Proton-memompa tipe-I NADH dehidrogenase dan Aa3-jenis sitokrom c oksidase yang sangat down-diatur.

Bersamaan, kurang hemat energi sitokrom oksidase bd adalah transiently up-diatur. Nitrat transporter NarK2 juga up-diatur, indikasi peningkatan respirasi nitrat. Menurunnya efisiensi rantai pernapasan didampingi oleh penurunan ekspresi gen sintesis ATP. Dengan demikian, adaptasi M. TBC menjadi tuan rumah kekebalan melibatkan tiga negara pernafasan berturut menyebabkan produksi energi menurun. Penurunan jumlah bakteri pada tikus yang terinfeksi dengan cydC mutan (cacat di bd sitokrom oksidase terkait transporter) pada transisi ke infeksi kronis memberikan bukti awal bahwa oksidase jalur bd diperlukan untuk M. TB adaptasi untuk menjadi tuan rumah kekebalan. In vitro, NO pengobatan dan hipoksia menyebabkan beralih dari transkripsi tipe I untuk mengetik II NADH dehidrogenase. Selain itu, sitokrom bd ekspresi oksidase meningkat, namun sitokrom c oksidase ekspresi sedikit menurun (nitric oxide) atau tidak sama sekali (hipoksia). Perbedaan-perbedaan tertentu dalam metabolisme pernapasan selama M. pertumbuhan penangkapan TB in vitro dan in vivo akan membimbing manipulasi dalam kondisi in vitro untuk model adaptasi bakteri untuk host kekebalan.

Page 1 MINIREVIEW RespiratoryATPsynthesis: thenewgenerationof mikobakteri Kata kunci mycobacteria, sintesis ATP, rantai pernapasan; dormansi, obat antimycobacterial. Abstrak Mycobacterium tuberculosis, agen penyebab TB, pose global tantangan kesehatan akibat munculnya strain yang resistan terhadap obat. Baru-baru ini, bakteri metabolisme energi telah datang ke dalam fokus sebagai sasaran menjanjikan jalur baru untuk pengembangan obat antimycobacterial. Ulasan ini merangkum saat ini kami pengetahuan tentang konversi energi mikobakteri pernafasan, khususnya, selama negara fisiologis aktif yang berhubungan dengan laten atau persisten infeksi tuberkulosis. Penargetan komponen produksi ATP pernapasan, seperti jenis-2 NADH dehidrogenase atau ATP synthase, digambarkan sebagai muncul strategi dalam pengembangan obat baru. Pengantar Beban global infeksi Mycobacterium tuberculosis menyebabkan sekitar 2 juta kematian per tahun, dengan Diperkirakan sepertiga dari populasi dunia yang laten terinfeksi (Dye et al, 1999;. Periksa, 2007). Secara konvensional, TB dapat diobati dengan koktail dari lini pertama antibiotik, tetapi baru-baru strain mikobakteri resisten terhadap pertama dan / atau obat lini kedua telah muncul, dan menimbulkan

tantangan kesehatan global (Lihat, 2007; Dye, 2009). Mycobacterium TBC, sebuah bakteri aerobik, dapat bertahan dalam makrofag manusia dalam keadaan hypometabolic tanpa atau pertumbuhan yang sangat lambat (Wayne & Sohaskey, 2001). Dalam hal ini negara metabolisme aktif, ketebalan dinding sel bakteri meningkat, protein dan sintesis asam nukleat secara signifimetabolisme signifikan menurunkan regulasi dan lipid tampaknya sumber energi primer (Wayne & Sohaskey, 2001; Timm et al., 2003). Perubahan ini disertai dengan karakteristic up-peraturan satu set 48 gen, disebut sebagai dosR regulon (Voskuil et al., 2003). Ini renovasi besar kunci jalur metabolik menyebabkan penurunan sensitivitas untuk skrrently digunakan antibiotik (Gomez & McKinney, 2004), dan sehingga merupakan faktor penting yang bertanggung jawab atas diperpanjang Waktu pengobatan TB pada pasien (6-9 bulan). Di Terlepas dari fenotipe aktif, bakteri ini masih memiliki kebutuhan energi basal untuk mempertahankan metabolisme kritis fungsi (Koul et al., 2008). Dalam beberapa tahun terakhir, signifikan Informasi telah diperoleh pada esensial pernapasan komponen rantai Tory di aktif serta replikasi bakteri. Identifikasi calon obat baru yang menargetkan mesin penghasil ATP menggambarkan terapi potensi memblokir konversi energi mikobakteri (Anmengering et al, 2005;. Weinstein dkk, 2005).. Pernapasan ATP generasi di mikobakteri Banyak bakteri, seperti Escherichia coli dan Bacillus subtilis, dapat mensintesis ATP yang cukup untuk pertumbuhan menggunakan substrat fosforilasi tingkat sumber karbon difermentasi (Friedl et al, 1983;. Santana et al, 1994).. Namun, dalam kasus M. tuberkulosis, ATP sintase diperlukan untuk pertumbuhan optimal diungkapkan oleh mutagenesis high-density (Sassetti et al., 2003). Selain itu, dalam Mycobacterium mutan penghapusan smegmatis menunjukkan fungsi penting dari ATP sintase untuk pertumbuhan pada difermentasi serta sumber karbon nonfermentable Janin Microbiol Lett 308 (2010) 1-7 c 2010 Federasi Masyarakat Mikrobiologi Eropa Diterbitkan oleh Blackwell Publishing Ltd All rights reserved MICR SURAT OBIOLOGY Page 2 (Tran & Cook, 2005). Temuan ini menunjukkan bahwa mycobacteria tidak dapat mendapatkan energi yang cukup dengan tingkat substrat phosphorylation dan perlu sintesis ATP pernapasan untuk pertumbuhan. Dalam rantai pernapasan, dua jenis NADH dehydro-

