Professional Documents
Culture Documents
4. Molekul A yang tengah didelete 5. Menyisakan 2 molekul A, molekul A yang terletak paling bawah terdiri dari "Hem" dan "S58",
6. Ditambahkan Hydrogen, Edit > Add > Hydrogen to : All, Gambarnya sebagai berikut :
7. Disimpan file sebagai Yasara Object, File > Save as > Yasara Object > Filename : 6COX.yob 8. Delete Ligan asli (Untuk menyisakan protein target saja), Edit > Delete > Residue > Pilih nama S58 > Pilih All
9. Disimpan sebagai protein.mol.2, File > Save as > Other Format 10. File > New > Klik yes 11. File > Load > Yasara Object > Browse file 6COX.yob 12. Edit > Delete > Residue 13. Seperti perintah No.8 (ditambah negate name diaktifkan/dicentang) 14. Disimpan sebagai ref_ligand.mol2