Biokimia = Ilmu yang mempelajari gejala-gejala kimia di dalam zat hidup atau makhluk hidup.

Tiga hal penting dalam ilmu biokimia = 1. Fungsi 2. Struktur 3. Metabolisme biomolekul

1. Istilah Biokimia dikemukakan oleh Karl Neuberg ahli kimia Jerman pd tahun 1903. 2. Diawali dgn penelitian Karl Wilhelm Scheele (ahli kimia Swedia) pertengahan abad 18 yg menemukan susunan kimia jaringan pd hewan dan tumbuhan, spt asam oksalat, asam laktat, asam sitrat, dan bbrp ester dan kasein dr bahan alam. 3. Biokimia ditetapkan sbg disiplin ilmu pd awal abad 19 dgn penelitian yg dipelopori Friedrich Wohler (1828) urea yg semula hanya dikira dr urine, ternyata dpt dibuat di lab

Tumbuhan maupun hewan

DIANGGAP

Senyawa organik mempelajari senyawa-2 karbon yg berasal dari makhluk hidup

Memiliki tenaga gaib (vital force)

Awalnya

Utk sintesis senyawa-2 karbon

Perkembangan IPTEK akhirnya menggugurkan teori ini

Menganggap semua senyawa organik berasal dari makhluk hidup gula (dari batang tebu), pupuk urea (dari air seni mamalia), formalin (dihasilkan semut), alkohol (fermentasi beras & gandum) Sampai akhirnya muncul hasil penemuan

Dianggap tdk dpt dibuat di lab

Karl Wilhelm Scheele (1780) dr Swedia istilah zat organik utk menyebut zat-2 yg dihasilkan oleh makhluk hidup (organisme) & istilah zat anorganik utk zat-2 yg diperoleh dr mineral-2 pd kulit bumi.
Pernyataan tsb GUGUR ditemukan urea pd pemanasan senyawa sianat yg mrpk senyawa anorganik Friedrich Wohler dr Jerman. Penemuan ini memupus pernyataan bahwa senyawa organik dihasilkan dari makhluk hidup. Senyawa organik (senyawa karbon) tdk selamanya berasal dr senyawa organik, tp dpt disintesis (dibuat) dr senyawa anorganik.

KOCN + NH4Cl NH4OCN + KCl ammonium sianat NH4OCN NH2CONH2 biasa ditulis CO(NH2)2 urea Hasil eksperimen tak sengaja menguapkan pelarut sianat utk memperoleh kristal amonium sianat, tp krn pemanasan terlalu lama amonium sianat berubah menjadi urea.

MINYAK BUMI & BATU BARA

Dari sumber ini diperoleh senyawa-2 organik yg digunakan sbg bahan dasar utk mensintesis berbagai senyawa-2 organik lainnya

Ribuan senyawa organik baru ditemukan & disintesis, spt vitamin-2, obat-2an, serat sintetis, insektisida, kertas, tinta, bahan bakar, plastik, zat aditif, dll

SENYAWA PENTING UTK KEHIDUPAN

Mengapa senyawa organik / karbon dibahas tersendiri dlm ilmu kimia ?

Krn senyawa organik / karbon memiliki kekhasan

1. Senyawa yg sgt penting dlm kehidupan & penghidupan manusia.
2. Memiliki karakteristik khas yg tdk dimiliki oleh senyawa anorganik, yaitu dpt membentuk rantai C yg sangat panjang & bercabang-2. Atom karbon memiliki kemampuan mengadakan ikatan kovalen yg sgt kuat dg atom sesamanya dg menggunakan keempat elektron valensinya menghasilkan senyawa yg sgt banyak jumlahnya

2 1s

2 2s

2 2p

2 4

Elektron valensi

Lalu dimana istimewa atau kekhasan-nya ?

Suatu atom dgn elektron valensi 4 tdk dpt seluruhnya mengikat atom sejenis yg lain

Berapa banyak senyawa karbon dpt terbentuk, jika ada 100, 1000, dst-nya atom C yg dpt saling berikatan membentuk rantai lurus maupun bercabang ?

CONTOH
CCCCCCCC

CCCCCCC
Jika ada 8 atom C C CCCCCCC C CCCCCC C C Dst-nya

Mengapa 4 elektron valensi hrs berikatan dgn elektron dr atom lain ?

