilan nergtique - malgr un passage plus frquent dans les parcelles pour les faux semis -, ni les missions de gaz effet de serre, grce en particulier lintroduction de lgumineuses dans des rotations diversifies. En rduisant ses intrants, lagriculteur diminue ses charges de 100 170 /ha/an. Mais la diversification de lassolement couple une baisse des rendements de 19 % (en moyenne en bl) entrane une perte de produit brut denviron 200 . Les cultures introduites, comme le sorgho, la fverole, le lupin ou le soja, contribuent beaucoup cette baisse de produit brut. Au bilan, la baisse des charges ne compense pas la perte de produit brut, et la marge est rduite denviron 100 par rapport au systme de rfrence, valeur approximative qui dpend beaucoup du contexte conomique fluctuant. Les systmes tests tendent diminuer la rentabilit, du fait essentiellement de la diversification des cultures moins valorisables sur le march, mais le diffrentiel reste modr . Dautres rsultats de lexprimentation systme ont galement t

DR / Inra - Dijon

publis dans plus de neuf revues de science. Les chercheurs proposent en parallle une importante diffusion de leur acquis auprs des conseillers et des agriculteurs. Et sur place, les quipes informent et forment de manire rptitive. Autant que la production de rsultats scientifiques ou exprimentaux, le dispositif sattache la diffusion de ces techniques et connaissances au monde agricole. Il constitue un accompagnement de la profession dans ses changements de pratique, en particulier dans la dynamique Ecophyto actuelle. Pour Guy Richard, les rsultats sont multiples : Cela donne un ensemble de connaissances destination de la communaut scientifique et professionnelle . Lieu de production et de diffusion de savoirs Lexprimentation systme est aussi le lieu de production doutils daide la dcision et un lieu de visite et dchange avec les lves, tudiants, techniciens agricoles, agriculteurs, chercheurs.
DR / Inra - Dijon

Depuis son installation, PIC DijonEpoisses a ainsi reu la visite de plus de 800 agriculteurs, et une cinquantaine de conseillers, formateurs et chercheurs. Sans compter les 60 stagiaires en formation continue, les 300 tudiants en visite de terrain et les 200 tudiants en formation. Selon Marie-Sophie Petit, de la Chambre Rgionale dAgriculture de Bourgogne, lexprimentation de Dijon a un rle central dans les dynamiques de formation. Cest une ressource importante pour la communication et le dialogue. Cest une ressource pour la conception, par les agriculteurs eux-mmes, de systmes innovants et performants, quils peuvent tester en vraie grandeur sur leurs parcelles. Dans cette phase de conception, ils peuvent saider de OdERA-Systmes, Outil dEvaluation du Risque en Adventices dans les Systmes de culture, dvelopp par AgroTransfert Ressources et Territoires, sur la base de lexpertise de lquipe dijonnaise. OdERA est un systme didactique permettant de simuler les effets de scnarios de changements de pratiques sur la flore adventice . Nicolas Munier-Jolain confirme : le nombre de visiteurs est trs satisfaisant. On reoit galement des demandes de groupes dagriculteurs en semis direct qui cherchent des informations sur les retombes environnementales de leurs pratiques, notamment sur limpact du glyphosate et son risque de transfert dans les eaux souterraines et les nappes phratiques . Selon Herv Guyomard, directeur scientifique agriculture lInra : Cette exprimentation systme prfigurait Ecophyto et a t mise en place avec anticipation et intuition. Cest un bel exemple de recherche rpondant aux objectifs court et long termes dune agriculture qui doit se plier aux exigences sociales, conomiques et environnementales .
CARACtRISAtIoN Au ChAMP des proprits hydrauliques des sols.

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PRSeNtAtIoN des systmes de culture PIC un groupe dagriculteurs.

