chain reaction) are la baza o tehnologie in vitro care imita capacitatea naturala de replicare a ADN.
•Tehnica consta in generarea rapida a unor copii
multiple a unei secvente nucleotidice tinta (ADN sau ARN) dintr-o gena de interes sau un patogen specific. •Amplificarea se realizeaza intr-un analizor special, iar amestecul de reactie trebuie sa contina urmatoarele elemente:
- ADN sau ARN tinta: extras din proba in cursul etapei
de prelucrare - O enzima care faciliteaza sinteza lantului complementar de acid nucleic (ADN polimeraza Taq pentru o tinta ADN sau RTth ADN polimeraza pentru o tinta ARN) - Cofactori enzimatici: Mg2+ si/sau Mn2+
- Primeri (P1 si P2): sunt secvente scurte de20-30
nucleotide; ei servesc ca punct de plecare pentru sinteza lantului complementar cu ajutorul ADN polimerazei, marcand inceputul si sfarsitul regiunii care trebuie sa fie amplificata; - Deoxinucleotidele (dATP, dGTP, dCTP si dUTP): folosite pentru sinteza noii catene ADN prin atasarea lor la capatul primerilor;
- Amperaza: enzima care promoveaza amplificarea
selectiva a tintei si distrugerea produsilor de contaminare din cursul reactiilor de amplificare anterioare Reactia PCR se desfasoara in 3 etape:
1.Denaturarea
2. Hibridizarea primerilor
3. Elongatia DENATURAREA ADN-ULUI
• 94-98 ºC, timp de 20-30 de secunde
• ADN-ul dublu catenar este desfasurat in doua
lanturi complementare, de care se vor lega apoi primerii • La sfarsitul acestei etape in mediul de reactie vor fi prezente doua lanturi ADN mono-catenare HIBRIDIZAREA PRIMERILOR
• Se scade temperatura la 50-65 ºC, timp de 20-
40 de secunde • Primerii sunt in exces in mediul de reactie • Se vor atasa complementar la capetele 3’ ale celor 2 catene ELONGATIA • Temperatura depinde de ADN-polimeraza (de obicei 72ºC) • ADN-polimeraza: – Se leaga de lantul hibrid – „Citeste” secvenţa lantului ADN-tinta – Alungeste primerii prin adaugarea de dNTP, pe baza regulii complementaritatii Procesul global de amplificare este divizat in 3 faze: - Exponentiala: la fiecare ciclu se dubleaza cantitatea de amplicon ADN; - Lineara: pe masura ce componentele reactiei sunt consumate, se produce o incetinire a reactiei iar produsii PCR incep sa se degradeze; - Platou (end-point): reactia este stopata, nu se mai formeaza alti produsi de amplificare, iar daca faza se prelungeste mult produsii PCR vor suferi o degradare importanta.