genases hadir di sebagian mikobakteri untuk NADH oksidasi tion dan untuk makan mengurangi setara ke elektron transportasi jalur (Gambar 1). Namun, proton-transportasiing tipe-I NADH dehidrogenase (NDH-1), dikodekan oleh nuo operon, tidak penting dalam M. tuberculosis (Sassetti et al., 2003;. Rao et al, 2008) dan sebagian besar dihapus dari genom Mycobacterium leprae (Cole et al., 2001). Alternative, NADH dapat dioksidasi oleh non-proton-translocating, tipe-II NADH dehidrogenase (NDH-2), menggunakan menaquinone sebagai akseptor elektron (Gambar 1). Dalam M. tuberkulosis, NDH-2 hadir dalam dua salinan, disebut sebagai Ndh dan NdhA, sedangkan di M. smegmatis, hanya satu salinan ditemukan (Weinstein dkk., 2005). Studi mutagenesis pada M. smegmatis menunjukkan fungsi penting dari NDH-2 untuk kelangsungan hidup (Miesel et al., 1998). Penghambatan Kimia NDH-2 dilaporkan bakterisida untuk M. tuberculosis, sedangkan Penghambat khas dari NDH-1 tidak memiliki signifikan Efek (Rao et al., 2008). Secara keseluruhan, data ini menunjukkan bahwa NDH-2 bertanggung jawab untuk sebagian besar oksidasi NADH di mikobakteri. Setelah menerima elektron dari NDH-2, menaquinol bisa akan reoxidized melalui dua rute alternatif, berakhir dengan baik sitokrom aa 3 -Jenis atau sitokrom bd-jenis terminal oksidase (Gambar 1, untuk review, lihat Cox & Cook, 2007). Dalam penuh semangat lebih efisien rute, menaquinol teroksidasi oleh sitokrom bc 1 kompleks (terdiri dari subunit QcrAC), yang kemudian mentransfer elektron ke terminal sitokrom aa 3 Jenis-oksidase (CTAC-F) (Matsoso et al., 2005). Sitokrom bc 1 kompleks dan sitokrom aa 3 oksidase, berpikir untuk membentuk sebuah kompleks super mycobacteria, adalah enzim-enzim proton-pemindahan, menjamin tinggi hasil energik rute ini (Niebisch & Bott, 2003; Matsoso et al., 2005). Atau, menaquinol bisa langsung teroksidasi oleh sitokrom oksidase terminal bd-jenis (CYTAB) (Kana dkk., 2001). Reaksi ini tidak digabungkan dengan proton memompa, akibatnya, sitokrom oksidase bd rute adalah

penuh semangat kurang efisien. Namun, sitokrom oksidase bd menampilkan afinitas yang lebih tinggi terhadap oksigen dan dengan demikian digunakan pada lowketegangan oksigen (Kana dkk., 2001), sedangkan sitokrom aa 3 -Jenis enzim adalah elektron terminal dominan akseptor selama pertumbuhan aerobik (Shi et al., 2005). Energi dari kekuatan motif proton kemudian dimanfaatkan oleh ATP synthase untuk sintesis ATP. Selama dormansi, NDH-2 ditemukan diregulasi, sedangkan NDH-1 adalah sangat menurunkan regulasi (Schnappinger . et al, 2003; Shi et al, 2005).. Sitokrom bc 1 dan sitokrom aa 3 kompleks yang menurunkan regulasi juga, bagaimanapernah, sitokrom bd-jenis oksidase adalah transiently upregulated, bisa dibilang untuk memfasilitasi transisi ke keadaan tidak aktif dengan berkontribusi terhadap keseimbangan redoks (Shi et al., 2005). Itu pertanyaan akseptor elektron terminal dominan di keadaan aktif masih terbuka. Telah menyarankan bahwa nitrat reduktase (NarG-I) bertindak sebagai akseptor, dan memang, aktivitas enzim nitrat reduktase ditemukan meningkat (Wayne & Hayes, 1998), dan penambahan nitrat meningkatkan kelangsungan hidup aktif mikobakteri (GengenBacher et al., 2010). Selain itu, transporter nitrat NarK2 diregulasi selama dormansi (Schnappinger et al, 2003.; Voskuil et al, 2003;. Shi et al, 2005).. Subunit dari ATP kompleks sintase yang ditemukan downregulated menggunakan dalam Model dormansi vitro serta tikus in vivo paru Model infeksi (Shi et al, 2005;.. Koul et al, 2008). Ini Gambar. 1. Skema pandangan rantai pernapasan mikobakteri. Menaquinone The (MK) kolam dapat dikurangi dengan baik NDH-2 (kuning) atau melalui suksinat dehidrogenase (biru tua) dan dioksidasi oleh baik sitokrom bc 1 (Hijau tua) / sitokrom aa 3 (Pink) super-kompleks atau oleh sitokrom oksidase bd (Lampu hijau). Kekuatan motif proton digunakan oleh ATP sintase (biru muda) untuk produksi ATP. Nitrat reduktase dan sistem transporter adalah diarsir berwarna coklat. Jenis-I proton-pemindahan dehidrogenase NADH, yang tidak penting untuk pertumbuhan, tidak ditampilkan. Senyawa molekul kecil, yang blok pernapasan produksi ATP dan bertindak bakterisidal pada replikasi dan aktif mikobakteri, digambarkan dengan warna merah.