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 Inra / Ccile Poulain

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2 Des chercheurs au plus prs

des pratiques agricoles

Ici, les chercheurs malmnent les standards pour produire en adquation avec le milieu. Un vlage par vache et par an , une parcelle sale Ces normes standardisent les pratiques agricoles, limitant les capacits dvolution. Nous concevons des combinaisons de pratiques agricoles innovantes sur nos deux systmes que nous mettons directement lpreuve du rel en les testant sur plusieurs campagnes explique Xavier Coquil co-animateur de lexprimentation systme. Pour aller encore plus loin dans sa dmarche, lquipe de 15 ingnieurs et techniciens a converti en 2004 lensemble de linstallation exprimentale lagriculture biologique, avec un mot dordre : consommer le moins dintrants possible. Pour ces chercheurs, llevage, dont la rentabilit est trs dpendante des aides de la PAC, doit tendre vers plus dconomie, en maximisant lutilisation des ressources naturelles et en rduisant ses

Situe dans la plaine des Vosges, linstallation exprimentale de Mirecourt conduit depuis 2004, en parallle et avec une dmarche pas pas, deux systmes dlevages bio qui minimisent le recours aux intrants (zro engrais, zro pesticide, zro paille extrieure, minimum de fioul) : lun 100 % herbager et lautre en polyculture-levage.

ntours de leurs ternelles mouches, deux troupeaux mixtes dHolstein et de Montbliarde paissent dans deux prs encore verdoyants malgr cette fin dt 2012. Ils reviendront ce soir la salle de traite, avant de repartir nouveau dans les prairies permanentes ou temporaires. Une quarantaine de vaches laitires sont au rgime 100 % herbe. Pour les soixante autres, le menu est plus vari. Ces deux troupeaux de lunit de recherche Agrosystmes, territoires, ressources (Aster) de Mirecourt consomment uniquement des aliments produits sur lexploitation qui se dploie sur les 240 hectares de prairies permanentes, temporaires, de cultures de crales et de mlanges crales-protagineux. Chacun des troupeaux est autonome en fourrages et lensemble lest en pailles et en crales.

intrants extrieurs . Le milieu naturel doit devenir le principe organisateur de lactivit agricole : sa prservation est la condition et le moyen de grer ses ressources. Jean-Louis Fiorelli, co-animateur de lexprimentation systme tmoigne : notre choix de conversion biologique a suscit au dpart beaucoup dinterrogations dans le milieu agricole, car lunit de Mirecourt avait toujours eu un rle de vitrine, de modle rgional en matire de production agricole. Les agriculteurs se questionnaient sur le message transmis par lInra : lavenir devrait-il tre bio ? Mais avec la crise agricole de 2008-2009 qui a vu les prix des crales chuter et ceux des intrants augmenter, avec les chantiers du Grenelle de lenvironnement et dEcophyto, le contexte a chang. Les agriculteurs sont revenus vers nous, intresss par nos systmes un peu extrmes dconomie en intrants et en pesticides . Ils sont chaque anne 800 1 000 visiteurs : agriculteurs, conseillers

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agricoles, techniciens ou tudiants, venir changer sur les pratiques alternatives agronomiques et zootechniques et le fonctionnement conome et autonome de ces deux systmes. Lobjectif des recherches Mirecourt est double. Le premier vise vrifier que ces modes de production agricole dits durables le sont rellement du point de vue agroenvironnemental essentiellement, mais aussi conomique. Le second uvre enseigner les savoir-faire et les connaissances acquises par les exprimentateurs et des agriculteurs pendant leur passage de lagriculture conventionnelle une agriculture bio et conome en intrants. Un challenge agronomique pour la durabilit Sur une parcelle au loin, on dtruit une luzernire. On y smera du bl, bio et meunier, destination des moulins de la rgion. Plus loin encore, on pand du lisier sur une prairie qui vient dtre pture. La conception de lexprimentation systme est volutive : chaque anne de nouveaux essais sont mis en place pour ajuster au mieux linteraction culture-levage selon les observations des exprimentateurs. Sappuyant sur les pratiques des pionniers en techniques culturales simplifies dans les systmes craliers bio, ainsi que sur un essai ddi au travail du sol au sein du systme de polyculture levage, ces exprimentateurs ont russi limiter le recours au labour dans les rotations culturales (deux labours maximum sur une rotation de 8 ans). Sur la base de diffrents essais raliss depuis 2006, ils installent cette anne des intercultures qui promettent de multiples rponses agronomiques : couvrir le sol, fixer de lazote, concurrencer la prsence dadventices, ne pas intervenir pour la destruction du couvert Les granges de linstallation exprimentale croulent sous le poids de foins multicolores et de pailles Tout est prcisment tiquet. Pour atteindre une forte autonomie, la scurisation du systme requiert notamment une trsorerie fourragre importante, tant au pturage quen matire de fourrages rcolts. La traabilit est la rgle dor : on est capable de dterminer lorigine parcellaire de chaque botte. Tout lment entrant, sortant ou en circulation sur la ferme, passe un moment ou un autre sur une bascule : lait, veau, vache, fumier, foin, paille, refus alimentaire...

