Caryotype de la drosophile Exemples de marqueurs phénotypiques

X 2L 2R 3L 3R 4
Nom du mutant nom complet phénotype

ry rosy yeux roses

X Cy curly ailes recourbées

Sb stubble soies courtes
ubx ultrabithorax altères plus grandes
Y e ebony corps noir
Sexe déterminé par : Ser serrate ailes entaillées
nkd naked cuticle cuticule nue
nombre de chromosome X / nombre de jeu d’autosomes
cnbw cinnabar brown yeux blanc
ratio 0,5

ratio 1

Nomenclature

f ; cn bw ; tra
bw pour brown bw+ pour l’allèle sauvage +
récessif
cn pour cinnabar cn+ pour l’allèle sauvage
f (forked) allèle récessif présent sur les deux chromosome X (homozygote)
dominant Sco pour scutoid Sco+ pour l’allèle sauvage
cn (cinnabar) allèle récessif présent sur les deux chromosome 2 (homozygote)
bw (brown) allèle récessif présent sur les deux chromosome 2 (homozygote)

tra (transformer) allèle récessif present sur un des chromosomes 3 (hétérozygote)

homozygote bw hétérozygote bw+ ou bw/bw+
bw

Réarrangements chromosomiques Chromosomes balanceurs

Inversion Les balanceurs sont nommés avec une lettre qui correspond au chromosome
In (1) sc4 Inversion sur le chromosome X appelée sc4 pour scute-4 - un M pour inversion multiple
F pour first (X)
Délétion S pour second
+
- un chiffre et parfois une lettre minuscule
Df (3R) P14 Délétion (deficience) d ’une partie du bras droit du T pour third pour le classer dans une série
chromosome 3 appelée P14 pour pasadena 14
Le nom du balanceur est ensuite suivi par les symboles génétiques des
Translocation
principaux marqueurs portés par lui
T (1;4) Bs Translocation entre le 1er et le 4ème chromosome
conduisant à un phénotype appelé Bar of stone FM7a dont le nom complet est In (1) FM7 ; y31d sc8
porte les allèles récessifs
inversion sur le chromosome 1 appelée FM7 y31d (yellow) et sc8 (scute)
Transposition
Transposition d’un morceau du 3ème chromosome
Tp (3;1) ry35 dans le chromosome X conduisant à un phénotype TM3 dont le nom complet est In (3LR) TM3 ; y+ ri pp sep bx34e e
mutant appelé rosy porte l’allèle sauvage y+ de yellow
inversion sur le chromosome 3 et les allèles récessifs
appelée TM3
entre les bras gauche et droit ri (radius incompletus)
pp (pink peach)
sep (sepia)
bx34e (bithorax)
e (ebony)
 Elément P
2907 pb répétition terminale inversée

ACGTCTCGA-----------------AGCTCTGCA
TGCAGAGCT-----------------TCGAGACGT
0 1 2 3
cible
NNATGCATTANN
NNTACGTAATNN
tissus somatiques 0 1 2 Répresseur (66 kDa)
NNATGCATTA NN
tissus germinaux 0 1 2 3 Transposase (87 kDa) NN élément P TACGTAATNN

répétition directe de 8 pb
0 1 2 3

NNATGCATTA ATGCATTANN
NNTACGTAAT élément P TACGTAATNN
excision

1. Elément P incomplet ne codant pas pour la transposase 0 3

⇒ pas de transposition

excision

2. Elément P incomplet ne codant pas pour la transposase 0 3

plus élément P codant pour la transposase

Il a possibilité d'activation en trans transposase activation en trans transposase

⇒ transposition de l'élément incomplet

0 1 2 3 0 1 2 3

excision

Mutagenèse insertionnelle
élément transposable
2 3 3
31 ry+ amp ori 31 In (2LR) O, Cy, P[ry+] ; ry506 Sb P[ry+ ∆2-3]
X
+ ry506 TM6, Ubx
Cy Sb, Ubx
Appelé P[ry+] et porté par le chromosome balanceur 2 3 3
pour le chromosome 2 In (2LR) O, Cy In (2LR) O, Cy, P[ry+] ; Sb P[ry+ ∆2-3] ry506
X
Cy, Sb + ry506 ry506
Ubx+, ry+ ry
source de transposase

Sélectionner les individus Sb+, Cy+ et ry+ qui peuvent avoir des insertions (*)
0 1 2 3 ry+
1 2 3 1 2 3
+* ; +* ; ry506* +* ; +* ; ry506*
Appelé P[ry+ ∆2-3] et porté par un chromosome 3 Y ; + ; ry506 + ; + ; ry506
qui comporte la mutation Sb

Sauvetage du plasmide ("plasmid rescue") Capture de gènes par des amplificateurs

1. Digestion par une enzyme de restriction

construction région chromosomique
31 ry+ amp ori 31 gène contrôlé par l’amplificateur
promoteur faible
amplificateur

2. Circularisation et transformation de bactéries 31 P lacZ+ 31

Site d’intégration de l’élément P

3. Séquençage

amplificateur

31 P lacZ+ 31
 Exemples de croisements génétiques chez la drosophile

1. Rendre une souche isogénique : exemple pour le chromosome 2

In (2LR)O, Cy In (2LR)O, Cy
cnbw In (2LR)O, Cy X
cnbw Sco
cnbw X Sco
Dans le même flacon on aura en F2 entre autre

In (2LR)O, Cy
X In (2LR)O, Cy
On sélectionne les Cy et pas Sco i.e. :
cnbw cnbw
In (2LR)O, Cy ou In (2LR)O, Cy
cnbw cnbw
In (2LR)O, Cy cnbw
F3 In (2LR)O, Cy
On les croise individuellement In (2LR)O, Cy cnbw cnbw

Sélectionner les et qui ont les yeux blancs

2. Rechercher de nouveaux allèles 3. Rechercher des mutations létales récessives

e X TM6, Ubx
e Sb
cnbw In (2LR)O, Cy
X
cnbw DTS-91
e e
F1 et Sb
Marqueur dominant
TM6, Ubx létal conditionnel

cnbw* cnbw*
[Ubx+, Sb] [Ubx, Sb+] In (2LR)O, Cy
et
DTS-91

On prend les [Ubx+, Sb] (i.e. e/Sb) et on les On récupère les Cy et on les croise individuellement

croise individuellement avec des nkd

TM3, Ser cnbw* X In (2LR)O, Cy
In (2LR)O, Cy DTS-91

e* nkd Croissance à 29°C ⇒ les drosophiles DTS meurent pendant

X
Sb TM3, Ser le développement. Il faut également éliminer les parents.

4 In (2LR)O,Cy
1 2 3 Dans le flacon il ne reste que des drosophiles
cnbw
*
F2 e* e* Sb Sb
nkd TM3, Ser nkd TM3, Ser In (2LR)O, Cy In (2LR)O, Cy
X cnbw*
[Ser+, Sb+] [Ser, Sb+] [Ser+, Sb] [Ser, Sb] cnbw*

e* e* cnbw* In (2LR)O, Cy In (2LR)O, Cy

X
TM3, Ser TM3, Ser cnbw* cnbw* In (2LR)O, Cy
stock balancé yeux blancs létal
e* e* TM3, Ser
e* TM3, Ser TM3, Ser
létal létal