Janin Microbiol Lett 308 (2010) 1-7 c 2010 Federasi Masyarakat Mikrobiologi Eropa Diterbitkan oleh Blackwell Publishing Ltd All rights reserved 2 D. Bald & A. Koul Page 3 renovasi yang cukup besar dalam aktif mikobakteri mencerminkan mengurangi ketersediaan oksigen dan penurunan energi persyaratan KASIH dalam keadaan tanpa pertumbuhan. Selama dormansi, tingkat ATP selular adalah $ 10-kali lipat lebih rendah dibandingkan dengan basil replikasi (Starck et al, 2004;. Koul et al, 2008;. Rao et al, 2008;.. Gengenbacher et al, 2010). Namun demikian, aktif M. smegmatis aktif dalam pernapasan ATP sintesis dan mempertahankan membran energi (Koul et al., 2008). Selanjutnya, kedua replikasi dan aktif M. TB juga terbukti menjaga energi membran cytoplasmatic dengan kekuatan motif proton 110mV (Rao et al., 2008). Nilai ini jauh lebih rendah dari nilai biasanya ditemukan bakteri lain (A180 untuk 200mV). Senyawa campur dengan motif proton kekuatan, seperti uncouplers atau ionofor, terbukti sangat bakterisida pada M. tuberculosis aktif in vitro (Rao et al., 2008), menunjukkan bahwa kekuatan motif proton adalah elemen penting dari kehidupan dalam kondisi aktif. Ini adalah membuka pertanyaan yang enzim terutama bertanggung jawab untuk pemeliharaan kekuatan motif proton selama dorMancy. Calon dibayangkan untuk tugas ini adalah nitrat reduktase, yang aktivitasnya diregulasi dalam keadaan tidak aktif, atau suksinat dehidrogenase operasi secara terbalik sebagai FumaTingkat reduktase (Schnorpfeil et al, 2001;. Wayne & Sohaskey, 2001; Cox & Cook, 2007;. Rao et al, 2008). Sebaliknya, NDH2, jalur utama untuk oksidasi NADH dan mendorong elektron ke dalam rantai pernafasan di dorman negara (Rao et al., 2008), tidak mentranslokasi proton. Peran enzim ini bukannya mungkin untuk memberikan keseimbangan redoks, sebagai penghambatan fenotiazin dari NDH-2 mengakibatkan peningkatan konsentrasi NADH seluler (Rao et al., 2008). Lebih lanjutlebih, berbeda dengan situasi yang ditemukan di sebagian besar bakteri, mikobakteri ATP sintase rupanya tidak bisa efisien membalikkan fungsinya untuk memompa proton melintasi membran: ATP sintase dari Mycobacterium phlei hanya menunjukkan sangat aktivitas rendah di hidrolisis ATP (Higashi et al., 1975), khusus penghambatan ATP synthase pada replikasi dan aktif M. smegmatis tidak menurunkan kekuatan motif proton (Koul et al., 2008) dan vesikula membran Mycobacterium bovis