Inra / Etienne Gaujour

MIReCouRt est aujourdhui le seul levage exprimental bio du quart nord-est de la France et la seule installation exprimentale de lInra totalement convertie lAB.

La production laitire des deux exploitations est dun niveau acceptable : 5 000 kg par an pour les Holstein, 4 800 kg par an pour les Montbliarde dans le systme herbager et respectivement 6 200 et 5 200 kg/VL/an pour ces deux mmes races dans le systme de polyculture-levage. Les performances du troupeau sont values par des peses mensuelles, par le contrle de production laitire lors de chaque traite et deux contrles hebdomadaires individuels de la qualit du lait (taux butyreux, taux protique, comptage cellulaire). Le suivi de lalimentation est ralis par lot : les aliments distribus et les refus sont pess. Les vnements individuels de sant et de reproduction sont enregistrs, et ltat corporel des vaches est not chaque pese. Les performances agronomiques et zootechniques des productions vgtales et animales (pression de maladies, concurrence des adventices, attaques des ravageurs et rendement) des deux systmes sont analyses la loupe. Les stocks dherbe au pturage sont mesurs partir de relevs hebdomadaires de la hauteur de lherbe et de sa densit dans les parcelles ptures. Le rendement des prairies est valu par la pese de lherbe rcolte chaque fauche et par lestimation de lherbe ingre chaque cycle de pturage. Une valuation de la production valorise la parcelle est galement ralise. La transformation long terme du territoire agroenvironnemental lui-mme est suivie grce 74 zones fixes gorfrences et reprsentatives de linstallation exprimentale o sont quantifis

les cycles des lments (carbone, azote, potassium, calcium, phosphore et magnsium). Fabienne Barataud, ingnieur de recherche, travaille sur les mesures de la qualit des eaux collectes depuis 1990 via les bougies poreuses installes sur une quinzaine de parcelles de Mirecourt. Etudiant notamment lvolution du bilan azot lors du passage de linstallation exprimentale du conventionnel au bio, elle analyse les transferts de fertilit au sein de lexploitation : chaque parcelle possde son bilan azot : les exportations dazote (par la fauche, la production de lait et la viande) et les importations (semis de lgumineuses). Le bilan est quilibr lchelle de lexploitation mais pas toujours au niveau des parcelles. Nous modlisons ainsi les flux dazote en fonction des types de travaux du sol, des rotations, de la pture des vaches . Par ailleurs, la fertilit biologique du milieu est analyse au travers de ltude des populations de carabes, insectes et vers de terre, et la flore spontane des parcelles. comprendre la transition vers les systmes autonomes et bio Lunit de recherche Aster, intgre au dpartement des Sciences pour lAction et le Dveloppement, SAD, sintresse plus la manire dacqurir les connaissances et savoir-faire pour mettre en place les systmes autonomes quaux rsultats analytiques qui en sont issus. Un travail dquilibriste entre conception pas pas de systmes agricoles et valuation par des collectes de donnes quantitatives et qualitatives tout en ayant cur la diffusion de ces savoirs aux agriculteurs intresss. Lunit se revendique plus comme un
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dispositif exprimental dchange de savoirs que de production de solutions techniques clef en main . A limage de lagriculteur qui modifie son exploitation agricole par des ajustements et parfois des ruptures, la conception pas pas des deux systmes de production de Mirecourt fournit des connaissances sur la manire de conduire les transitions face aux fluctuations extrieures. Ces transitions, comme le passage lagriculture biologique des deux systmes, entranent lmergence de nouvelles techniques, de nouveaux savoir-faire et rgles de conduite. A Mirecourt, les exprimentateurs ont, par exemple, d apprendre grer les effectifs animaux selon les disponibilits en fourrage et en paille (et non selon lobjectif de produire le quota laitier), ils ont d apprendre grer le dsherbage des cultures en intgrant des prairies temporaires dans les rotations et en mobilisant des techniques de dsherbage alternatif (binage, herse-trille). Les techniciens se sont galement progressivement forms aux soins aux animaux partir dhuiles essentielles et dhomopathie. Comme les agriculteurs, ils ont eu besoin dacqurir de nouveaux savoir-faire pour dcider, piloter et agir. Quels sont les processus, les ressources et les situations impliqus dans cette acquisition de nouveaux savoir-faire ? Xavier Coquil dtaille :
Inra / Ccile Poulain

Inra / C. Etienne

LexPRIMeNtAtIoN, lchelle du systme de production et sur plusieurs annes, permet dtudier la transition de systmes de polyculture-levage vers lagriculture biologique et lautonomie.

