prin structura primar a polipeptidelor se nelege

secvena aminoacizilor (succesiunea lor)

ex. gly-gly-ser-ala

structura secundar
atomii de carbon chirali din poziia au
substituenii H i R
de o parte si de cealalt a catenei
atomii de hidrogen legai de azotul amidic
pot forma legturi de hidrogen
intra- sau intermoleculare
polipeptidele nu au o structur liniar ci
adopt forme plisate sau spiralate
n acest din urm caz catena polipeptidic este ncolcit
n form de spiral sau elice,
numit de Pauling i Corey elice ( helix)
resturile R sunt
orientate spre exteriorul elicei format
din resturile polipeptidice plane
astfel nct s
permit formarea legturilor de hidrogen
intramoleculare ntre spirale
structuri teriare
ntr-o elice cu caten mai lung se stabilesc i
legturi slabe ntre resturile R
provocnd ncolciri meninute rigid
Legturile pot fi :
- de tip van der Waals
- de hidrogen
( fiind implicate gruprile COOH din aminoacizii dicarboxilici )
- legturi covalente S - S
- de natur electrostatic ( H
3
N
+
i COO
-
)
prin asocierea mai multor structuri teriare
rezult agregate complexe
formate din mai multe tipuri de helixuri
uneori combinate i cu alte molecule
structura cuaternar reprezint
conformaiile rezultate din asocierea
intermolecular a helixurilor diferite

Peptidele inferioare au
proprieti asemntoare cu aminoacizii

uor solubile n ap
insolubile n alcool
au caracter amfoter i au
puncte izoelectrice caracteristice



Proteinele pot fi :

- solubile n ap sau soluii de electrolii

dintre proteinele solubile menionm:
- albuminele - solubile n ap
- globulinele - solubile n soluii de electrolii
- insolubile
proteinele insolubile sunt cele
fibroase sau de schelet
dintre proteinele insolubile menionm
cele din organismul animal
n pr (keratine)
n tendoane i esuturi conjunctive
colagen, elastin
n mtasea natural (fibroina)
proteinele fibroase
nu sunt digerate de enzimele implicate n digestie i
nu au valoare nutritiv
n majoritatea proteinelor fibroase exist puni S - S
Denaturarea proteinelor
const n
modificarea structurii cuaternare i teriare
sub influena diverilor factori exteriori
denaturrile pot fi :
- reversibile (modificri de pH )
cnd schimbrile conformaionale nu sunt prea profunde
i proteina denaturat poate reveni la starea iniial
(renaturare)
refcndu-se n acelai timp i eventuala activitate
fiziologic
- ireversibile

sub influena pH-ului, a radiaiilor UV,
a cldurii i solvenilor
(transformarea albuminei din albuul de ou
la nclzire, ntr-o protein insolubil)

proteinele cu activitate fiziologic o pierd prin
denaturare (vezi enzime, hormoni, anticorpi).
Fritz Haber

a luat premiul Nobel n 1918 pentru
sinteza amoniacului din elemente

considerat tatl armelor chimice - a fost coordonatorul
programului german de
producere a substanelor toxice de lupt
a utilizat n premier clorul pe front

aciunea iperitei (gaz mutar) asupra proteinelor
o reacie de alchilare a proteinelor
cu ajutorul ,' - diclor-dietiltioeterului (iperit)
folosit pentru prima dat de armata german
n iulie (sept.?) 1917 la Ypres (Belgia)
iperit
practic inodor (slab miros de mutar sau hrean)
produce efecte dup 12 ore
intrat n sol, rmne activ timp de cteva sptmni

aciune iritant a iperitei asupra pielii i mucoaselor

cca. 400 000 de victime
spontan, are loc n tioeter o reacie SN
2
intramolecular,
cu formarea unei cloruri de sulfoniu
- deosebit de reactiv datorit
activrii induse de prezena ciclului de 3 atomi
clorura reacioneaz imediat cu un nucleofil
- care poate fi o grupare - NH
2
dintr-o
molecul de
lizin aparinnd unei proteine
proteina se alchileaz
DETERMINAREA STRUCTURII
PEPTIDELOR
primii pai n determinarea structurii
primare a peptidelor sunt:

hidroliza lor la aminoacizi,
estimarea lor calitativ (care aminoacizi)
i
cantitativ (ct %).

procedura este complet automatizat
nainte de hidroliz,
peptida sau proteina trebuie purificat
trebuiesc rupte punile disulfidice

acest lucru se realizeaz prin
oxidare la acizi sulfonici



R
1
S S R
2
R
1
SO
3
H + R
2
SO
3
H
purificarea fragmentelor se realizeaz prin
tehnici cromatografice

- dializ
- filtrare pe gel
- electroforez
- cromatografie de afinitate .a.
apoi,

peptidele sunt hidrolizate cu
HCl 6N la 105 - 110
o
C

mediul bazic nu poate fi folosit din cauza
racemizrilor care pot avea loc la atomii de C

amestecul de aminoacizi obinut n urma
hidrolizei se separ i se analizeaz n
"analizorul de aminoacizi"
el este trecut printr-o

coloan cu schimbtori de ioni acizi (pH 5,3)

pentru aminoacizii bazici, amoniac i triptofan,

i apoi prin alta,

meninut la pH 3,25 pentru ceilali aminoacizi

o soluie tampon citrat va elua aminoacizii,
soluiile eluate fiind amestecate cu
ninhidrin i nclzite
el este trecut printr-o

coloan cu schimbtori de ioni acizi (pH 5,3)

pentru aminoacizii bazici, amoniac i triptofan,

i apoi prin alta,

meninut la pH 3,25 pentru ceilali aminoacizi

o soluie tampon citrat va elua aminoacizii,
soluiile eluate fiind amestecate cu
ninhidrin i nclzite
dup identificarea i dozarea aminoacizilor,
etapa urmtoare o constituie
determinarea secvenei lor de legare n peptid
determinarea aminoacizilor N - terminali
poate avea loc cu
Sau fr hidroliza peptidei
1. metoda Sanger
reacia cu 1-fluoro-2,4-dinitrobenzenului i
hidroliza ulterioar a peptidei
un procedeu alternativ pentru determinarea
aminoacidului N - terminal care
nu are loc cu hidroliza peptidei
poart numele de degradare Edmann

peptida reacioneaz cu fenilizotiocianat
pentru a da un N - feniltiocarbamil-derivat
la tratarea acestuia
cu HCl n nitrometan sau acid acetic
se formeaz un derivat de tiohidantoin
fr ca
celelalte legturi din peptid s fie afectate

procesul se reia,
de fiecare dat "tindu-se" cte un aminoacid N - terminal
care se izoleaz sub forma unui derivat de tiohidantoin
se poate apela, n prealabil, i la o
scindare enzimatic
are avantajul c
este foarte selectiv

unele enzime vor scinda, de ex.
numai anumite legturi carboxilice
ale unor aminoacizi
identificarea extremitii C - terminale
peptida se poate nclzi cu
hidrazin anhidr
pentru a nlocui legturile amidice cu
grupri hidrazidice
aminoacidul terminal este identificat ca acid liber,
pe cnd ceilali ca hidrazide