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microbiologia taxonomia

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1
TAXONOMÍA Y CLASIFICACIONDE BACTERIAS
Silvana Tarlera
Cátedra de MicrobiologíaFacultad de Química y Facultad de Ciencias2007
BIBLIOGRAFÍA
Brock, Biología de los microorganismos, 8
a
, 9
a
o 10
a
ed. (Evolución microbiana y sistemática, Diversidad deArchaeay Bacteria)
TEMARIO
Taxonomía y concepto de especie en procariotasTaxonomía clásica, numérica, molecular y polifásicaCaracteres fenotípicos: clásicos y quimiotaxonómicosCaracteres genotípicos: clásicos y modernos (fingerprinting)Filogenética: clasificación y relación evolutivagen del ARNr16S, árbol filogenético y definición de dominosRelación entre taxonomía clásica y filogenética.Diversidad bacteriana. Ejemplos.Identificación de una cepa
Clasificación
estructura los organismos en grupos (taxones) en base a susimilitud
Nomenclatura
asigna nombres a los taxones
Identificación
determina a que taxones pertenece un organismo que seaisla
TAXONOMÍA
 
2
Taxonomía
Caracterización exhaustivaAplicación de teoría y método de clasificaciónFormación de grupos taxonómicos (taxones)Nomenclatura
Identificación
Caracterización por número limitado de testsadecuados al problemaComparación con sppconocidasAsignación a una spNo identificado: estudio taxonómicounidad taxonómica básicagrupo de cepasque tiene un alto grado de similituden sus propiedades y que difieren en formasignificativa de otros grupos de cepas
Cepa
: población de organismos que desciende de unúnico organismo o de una sola célula
ESPECIE
 
Definición en revisión continua
ESPECIE BACTERIANA
Actualmente el criterio es POLIFÁSICO (combinaciónde características fenotípicas, genómicasy filogenéticas)
Definición metodológica estándar
:
-% de hibridación ADN
bacteria
1
-ADN
bacteria
2
> 70%-
Δ
Tm < 5ºC (estabilidad térmica del híbrido ADN
1
-ADN
2
)
Definición genómicade especie
Longitud de onda (nm)ADN simple hebraADN doble hebra
   A   b  s  o  r   b  a  n  c   i  a
220260300
   A   b  s .  r  e   l  a   t   i  v  a   2   6   0  n  m
8090100temperatura (ºC)T
m
= 86ºCADN doble hebraADN simple hebradesnaturalización
m
: punto mediodel perfil dedesnaturalizacióntérmica de ADN-ADNo de ADN-ARNAumento deabsorbancia delADN a 260nm pordesnaturalizacion
 
3
Cinéticas de desnaturalización térmica de ADNhomoduplexy heteroduplex
Hibridacióngenómicacomo herramientataxonómica
Taxones:
DominioPhylumClaseOrdenFamiliaGéneroEspecieSub-especieimportancia en estudiosclínicos y ecológicos
RANGOS TAXONOMICOS ENCLASIFICACION BACTERIANA

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