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Una de las principales caractersticas de las enzimas es su gran capacidad cataltica, aumentando la velocidad de las reacciones por factores que van de 10 x 10 7 a 10 x 10 12, y este lmite est dado por la velocidad de difusin de las macromolculas en disolucin
Presupuestos de la Teora
Al efectuarse la reaccin debe haber un desprendimiento de energa, G debe ser negativo. Es decir el potencial qumico de los reactivos debe ser mayor que el de los productos Para que los reactivos acten entre s debe formarse un complejo activado con mayor energa que la que corresponde a los reactantes en su estado basal En el estado de transicin , que corresponde al mximo de energa que alcanza el sistema, se estn rompiendo enlaces y formando otros nuevos. Es un estado muy inestable en el camino de reaccin La diferencia de energa entre el estado de transicin y los reactantes en su estado basal se denomina energa de activacin
Para derivar la velocidad de reaccin por un mtodo sencillo se considera que el estado de transicin y el estado basal estn en equilibrio termodinmico, de modo que la concentracin del estado de transicin se puede calcular a partir de la diferencia de energa de Gibbs
Para una reaccin unimolecular, si (X) es la concentracin del reactante y (X) la del estado de transicin , y G la diferencia de energa entre ambos (X) = (X) e G/RT La frecuencia a la cual se descompone el estado de transicin es igual a la frecuencia de vibracin del enlace que se rompe. Igualando la energa de un oscilador armnico E= h con E= kT energa promedio por molcula, tenemos
= kT/ h
k= kT/h e
S/R
. e - H /RT
ec. de Eyring
Un tratamiento ms riguroso incluye el empleo de un factor , coeficiente de correlacin, que es la igual a la fraccin del estado de transicin que se transforman en productos. En las reacciones simples es aproximadamente 1, en reacciones complejas puede ser muy diferente a 1.
Postulado de Hammond
Si en el curso de una reaccin se forma un intermedio inestable, la estructura del estado de transicin se parecer a la de ese intermedio La aplicacin de este postulado permite tener una idea del estado de estado de transicin y as predecir los tipos de estabilizacin que requerir. Si el producto o el sustrato es muy inestable, es de esperar que el estado de transicin sea parecido a l. Se aplica a reacciones unimoleculares
Consideraciones energticas. La presencia de un catalizador no afecta el equilibrio, las magnitudes termodinmicas de reaccin no varan Como G = H -T S, Si se tiene un valor de H muy positivo (necesidad de gran cantidad de energa) o una conformacin poco probable del estado de transicin, S, llevarn a un valor de la energa libre de activacin muy elevado y en consecuencia pocas molculas alcanzarn ese estado ( reaccin lenta). Con frecuencia las molculas deben pasar por un estado de tensin que requiere mucha energa. En muchos casos el catalizador puede reducir esta necesidad de energa forzando el paso a travs de intermediarios. En la grfica de coordenada de reaccin se sustituye la barrera de energa inicial por dos barreras, o ms de energa ms bajas.
Consideraciones entrpicas
La concentracin efectiva no es una concentracin real. La velocidad del sustrato en la reaccin intramolecular se ha multiplicado por un factor, como si la concentracin del sustrato hubiera sido aumentada por el mismo factor Las enzimas actan produciendo una ganancia de entropa de la reaccin , es decir de la S de la reaccin El paso de E y S al complejo ES est entrpicamente desfavorecido pero en el paso de ES a complejo ES , activado se produce con aumento de entropa como es una reaccin intramolecular, y al considerar ambos pasos hay ganancia de entropa
Orientacin orbital
Para que se produzca una reaccin los tomos involucrados en la ruptura y formacin de enlaces deben estar en una orientacin adecuada, ya que se debe producir un solapamiento de los orbitales involucrados. La formacin del complejo enzima-sustrato favorece esta orientacin correcta, sin embargo se ha demostrado que este efecto no es tan importante. Una distorsin de 10 de la orientacin ms favorable significa una energa extra de solo 11 kJ/mol y si es de 5 %, 2,8 kJ /mol
Catlisis cido-bsica