Notre volution pas pas nous amne accder ce qui nous tait impensable auparavant, questionner, voire modifier les rfrentiels et normes agricoles auxquels nous adhrions. Cela nous amne galement changer notre manire de chercher. Les techniciens, trs associs aux prises de dcisions, deviennent aujourdhui des transmetteurs de savoir. Au final, nous avons plus comme objet de recherche les techniciens eux-mmes et leur manire dinnover : leurs ressources, leurs normes, leurs objectifs de travail. Comment trouventils le fil pour convertir nos deux exploitations en bio ? Ce travail sur les transitions permet la formalisation de savoirs singuliers, locaux, ns des interactions entre lhomme et le milieu. Selon Matthieu Godfroy, responsable de linstallation exprimentale, ces savoirs sont la base des changes avec les visiteurs du dispositif : Nous produisons normment de donnes. Ces connaissances analytiques sont utiles pour des publications scientifiques mais souvent limites dans lusage que peuvent en faire les agriculteurs. Ce qui nous intresse essentiellement est dvaluer et comprendre les performances de nos deux systmes, pour proposer des connaissances, ressources ou outils mobilisables par les agriculteurs pour voluer. Quels sont les besoins de

ceux qui innovent ? Quelles sont les clefs fournir aux agriculteurs qui veulent faire voluer leur systme de production ? Lobjectif nest pas de convaincre, avec nos chiffres ou nos rfrences, les agriculteurs de passer en bio ou en 100 % autonome. Nous ne souhaitons dailleurs pas les asphyxier de chiffres et rfrences, mais leur apprendre apprendre. Nous proposons aux visiteurs des situations quelque peu extrmes avec des garanties techniques et conomiques, et sur cette base nous changeons sur les pistes que nous avons suivies pour conduire ces systmes dans leur territoire propre. Bien sr ce nest pas reproductible tel quel et cest ce qui justifie notre dmarche base sur les processus de changement. Notre ferme exprimentale a une notorit utile pour permettre dattirer et dchanger sur une base concrte . La conception pas pas travaille sur lessai systme de Mirecourt est base sur lidentification progressive des connaissances et savoir-faire pertinents pour conduire des systmes autonomes. Ces ressources sont les objets de recherche et la base des changes avec la profession. Un tel dispositif fait apparatre des conduites et des pratiques originales (lactation de deux ans) que lquipe tudie grce des collaborations entre la recherche et le dveloppement.

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eN SyStMe AutoNoMe, les fourrages, tant au pturage quen grange, sont le nerf de la guerre. Lexploitation de Mirecourt est capable de dterminer lorigine parcellaire de chaque botte stocke dans ses granges.

 Inra / Caroline Colnenne

3 Energie, gaz effet de serre,

biodiversit : de nouveaux objectifs

repousser les limites. Mme si nous navons pas encore tous les rsultats, nous montrons que ces objectifs ambitieux sont atteignables, et ce, pour des systmes de grandes cultures reprsentatifs du Bassin parisien, avec un niveau de productivit correct, mme si cette dernire nest pas la priorit . En fait, il y a une hirarchie dans les objectifs : dabord respecter la contrainte majeure, puis remplir dautres critres agri-environnementaux quil ne sagit pas dhypothquer, et enfin maximiser les rendements dans la marge de manuvre restante. Une phase de conception complexe Comme dans lexemple de Dijon (voir partie 1) la conception des

economiser lnergie fossile, rduire les missions de gaz effet de serre (GeS), favoriser la biodiversit, sont de nouveaux objectifs environnementaux, porte plus globale que locale, que les chercheurs ont maintenant les moyens mthodologiques dintgrer dans des systmes de culture ou dlevage. exemples avec les exprimentations systmes de Grignon (Bassin parisien) et SaintLaurent-de-la-Pre (Poitou-Charentes).

