HGU DE ELCHE PAG: 13

S. MICROBIOLOGÍA

CONTENIDO:
Cartera de servicios de la Sección de
Microbiología
REALIZADO POR: FECHA REALIZACION: 2003
Dra. M. Ruiz
Dra. P. López
Dr. J.C. Rodríguez
APROBADO POR: FECHA ULTIMA REVISIÓN: diciembre 2009
Dra. Gloria Royo

CARTERA DE SERVICIOS
DE MICROBIOLOGIA

ATENCION PRIMARIA

DIRECCIÓN

S. de Microbiología. Anexo II. Planta 2

Hospital General Universitario de Elche
Camí de L’Almàssera, nº 11
03203 Elche (Alicante)

TELÉFONOS

Laboratorio bacteriología
Interno 16121
Desde el exterior 966616121
Laboratorio serología
Interno 16122
Desde el exterior: 966 616 122

Laboratorio micobacterias
Interno 16124
Desde el exterior: 966 616 124

Secretaría
Interno 16187
Desde el exterior: 966 616 187

Dra. Gloria Royo

Interno 16188
Desde el exterior: 966 616188
Email: royo_glo@gva.es

Dra. Montserrat Ruiz

Interno 16132
Desde el exterior: 966 616132
Email: ruiz_mongar@gva.es

Dra. Pilar López

Interno 16133
Desde el exterior: 966 616133
Email: lopez_pilgar@gva.es

Dr. Juan Carlos Rodríguez

Interno 16131
Desde el exterior: 966 616131
Email: rodriguez_juadia@gva.es

FAX: 966 616 123

E-mail: micro_elx@gva.es

HORARIOS DE FUNCIONAMIENTO DE LABORATORIO

Mañanas de 8:00 a 15:00 h

Tardes hasta las 22:00 h de lunes a viernes (guardias de los residentes)
Domingos de 8:00 a 15:00 h (guardias de residentes)

Jefe de Sección:
• Gloria Royo García

Facultativos especialistas

• Pilar López García

• Juan Carlos Rodríguez Díaz
 • Montserrat Ruiz García

Residentes
• María Moreno Rodríguez (Residente 4º año)
• Sofía Belda Gas (Residente 3º año)
• Ledicia Álvarez Paredes (Residente 2º año)
• David López Parra (Residente 1º año)
 I.-DETERMINACIONES ANALITICAS REALIZADAS MEDIANTE ESTUDIOS SEROLOGICOS.

ANÁLISIS MUESTRA VALORES TIEMPO DE OBSERVACIONES

Detección de anticuerpos REFERENCIA RESPUESTA
Virus Epstein Barr Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 2días Métodos de cribado: Ac
- Ig G (ELISA) tapón amarillo VCA positiva Máximo: 10 días heterófilos e IgG/IgM totales
- Ig M (ELISA) (suero)
- Ig M Ag VCA (IFI)
- Anticuerpos heterófilos
(Aglutinación)
Toxoplasma gondii Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 2 días
- Ig M (ELFA) tapón amarillo positiva y Máximo: 10 días
- Ig G (ELISA) (suero) seroconversión

Sífilis Sangre en tubo Confirmación de Mínimo: 1 días Técnica de cribado: RPR

- RPR (Aglutinación)
- TPHA (Hemaglutinación)
- IgM (ELISA)
- FTA (Inmunofluorescencia)
- VDRL (LCR)
Micoplasma pneumoniae
- Hemaglutinación
- IgM (ELISA)
Brucella
- Rosa de Bengala
- Aglutinación específica
- Test de Coombs
tapón amarillo diagnóstico: TPHA ≥ Máximo: 7 días Técnicas confirmatorias: TPHA y
(suero) 1/160 o FTA positivo FTA
LCR Neurosífilis: VDRL Neurosífilis: VDRL en LCR
positivo en líquido
Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 2 días Se recomienda el envío de dos
tapón amarillo positiva y Máximo: 10 días muestras del paciente, obtenidas
(suero) seroconversión o con un intervalo de 2-4 semanas
títulos altos
Sangre en tubo Infección aguda: Rosa Mínimo: 2 días
tapón amarillo Bengala positivo, Máximo: 10 días
(suero) aglutinación ≥ 1/160 y
Coombs ≥ 1/160