BCG tidak mampu membangun kekuatan motif proton menggunakan ATP (AC Haagsma & D. Bald, data tidak dipublikasikan). Ini Hasil penelitian menunjukkan bahwa dalam aktif mycobacteria, ATP sintase aktif dalam produksi ATP, yang dapat memberikan energi yang dibutuhkan untuk kegiatan biosintesis sisa. ATP Kegiatan sintesis juga dapat memfasilitasi elektron kontinyu mengalir melalui rantai pernapasan, dan dengan cara ini, conupeti ke saldo redoks. Penghambatan baik NADH oksidasi tion atau sintesis ATP atau runtuhnya kekuatan motif proton menyebabkan pembunuhan M. tuberculosis (Rao et al., 2008, lihat juga Gambar. 1). Rantai pernapasan M. tuberculosis dapat menunjukkan khusus adaptasi untuk bertahan hidup dalam kondisi aktif dan / atau kekuatan motif proton rendah. Kegiatan ATP sintase secara signifikan tergantung pada kekuatan motif proton, dengan variasi antara organisme yang berbeda (Kaim & Dimroth, 1999). ATP sintase M. tuberculosis dapat berubah keluar agar aktif pada potensial membran lebih rendah dibandingkan dengan sebagian besar bakteri atau mitokondria. Dasar molekuler untuk Variasi ini antara spesies tidak jelas, meskipun peran intrinsik hambat subunit e dan oligomer tersebut, proton-pemindahan subunit c telah tersirat (Turina et al., 2006, lihat juga Gambar. 2). Dalam Bacillus sp alkaliphilic. regangan TA2.A1, yang harus mengatasi motif proton rendah kondisi kekuatan juga, c kompleks subunit terdiri dari 13 monomer, dibandingkan dengan 10 kompleks monomer ditemukan dalam E. coli dan Bacillus PS3 (Jiang et al, 2001;. Mitome et al, 2004;. Meier et al, 2007).. Sejumlah besar monomer per subunit c oligomer dapat meningkatkan H 1 / Rasio ATP dan dengan demikian memfasilitasi aliran proton dan sintesis ATP bawah proton motif kondisi kekuatan rendah (Meier et al., 2007). Investigasi Biokimia dan bioinformatika studies akan membantu untuk menjawab pertanyaan ini dan juga dapat memperjelas mengapa mikobakteri ATP sintase tidak bisa membalikkan fungsinya untuk mendirikan sebuah kekuatan motif proton. b sebuah c H

+ H + H + Selaput Periplasm Sitoplasma sebuah c-oligomer H + ADP + Pi (A) (B) ATP Periplasm Sitoplasma Selaput H + Gambar. 2. Skema pandangan ATP sintase dan aliran proton selama sintesis ATP. (A) Selama sintesis ATP, oligomer subunit c (abu-abu gelap), bersama-sama dengan subunit g dan e (coklat), berputar relatif terhadap subunit lain dari kompleks sintase ATP. (B) aliran Proton dalam membran-embedded bagian dari ATP synthase, residu asam penting dalam subunit c (E61 di Mycobacterium tuberculosis) digambarkan dalam warna merah untuk masing-masing monomer. Struktur c-oligomer adalah dari Spirulina platensis (PBD kode aksesi 2WIE). Janin Microbiol Lett 308 (2010) 1-7 c 2010 Federasi Masyarakat Mikrobiologi Eropa Diterbitkan oleh Blackwell Publishing Ltd All rights reserved 3 Pernapasan ATP sintesis dalam mikobakteri Page 4 Hanya sangat sedikit informasi yang tersedia pada energi dan fluks metabolik pada aktif mycobacteria, misalnya pada tingkat seluler produksi ATP dan konsumsi dan di paling menonjol ATP tenggelam. Analisis kuantitatif fluks metabolik dapat memberikan informasi tentang minimal Persyaratan ATP untuk bertahan hidup selama dormansi. Tampaknya pernapasan sintesis ATP adalah kunci metajalur bolic dalam mereplikasi serta aktif mycobacteria. Dalam ayat berikutnya, pendekatan memanfaatkan pernapasan produksi ATP sebagai target novel antibacobat terial diilustrasikan.