exprimentation systme SIC (Systmes innovants sous contraintes), conduite depuis 2008 par lInra (UMR Agronomie Inra/APT) en partenariat avec la ferme dAgroParisTech Grignon, value trois systmes de grandes cultures respectant chacun une contrainte majeure : soit se passer de pesticides, soit rduire de moiti la consommation dnergie fossile, soit diminuer de moiti les missions de GES. Des objectifs environnementaux en rupture Nous avons mis la barre assez haut, commente Thierry Dor, de lUMR Agronomie. Mais le propre de lexprimentation est justement dessayer de

systmes se fait par prototypage en combinant diffrents leviers techniques connus des professionnels agricoles ou des chercheurs (voir le tableau). Puis les chercheurs calculent plusieurs variables telles que la consommation en nergie fossile ou les missions de GES, mais aussi une dizaine dautres indicateurs agri-environnementaux dfinis selon la mthode Indigo dveloppe lInra. Il sagit par exemple dindicateurs portant sur la prsence de pesticides dans lair, leau et le sol, les teneurs du sol en nitrate, phosphore et matires organiques, etc. Si le systme envisag ne donne pas satisfaction pour toutes ces variables, il est modifi, et les calculs sont reconduits jusqu obtention
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LeS CuLtuReS INteRMDIAIReS MIxteS (ici, phaclie et moutarde) enrichissent le sol en azote, rduisent la lixiviation des nitrates et attirent les pollinisateurs.

des rsultats viss. De nombreuses boucles de conception-valuationcorrection de ce type sont ncessaires pour arriver au systme qui sera ensuite test en champ. Qui dit systme dit contradictions rsoudre Le systme 50% GES a t le plus difficile concevoir, explique Caroline Colnenne, lingnieur qui a pilot la conception des systmes de culture. Les missions de protoxyde dazote (N 2 O) sont trs variables selon les conditions pdoclimatiques et selon la forme sous laquelle lengrais azot est apport, et en faire une valuation a priori est trs hasardeuse. Cest pourquoi nous avons pris le parti doptimiser le stockage de carbone dont on connat mieux les mcanismes (cf. lexpertise Inra de 2002 (1)). Mais il est ncessaire de faire des compromis : des leviers techniques favorables au stockage de carbone (absence de labour, biomasse abondante de crales paille dont les rsidus favorisent le stockage de carbone dans le sol) peuvent tre dfavorables du point de

Inra / Caroline Colnenne

DNoMbReMeNt des populations de vers de terre, une des composantes biologiques mesures pour chaque systme.

vue des missions dazote (compaction du sol, utilisation de quantits dengrais azots leves pour assurer la production de biomasse suffisante). Ceci nous oblige aller plus loin dans

la dfinition des leviers techniques mobiliser : utiliser des formes dengrais spcifiques, des inhibiteurs de dnitrification, des intercultures pour piger lazote, etc.

Les trois systmes innovants sous contraintes tudis Grignon

SyStmeS
Systme de rfrence (1)

RotationS
Cinq ans - Fverole dhiver - Bl tendre dhiver - Colza dhiver - Bl tendre dhiver - Moutarde - Orge de printemps

PRinciPaux levieRS
Varits rsistantes Dates et densits de semis Lgumineuses Un seul labour Dsherbage mcanique Alternance despces dhiver et de printemps Luzerne deux annes de suite si adventices Lgumineuses Diminution de production Espces efficientes pour lazote (avoine, lin) Economie dengrais azot Pas de labour Crales paille Production leve Pas de labour Stockage de carbone

RendementS**(t/ha)
Bl : 7,9 Colza : 3,1 Orge de printemps : 6,2 Fverole : 3,4 Bl : 5,5 Mas : 6,5 Triticale : 5,0 Chanvre : 8,0 Bl : 6,3 Avoine : 3,8 Lin : 1,8 Fverole : 3,4

Six ans IC* - Fverole de printemps - Bl Sans pesticides (2) tendre dhiver - IC* - Chanvre Triticale - IC* - Mas - Bl tendre dhiver Six ans Fverole dhiver - Bl tendre dhiver - Lin olagineux dhiver Association Bl tendre dhiver et Trfle blanc - Trfle blanc - Avoine de printemps Six ans IC* - Fverole de printemps - Colza dhiver - repousses + IC* - Bl tendre dhiver - IC* - Orge dhiver IC* - Mas - Triticale

50% nergie (2)

50% Gaz effet de serre (2)

Bl : 7,9 Colza : 3,1 Orge dhiver : 7,2 Triticale : 7,1

IC* : Interculture dont la nature nest pas dfinie ce jour. ** Sur les rcoltes 2009 2011. (1) Le systme de rfrence est un systme dit Productif Hautes Performances Environnementales , car tout en satisfaisant des critres environnementaux spcifis, les niveaux de production doivent tre relativement levs. (2) Pour ces systmes, comme pour le systme de rfrence, on joue aussi sur le choix des varits et les densits de semis.

