EL CROMOSOMA X

.Submetacentrico (Grupo C)
. Contiene aproxim. 155 Mb de ADN: 62 Mb Xp
. Alrededor de 300 enfermedades se han mapeado en el X.
. Contiene el 4% de todos los genes humanos.
. Esta asociado al menos al 10% de enfermedades hereditarias
causadas por un solo gen (Enf. Ligadas X)
 EL CROMOSOMA X
Región Pseudoautsómica (RPA)
. Constituido por 2.5Mb de ADN
. Completamente homóloga en el
X y el Y.
. La recombinación es máxima
para la región subtelomérica de
Xp e Yp.
. La región polimórfica DXYS14
recombina con una frecuencia
cercana al 50%.
. La recombinación es al azar en
cualquier lugar de la RPA, las
secuencias más alejadas de los
´ telómeros tienen un índice de
recombinación más bajo. Así el
gen MIC2 tiene un frecuencia de
recombinación del 2%.
Genes de la RPA:
1) Gen MIC2: Glucoproteína de la
membrana celular de 32 KDa y
está relacionada con procesos
de adhesión celular.
2) Gen XE7: Función desconocida
3) Gen ASMT: enzima acetil-sero_
tonina metiltransfersa, que ca-
taliza el paso final de la síntesis
melatonina. Relacionado con
desordenes psiquiátricos.
4) Gen ANT3: enzima adenina nu-
cleótido translocasa, que en las
mitocondrias cataliza la translo-
cación de ADP y ATP .
5) Gen IL3RA: Subunidad alfa del receptor para la Interleuquina.
6) Gen CSF2RA: Receptor alfa para el GMSF.
7) Gen SHOX: relacionado con la estatura
El CROMOSOMA X
EL CROMOSOMA X
 El CROMOSOMA X
Inactivación del Cromosoma X:
. Gen XIST: Xq13 . Estrechamente liga-
do al RPS4X (gen de la proteína ribo-
sómica S4 del X) y al PHKA1.
. El Gen XIST se extiende por cerca de
80 Kb. Consta de 8 exones y su pro-
ducto de transcripción es mayor de
15 Kb.
. El Gen XIST se transcribe pero no se
traduce en ningún polipéptido signi-
ficativo.
. El producto del gen XIST es directa-
mente un ARN que actúa sobre el
propio cromosoma X (en “cis”). Parece
ser que la acumulación progresiva de
este ARN sobre la región periférica gen,
provoca un cambio de conformación de
la cromatina que se va extendiendo y
finalmente abarca todo el cromosoma,
inhibiendo su actividad transcripcional.
La Hipótesis de Mary Lyon (1961)
El cromosoma X inactivo suele adoptar una forma circular unido
por los telómeros y, generalmente, adyacente a la membrana
nuclear. El RNA transcrito del XIST produce los locus
heterocromáticos denominados Cuerpos de Barr.
. El cromosoma X se ha desarrolla-
do de un par de cromosomas auto-
somicos a travez de unos 300 mi-
llones de años.
. Perdida progresiva de la recombi-
nación entre X e Y.
. Las secuencias de los loci génicos en el cromosoma X de mamí-
feros son en especial similares debido al efecto conservado de la
inactivación del X. En los cromosomas
X de humanos y ratones hay 5 bloques
de loci génicos tienen las mismas
secuencias.
. Se han identificado 165 genes
. Genes izquierda han sido clo-
nados. Los genes de la dere-
cha han sido mapeados.
. Se han identificado 295
genes.
. Se identifican alrededor
de 10 genes asociados a
retardo mental inespecífico.
The DNA sequence of the human
X chromosome
A list of authors and their affiliations appears at the end of the paper

