Prokariot dan Eukariot

Klasifikasi sel
Prokariot dan eukariot

Sel
Prokariot Eukariot

Sel prokariot: bakteri

Tidak memiliki nukleus - DNA bebas dalam

sitoplasma
Tidak memiliki membrane-bound organelles Berukuran lebih kecil Sebagian besar memiliki dinding sel Polisakarida menutupi dinding sel pada banyak

spesies

Genom: Kandungan genetik total pada set haploid kromosom pada eukariot Kromosom tunggal pada bakteri atau pada DNA atau RNA virus

Material genetik pada organisme

Genom bakteri terdiri dari kromosom sirkular

Terkondensasi dengan cara supercoiling dan looping membentuk badan nukleoid yang terpak secara rapat Kromosom bereplikasi di dalam sel dan sel membelah secara biner

Genom bakteri Circular dsDNA

G+C = 50%

G+C content merupakan struktur genom

Gen transfer pada bakteri

Transduction: Melalui bacteriophage

Conjugation: Kontak langsung

Transformation: Mengintegrasikan free DNA atau plasmid

(from Redfield, Nat. Rev. Genet. 2001)

Plasmid adalah DNA sirkular kecil yang terdapat pada sel prokariot

Plasmids
Extra chromosomal circular DNAs
Ditemukan pada bakteri
Ukuran bervariasi dari ~ 3,000 bp sampai 100,000 bp. Bereplikasi secara otonomi (origin of replication) Dapat mengandung gen resisten

Dapat ditransfer dari satu bakteri ke bakteri lainnya

Dapat ditransfer kepada kingdom yang berbeda Multicopy plasmids (~ up to 400 plasmids/per cell) Low copy plasmids (1 2 copies per cell) Digunakan sebagai vektor untuk membawa gen yang

diinginkan

Genom bakteri berukuran kecil dan terpak secara padat dengan gen-gen

Spesies
Fungi Saccharomyces cerevisiae Aspergillus nidulans Protozoa Tetrahymena pyriformis Invertebrates Caenorhabditis elegans Drosophila melanogaster Bombyx mori (silkworm) Strongylocentrotus purpuratus (sea urchin) Locusta migratoria (locust) Vertebrates Takifugu rubripes (pufferfish) Homo sapiens Mus musculus (mouse) Plants Arabidopsis thaliana (vetch) Oryza sativa (rice) Zea mays (maize) Pisum sativum (pea) Triticum aestivum (wheat) Fritillaria assyriaca (fritillary)

Ukuran genom (Mb)

12.1 25.4

190
97 180 490 845 5000 400 3200 3300 125 430 2500 4800 16 000 120 000

ORGANISASI GEN
EUKARIOT dan PROKARIOT
SITOPLASMA

NUKLEUS
DNA RNA

INTRON EKSON

TRANKRIPSI DNA TRANKRIPSI RNA PENYAMBATAN RNA TRANSLASI PROTEIN TRANSLASI

mRNA PROTEIN

Eukariot

Genom
Keseluruhan informasi genetik dalam suatu

organisme
Informasi genetik inti: terletak di kromosom Infromasi genetik organel:

- mitokondria, - plastid (kloroplast)

Eucaryotic genomes
Berlokasi pada beberapa kromosom Low gene density Juga terdapat genom organel

Kromosom
Terlihat di dalam nukleus dengan zat pewarna

dan diamati dibawah mikroskop. Material kromosom: Kromatin Kromatin terdiri atas nukleosom Nukleosome merupakan lilitan DNA pada molekul protein yaitu protein histon

 Nukleosom terorganisasi ke dalam 30 nm benang-

benang Benang-benang terlipat-lipat membentuk 10,000-fold compaction yang diperlukan untuk membentuk kromosom eukariot di dalam nukleus.

Kekompakan genom
Karakteristik Yeast Lalat buah Manusia

Gene density (average number 479 per Mb) Introns per gene (average) 0.04 Amount of the genome that is taken up by genome-wide repeats 3.4%

76 3 12%

11 9 44%

Genom Mitokondria (mtDNA)

Berbentuk circular chromosomes
Terdapat lebih dari satu Berukuran ~15 Kb pada hewan Berukuran ~ 200 kb sampai 2,500 kb pada

tumbuhan Lebih dari 95% protein mitokondria dikode di genom nuklear.

Genom kloroplas (cpDNA)

Multiple circular molecules Ukuran berkisar dari 120 kb sampai 160 kb Mirip dengan mtDNA Banyak protein kloroplas dikode di nukleus

(separate signal sequence)