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Introdução
Perfil do solo
O solo como hábitat microbiano
O efeito rizosférico
Constituintes do solo
• Minerais:
– sílica (SiO2), Fe, Al, Ca,Mg, K
– P, S, Mn, Na, N ...
• Água
– livre: poros do solo
– adsorvida: ligada aos colóides (argilas)
• Gases:
CO2, O2, N2 ...
• Sistemas biológicos:
– plantas
– animais
– Microrganismos: grande diversidade e abundância
Dependendo de:
nutrientes
umidade
aeração
temperatura
pH
interações
Presença de microrganismos nas várias profundidades do solo
aeróbias anaeróbias
0-8 18,2 4,4 24 2,7 280
Streptomyces
A microbiota do solo
• Fungos:
– 5 x 103 - 9 x 105 por g de solo seco
– limitados à superfície do solo
– favorecidos em solos ácidos
– ativos decompositores de tecidos vegetais
– melhoram a estrutura física do solo
• Algas
– 103 - 5 x 105 por g de solo seco
– abundantes na superfície
– acumulação de matéria orgânica
• Protozoários e vírus
- equilíbrio das populações
- predadores de bactérias
- parasitas de bactérias, fungos, plantas, ...
Microrganismos e os ciclos da matéria
• Ciclo carbono
• Ciclo nitrogênio
• Ciclo do enxofre
• Ciclo do ferro
O ciclo do carbono
• Fixação do CO2
• CO2 + 4H (CH2O) + H2O
– Plantas
– bactérias verdes e púrpuras fotossintetizantes
– algas
– cianobactérias
– bactérias quimiolitróficas
– algumas bactérias heterotróficas:
» CH3COCOOH + CO2 HOOCCH2COCOOH
ácido pirúvico ácido oxaloacético
Transformações bioquímicas do carbono
Celobiose 2 glicose
β-glicosidase
- Em diversos ambientes, a
produtividade é limitada pelo
suprimento de N.
- Importância ecológica e
econômica envolvida na
fixação
Transformações bioquímicas do nitrogênio
• Fixação do nitrogênio atmosférico
N2 NH3 aminoácidos
• Proteólise:
• Amonificação (desaminação)
Utilização do nitrato:
• Redução assimilatória: plantas e microrganismos
– NO3- + 8e- + 9H+ NH3 + 3H2O
2H+ + SO4=
– ex. Thiobacillus thioxidans
• Oxidação de sulfato
– bactérias fototróficas
• CO2 + 2H2S (CH2O) + H2O + 2S
enzimas/luz
Transformações bioquímicas do ferro
Um dos elementos mais abundantes
Naturalmente encontrado em apenas dois estados de oxidação
O O2 é o único aceptor
de elétrons que pode
oxidar o ferro Fe2+, e
em pH neutro.
Comum em solos
alagados e pântanos
Em condições ácidas
ocorre o crescimento
de acidófilos oxidantes
do ferro.