Semua atom agar stabil elektron terluarnya hrs menjadi delapan (aturan oktet), meskipun ada beberapa atom yg berelektron rendah mengikuti aturan duplet (mjd 2).

Konfigurasi oktet (8) atau duplet (2) dimiliki oleh atom-2 unsur gas mulia. Semua atom unsur ingin memiliki konfigurasi spt gas mulia, krn mrpkan konfigurasi elektron yg stabil

Utk mencapai konfigurasi tsb melalui cara berikatan dg atom dari unsur yg sama atau berbeda

1. Para ahli biokimia sel struktur sel. Robert Hooke pd abad 17 mengamati sel-sel dgn mikroskop shg terlihat struktur kompleksnya 2. Mikroskop elektron pd abad 20 pengamatan organel sel (mitokondria, kloroplas) & fungsinya semakin jelas menunjang pemahaman biokimia trtm struktur senyawa biokimia & identifikasi reaksi metabolik dlm sel. 3. Muncul ilmu genetika GEN (unit pembawa sifat-2 yg diturunkan oleh individu) Gregor Mendel (per1/2an abad 19) abad 20 gen tdp dlm kromosom meski blm dpt mengisolasi.

1. Kromosom diketahui terdiri dari protein & asam nukleat meski strukturnya blm diketahui pdhal pd th 1869 asam nukleat tlh dpt diisolasi Friedrich Miescher. 2. Pd awal abad 20 kebanyakan ahli biokimia berpendapat hanya protein dg struktur yg kompleks yg membawa informasi genetika, sedangkan asam nukleat dipandang sbg senyawa sederhana dlm sel. 3. Baru pd per1/2an abad 20 terbukti DNA pembawa informasi genetika.

Pd th 1953 JAMES WATSON DAN FRANCIS CRICK menjelaskan struktur DNA yg berbentuk double heliks.

Dpt dijelaskan bgmn informasi genetika dpt dilangsungkan shg dpt diketahui proses-2 kimia yg terjadi dlm sel.

Tubuh makhluk hidup

Terdiri dari organ2

Terdiri dr organel-2 sel yg di dlmnya terdiri dr biomolekul (polimer)

Terdiri dr jaringan2 yg mengandung sel hidup

Karbohidrat polimer sakarida Protein polimer asam amino Lipid polimer asam lemak

Monomer unsur-2

Tubuh makhluk hidup

Kumpulan unsur-2

Ada aliran yg mengatakan yg menyebabkan kumpulan unsur-2 yg merupakan zat tak hidup mjd hidup adalah NYAWA!! Lalu apa nyawa sebenarnya ? Dimana letaknya dlm tubuh?

Jika DNA dpt dibuat maka manusia akan dpt membuat makhluk hidup

Hal itu mustahil, krn jika kita dpt mengisolasi DNA dan kita tempatkan pada kondisi yg tidak sesuai saja DNA akan rusak & tdk berfungsi lagi!!

Ilmu kita memang hanya setetes air di tengah lautan, jadi mengapa kita sombong!!!

Namun penemuan DNA, gen, dan semua yg berkaitan dgn gejala kehidupan akhirnya melahirkan ilmu pengetahuan baru, yaitu

Abad 20 biokimia mengalami perkembangan pesat. Penelitian gizi penemuan vitamin Penemuan enzim sbg biokatalis bagi reaksi yg tjd dlm tubuh adlh protein Kemajuan analisis kromatografi, penemuan hasil antara (intermediet) dlm metabolisme, karbohidrat, lemak, struktur primer, sekunder, tersier & kuartener protein, struktur DNA & RNA arti penting dlm perkembangan BIOKIMIA

Manfaat biokimia tampak pd penerapan di bidang pertanian dan kedokteran CONTOH: Masalah gizi & penyakit kurang gizi. Menjelaskan hal-2 dlm bid farmakologi & toksikologi berhubg dgn pengaruh bahan kimia dr luar thd metabolisme Obat-2an mempengaruhi jalur metabolik tertentu misal antibiotik penisilin dpt membunuh bakteri shg menghambat pembentukan polisakarida pd dinding sel bakteri bakteri akan mati krn tdk dpt membentuk dinding sel.