Pernapasan produksi ATP sebagai baru target obat Seperti dijelaskan di atas, penghambatan oksidasi NADH, antarinterferensi dengan kekuatan motif proton atau memblokir ATP sintase semua memiliki efek bakterisida diucapkan pada replikasi dan aktif M. tuberculosis. Sedangkan compon campur dengan kekuatan motif proton cenderung menjadi nonselektif dan beracun, untuk dua calon lain sasaran, calon obat molekul kecil telah dilaporkan: para fenotiazin menghambat NDH-2 (Boshoff & Barry, 2005; Weinstein dkk, 2005) dan diarilkuinolin blok. ATP synthase (Andries et al, 2005;.. Koul et al, 2007). Fenotiazin dan fenotiazin analog efisien membunuh M. tuberculosis in vitro dan terbukti efektif dalam model infeksi tikus (Weinstein dkk., 2005). Fenotiazin menghambat kedua homolog dari NDH-2 di M. tuberculosis, Ndh dan NdhA, dan sangat ditekan konsumsi oksigen oleh mikobakteri vesikel membran energi dengan NADH (Weinstein dkk, 2005;.. Yano et al, 2006). Berdasarkan data kinetik, telah menyarankan bahwa fenotiazin tidak bersaing dengan NADH atau menaquinone mengikat, tapi blok pembentukan atau reaksi dari suatu spesies peralihan dari siklus katalitik (Yano et al., 2006). NDH-2 adalah membran terkait, single-subunit enzim, yang membawa satu dinukleotida flavin adenin-(FAD) cofactor (Kerscher et al, 2008;.. Fisher et al, 2009). Homologi Penelitian menunjukkan adanya dua domain untuk pengikatan NADH dan FAD, masing-masing (Schmid & Gerloff, 2004). Sebagai seperti, NDH-2 berbeda secara signifikan dari NDH-1 di manusia mitokondria, yang merupakan membran, multisubunit protein kompleks membawa tambahan besi-sulfur pusat redoks (Kerscher et al., 2008). NDH-2 merupakan komponen penting dari rantai pernapasan mikobakteri, diregulasi selama dormansi dan tidak memiliki homolog di mitokondria manusia. Fitur-fitur NDH-2 a target menjanjikan untuk pengembangan obat baru canditanggal. Data struktur beresolusi tinggi dan lebih dalam di bawahberdiri tindakan fenotiazin dapat memfasilitasi strukturdesain berbasis molekul kecil NDH-2 inhibitor dengan meningkatkan efektivitas dan selektivitas. Diarilkuinolin mewakili kelas novel antimycobacobat terial dengan kuat in vitro dan in vivo aktivitas terhadap spesies yang berbeda mikobakteri (Andries et al, 2005;. Ji et al,. 2006). Diarilkuinolin memblokir sintesis ATP dan menyebabkan penurunan tingkat ATP seluler (Koul et al., 2007). Sebagai toko ATP bakteri yang habis selama periode waktu,

membunuh bakteri kemudian diucapkan diamati (Koul et al., 2008). Diarilkuinolin khusus berinteraksi dengan oligomer transmembran subunit c mikobakteri ATP synthase (Koul et al., 2007, lihat juga Gambar. 2). Selama enzykatalisis matic, ini subunit oligomer, bersama-sama dengan subunit e dan g, berputar relatif terhadap subunit a 3 b 3 dab dan dalam hal ini cara pasangan aliran proton sintesis ATP (Boyer, 1993; Junge et al, 1997).. Proton masuk dari periplasmic ruang melalui saluran masuk dalam subunit a dan kemudian ditransfer ke residu asam esensial dalam membranmencakup bagian dari subunit c (Gambar 2). Setelah dekat dengan 3601 rotasi subunit silinder c oligomer relatif terhadap subunit a, proton dilepaskan pada sisi sitosol membran melalui saluran keluar dalam subunit (Vik & Antonio, 1994; Diez et al, 2004).. Studi mutagenesis menunjukkan bahwa senyawa diarylquinoline memimpin TMC207 mengikat wilayah tengah subunit c, dekat dengan penting residu asam (Koul et al., 2007). TMC207 mungkin bersaing dengan proton untuk mengikat subunit c atau mungkin alternatif mengganggu perubahan konformasi luas ini subunit selama katalisis. Sedangkan inhibitor khas ATP sintase subunit c, seperti dicyclohexyl-carbodiimide dan oligomycin, tidak sangat beracun dan selektif (Matsuno-Yagi & Hatefi, 1993; Wallace & Starkov, 2000; Amacher, 2005), TMC207 menampilkan selektivitas mengejutkan, dengan hanya efek yang sangat rendah pada sintesis ATP manusia (Haagsma et al., 2009). Meskipun beberapa residu subunit c dilaporkan untuk memodulasi diarylquinoline sensitivitas (Koul et al., 2007), dasar molekuler untuk selektivitas diamati kebutuhan untuk diteliti lebih lanjut. Tidak ada struktur-resolusi tinggi tersedia untuk mikobakteri ATP sintase atau subunit, serta model struktural untuk subunit mikobakteri c hanya memiliki dibangun berdasarkan struktur yang dikenal dari homolog subunit dari E. coli, Bacillus Ilyobacter tartaricus atau PS3 (de Jonge et al, 2007;. Koul et al, 2007).. Resolusi tinggi Data struktural untuk subunit mikobakteri c dan biokimia investigasi terhadap interaksi obat / target akan membantu untuk menjelaskan selektivitas obat dan akan memberikan masukan untuk dermagaing mempelajari untuk merancang turunan senyawa baru. Berdasarkan struktur diarilkuinolin, Novel quinoline turunan dengan signifikan in vitro aktivitas bakterisida pada M. tuberculosis telah disintesis (Lilienkampf et al, 2009;. Upadhayaya