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w reportage

Des

puces chez les poulets

Inra / Christophe Matre

Premire plateforme exprimentale sur les systmes dlevage de volailles de plein air en France, la plateforme avicole AlterAvi du Magneraud explore depuis 2009 les performances zootechniques, environnementales et sanitaires de systmes dlevage biologiques.

lus d e 6 0 0 0 p o u l e t s caquettent et picotent sur les deux hectares de prairies ou de chnaies de la plateforme avicole biologique du Magneraud. Une libert sous troite surveillance : chacun de leur dplacement depuis leur btiment jusquau parcours en plein air, est minutieusement enregistr, via une puce RFID fixe sur leur aile. Cette technologie met des ondes radios toutes les dix secondes, localisant le poulet sur le parcours. Ce suivi lectronique individuel est dvelopp depuis deux ans sur le site du Magneraud : nous avons cr cette technologie en partenariat avec lentreprise Pic Di. Elle produit une quantit de donnes complexes analyser, mais le rsultat est fiable 98 %, sans doute plus que des observations de terrain ! Cest une dmarche de recherche trs innovante pour comprendre le comportement exploratoire de chaque individu et dterminer sils sont plutt casaniers ou explorateurs explique Karine Germain, responsable de la plateforme AlterAvi.
DeS cARRS DAILS, de fenugrec, de thym et de tanaisie sont rpartis sur le parcours des volatiles pour tudier leurs effets prophylactiques.

A ces observations comportementales, sajoutent les donnes collectes par les vingt agents de lunit exprimentale sur le poids de chacun, leur parasitisme, leur gntique, leur flore intestinale. Ils calculent les quantits de vgtaux et de terre ingres, analysent la qualit sensorielle de la viande et mesurent galement limpact de llevage biologique et du plein air sur len-

vironnement, les rejets dans latmosphre et le sol, lvolution des pathognes du sol Dissmins entre les jachres apicoles et les parcelles dessais de la station trs rurale du Magneraud, trois laboratoires spcialiss en chimie, analyse sensorielle et biologie -qui sintresse notamment la flore digestive-, appuient ces recherches avicoles. Depuis sa cration

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Inra / Christophe Matre

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Inra magazIne n22 octobre 2012

