TRIA WULAN G84100075 KELOMPOK 2

1. Pohon Filogenetik

Gambar 1 Pohon filogenetika yang diperoleh dari program MEGA Program MEGA berfungsi untuk mengetahui kekerabatan secara genetik dari suatu spesies. Dari pohon filogenetika yang diperoleh dari 9 sekuens yang telah ada bahwa cellulase Melanocarpus albomyces memiliki kekerabatan paling dekat dengan cellulase Caldicellulosiruptor saccarolyticus. Sedangkan kekerabatan yang paling jauh diperoleh dari cellulase Agaricus bisporus dengan cellulase partial Baccillus subtilis. 2. PhotocapMW

Gambar 2 Hasil analisis bobot/pasang basa pada program PhotocapMW

TRIA WULAN G84100075 KELOMPOK 2

PhotocapMW merupakan program pada komputer yang digunakan untuk menganalisis dan mengkuantifikasi hasil dari gel elektroforesis. Program ini juga dapat digunakan untuk menghitung jumlah koloni bakteri pada media. Namun pada percobaan kali ini digunakan untuk menganalisis hasil pita yang terbentuk dari gel elektroforesis yang telah dirunning. Berdasarkan hasil analisis yang dilakukan pada gel elektroforesis yang telah tersedia (Gambar 2), dihitung jumlah pita (amplikon) yang terbentuk dari 7 sumur (lane). Sumur paling kanan merupakan marker, dan 6 sumur lainnya merupakan dari sampel DNA. Ukuran marker value yang digunakan yaitu (dalam bp) yaitu 1500, 1300, 1000, 800, 400, 300, 200, dan 50. Sedangkan untuk dimasukkan kedalam PhotocapMW dirubah dahulu menjadi kb. Pada sumur pertama (paling kiri) diperoleh 2 buah amplikon dengan ukuran 0.743 kb dan 0.336 kb. Untuk sumur kedua diperoleh 2 buah amplikon dengan ukuran 0.815 kb dan 0.050 kb. Untuk sumur ketiga diperoleh 2 buah amplikon dengan ukuran 0.672 kb dan 0.062 kb. Untuk sumur keempat diperoleh 3 buah amplikon dengan ukuran 0.496 kb, 0.359 kb, dan 0.062 kb. Untuk sumur kelima diperoleh 2 buah amplikon dengan ukuran 0.300 kb dan 0.119 kb. Untuk sumur yang keenam diperoleh 2 buah amplikon dengan ukuran 0.680 kb dan 0.091 kb. Ukuran terbesar pita terletak pada bagian atas dan semakin ke bawah ukurannya semakin mengecil.

3. VMD