et al., 2009). Diarilkuinolin juga terbukti dapat membunuh aktif M. TB basil seefektif mereplikasi dan untuk menghambat ATP sintesis dalam dorman M. smegmatis (Koul et al., 2008). Ini aktivitas bakterisida yang unik ganda, dengan potensi yang sama pada Janin Microbiol Lett 308 (2010) 1-7 c 2010 Federasi Masyarakat Mikrobiologi Eropa Diterbitkan oleh Blackwell Publishing Ltd All rights reserved 4 D. Bald & A. Koul Halaman 5 replikasi dan aktif basil, membedakan diarylquinobaris dari semua obat antituberkulosis yang digunakan saat ini, seperti sebagai isoniazid dan rifampicin. Obat ini lini depan menunjukkan signifikan kurang aktivitas di mikobakteri aktif sebagai comdikupas dengan basil replikasi (Koul et al, 2008;.. Rao et al, 2008). Jadi, meskipun ATP sintase secara signifikan turundiatur selama dormansi, aktivitas residu yang tampaknya menjadi penting untuk mikobakteri terlepas dari mereka physiolonegara gical. Hal ini membuat ATP sintase sasaran obat yang efisien untuk mengatasi kedua replikasi serta basil dorman. In vivo percobaan menggunakan model tikus menunjukkan bahwa diarilkuinolin memiliki aktivitas bakterisida melebihi pengaruh arus antibiotik lini pertama (Andries et al, 2005.; Lounis et al., 2006). Diarilkuinolin, khususnya ketika diterapkan dalam terapi kombinasi dengan antibiotik lini pertama pirazinamid, memiliki potensi kuat untuk memperpendek durasi pengobatan tuberkulosis (Lounis et al, 2006.; Ibrahim et al., 2007). Dasar fisiologis untuk ini sinergi yang diamati tetap tidak jelas. Pada fase IIb uji klinis, penambahan TMC207 pada terapi standar kuat menurunkan hitungan CFU dalam dahak pasien dengan TB multi-obat-tahan dibandingkan dengan ackelompok tive-plasebo (Diacon et al., 2009). TMC207 juga konversi dipercepat untuk budaya dahak negatif, seperti dibandingkan dengan plasebo. Temuan ini memvalidasi ATP sintase sebagai target untuk pengobatan tuberkulosis. Kesimpulan Produksi ATP pernapasan tidak hanya penting untuk pertumbuhan, tetapi juga merupakan titik lemah penting dalam aktif cendawan bakteri. Meskipun sebagian besar enzim yang terlibat dalam pernapasan Sintesis ATP dilestarikan antara prokariota dan eukariota, menargetkan produksi ATP mungkin sangat pendekatan yang efisien untuk pengembangan antibakteri obat. Strategi ini mungkin untuk enzim target, yang tidak

memiliki homolognya dalam metabolisme tubuh manusia, seperti dalam kasus NDH-2. Atau, seperti yang diterapkan untuk ATP sintase, kecil perbedaan struktur antara enzim bakteri dan homolog manusia dapat digunakan untuk penghambatan selektif. Memahami produksi ATP pernapasan dalam mereplikasi dan aktif mikobakteri tidak hanya akan mendorong perkembangan obat baru, tetapi juga menjelaskan bagaimana bakteri ini melakukan tugas menarik mereka ketekunan ekstrim tanpa pertumbuhan yang signifikan. Pengakuan Penulis mengucapkan terima kasih kepada Prof Dr H. Lill (VUAmsterdam) dan Prof Dr K. Andries (Johnson dan Johnson) untuk kritis membaca naskah, dan Dr J. Guillemont, Dr E. Arnoult (Johnson & Johnson) dan Ms A. Haagsma (VUAmsterdam) untuk bantuan dengan desain angka. Referensi Amacher DE (2005) toksisitas mitokondria Obat-terkait dan deteksi. Curr Med Chem 12: 1829-1839. Andries K, Verhasselt P, Guillemont J dkk. (2005) A diarylquinoline obat aktif pada sintase ATP Mycobacterium tuberculosis. Ilmu 307: 223-227. Boshoff HI & Barry CE III (2005) Tuberkulosis - metabolisme dan respirasi dalam ketiadaan pertumbuhan. Nat Rev Microbiol 3: 70-80. Boyer PD (1993) Mekanisme perubahan mengikat bagi ATP sintase - beberapa probabilitas dan kemungkinan. Biochim Biophys Acta 1140: 215-250. Periksa E (2007) Setelah puluhan tahun kekeringan, kemungkinan obat baru pipa TB banjir. Nat Med 13: 266. Cole ST, Eiglmeier K, Parkhill J dkk. (2001) kerusakan gen besar-besaran dalam basil kusta. Nature 409: 1007-1011. Cox RA & Cook GM (2007) regulasi Pertumbuhan sel mikobakteri. Curr Mol Med 7: 231-245. de Jonge MR, Koymans LH, Guillemont JE, Koul A & Andries K (2007) Sebuah model komputasi dari penghambatan Mycobacterium tuberculosis ATPase oleh calon obat baru R207910. Protein 67: 971-980. Diacon AH, Pym A, Grobusch M dkk. (2009) diarylquinoline TMC207 untuk TB-MDR. New Engl J Med 360: 2397-2405. Diez M, Zimmermann B, Borsch M dkk. (2004) Proton bertenaga rotasi subunit dalam satu terikat membran F 0 F 1 -ATP

