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Apuntes de Bioquímica 2

Apuntes de Bioquímica 2

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Apuntes de Bioquímica (2º Biología 2º cuatrimestre)
Apuntes de Bioquímica (2º Biología 2º cuatrimestre)

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1
 
TTeemmaa1199
 
IInnrroodduucccciióónnaallMMeeaabboolliissmmoo
 
Introducción: energía en los seres vivos
 
Los seres vivos:
 
Desarrollan trabajo para permanecer vivos, crecer y reproducirse.
 
Tienen capacidad para aprovechar energía y canalizarla en trabajo biológico.
 
Realizan diversidad de conversiones de una forma de energía en otra(transducciones de energía).En la célula nada se hace sin energía, a excepción de la difusión pasiva, que no vale demucho por lo lenta que es. Es más, hasta el transporte de vesículas entre los orgánulosrequiere energía.Todos los seres vivos usan la energía química de los combustibles (que son los nutrientescomo los hidratos de carbono y los lípidos) para:
 
Síntesis de moléculas complejas a partir de precursores sencillos:
por ejemplo, apartir de aminoácidos, se forman proteínas y a partir de los monosacáridos, seforman los polisacáridos.
 
Generación de gradientes de concentración o eléctricos:
en muchas células, estoes necesario, como se puede ver en las neuronas para mantener el equilibrio.
 
Movimiento:
tanto a nivel de tejido (la contracción muscular) como a nivel celular(el movimiento celular por los flagelos) y subcelular (transporte de vesículas entreorgánulos).
 
Termogénesis:
es la generación de calor y sirve para mantener la temperatura en losanimales homeotermos.
 
 
Fotogénesis:
algunos seres vivos pueden generar luz.Los seres vivos se pueden clasificar, según la fuente de energía que usan, en:
 
Fototrofos:
son los organismos que obtienen la energía a partir de la luz, como lasplantas y algunas bacterias.
 
Quimiotrofos:
son los organismos que obtienen la energía a partir de compuestosquímicos (nutrientes), como los animales, los hongos y la mayor parte de lasbacterias.También se pueden clasificar según la fuente de carbono usada:
 
Autótrofos:
son aquellos seres vivos que fijan el CO
2
atmosférico, como las plantasy algunas bacterias como las cianobacterias.
 
Heterótrofos:
son los seres vivos que necesitan ingerir el carbono de los nutrientes,como los animales y los hongos.También hay diferencias en los organismos en cuanto a la fuente de nitrógeno. Estenitrógeno se usa, en todos, para sintetizar aminoácidos y nucleótidos, pero las fuentes sondistintas:
 
Plantas:
usan el amoniaco (NH
3
), los nitratos (
3
NO
) o los nitritos (
2
NO
).
 
Animales vertebrados:
usan compuestos nitrogenados orgánicos.
 
Cianobacterias y algunas bacterias del suelo:
son bacterias fijadoras del N
2
 atmosférico y lo asimilan para convertirlo en amoniaco.
Bioquímica 2º cuatrimestre
 
2
 Hay que recordar, además, que hay dos tipos de rutas metabólicas:
 
Catabolismo:
se denomina así a aquellas rutas donde se degradan los nutrientes(hidratos de carbono o lípidos) para obtener energía.
 
Anabolismo:
se denomina así a aquellas rutas del metabolismo biosintético, esdecir, la síntesis de polímeros necesarios para la célula (polisacáridos, proteínas...).Cada ruta es una secuencia de reacciones.
Bioenergética y relaciones termodinámicas
La
bioenergética
es el campo de la bioquímica (la bioquímica son las reacciones de lascélulas vivas) relacionado con la transformación y empleo de la energía por las célulasvivas, o lo que es lo mismo, es el estudio cuantitativo de las transducciones de energía quetienen lugar en las células.Todas las transformaciones biológicas de la energía siguen las leyes de la termodinámica:
 
Primera Ley de la Termodinámica:
en cualquier transformación física o química,la cantidad total de la energía del universo permanece constante. La energía ni secrea ni se destruye.
 
