TEMA 4. NATURALEZA QUMICA DE LOS ENZIMAS.

Especificidad de los enzimas.

Los enzimas son protenas catalticas. Casi todas las reacciones celulares estn catalizadas. Alguna actividad cataltica no reside en las protenas sino en el RNA, es el caso de la ribozima que tiene parte de RNA y parte proteica aunque la catlisis la efecta el cido nucleico. Esto tiene una importancia evolutiva pues demuestra que el RNA catalizaba antes que los enzimas que luego se especializaron. El RNA es peor catalizador. La funcin de los enzimas ests relacionada con la unin de un ligando que ser el sustrato. Se forma complejo enzima-sustrato, que luego se convierte en producto:

enzima + sustrato enzima-sustrato enzima + producto

Como es un catalizador el enzima no se consume, acelerando la velocidad de reaccin sin modificar la posicin de equilibrio. Las propiedades que tienen los enzimas que los hacen efectivos como catalizadores son:

- Capaces de acelerar las reacciones en las condiciones suaves de la clula.

- Alto poder cataltico por su gran actividad molecular, aceleran las reacciones hasta 1017 veces. Esto es

porque se une al sustrato en relacin 1:1 y la reaccin que ocurre en los confines de ste ve rebajada su energa de activacin como consecuencia de esa unin.

- Son muy especficos respecto a.

a) Tipo de reaccin: ya que no son catalizadas reacciones de naturaleza distinta.

b) Respecto al sustrato: el enzima no puede unirse con cualquier sustrato. Hay enzimas ms especficos que otros. La especificidad puede ser tan alta que se distinga entre estereoismeros. Sin embargo los enzimas digestivos son poco especficos porque si no haran falta demasiados. La ventaja de la especificidad reside en que se pueden catalizar muchas reacciones a la vez sin reacciones laterales ni que se acumulen los productos secundarios.

Centro activo.

El sitio de unin del ligando est muy bien definido. En l habrn distintos residuos que aporten los grupos funcionales necesarios para cada funcin:

- Residuos catalticos: son capaces de llevar a cabo la catlisis.

- Residuos de unin: aportan soporte para unir el enzima a su sustrato y no a otro.

- Residuos que participan en la estructura tridimensional.

La protena al plegarse determina el centro activo que ser una cavidad hidrofbica (ambiente especial). No habr agua si no participa en la reaccin. Se crea un microambiente especial para que los grupos catalticos sean ms reactivos. <<la unin del centro activo y el enzima es la base de la especificidad.

Proposicin de Fisher: Un enzima distingue un sustrato igual que una cerradura y una llave. El sustrato y el centro activo son complementarios. El centro activo slo es complementario cuando se a unido al sustrato, no

antes.

Hiptesis de Koshland: ajuste inducido. El sitio activo es complementario despus de la unin. Un sustrato correcto induce un cambio de conformacin adecuado y uno malo no. Cuando se produce la unin el sustrato queda unido al centro activo de manera determinada por lo que tiene menos movilidad que en entorno acuoso. La posicin ser la adecuada para que los grupos catalticos estn lo mejor orientados posible. La actividad molecular es muy alta porque es la mejor posicin para que acten los grupos catalticos. Los sustratos pasan por un estado de transicin tras superar la energa de activacin antes de convertirse en productos. El catalizador ayuda a alcanzar ese estado de transicin por lo que la reaccin ocurre. El enzima es complementario del estado de transicin. Si la funcin del enzima debe estar regulada puede tener moduladores.

Cofactores.

A veces se necesitan grupos catalticos que no se encuentran en los aminocidos por lo que se necesita una molcula extra, un cofactor, que puede ser inorgnico (iones en general) u orgnicos. Estos ltimos pueden estar unidos reversiblemente (coenzimas) o permanentemente (grupo prosttico).

Catlisis de la hidratacin de CO2 por la anhidrasa carbnica (que contiene Zn2+): CO2 + H2O H+ + HCO3-

Zn2+ Como ninguna cadena lateral de los aminocidos puede formar OH el Zn aporta lo que se necesita. El Zn se

une al H2O y luego se separan: Zn --- H - O - H Zn --- H - O- + CO2 Zn2+ + HCO3H+ Los enzimas que catalizan reacciones redox necesita algn grupo donde transportar los electrones y no hay

ninguna cadena lateral de aminocido que pueda, por lo que necesita un cofactor. Muchos cofactores deben ser ingeridos porque la clula no los sintetiza. Las vitaminas suelen ser cofactores o precursores de cofactores. Las vitaminas B2 y B3 son precursores de cofactores redox.

Clasificacin de los enzimas.

Cada enzima es nombrado por 4 dgitos: EC a.b.c.d. a.- Clase de enzima atendiendo a la clase de reaccin que catalizan: 1.- Oxidorreductasas: participan en reacciones redox. 2.- Transferasas: catlisis de transferencias de grupos. 3.- Hidrolasas: hidrlisis. 4.- Liasas: adicin de grupos para formar dobles enlaces o eliminacin de grupos para formar dobles enlaces.

5.- Isomerasas: isomerizacin cambiando de sitio los grupos.

6.- Ligasas: formacin de enlaces que requieren aporte de ATP b.- Tipo de grupo que interviene. c.- Clase de sustrato sobre el que actan. d.- Orden de clasificacin. Normalmente se utiliza el nombre del sustrato y el tipo de reaccin. Las oxidorreductasas se conocen tambin

por deshidrogenasas.