Mark T. Ross1, Darren V. Grafham1, Alison J. Coffey1, Steven Scherer2, Kirsten McLay1, Donna Muzny2, Matthias Platzer3, Gareth R. Howell1,
Christine Burrows1, Christine P. Bird1, Adam Frankish1, Frances L. Lovell1, Kevin L. Howe1, Jennifer L. Ashurst1, Robert S. Fulton4,
Ralf Sudbrak5,6, Gaiping Wen3, Matthew C. Jones1, Matthew E. Hurles1, T. Daniel Andrews1, Carol E. Scott1, Stephen Searle1, Juliane Ramser7,
Adam Whittaker1, Rebecca Deadman1, Nigel P. Carter1, Sarah E. Hunt1, Rui Chen2, Andrew Cree2, Preethi Gunaratne2, Paul Havlak2,
Anne Hodgson2, Michael L. Metzker2, Stephen Richards2, Graham Scott2, David Steffen2, Erica Sodergren2, David A. Wheeler2, Kim C. Worley2,
Rachael Ainscough1, Kerrie D. Ambrose1,M. Ali Ansari-Lari2, Swaroop Aradhya2, Robert I. S. Ashwell1, Anne K. Babbage1, Claire L. Bagguley1,
Andrea Ballabio2, Ruby Banerjee1, Gary E. Barker1, Karen F. Barlow1, Ian P. Barrett1, Karen N. Bates1, David M. Beare1, Helen Beasley1,
Oliver Beasley1, Alfred Beck5, Graeme Bethel1, Karin Blechschmidt3, Nicola Brady1, Sarah Bray-Allen1, Anne M. Bridgeman1,
Andrew J. Brown1, Mary J. Brown2, David Bonnin2, Elspeth A. Bruford8, Christian Buhay2, Paula Burch2, Deborah Burford1, Joanne Burgess1,
Wayne Burrill1, John Burton1, Jackie M. Bye1, Carol Carder1, Laura Carrel9, Joseph Chako2, Joanne C. Chapman1, Dean Chavez2, Ellson Chen10,
Guan Chen2, Yuan Chen11, Zhijian Chen2, Craig Chinault2, Alfredo Ciccodicola12, Sue Y. Clark1, Graham Clarke1, Chris M. Clee1, Sheila Clegg1,
Kerstin Clerc-Blankenburg2, Karen Clifford1, Vicky Cobley1, Charlotte G. Cole1, Jen S. Conquer1, Nicole Corby1, Richard E. Connor1,
Robert David2, Joy Davies1, Clay Davis2, John Davis1, Oliver Delgado2, Denise DeShazo2, Pawandeep Dhami1, Yan Ding2, Huyen Dinh2,
Steve Dodsworth1, Heather Draper2, Shannon Dugan-Rocha2, Andrew Dunham1, Matthew Dunn1, K. James Durbin2, Ireena Dutta1,
Tamsin Eades1, Matthew Ellwood1, Alexandra Emery-Cohen2, Helen Errington1, Kathryn L. Evans13, Louisa Faulkner1, Fiona Francis14,
John Frankland1, Audrey E. Fraser1, Petra Galgoczy3, James Gilbert1, Rachel Gill2, Gernot Glo¨ckner3, Simon G. Gregory1, Susan Gribble1,
Coline Griffiths1, Russell Grocock1, Yanghong Gu2, Rhian Gwilliam1, Cerissa Hamilton2, Elizabeth A. Hart1, Alicia Hawes2, Paul D. Heath1,
Katja Heitmann5, Steffen Hennig5, Judith Hernandez2, Bernd Hinzmann3, Sarah Ho1, Michael Hoffs1, Phillip J. Howden1, Elizabeth J. Huckle1,
Jennifer Hume2, Paul J. Hunt1, Adrienne R. Hunt1, Judith Isherwood1, Leni Jacob2, David Johnson1, Sally Jones2, Pieter J. de Jong15,
Shirin S. Joseph1, Stephen Keenan1, Susan Kelly2, Joanne K. Kershaw1, Ziad Khan2, Petra Kioschis16, Sven Klages5, Andrew J. Knights1,
Anna Kosiura5, Christie Kovar-Smith2, Gavin K. Laird1, Cordelia Langford1, Stephanie Lawlor1, Margaret Leversha1, Lora Lewis2, Wen Liu2,
Christine Lloyd1, David M. Lloyd1, Hermela Loulseged2, Jane E. Loveland1, Jamieson D. Lovell1, Ryan Lozado2, Jing Lu2, Rachael Lyne1,
Jie Ma2, Manjula Maheshwari2, Lucy H. Matthews1, Jennifer McDowall1, Stuart McLaren1, Amanda McMurray1, Patrick Meidl1,
Thomas Meitinger17, Sarah Milne1, George Miner2, Shailesh L. Mistry1, Margaret Morgan2, Sidney Morris2, Ines Mu¨ ller5,18, James C. Mullikin19,
Ngoc Nguyen2, Gabriele Nordsiek3, Gerald Nyakatura3, Christopher N. O’Dell1, Geoffery Okwuonu2, Sophie Palmer1, Richard Pandian1,
David Parker2, Julia Parrish2, Shiran Pasternak2, Dina Patel1, Alex V. Pearce1, Danita M. Pearson1, Sarah E. Pelan1, Lesette Perez2,
Keith M. Porter1, Yvonne Ramsey1, Kathrin Reichwald3, Susan Rhodes1, Kerry A. Ridler1, David Schlessinger20, Mary G. Schueler19,
Harminder K. Sehra1, Charles Shaw-Smith1, Hua Shen2, Elizabeth M. Sheridan1, Ratna Shownkeen1, Carl D. Skuce1, Michelle L. Smith1,
articles
NATURE | VOL 434 | 17 MARCH 2005 |www.nature.com/nature 336
© 2005 Nature Publishing Group
La Secuencia del Cromosoma X
. Construyeron un Mapa del Cromosoma X usando cromosomas
artificiales P1 (PAC) y clones de cromosomas artificiales de bac-
terias (BAC) ensamblados en forma contigua usando enzimas de
restricción.
. Utilizaron 1832 clones para el mapeo.
. Determinaron 150,396,262 pb de la secuencia (el comosoma X es
aproximadamente 155 Mb de longitud).
. Cromosoma pobre en genes que esta altamente enriquecido en
repetidos interespaciados y tiene un bajo contenido de (G+C)
39% comparado con el genoma promedio 41%.
. Reportan: 1098 Genes (7.1 genes por Mb) distribuido en cuatro ca-
tegorías diferentes: Genes conocidos (699)
Secuencias codificantes nuevas (132)
Transcritos nuevos (166)
Transcritos putativos (101)
. Identificaron 700 pseudogenes en la secuencia (4.6 pseudoge por
Mb).
. La densidad génica (excluyendo pseudogénes) en el cromosoma
X es en promedio el más bajo relacionado con los demás cromos.
. Los exones de los 1098 genes calculados son solamente 1.7% de
la secuencia del cromosoma X.
. Sobre la base de la longitud de los loci de estos genes el 33% del
cromosoma es transcrito. Considerablemente por debajo compa-
rado con los cromosomas 6, 9, 10 y 13.
. La secuencias de las islas CpG en el cromosoma X es solamente
525 Mb (exactamente la mitad del promedio del Genoma estimado)
Hay una asociación de las islas CpG para el 49% de los genes co-
nocidos.
. Han identificado 4493 Regiones Conservadas Evolutivamente
(ECRs) que son coservadas entre los cromosomas X de todas las
otras especies (ratón, rata, pez cebra, Tetraodon nigroviridis).
. Dentro de estos genes se incluyen los Genes RNA no codificantes
(ncRNA). El más importante los genes ncRNA en el cromosoma X
es el XIST (X inactive- specific transcript).
. El locus XIST se extiende 32,103 pb en Xp13 y su transcito no tra-
ducido transcripcionalmente silencia uno de los cromosomas X en
cis.
. El transcrito de XIST es un RNA de 19,275 pb el cual incluye un
exón grande en el cromosoma (Exon 1: 11,372 pb).