synthase. Nat Struct Mol Biol 11: 135-141. Dye C (2009) Kiamat ditunda? Mencegah dan membalikkan epidemi TB yang resistan terhadap obat. Nat Rev Microbiol 7: 81-87. Dye C, Scheele S, Dolin P, Pathania V & Raviglione MC (1999) Pernyataan konsensus. Beban global TBC: Diperkirakan kejadian, prevalensi, dan kematian oleh negara. WHO Surveillance Global dan Proyek Pengawasan. J Am Med Assoc 282: 677-686. Fisher N, Warman AJ, Ward SA & Biagini GA (2009) Tipe II NADH: oxidoreductases kuinon Plasmodium falciparum dan Mycobacterium tuberculosis kinetik dan tinggi-throughput tes. Metode Enzymol 456: 303-320. Friedl P, J Hoppe, Gunsalus RP, Michelsen O, von Meyenburg K & Schairer HU (1983) integrasi Membran dan fungsi tiga F 0 subunit dari sintase ATP Escherichia coli K12. EMBO J 2: 99-103. Gengenbacher M, Rao SP, Pethe K & Dick T (2010) Gizikelaparan, tidak bereplikasi Mycobacterium tuberculosis membutuhkan respirasi, ATP sintase dan isocitrate liase untuk pemeliharaan ATP homeostasis dan kelangsungan hidup. Mikrobiologi 156: 81-87. Gomez JE & McKinney JD (2004) M. tuberculosis ketekunan, latency, dan obat toleransi. Tuberkulosis 84: 29-44. Haagsma AC, Abdillahi-Ibrahim R, Wagner MJ, Krab K, Vergauwen K, Guillemont J, K Andries, Lill H, Koul A & Bald D (2009) Selektivitas TMC207 terhadap mikobakteri ATP sintase dibandingkan dengan menuju eukariotik homolog. Antimicrob Agen Ch 53: 1290-1292. Janin Microbiol Lett 308 (2010) 1-7 c 2010 Federasi Masyarakat Mikrobiologi Eropa Diterbitkan oleh Blackwell Publishing Ltd All rights reserved 5 Pernapasan ATP sintesis dalam mikobakteri Page 6 Higashi T, Kalra VK, Lee SH, Bogin E & Brodie AF (1975) Energi-pentransduksi terikat membran kopling faktorATPase dari Mycobacterium phlei. I. Pemurnian, homogenitas, dan properti. J Biol Chem 250: 6541-6548. Ibrahim M, Andries K, Lounis N, Chauffour A, Truffot-Pernot C, Jarlier V & Veziris N (2007) aktivitas Sinergis R207910 dikombinasikan dengan pirazinamid terhadap TBC murine. Antimicrob Agen Ch 51: 1011-1015. Ji B, Lefrancois S, Robert J, Chauffour A, C & Truffot Jarlier V

(2006) in vitro dan in vivo dalam kegiatan rifampisin, streptomisin, amikasin, moksifloksasin, R207910, linezolid, dan PA-824 melawan Mycobacterium ulcerans. Antimicrob Agen Ch 50: 1921-1926. Jiang W, Hermolin J & Fillingame RH (2001) pilihan stoikiometri c subunit di sektor bermotor putar Escherichia coli ATP sintase adalah 10. P Natl Acad Sci USA 98: 4966-4971. Junge W, Lill H & Engelbrecht S (1997) ATP sintase: sebuah elektrokimia transduser dengan mekanika berputar. Tren Biochem Sci 22: 420-423. Kaim G & P Dimroth (1999) sintesis ATP oleh F-jenis ATP sintase adalah secara wajib tergantung pada transmembran tegangan. EMBO J 18: 4118-4127. Kana BD, Weinstein EA, Avarbock D, Dawes SS, Rubin H & Mizrahi V (2001) Karakterisasi cydAB-encoded sitokrom oksidase bd dari Mycobacterium smegmatis. J Bacteriol 183: 7076-7086. Kerscher S, Drose S, Zickermann V & Brandt U (2008) Ketiga keluarga dehydrogenases NADH pernapasan. Hasil probl Sel Berbeda 45: 185-222. Koul A, Dendouga N, Vergauwen K et al. (2007) diarilkuinolin Target subunit c mikobakteri ATP synthase. Nat Biol Chem 3: 323-324. Koul A, Vranckx L, Dendouga N dkk. (2008) diarilkuinolin adalah bakterisida selama aktif mikobakteri sebagai akibat dari ATP terganggu homeostasis. J Biol Chem 283: 25.273-25.280. Lilienkampf A, Mao J, Wan B, Wang Y, kata Franzbau SG & Kozikowski AP (2009) Struktur-aktivitas hubungan untuk serangkaian senyawa berbasis quinoline aktif terhadap replikasi dan nonreplicating Mycobacterium tuberculosis. J Med Chem 52: 2109-2118. Lounis N, N Veziris, Chauffour A, Truffot-Pernot C, Andries K & Jarlier V (2006) Kombinasi R207910 dengan obat yang digunakan untuk mengobati tuberkulosis resisten memiliki potensi untuk memendekkan masa pengobatan. Antimicrob Agen Ch 50: 3543-3547. Matsoso LG, Kana BD, Crellin PK, Lea-Smith DJ, Pelosi A, Powell D, Dawes SS, Rubin H, Coppel RL & Mizrahi V (2005) Fungsi sitokrom BC1-Aa3 cabang pernapasan jaringan dalam mikobakteri dan jaringan adaptasi yang terjadi di respon terhadap gangguan tersebut. J Bacteriol 187: 6300-6308. Studi Matsuno-Yagi A & Hatefi Y (1993) pada mekanisme fosforilasi oksidatif. Efek yang berbeda dari F 0 inhibitor pada