Penggunaan pestisida di bid pertanian bekerja menghambat enzim yg bekerja pd hama/organisme tertentu biokimia berperan meneliti mekanisme kerja pestisida tsb shg dpt meningkatkan selektivitas shg dpt dicegah dampak negatif thd lingkungan hidup yg dpt ditimbulkannya. Peningkatan kualitas produk dlm bid pertanian & peternakan dgn penerapan genetika bibit unggul. Bagi kita mengeth reaksi-2 kimia penting yg tjd dlm sel mampu menghindari hal-2 dr luar yg akan mempengaruhi proses dlm sel tubuh mengatur pola makan, menghindari limbah pencemar lingkungan.

ASPEK BIOKIMIA

Karbohidrat

mengalami

Protein Suhu kamar

Lemak berupa

Monosakarida

Disakarida

Polisakarida

denaturasi

contoh
sukrosa amilum

monomernya minyak Asam amino jenuh Tidak jenuh

aldosa

ketosa

maltosa
laktosa

glikogen

contoh contoh
ribosa

Lemak hewani

selulosa berupa

Lemak nabati

fruktosa
glukosa galaktosa

esensial

Non esensial

Karbon yg mengandung hidrat dgn rumus umum Cn (H2O)m selain mengandung atom C juga mengandung atom H dan O dgn perbandingan 2 : 1 seperti pada air.

Pd karbohidrat atom H & O tdk terikat spt pd air & banyaknya senyawa-2 organik yg mempunyai perbandingan H & O yg sama, spt asam asetat & asam laktat. Oleh karena itu untuk menghindari salah pengertian para ahli kemudian cenderung menggunakan nama

1. Contoh: glukosa, fruktosa, galaktosa 2. Rumus umum (CH2O)n, n = 3 10, C = 5 - 6 3. Umumnya terdapat di alam 4. Berdasarkan gugus keton/aldehid, dibagi 2, yaitu aldosa dan ketosa 5. Jumlah atom C-nya 3 disebut triosa 6. Semua mono sakarida memiliki 1/lebih atom C asimetri 7. Struktur monosakarida memiliki 1 gugus aldehid pd atom C1 dan keton pd atom C2

O C H HO H H C C C C H OH H OH OH

O C H HO HO H C C C C H OH H H OH

H H C C HO H H C C C OH O H OH OH

CH2OH

CH2OH

CH2OH

d-glukosa

d-galaktosa

fruktosa

O C H HO H H C C C C H
CH2OH

OH H OH OH

H H OH OH H

H OH OH

-D-glukosa
CH2OH

d-glukosa

H H C C HO H H C C C OH O H OH OH
OH H CH2OH H OH H CH2OH O OH

D - fruktosa
CH2OH

fruktosa

1. Memiliki struktur terbuka 2. Memiliki struktur tertutup

1. Reaksi transformasi enediol dari Lobry de Bruyn

D-glukosa

enediol
D fruktosa

D mannosa

2. Reaksi mereduksi : adanya gugus aktif aldehid dapat mereduksi ion logam sbg dasar identifikasi kualitatif dan kuantitatif

3. Reaksi pembentukan ozazon, bila direaksikan dgn fenil hidrazin

D- glukosa D-glukosa fenil hidrazon hasil antara (intermediet) D-glukosa fenil ozazon. Demikian juga berlaku untuk fruktosa Selanjutnya ozazon akan dihidrolisis oleh HCl pekat menjadi ozon. Jika ozon direaksikan dg Zn dan asam asetat akan mereduksi gugus aldehid menjadi ketosa. 4. Reaksi adisi oleh HCN (sintesis kiliani) mjd cyanhidrin utk memperpanjang rantai karbon

5. Pembentukan asam gula dgn oksidasi air brom akan terjadi 3 macam asam, yaitu asam aldonat, asam aldarat, dan asam uronat.
6. Reaksi asam terhadap monosakarida, Pd umumnya monosakarida relatif stabil dlm asam encer pd pemanasan singkat, tp untuk ketosa akan mengalami dekomposisi pd pemanasan yg lebih lama.

Bila konsentrasi asam diperbesar, monosakarida akan mengalami dekomposisi.

7. Pembentukan glikosida

Gula sederhana direaksikan dgn alkohol dgn katalisator HCl. Pada atom C1 mengikat OR (hidroksil).

