AMINOACIZI I PEPTIDE (cursul I)

Camera de garda (facultativ)

Cal Kulis este un baiat de 16 ani adus de mama datorita unei dureri acute in jumatatea stinga a abdomenului, care iradiaza catre zona pubiana. Urina este rosie-maronie si analiza ei indica prezenta sangelui. La acidifiere cu acid acetic a urinei, se observa la microscop formarea de cristale hexagonale plate transparente de cistina. Radiografia abdominala arata calculi in ambii rinichi.

Structura generala a unui aminoacid

Radicalul R este extrem de IMPORTANT! DE CE?

RADICALUL R determin hidrofobicitateapolaritatea- sarcina electrica a aa

Structura tridimensional a proteinelor

Ex. PROTEINE CITOPLASMATICE

R polar, ncrcat electric- la suprafaa proteinei R non-polar, hidrofob- la interiorul proteinei PROTEINE MEMBRANARE -inversDE CE?

Aminoacizi alifatici cu R fr grupe funcionale

Iminoacizi

Aminoacizi aromatici

Aminoacizi alifatici cu grupe OH

Aminoacizi alifatici dicarboxilici i amidele lor

Aminoacizi bazici (alifatici Lys, Arg i aromatici Hys)

Aminoacizi alifatici care conin sulf

Alte clasificri ale aminoacizilor I

I. aminoacizi proteinogeni fundamentali (codificai genetic; 20; configuraia L) nefundamentali (derivai: care nu sunt codificai genetic): 4 HO-Pro, 5 HO-Lys, GLA (acid gamacarboxi-Glu) II. aminoacizi neproteinogeni ex. -Ala, ornitina, citrulina, GABA, homocisteina, homoserina, ac. para-aminobenzoic

Alte clasificri ale aminoacizilor II

Aminoacizi eseniali- 9 (Leu, Ile, Val, Trp, Phe, Met, Thr, Lys, Hys); aminoacizi limitani pt. o protein Aminoacizi neeseniali ex Glu, Ala, Asp Aminoacizi semieseniali (ex. Arg, Pro, Ser, Tyr, Cys, Gly, taurina)

Proprietile aminoacizilor
Chiralitatea. Definiia?

AMINOACIZI NATURALI

PROPRIETATI CHIMICE

PUNCTUL IZOELECTRIC (pI) AL AA

Punctul isoelectric -date necesare pentru calculul pIGruparea funcional

-carboxil non -carboxyl (Asp, Glu) imidazol (His) sulfhidril (Cys) -amino non -amino (Lys) hidroxil (Tyr) -imino (Pro) guanido (Arg)

pKa aproximativ
2 4 6 8 8 10.5-11 10 9 12

Calculul ph isolectric pentru arginina (Arg) prin metoda 1

Calculul pI prin metoda 2

REGULI DE STABILIRE A FORMEI ACIDE/BAZICE PREDOMINANTE LA UN ANUMIT pH 1. Dac pH < pKa (pH mai acid) predomin forma acid 2. Dac pH > pKa (pH mai bazic) predomin forma bazic 3. Dac pH = pKa concentraia formei bazice este egal cu concentraia formei acide

-COOH forma acid (0) -NH3+ forma acid (+) 0 COOH NH3+

COO- + H+ forma bazic (-) NH2 + H+ forma bazic (0) pH < pKa 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + + + + + + + + + + + + pKa pH > pKa 14

- - - - - - - - - - - 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Metoda 2 de calcul al pI

Calculul pI al Arg prin metoda 2. Grupa / pKa 0 2 -COOH 0 - NH3+ + guanidiniu + TOTAL 2+

9 + + 1+ 0 + 0

12 0 0 1-

14

Proprieti chimice ale aminoacizilor

CARACTER AMFOTER, PROP. TAMPON Rr ale grupei COOH: decarboxilare (ex. Hys histamin)