Foliage dan multisite hidrolisis ATP oleh sapi partikel submitochondrial. J Biol Chem 268: 1539-1545. Meier T, Morgner N, Matthies D, Pogoryelov D, Keis S, Cook GM, Dimroth P & Brutschy B (2007) A c cincin tridecameric dari dengan adenosin trifosfat (ATP) sintase dari thermoalkaliphilic Bacillus sp. regangan TA2.A1 memfasilitasi ATP sintesis pada potensi proton elektrokimia rendah. Mol Microbiol 189: 5895-5902. Miesel L, Weisbrod TR, Marcinkeviciene JA, Bittman R & Jacobs WR Jr (1998) NADH dehidrogenase cacat menganugerahkan isoniazid resistensi dan mematikan kondisional dalam Mycobacterium smegmatis. J Bacteriol 180: 2459-2467. Mitome N, Suzuki T, Hayashi S & M Yoshida (2004) Termofilik ATP sintase memiliki decamer c-ring: indikasi dari integer 10:03 H 1 / ATP rasio dan elastis permisif kopling. P Natl Acad Sci USA 101: 12.159-12.164. Niebisch A & M Bott (2003) Pemurnian dari sitokrom bc-Aa3 supercomplex dengan aktivitas oksidase kinol dari Corynebacterium glutamicum. Identifikasi keempat subunity sitokrom oksidase Aa3 dan analisis mutasi dari diheme sitokrom c1. J Biol Chem 278: 4339-4346. Rao SP, Alonso S, L Rand, Dick T & K Pethe (2008) proton kekuatan motif diperlukan untuk mempertahankan homeostasis ATP dan viabilitas hipoksia, nonreplicating Mycobacterium TBC. P Natl Acad Sci USA 105: 11.945-11.950. Santana M, Ionescu MS, Vertes A, Longin R, F Kunst, Danchin A Glaser & P (1994) Bacillus subtilis F 0 F 1 ATPase: urutan DNA dari operon ATP dan karakterisasi mutan ATP. J Bacteriol 176: 6802-6811. Sassetti CM, Boyd DH & Rubin EJ (2003) Gen yang diperlukan untuk pertumbuhan mikobakteri didefinisikan oleh mutagenesis kepadatan tinggi. Mol Microbiol 48: 77-84. Schmid R & Gerloff DL (2004) sifat fungsional dari alternatif NADH: oksidoreduktase ubiquinone dari E. coli melalui perbandingan 3-D modeling. FEBS Lett 578: 163-168. Schnappinger D, Ehrt S, Voskuil MI dkk. (2003) transkripsi adaptasi Mycobacterium tuberculosis dalam makrofag: wawasan lingkungan phagosomal. J Exp Med 198: 693-704. Schnorpfeil M, Janausch IG, Biel S, Kroger A & Unden G (2001)

Generasi potensi proton oleh dehidrogenase suksinat Bacillus subtilis berfungsi sebagai reduktase fumarat. Eur J Biochem 268: 3069-3074. Shi L, Sohaskey CD, Kana BD, Dawes S, North RJ, Mizrahi V & Gennaro ML (2005) Perubahan dalam metabolisme energi Mycobacterium tuberculosis pada paru tikus dan di bawah in vitro kondisi yang mempengaruhi respirasi aerobik. P Natl Acad Sci USA 102: 15.629-15.634. Starck J, G Kallenius, Marklund BI, Andersson DI & kerlund T (2004) Perbandingan analisis proteome Mycobacterium TB tumbuh di bawah kondisi aerob dan anaerob. Mikrobiologi 150: 3821-3829. Timm J, Pos FA, Bekker LG dkk. (2003) ekspresi Diferensial dari-, besi, karbon dan oksigen gen mikobakteri-responsif di paru-paru tikus dan TBC kronis terinfeksi pasien. P Natl Acad Sci USA 100: 14.321-14.326. Janin Microbiol Lett 308 (2010) 1-7 c 2010 Federasi Masyarakat Mikrobiologi Eropa Diterbitkan oleh Blackwell Publishing Ltd All rights reserved 6 D. Bald & A. Koul Page 7