Segunda Ley de la Termodinámica:
todos los cambios físicos o químicos tiendena evolucionar en la dirección en la que la energía útil experimente una degradaciónirreversible hacia una forma al azar o desordenada denominada
entropía
. Estecrecimiento de la entropía se interrumpe en un punto de equilibrio en el que laentropía formada es la máxima posible en las condiciones existentes. Todo tiende almayor desorden y en el máximo se detiene.Para entender todo esto, hay que introducir el concepto de
sistema reaccionante
, que es elconjunto de materia que está experimentando un proceso físico o químico (organismo,célula o dos compuestos que reaccionan). Este sistema reaccionante, junto con el entorno,constituye el universo.Estos sistemas pueden ser:
 
Aislados o cerrados:
no intercambian energía con el entorno.
 
Abiertos:
intercambian energía con su entorno. Los sistemas reaccionantes que sedan en el mundo biológico son sistemas abiertos.Magnitudes termodinámicas más importantes:
 
Energía libre de Gibbs (G):
es la cantidad de energía capaz de realizar trabajo enuna reacción a temperatura y presión constante. Es
 
la energía útil, disponible para lacélula. Con esto, las reacciones se pueden clasificar en:
o
 
 Reacciones exergónicas:
son aquellas que liberan energía útil.
o
 
 Reacciones endergónicas:
son aquellas que consumen energía útil.
 
Entalpía (H):
es la cantidad de calor que el sistema reaccionante libera o absorbedel entorno a temperatura y presión constante. Con esto, las reacciones pueden ser:
o
 
 Reacciones exotérmicas:
son aquellas reacciones que generan calor.
o
 
 Reacciones endotérmicas:
son aquellas reacciones que requieren calor, esdecir, lo absorben.
 
Entropía (S):
es la expresión cuantitativa del desorden del sistema, a temperatura ypresión constantes. A mayor desorden del sistema, mayor es la entropía y viceversa.La tendencia del Universo es que aumente la entropía.
 Alberto Fonte Polo
 
3
 En los sistemas biológicos, donde la temperatura y la presión son constantes, se ve queestas tres magnitudes están relacionadas entre sí mediante la siguiente fórmula:
S H G
 Donde
 ΔG
es la variación de la energía libre de Gibbs,
 ΔH 
es la variación de entalpía de lasreacciones bioquímicas,
es la temperatura absoluta (medida en grados Kelvin) y
 ΔS 
es lavariación de entropía.Los seres vivos conservan su orden interno tomando de su entorno energía libre en formade nutrientes o luz solar y devolviendo al entorno una cantidad igual de energía en forma decalor y entropía.Las células son sistemas isotérmicos que funcionan a temperatura y presión constantes.La variación de la energía libre se relaciona con la constante de equilibrio de una reacciónquímica. Para que una reacción esté en equilibrio, ha de ser reversible: 
bBaA
 
dDcC 
 Donde las letras en minúscula son los coeficientes estequiométricos de la reacción,
 A
y
 B
 son los reactivos y
y
 D
son los productos.Para este tipo de reacciones, se define la
constante de equilibrio
(o Ley de Acción deMasas) como la relación que hay entre las concentraciones de los productos y de losreactivos:
baceq
 B A D
 Esta constante K
eq
depende de la temperatura (a distinta temperatura, distinto valor deK
eq
) y de las concentraciones de reactivos en el equilibrio, pero no del modo en el que seha llegado al equilibrio.Indica, además, hacia donde está desplazada la reacción, puesto que puede suceder:
 
K
eq
> 1: la reacción está desplazada hacia los productos
(∆Gº’ < 0).
R. favorable.
 
K
eq
<
 
1:
 
la reacción está desplazada hacia los reactivos
(∆Gº’
 
>
 
0).
 
R. desfavorable.
 
K’
eq
 
= 1: en condiciones estándar (∆Gº’ = 0).
Reacción en equilibrio.Curiosamente, la K
eq
cambia de valor si se hace la reacción inversa a la reacción mostradaanteriormente, porque existe una relación inversa:
1
eqeq
 Por otro lado, la energía libre de Gibbs estándar biológica se define como la energía útil deun sistema en
condiciones estándar 
, es decir, a una temperatura de 25ºC (298 K), unapresión de 1 atm, a concentraciones de reactivos y productos de 1 M y, en el caso de lasreacciones bioquímicas, a un pH de 7. En condiciones estándar, las variaciones de energíaen la reacción química son aditivas. Matemáticamente, se define con la siguiente relación:
eqeq
 R RG
log303,2ln
'0
 Donde
 R
es la constante de los gases ideales,
es la temperatura absoluta en grados Kelvin,y
 K’ 
eq
es la constante de equilibrio de la reacción.
Bioquímica 2º cuatrimestre

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