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v = k
2
[E
o
]
<< S
13
La ecuacin anterior demuestra que la formacin de producto es
constante de algn valor mximo igual al producto de la
concentracin inicial de enzima por k2. Tambin se puede
construir una grafica reciproca de la velocidad de reaccin
resultando la ecuacin de Lineweaver-Burk
14
DeVoe y Kistiakowsky estudiaron la cinetica de hidratacin de CO2
catalizada por la enzima carbonico anhidrasa.
CO2 + H2O HCO3- + H+
En esta reaccin el CO2 se convierte en ion bicarbonato. El bicarbonato
es transportado por el flujo sanguneo y se vuelve a convertir en CO2 en
los pulmones, una reaccin que esta catalizada por la carbnico
anhidrasa. Se obtuvieron las siguientes velocidades de reaccin inicial
para la reaccin de hidratacin con concentracin de 2.3nM y temperatura
de 0.5C.
Velocidad (M s-1) [CO2] (nM)
2.78 x10-5 1.25
5.00x10-5 2.5
8.33x10-5 5.0
1.67x10-4 20.0
Determinar Km y k2 para la enzima a esta temperatura
Cintica Enzimtica
La cintica enzimtica es el anlisis cuantitativo del efecto de cada
uno de los factores que intervienen en la actividad enzimtica, que
se evala a travs de la velocidad de la reaccin catalizada.
Las variables ms importantes son:
Concentracin de enzima, sustratos y productos
(incluyendo inhibidores y/o activadores)
pH
Temperatura
Ella est basada en la medicin de la velocidad de reaccin. As en
la reaccin:
Se tendr:
Como se observa en la figura, la velocidad de reaccin (pendiente)
disminuye continuamente a partir de un valor mximo inicial. Esto
se puede deber a:
Desaturacin de la enzima con sustrato, por disminucin
de la concentracin del sustrato
Inactivacin de la enzima por su inherente inestabilidad
Inhibicin por el producto
Desplazamiento del equilibrio, si la reaccin es
reversible
dt
ds
dt
dp
v = =
E
S P
Baja
concentracin
de sustrato
ALTA
concentracin
de sustrato
SATURACION
v
[s]
Efecto de la concentracin de substrato
.
.
.
.
.
. .
.
E + S
ES E + P
k
+1
k
-1
k
+2
Una cintica hiperblica implica un proceso saturante:
Hay un nmero limitado de sitios en la enzima
para fijar substrato; una vez que estn ocupados
todos, por mucho que aumente la concentracin
de substrato, la velocidad permanecer constante
tendiendo a un valor asinttico
El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinmica
del sistema
E + S
ES E + P
k
+1
k
-1
k
+2
Sistema No admite solucin analtica.
- Simulaciones numricas
- Hiptesis que lo simplifiquen
Hiptesis de Michaelis - Menten
E + S
ES E + P
k
+1
k
-1
k
+2
- La primera parte del mecanismo,
E + S
ES
k
+1
k
-1
Tiene lugar mucho ms rpidamente que la segunda:
ES E + P
k
+2
| || |
| |
( )
K
E S
ES
es
x
e x s
x
m
= = =
0
x
e s
K s
m
=
+
0
v
k e s
K s
m
=
+
+2 0
k e V
+
=
2 0 max
v
V s
K s
m
=
+
max
Hiptesis de
Michaelis-Menten
Equilibrio rpido
v k x =
+2
Hiptesis de estado estacionario
Segn veamos en la simulacin numrica, hay un tiempo
relativamente prolongado en el curso de la reaccin en el
que la variacin de complejo [ES] es prcticamente igual
a cero:
dx/dt = k
+1
es - (k
-1
+ k
+2
) x = 0
A partir de esta expresin podemos llegar a obtener una
expresin que nos da la velocidad para la concentracin
de substrato
( )
dx
dt
k es k k x = = +
+ +
0
1 1 2
( ) ( ) k es k e x s k k x
+ + +
= = +
1 1 0 1 2
x
e s
k k
k
s
e s
K s
m
=
+
+
=
+
+
+
0
1 2
1
0
v
V s
K s
m
=
+
max
v k x =
+2
k e V
+
=
2 0 max
Hiptesis de
estado estacionario
A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y
Estado estacionario, llegamos a la ecuacin
K
m
+ s
v =
V
max *
s
La nica diferencia radica en el significado de K
m
:
K
m
= k
-1
/k
+1
en mecanismo de M.M.