Rr ale grupei NH2 - condensarea cu grupe carbonil (formare de baze Schiff ex. Hb glicozilata) - alchilare (formare betaine) - acilare - carboxilare (formare de carbaminoacizi ex. carboHb) - oxidare CH2-NH2 -CH=O (ex. transformarea Lys n alizin) - transaminare (formare de cetoacizi) Rr ale grupelor funcionale din radicalul R: - oxidarea bland a SH din Cys (formare cistina Cys-S-S-Cys) - oxidarea energic a SH din Cys (formare acid cisteic R-SO3H) R-SAg (mercaptide) + HNO3 - R-SH + AgNO3 - esterificarea OH din Ser, Thr sau Tyr cu H3PO4 (formare esteri fosforici)

Camera de garda- concluzii (FACULTATIV)

Ionica are cistinurie, o boala genetica rara (1 la 2500-1 la 15000 nasteri) in care exista un defect de reabsorbtie a cistinei, Arg si Lys la nivelul tubulilor renali.

Astfel cistina se concentreaza in urina, si fiind insolubila la pH acid, precipita in tubii renali formand calculi urinari (la microscop se vad cristale hexagonale).

DE CE CISTINA ESTE INSOLUBILA LA PH ACID SI SOLUBILA LA PH ALCALIN? DE CE E MAI PUTIN SOLUBILA DECIT Arg sau Lys?

Camera de garda (FACULTATIV)

Tratamentul include scaderea concentratiei de Cys prin restrictie alimentara a Met (aa esential care contribuie prin S la sinteza Cys in organism) si astfel scade concentratia de cistina care se elimina prin urina. Pentru a preveni precipitarea ei in tubii renali se creste volumul de fluide ingerate si se alcalinizeaza urina. Se administreaza medicamente care convertesc cistina in compusi mai hidrosolubili, care se elimina prin urina.

PEPTIDE

Legtura peptidic CO-NH-

Legtura peptidic este PLANAR i RIGID. DE CE?

Ce se poate prezice despre legtura peptidic pornind de la aceast structur?

CARACTER PARIAL DE DUBL LEG. -Trans -Rotaie liber mpiedicat -Capac. Crescut de a forma leg. de H

PEPTIDE BIOACTIVE
1. Glutation (GSH): gama-Glu-Cys-Gly Roluri: - agent reductor cu rol antioxidant a) reacia GPx (glutation peroxidazei): 2 GSH + LOOH GSSG + LOH + H2O GSSG + prot-SH b) reface gr SH ale proteinelor 2 GSH + prot-S-S-prot - catabolismul insulinei - catabolismul xenobioticelor: reacia glutationtransferazei: R-X + GSH R-S-G + HX unde R-X este xenobiotic (X- frecvent OH) - transportul aminoacizilor prin membrane (reacia gama-glutamil-transpeptidazei) -Glu-Cys-Gly + aa -Glu-aa + Cys-Gly

PEPTIDE BIOACTIVE
PEPTIDE CU ROL HORMONAL

2. Kinine (peptide cu rol vasoactiv): Bradikinina- 9aa, hipotensiv Kalidina 10 aa 3. Angiotenina II- 8 aa, hipertensiv, stimul pt secretia de aldosteron 4. TSH-RH- amid intern Glu de la cap N-terminal 5. Ocitocina, vasopresina- 9aa, 1 S-S, amid Gly, respectiv Glu la cap C 6. Endorfine, encefaline- neuropeptide cu rol analgezic (opioide endogene)

ABC-ul cursului (pt cei care nu vor sa fie ca el

dupa examen)

Structura general a unui aa Tipuri de aa cu S, hidroxilai, cu 2 grupri carboxil, cu dou gr amino, alifatici/aromatici Exemple de aa cu R polar, cu R nepolar Definitie punct izoelectric si formula de calcul pt aa monoaminomonocarboxilici Peptide cu rol biologic: bradikinina, angiotensina, endorfine