Precipitação de depósitos
marrons de ferro
MS
MS
Resíduos
Máquina orgânicos
decompositora
Nitrogênio
MS
Carbono MS
Fósforo MS
Potássio
Cálcio
Magnésio
Ferro
Enxofre
Manganês Microrganismo
Cobre operário
outros
MS
Húmus
Decomposição de restos vegetais no solo: máquina decompositora
operada pelos microrganismos (Siqueira & Franco, 1988)
Microbiologia do Ar
MICROBIOLOGIA DO AR
COMPOSIÇÃO DA ATMOSFERA
79% de nitrogênio,
21% de oxigênio,
0,032% de dióxido de carbono e outros
gases (neônio, argônio e hélio);
Microrganismos do Ar Externo
(Atmosfera)
2-Operações de debulhamento
4- Abatedouros de animais
MICROBIOLOGIA DO AR
MICRORGANISMOS DO AR
• Os microrganismos podem:
• Temperatura
• superfície:
» varia de 0 ºC nos pólos a 40 ºC nos trópicos
• sob a superfície:
» 90 % do ambiente marinho estão a 5 ºC
– PSICRÓFILOS
• Pressão hidrostática
– pressão no fundo de uma coluna d’água:
• 1 atm/10 m - no fundo dos oceanos é enorme:
– danos às células
• Luz
– a vida na água depende, direta ou
indiretamente, dos produtos da fotossíntese
• algas e cianobactérias são os principais
microrganismos fotossintetizantes encontrados
nos ambientes aquáticos
- estão limitados às regiões superficiais
O ambiente aquático
• Salinidade da água
– água doce: 0 %
• Turbidez
– material suspenso:
• partículas minerais: erosão das rochas, solo
• microrganismos suspensos
• matéria orgânica: tecidos vegetais e animais
- superfície de adesão dos microrganismos
- fonte de nutrientes
TURBIDEZ x LUZ
O ambiente aquático
• pH
– A maioria dos microrganismos aquáticos cresce
melhor próximo à neutralidade: 6,5 - 8,5
– pH dos oceanos: 7,5 - 8,5
– organismos marinhos: 7,2 - 7,6
– lagos e rios: variação ampla
• Archaea de lagos do sul da África: 11,5
• Archaea de geisers: 1,0
O ambiente aquático
• Nutrientes
• orgânicos e inorgânicos
– nitratos e fosfatos:
» algas eutrofização O2 crescimento
de outros organismos
• carga de nutrientes:
– águas próximas à praia: variável (esgotos)
– águas de mar aberto: estável e baixa
» baixo fitoplâncton (baixo N e Fe)
» baixa atividade heterotrófica
» atividade fotossintetizante: cianobactérias
• efluentes industriais: presença de antimicrobianos
» alguns microrganismos convertem tais substâncias
em formas menos nocivas: Pseudomonas spp.:
mercúrio metil mercúrio (volátil)
Microbiologia da Água Potável
• rios, riachos, lagos,
– sujeitos a freqüente poluição:
• esgoto doméstico
• agricultura
• dejetos industriais
– reutilização da água
• processo natural, parte do ciclo hidrológico
• mas, atualmente, há enormes pressões
– crescimento populacional
– uso industrial
– irrigação
Microbiologia da Água Potável
Físicos
Asbestos Resíduos industriais Câncer
Argila suspensa Precipitação Interfere com
tratamentos sanitários
Químicos
Metais pesados Indústrias Várias doenças
Sulfatos Algicidas e minas Diarréias
Nitratos Fertilizantes Metemoglobinemia
Sódio Amaciantes de água Retenção de fluidos
Doenças do coração
Pesticidas Agricultura Várias doenças
Clorofórmio Indústria Câncer
Biológicos
Bactérias Fezes e urina Febre tifóide
Shigeloses
Salmoneloses
Gastroenterites
Tularemia
Leptospirose
Vírus Fezes Hepatite
Poliomielite
Gastroenterites
Protozoários Fezes Disinteria amébica
Giardíase
Balantidíase
Microbiologia da Água Potável
• Purificação da água
– abastecimento residencial:
• áreas rurais: poços e fontes: filtração no solo
• cidades: estações de tratamento:
– sedimentação
– filtração
– cloração
Microrganismos patogênicos na água
• Bactérias
–Salmonella spp.
–Vibrio cholerae
» principais problemas associados à falta de cuidados
sanitários
–Shigella spp.
–Yersinia enterocolitica: gastroenterite aguda
–Escherichia coli: linhagens patogênicas: enterites
–Clostridium perfringens: enterite, gangrena gasosa
–Vibrio parahaemolyticus: gastroenterites
–Pseudomonas aeruginosa: infecções nos olhos, ouvidos
–Staphylococcus aureus: infecções cutâneas, garganta e
intoxicações alimentares
–Leptospira: hepatite, conjuntivite e insuficiência renal
Microrganismos patogênicos na água
• Fungos
• Vírus
– Hepatites A e B
– Gastroenterite infecciosa não bacteriana
– Poliomielite
O monitoramento de todos os microrganismos patogênicos
é difícil e anti-econômico: meios e metodologias diferentes,
dificuldade de analisar os resultados
Microrganismos indicadores de
qualidade da água
Teste da membrana
filtrante