Biasanya terjadi pada bayi prematur ataupun imatur,misalnya pada ibu yang menderita diabetes mellitus, atau pada

ibu eklamsia dengan pemberian terapi magnesium sulfat, dimana didapatkan obstruksi kolon secara fungsional. Secara teoritis, timbulnya obstruksi fungsional dapat diterangkan sebagai berikut hipermagnesium menyebabkan berkurangnya pengeluaran asetilkolin dan selanjutnya terjadi depresi myoneural. Akibatnya timbul hipomotilitas kolon. Keadaan hipoglikemia pada bayi dengan ibu diabetes akan merangsang pembentukan glukagon sehingga terjadi penurunan aktivitas usus. Pleksus myenterikus yang imatur akan menyebabkan hipomotilitas kolon. Hipomotilitas kolon dapat meningkatkan absorbsi air. Perubahan ini cenderung dapat menyebabkan terjadinya plug / sumbatan. Obstruksi biasanya terjadi pada colon desenden atau rektosigmoid, dapat disebabkan oleh imaturitas sel ganglion kolon yang normal.