Catlisis cida Muchas reacciones son catalizadas por la transferencia de un protn (H3O+) al sustrato. Los protones en disolucin provienen fundamentalmente de la disolucin de cidos fuertes. Es la catlisis aida especfica Sin embargo otras reacciones se pueden producir por protones que provienen tanto del in hidronio como de cidos dbiles. Se denomina entonces catlisis cida general. Es esta ltima la que tiene importancia en el mecanismo de muchas enzimas
Catlisis bsica
En la misma forma que se produce la catlisis cida, se puede tener la catlisis bsica especfica o la general. En la catlisis especfica hay transferencia del protn del sustrato hacia el in OH En la catlisis general, tanto el OH- como las bases dbiles pueden aceptar el protn
Catlisis covalente
En este tipo de catlisis el catalizador reacciona con el sustrato, unindose a l mediante un enlace covalente, para dar un compuesto intermediario que luego se descompone dando el o los productos y regenerndose la enzima. A veces el compuesto formado experimenta varias transformaciones antes de separarse el catalizador del sustrato
Catlisis nucleoflica
El catalizador es un nuclefilo: tomo rico en electrones que ataca a otro tomo pobre en electrones (electrfilo)
El nuclefilo posee un par de electrones no compartidos que, al formar el enlace covalente comparte con el electrfilo N : + E N:E P + N:
Un catalizador nucleoflico eficaz es el que es buen nuclefilo (reacciona fcilmente con el Sustrato y se puede liberar con relativa facilidad
Centros duros_Los grupos carbonilo, fosforilo, sulfurilo y otros se pueden considerar centros duros En este caso la valencia del tomo atacado(C o P) mantiene su valencia normal en el estado de transicin Estn en este grupo el ataque de un N: a una amida, ester o ester fosfrico Se observa una diferencia de reactividad en distintos grupos, por ej las aminas y tiolatos son ms reactivos que los oxianiones Cuando existe un tomo electronegativo cerca del nuclefilo, aumenta la reactividad del mismo (Efecto alfa)
Facilidad de expulsin
La facilidad de expulsin depende de: - valor del pKa
- estado de protonacin
A menor fuerza bsica mayor facilidad de expulsin
Centros suaves:
En estos casos, el ataque del nuclefilo produce un estado de transicin donde el tomo atacado acta con valencia mayor a la normal Por ejemplo cuando un nuclefilo acta sobre un carbono saturado, en el estado de transicin el C est unido a 5 grupos. Grupos grandes y polarizables como el ioduro o sulfuro (ligandos suaves) reaccionan ms facilmente que los tomos pequeos y poco polarizables como el oxgeno o nitrgeno (ligandos duros) Los grupos con basicidad menor son ms fcilmente expulsados que los tienen mayor fuerza bsica
-OH de treonina
acilenzima
amidasas
-SH de cistena acilenzima tiolproteasas,G3Pdeshidrogen. -CO2 de aspartato fosforilenzima -NH2 de lisina imidazol de la base de Schiff fosforilenzima ATPasas (K+Na+, Ca2+) enzimas de piridoxal, aldolasas,transaldolasas fosfoglicerato mutasa,
histidina
-OH de la tirosina adenilenzima
succinilCoAsintetasa
glutamina sintetasa
Catlisis electroflica
El catalizador es un electrfilo es decir un tomo que tiene dficit de electrones E + N: P + E Un catalizador eficaz es aquel que es buen electrfilo y tambin es fcil de liberar Varias coenzimas actan como catalizadores electroflicos
El fosfato de piridoxal se condensa con los aminocidos para dar bases de Schiff El anillo de piridina acta como un sumidero de electrones,estabilizando una carga negativa Cada uno de los grupos alrededor del C quiral del aminocido puede ser separado formando un anin que es estabilizado por la base de Schiff formada con el anillo de la piridina Se puede producir: 1. separacin del H 2. alfa descarboxilacin
Descarboxilacin
El anillo de la piridina al actuar como sumidero de electrones, favorece la descarboxilacin del grupo carboxilo, el resto adiciona un protn al carbono quiral y luego por hidrlisis da amina y piridoxal
La carga positiva en el nitrgeno del anillo, promrgaoviendo la ionizacin del C 2 que al convertirse en carboin acta como un potente nuclefilo El tomo de nitrgeno provoca estabilizacin de cargas deslocalizando una carga negativa en el compuesto formado entre la tiamina y varios sustratos
Esta coenzima est fuertemente unida a las enzimas
Piruvato descarboxilasa
Anhidrasa carbnica Enzimas de cobalamina Carboxipeptidasa Piruvato carboxilasa Piruvato kinasa
Fosfotransferasa
Efecto de fatiga