en 2009, les projets se succdent pour amliorer la performance environnementale et zootechnique des systmes dlevage de plein air. Constitue de huit modules dlevage comprenant chacun un btiment de 75 m2 ouvert sur un parcours arbor ou en prairie, de 2 500 m2, cest la premire plateforme exprimentale sur les systmes dlevage de volailles de plein air en France. Selon Karine Germain, la production de poulet de chair biologique est en progression : son cheptel a cr de 18 % entre 2009 et 2010 et les tendances de la consommation en biologique sont la hausse, dautant plus que les consommateurs rejettent de plus en plus llevage en claustration. Nos recherches accompagnent le travail de lleveur autour du bien-tre animal et de limpact environnemental . Des comportements FIxe SUR LAILe, la puce RFID suit individuellement le parcours du poulet. individuels Contrairement aux traditionnelles recherches avicoles, les poulets sont tion gntique des poulets casaniers et Des alternatives au soja tudis ici individuellement, et non en des explorateurs, ils ont russi lier lots. Grce au procd RFID, les cher- leur comportement exploratoire leur La plateforme met en place cette anne une srie cheurs du projet AlterAviBio se sont gntique. Ces recherches ouvrent des dessais dans le cadre du projet AviAlimBio pour aperus que les poulets se distinguent pistes une slection gntique plus trouver des formules alimentaires innovantes. La par leur aptitude explorer leur aire fine pour les levages de plein air. filire aviculture biologique doit en effet passer dlevage. Les casaniers prfrent dici le 1er janvier 2015 une alimentation 100 % sjourner dans le btiment tandis que Les poulets marchent dorigine biologique, mais la ration traditionnelle les autres sillonnent leur parcours. Ces lombre soja-mas-bl est coteuse pour la filire qui doit derniers, les explorateurs, qui grattent Les poulets explorent plus facilement importer du soja bio prix lev. Il faut donc trouet mangent de la terre, captent plus de des surfaces arbores que des parver dautres sources de protines produites locaparasites. Les distinguer permettrait cours de prairie seule, sans ombre. lement pour remplacer ou diminuer lincorporation lleveur de mieux cibler ses traite- Plus les poulets sortent, plus leur de soja dans la ration. Des rsultats sont attendus ments. Sur le plan environnemental, indice corporel diminue et moins il y a courant octobre. plus les poulets sortent, plus les rejets de gras. En les incitant sortir, par des (djection, missions gazeuses) sont parcours plus arbors, on augmente les importants, surtout proximit du performances zootechniques des poulets. risation pour lleveur dont les arbres btiment. Une bonne gestion des par- Le nombre de sorties et le type de par- plants sur le parcours des poulets cours modifierait le comportement des cours - arbor ou non - naffectent pourraient servir une valorisation poulets en les rpartissant de manire cependant pas les qualits sensorielles ultrieure (fruits, fixation de carbone, plus homogne sur le terrain et amlio- de la viande, qui dpendent essentielle- biodiversit) Lunit teste galererait ainsi la durabilit de ce systme ment de lge labattage explique ment lapport de plantes aromatiques dlevage. Les chercheurs sont alls Karine Germain, mais cela peut sur le parcours pour lutter naturelleencore plus loin : en tudiant la filia- ouvrir de nouvelles perspectives de valo- ment contre le parasitisme des poulets. Les chercheurs ont ainsi rparti rgulirement sur tout un parcours Lpineuse question de lge labattage des petits carrs dail, de fenugrec, de thym et de tanaisie, herbes utilises Nous mesurons limpact en terme de performance sensorielle, sanipar des leveurs de poulets biolotaire, conomique et environnementale de quatre systmes dlevage giques en phytothrapie pour leurs de poulets biologiques levs jusqu 56, 70, 84 et 100 jours. Cest effets vermifuge, anti-helminthique une exprimentation dactualit lheure o la filire bio franaise doit ou anti-coccidiose. Ils estiment lapsuivre les recommandations de Bruxelles et tre comptitive, (projet ptence de ces vgtaux, mesurent Dynrurabio port par lANR) explique Karine Germain. Depuis 2009, leur ingestion, tudient leur tat sanila directive europenne ne prconise plus dge minimum dabattage taire Plus tard (les rsultats sont pour les souches croissance lente. Il est donc autoris dabattre en attendus dici fin octobre) ils testeFrance des animaux ds 70 jours au lieu de 81 jours comme le prront la qualit sensorielle de la viande. cdent rglement franais limposait. Dans le cas dlevage de pouUn poulet au bouquet dj garni ? l let issu de poussin bio - nous nen navons pas en France -, lge
dabattage est rduit 56 jours.

Inra / Christophe Matre

Ccile Poulain
Inra magazIne n22 octobre 2012 27

w reportage

Manger et sclairer

Au domaine de La Valette Montpellier, une installation exprimentale associe des panneaux photo au sol. Les chercheurs ont pu mesurer et modliser lintrt cumul de la production dnergie et dali pilote de plus grande ampleur verra le jour prochainement.

n sait que la photosynthse des plantes a un faible rendement de conversion de lnergie solaire (3 %), trs infrieur celui de panneaux photovoltaques (15 %). Par contre, lune produit laliment, essentiel la vie, pendant que lautre fournit de llectricit. Les systmes agrivoltaques, imagins par les chercheurs de lunit mixte de recherche SYSTEM* en collaboration avec la socit SunR, associent ces deux convertisseurs dnergie solaire, lun biologique et lautre physique, sur une mme surface. Ce nouveau concept permet de prserver lusage des terres agricoles pour lalimentation, tout en rpondant aux besoins croissants de production dnergie.

Le sol gagne en productivit Lexprimentation consiste valuer les rendements de cultures sous des panneaux photovoltaques, et les comparer ceux de cultures tmoins sans cet ombrage particulier. Linstallation a pour objet de comprendre si les deux productions peuvent tre associes. Une centrale photovoltaque de 8 500 m a t construite en pergola sur le campus dAgropolis Montpellier. Deux
* Unit mixte de recherche SYSTEM Fonctionnement et conduite des systmes de culture tropicaux et mditerranens Cirad-Inra-SUPAGRO.

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Inra magazIne n22 octobre 2012

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h. MARRoU, eN thSe MoNtPeLLIeR, enregistre des mesures pour tudier la photosynthse dune culture de bl dans lombre des panneaux.