CONTOH:

Glikosida saponin: gula + sapogenin Glikosida indican: glukosa + indoxyl Glikosida plorizin: glukosa + ploretin

Monosakarida yg terdapat di alam banyak bersifat optik aktif. Contoh paling sederhana gliseraldehid, terdapat 1 pusat khiral, shg dpt membentuk 3 isomer optik yg berbeda. Aldoheksosa memiliki 4 pusat khiral, shg dapat berada dlm 2n = 24 = 16 stereo isomer yg berbeda. Penggambaran struktur heksosa terdapat 3 cara, yaitu rumus proyeksi, rumus Haworth, & rumus konformasi. Jika 2 gula berbeda konfigurasi pd 1 atom C spesifik, senyawa tsb dinamakan EPIMER. Contoh: D-glukosa & D-mannosa epimer pd atom C2, D-glukosa & D-galaktosa epimer pd atom C4.

Contoh: sukrosa, maltosa, laktosa

Ke2 unit monosakarida digabungkan dgn ikatan kovalen yg disebut IKATAN GLIKOSIDA, yaitu gugus hidroksil pd salah 1 gula bereaksi dgn karbon anomer pd gula ke-2. Ikatan glikosida segera terhidrolisis oleh asam encer, tetapi tahan thd basa, shg dihasilkan monosakarida bebas.

Dibentuk oleh tanaman (tebu, biet, buah-buahan) mrpk gula paling manis drpd disakarida yg lain.

Terdiri dari monosakarida -D-glukopiranosa dgn -D-fruktofuranosa, ikatan pd C 1-2 (kita sering menyederhanakan sukrosa terdiri dari glukosa dan fruktosa).
Tdk dpt mereduksi, shg tdk dpt dioksidasikan Cu2+, bila dipanaskan suhu 200oC mjd kental spt sirup dan disebut

CH2OH H H H OH H OH O H CH2OH H H O OH

O
OH H

CH2OH

Disakarida plg sederhana mengandung 2 residu D-glukosa, dihubgkan oleh ikatan glikosida C 1 4
Mrpk disakarida pereduksi krn mengandung OH bebas yang diperoleh dari hasil pemecahan: amilase Pati air liur Bila masuk usus: maltase Maltosa maltosa

D - glukosa

CH2OH H H O H H

CH2OH O H H OH OH H OH OH H OH H

OH
OH H

OH

- D - Glukosa
CH2OH H H H OH H OH O H

- D - Glukosa
+ H2O

CH2OH O H OH H OH H OH H

IKATAN GLIKOSIDA

MALTOSA

Terdapat dlm susu, mrpk gabungan -D-galaktopiranosa dan -D-glukopiranosa dgn ikatan C1-4
Mrpk disakarida pereduksi krn mengandung OH bebas. Dlm proses pencernaan dihidrolisis enzimatik oleh enzim laktase (dr sel mukosa usus) mjd glukosa & galaktosa. Trisakarida = rafinosa (fruk-gluk-gal), gentianosa (fruk-fruk-gluk) Tetrasakarida = skhiosa (gal-gal-gluk-fruk).

CH2OH OH H OH H H OH H O

OH OH

O
OH H O CH2OH H

Sukrosa + air glukosa + fruktosa Maltosa + air glukosa + glukosa Laktosa + air glukosa + galaktosa

Polisakarida mrpk polimer dr heksosa dgn rumus molekul (C6H10O5)n. Karbohidrat yg tmsk polisakarida antara lain amilum, glikogen dan selulosa.

Terdiri atas molekul-2 monosakarida Contoh: pati, dekstran, glikogen, selulosa. Karbohidrat di alam terdapat sbg polisakarida dgn BM tinggi, memiliki fungsi macam-2 (sbg penyimpan monosakarida, sbg unsur struktural dinding sel dan jaringan pengikat). Mengalami hidrolisa sempurna oleh asam/enzim spesifik menghasilkan monosakarida. Jika polisakarida tdr 1 jenis unit monosakarida disebut HOMOPOLISAKARIDA, contoh: D-glukosa saja PATI (AMILUM) Jika polisakarida tdr dr 2/lebih unit monosakarida disebut HETEROPOLISAKARIDA, contoh: 2 unit gula berganti-2 hialuronat pd jaringan pengikat, polisakarida penyimpan pati pd tanaman dan glikogen pd hewan.