El Gen Antígeno Cáncer-Testicular

. El cromosoma X contiene 99 Ags CT.
. Importante hallazgo la presencia del dominio MAGE de 32 genes.
Solamente se han reportado 4 otros genes MAGE en el resto del
Genoma: MAGEF 1 en cromosoma 3
MAGEI 2, NDN y NDL 2 en cromosoma 15
. El grupo de Ags Cáncer-Testicular (CT) se caracterizan por su
expresión en un gran número de tipos de cáncer, mientras que
su expresión en tejido normal es solo predominantemente en
Testículo. Esta expresión permite sugerir que los Ags CT son po-
tencialmente blancos o target para Inmunoterapia Tumoral.
. Aproximadamente 10% de los genes en el cromosoma X son de
tipo Ags CT.

Homología de Secuencias X e Y:
. X: 1098 genes Y: 78 genes
. 54 de los 1098 genes tiene función
compartida con el Y.
. En el humano hay 5 regiones de se-
cuencias homólogas.
. I y II corresponden a la RPA.
Evolución del Cromosoma X
. El origen autosómico del cromosoma X en mamíferos está demos-
trado poe estudio comparativo de secuencias de cromosoma X hu-
mano y secuencias del genoma del pollo.
. Genes del cromosoma humano fueron mapeados en los cromoso-
mas de pollo: 1q13-q21 y 4p11-p14.
. Identificaron 30 regiones de homología que cubren más del Xq hu-
mano y que corresponden a 20 Mb de la parte final 4p de pollo. Mi-
entras que el brazo corto (Xp11.3---- pter) incluyendo la región
pseudoautosómica PAR1 se corresponde con 1q.
. Se determinó que existen 9 bloques de secuencias homólogas con
el cromosoma X de ratón y 11 con la rata, mientras que X humano
y del perro sus secuencias son esencialmente colineales.
Genética Médica y la Secuencia del Cromosoma X
. Aunque el X contiene solamente el 4% de todos genes humanos
alrededor del 10% de las enfermedades mendelianas han sido a-
signadas al X (307 de los 3,199; según OMIM).
. Hasta la fecha, las bases moleculares de 168 fenotipos ligados a
X han sido determinados y las secuenciación del cromosoma X
ha permitido el procesamiento de 43 de ellos.
. El Retardo Mental es uno de los problemas más comunes en Ge-
nètica Clìnica y afectan más a hombres que mujeres. Hasta la
fecha 16 genes del X han sido asociados con casos de Retardo
Mental ligado a X no Sindrómico (NS-XLMR) en el cual el RM es
solamente una característica fenotípica.
. Gen ARX que codifica un factor de transcripción homeobox
Gen MECP2 que codifica una proteína de unión a la isla CpG met.
Alteraciones Cromosómicas del Cromosoma X