K
m
= (k
-1
+ k
+2
)/k
+1
en mecanismo de E.E.
Significado de la constante K
m
1. Constante de equilibrio de disociacin del complejo ES
(en condiciones de equilibrio rpido)
2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato
(en condiciones de equilibrio rpido)
3. Mide la funcin de fijacin (en cond.de equilibrio rpido)
4. Concentracin de substrato para la que la velocidad se hace
igual a la mitad de la mxima (s
0.5
)
5. Se define para una pareja enzima-substrato
6. Se mide en unidades de concentracin
Significado de la constante V
max
= k
+2
e
0
1. Velocidad asinttica para s
2. Directamente proporcional a la concentracin de
enzima (hoy se prefiere caracterizar a la enzima
por k
+2
)
3. Mide funcin de transformacin cataltica
4. Se expresa en unidades de velocidad
RELACIN ENTRE KM Y VMAX
MICHAELIS Y MENTEN
Concentracin de Sustrato [S]
V
e
l
o
c
i
d
a
d
d
e
l
a
r
e
a
c
c
i
n
(
v
)
Km
Vmax
Vmax/2
La Km es la concentracin de sustrato
donde se obtiene la mitad de la Vmax
Concentracin de Sustrato [S]
V
e
l
o
c
i
d
a
d
d
e
l
a
r
e
a
c
c
i
n
(
v
)
Km
Vmax
Vmax/2
A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato
A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
Representacin directa
s
0 20 40 60 80 100
v
0
20
40
60
80
100
K
m
V
max
v
V s
K s
mx
m
=
+
Representacin recproca doble
(Lineweaver - Burk)
1/s
-0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6
1/v
0.00
0.01
0.02
0.03
0.04
1 1 1
v
K
V s V
m
mx mx
= +
-1/K
m
1/V
max
REPRESENTACIN LINEWEAVER-BURKE
Representacin s -s/v
(Eadie - Hofstee)
s
-20 0 20 40 60 80 100 120
s/v
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
1.2
s
v V
s
K
V
mx
m
mx
= +
1
-K
m
REPRESENTACIN HANES
Representacin v/s - v
(Wong - Hanes)
v/s
0 2 4 6 8 10 12 14 16
v
0
20
40
60
80
100
v K
v
s
V
m mx
= +
V
max
REPRESENTACIN DE EADIE-HOFSTEE
MTODOS DE LINEALIZACIN PARA DETERMINACIN
PARMETROS CINTICOS
Mtodo Eje Y Eje X Intercepto
Eje Y
Intercepto
Eje x
Pendiente
Lineweaver-
Burke
1/v 1/s 1/V -1/K K/V
Hanes s/v s K/V -K 1/V
Eadie-
Hofstee
v v/s V V/K -K
Un Qumico midi la rapidez inicial de una reaccin catalizada por
enzima en presencia y en presencia del inhibidor A y en un
procedimiento aparte del inhibidor B. En cada caso el inhibidor fue
de 8mM (8x10
-3
M). A continuacin se muestran los datos
36
[S]/M Vo/M s
-1
Sin inhibidor
Vo/M s
-1
Inhibidor A
Vo/M s
-1
Inhibidor B
0.0005 0.00000125 0.00000058 0.00000038
0.001 0.000002 0.00000104 0.0000063
0.0025 0.00000313 0.000002 0.000001
0.005 0.00000385 0.00000278 0.00000125
0.01 0.00000455 0.00000357 0.00000143
a) Determine los valores de Km y Vmax de la enzima b)
Determine el tipo de inhibicin causada por los inhibidores A y
B y calcule el valor de K1 en cada caso.