Terdiri dari -amilosa dan amilopektin -amilosa merupakan rantai lurus dari Dglukosa dgn ikatan 1 - 4
Amilopektin merupakan rantai bercabang dgn ikatan 1 4 & pd percabangan dgn ikatan 1- 6.

Amilum/zat tepung (pati) tdpt dlm umbi-2an, jagung, beras & gandum. Hidrolisis amilum dgn katalis asam/enzim maltase akan menghasilkan glukosa. Dlm ludah & cairan yg dikeluarkan oleh pankreas tdpt amilase yg bekerja thd amilum yg tdpt dlm makanan kita. Oleh enzim amilase, amilum diubah menjadi maltosa.

Amilum dpt dibentuk oleh tumbuhan mll proses fotosintesis. Proses fotosintesis yg berlangsung dgn bantuan sinar matahari akan membentuk glukosa. Namun krn glukosa mudah larut dlm air, tumbuhan mengubahnya sebagian mjd amilum yg kmd disimpan dlm akar, batang, biji & daun. Amilum mrpk polimer dr glukosa dimana glukosa yg terikat berkisar antara 200 3000 unit. Berbagai macam pati memiliki sifat yg berbeda adanya perbedaan panjang rantai C-nya serta lurus/bercabang rantai molekul gluk yg dimiliki.

Amilum terdiri atas dua fraksi yg dpt dipisahkan dgn air panas, yaitu -amilosa dan amilopektin. -amilosa fraksi yg larut dlm air, sedangkan amilopektin fraksi yg tdk larut dlm air. -amilosa dan amilopektin sama-2 mengandung monomer D - glukosa. Perbedaannya terletak pd bentuk rantai & jumlah monomer D - glukosa.

-amilosa rantai lurus yg membtk gulungan spt spiral & mengikat 1000 molekul D-glukosa.

Amilopektin rantai yg bercabang & mengandung 100 unit glukosa pd rantai induknya & 20 25 unit pd cabangnya. Amilopektin sukar larut dlm air, shg bila kita melarutkan amilum dlm air akan terbentuk koloid.

Pereaksi yg biasa digunakan utk menguji amilum adalah larutan iodin yg lebih dikenal dgn lugol. -amilosa akan menunjukkan warna positif biru bila beraksi dgn lugol senyawa kompleks yg terbentuk akibat reaksi antara larutan iodin dgn amilosa. Amilopektin akan membentuk senyawa kompleks lain bila bereaksi dengan lugol.

Amilum sukar larut dlm air dingin dan dlm air panas akan membentuk larutan koloida.
Larutan koloida amilum dpt bereaksi dgn larutan iodium membentuk iodamilum yg berwarna biru.

Mrpk polisakarida utama pd sel hewan, terdiri D-glukosa bercabang dgn ikatan 1 4 spt struktur amilopektin, tetapi percabangan lebih banyak & struktur lebih kompak.

Pati dan glikogen dlm saluran pencernaan dapat dihidrolisis dgn bantuan enzim amilase, shg memecah ikatan 1 4 pd cabang luar. Terbentuk D-glukosa + maltosa + dekstrin yang dihidrolisis dgn bantuan glukosidase memecah ikatan cabang 1 6 hingga terbentuk glukosa + maltosa

Glikogen mrpk karbohidrat yg tersimpan sbg cadangan makanan dlm tubuh manusia/hewan, misalnya dlm hati & otot. Dlm tubuh, glikogen dpt terhidrolisis & menghasilkan glukosa. Glikogen mudah larut dlm air panas & larutannya dpt mereduksi reagen Fehling. Hati mrpk tmpt pembentukan glikogen dr glukosa. Jk kadar gluk dlm darah ber+, sebagian diubah mjd glik shg kadar glukosa dlm darah normal kbl.

Sebaliknya jk kadar gluk dlm darah menurun, glik dlm hati akan diuraikan mjd gluk kembali, shg kadar glukosa dlm darah kembali normal.
Glik yg ada dlm otot digunakan sbg sumber energi utk melakukan aktivitas sehari-hari. Di alam glikogen terdapat pada kerang dan alga atau rumput laut.

Selulosa terdapat dlm tumbuhan sbg bahan pembentuk dinding sel.

Dlm tubuh selulosa tdk dpt dicerna, krn kita tdk memiliki enzim yg dpt menguraikan selulosa.
Dgn asam encer tdk dpt terhidrolisis, tetapi oleh asam dgn konsentrasi tinggi akan terhidrolisis mjd selobiosa dan D - glukosa.

Meskipun selulosa tdk dpt digunakan sbg bahan makanan oleh tubuh, namun selulosa yg tdpt sbg serat-2 tumbuhan, sayuran atau buahbuahan berguna untuk memperlancar pencernaan makanan. Adanya serat dlm saluran pencernaan, gerak peristaltik ditingkatkan, shg memperlancar proses pencernaan. Selulosa banyak tdpt dlm kayu, jerami, kapas, & sutra. Sering digunakan untuk membuat kertas, rayon, serat sintetis, dan bahan bangunan.

Mrpk unsur struktural ekstra sel pd dinding sel tumbuhan, sifatnya spt serabut, liat, tdk larut dlm air.

Mrpk homopolisakarida linear tdk bercabang, tdr dr 10.000/lebih unit D-glukosa dgn ikatan 1-4
CONTOH; kayu, katun, kertas, kulit udang, kepiting, insekta (polisakarida khitin), tdr dr Nasetil D-glukosamin dgn ikatan 1-2

Pd bakteri, dinding sel sebelah luar membran sel membentuk pembungkus yg kuat.

Tdr dari polisakarida (N-asetil D-glukosamin) bercabang diselingi dgn polipeptida (pentapeptida residu glisin) membentuk

Peptidoglikan pd bakteri dpt dihambat pertumbuhannya oleh penisilin

Kau karbohidrat untukku Sumber energi baru Untuk aktivitasku Karbohidratku ku butuhkan Sumber energi dari makan Di setiap hari kubutuh pangan Sukrosa itu salah satunya Ada di gula sakarida Terurai jadi fruktosa glukosa Maltosa jadi dua glukosa dan Laktosa jadi galaktosa dan juga glukosa Kau glukosa dan fruktosa Juga kau galaktosa Kau monosakarida Kau sukrosa dan maltosa Dan juga kau laktosa Kaulah disakarida Kau contoh poliskarida Amilum, selulosa Dan glikogen disana Tak dapat diurai dia Karna kompleks strukturnya Banyak sakaridanya

Kala cinta berlabuh dihatiku Semanis glukosa yang tersimpan di kalbu Tak terhidrolisis oleh air yang mengenaimu Karna kau monosakarida yang ku tunggu Betapa bahagia hatiku dekat denganmu Kau tandai cinta dengan cincin ungu Bak diriku tersiram Molisch di labu Tunjukkan tanda positif cintamu Kekasihku fruktosa yang pemalu Kita berdua dalam jalinan sukrosa yang baru Pegang erat dalam kristal gula seputih salju Meski larut tapi kita tetaplah satu Namun sayang cintaku terpolarisasi Berbeda arahku karena hidrolisis terjadi Jadikan kita mengalami inversi Terkekang dalam buah kaleng sendiri Ku coba bangkit dan raih teman sejenis Melalui ikatan glikosida ku merintis Bentuk maltosa yang manis seperti buah manggis Bayipun senang padaku sampai meringis

Sayang cintaku putus di tengah jalan Hingga ku takut membina masa depan Namun ku tak mampu tolak galaktosa yang mapan Tawarkan bahagia dalam laktosa keceriaan Ku reguk nikmatnya berpacaran dengannya Tak terasa glikogen mengendap di jiwa Hingga ku tak dapat bernafas tiba-tiba Meski serat selulosa membantu melegakannya Perjalanan cintaku kini berakhir Direduksi Benedict dan Fehling yang mengalir Hingga kalbuku terasa berdesir Hidupku pun jadi kocar-kacir Kini hatiku tlah mengharu biru Sebiru amilum tetesi iodium hatimu Ku coba lupakan kisah cinta laluku Agar aku dapat berjalan trus maju

BURUNG IRIAN BURUNG CENDERAWASIH CUKUP SEKIAN TERIMA KASIH