Salmonella Sangre en tubo Infección aguda: Mínimo: 2 días En caso de resultado positivo, se
Por aglutinación: tapón amarillo Títulos ≥ 1/160 Máximo: 10 días recomienda confirmar mediante
- Ag O de S. typhi (suero) cultivo
- Ag H de S. typhi
- Ag O de S. paratyphi A
- Ag H de S. paratyphi A
- Ag O de S. paratyphi B
- Ag H de S. paratyphi B
Virus herpes Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 2 días No diferencia infección entre tipo
- Ig G (ELISA) tapón amarillo positiva Máximo: 10 días 1y2
- Ig M (ELISA) (suero)

Citomegalovirus Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 2 días Se recomienda confirmar con
- Ig G (ELISA) tapón amarillo positiva Máximo: 10 días cultivo viral o detección de Ag en
- Ig M (ELISA) (suero) leucocitos

Legionella Sangre en tubo Infección aguda: Mínimo: 2 días Se recomienda el envío de dos
- Ac totales (IFI) tapón amarillo Seroconversión Máximo: 10 días muestras del paciente, obtenidas
(suero) con un intervalo de 2-4 semanas
Complementar con detección de
Ag en orina
Rickettsias Sangre en tubo Infección aguda: Mínimo: 2 días Se requiere confirmación con
Por aglutinación: tapón amarillo Títulos ≥1/160 Máximo: 10 días serología especifica de R. conorii
- Ag OX2 de Proteus (suero) (IFI)
- Ag OXK de Proteus
- Ag OX19 de Proteus
Hidatidosis Sangre en tuboInfección: Títulos Mínimo: 2 días Puede complementarse con
- Hemoaglutinación
Virus de la rubéola
- Ig G (ELISA)
- Ig M (ELISA)
Borrelia burgdorferi
- Ac totales (ELISA)
Coxiella burnetti
- Ig G frente a Ag de fase II (IFI) tapón amarillo positiva y
- Ig M frente a Ag de fase II (IFI) (suero)
Leishmania
- Ig G (IFI)
Trypanosoma cruzi (enfermedad Sangre en tubo Sospecha de Infección Mínimo: 1 días
de Chagas)
− IgG (ELISA)
− Confirmación IgG (IFI)
− IgM (IFI)
Virus hepatitis A
- Ig M (ELFA)
Virus hepatitis B
- HBsAg (ELFA)
- Anti HBs (ELFA)
- Anti HBc (ELFA)
- Anti HBc (Ig M) (ELFA)
- HBe (ELFA)
- Anti HBe (ELFA)
Virus hepatitis C
- Ac totales (ELFA)
- Western Blot
Virus HIV
- Ac totales (ELFA)
- Ac totales (ELISA)
- Western Blot
ANÁLISIS
Detección de antígenos
Legionella pneumophila
- Inmunocromatografía
Virus respiratorio sincitial
- ELISA
Streptococcus pneumoniae
- Inmunocromatografía
Entamoeba histolytica
- ELISA
tapón amarillo ≥1/160 Máximo: 10 días estudio mediante ELISA en
(suero) Majadahonda
Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 2 días
tapón amarillo positiva Máximo: 10 días
(suero)
Sangre en tubo Sospecha de Infección: Mínimo: 1 días Si hay Ac se deben caracterizar en
tapón amarillo Presencia de Ac. Máximo: 10 días Majadahonda (IgG, IgM)
(suero) mediante ELISA y WB
Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 2 días Se recomienda el envío de dos
Máximo: 10 días muestras del paciente, obtenidas
seroconversión o con un intervalo de 2-4 semanas
títulos altos En caso de sospecha de infección
crónica se debe hacer serología
frente a Fase I en Majadahonda
Sangre en tubo Sospecha de Infección: Mínimo: 1 días Se debe completar el diagnóstico
tapón amarillo Presencia de Ac. Máximo: 10 días con el cultivo si es posible
(suero)
En neonatos de madres de
tapón amarillo en adultos: presencia Máximo: 15 días anticuerpos, se debe completar el
(suero) de IgG diagnóstico con la visualización
Infección en neonatos: del parásito en sangre y la
Presencia de Ig M detección de DNA mediante PCR
en Majadahonda
Sangre en tubo Infección aguda: IgM Mínimo: 1 días
tapón amarillo positiva Máximo: 10 días
(suero)
Sangre en tubo Se detecta HbsAg, Mínimo: 1 días
tapón amarillo HbeAg, anti HBc Máximo: 10 días
(suero) (total/IgM), antiHBs y
anti HBe
Sangre en tubo Presencia de Ac Mínimo: 1 días Se requiere un segundo suero del
tapón amarillo mediante ELISA y Máximo: 15 días paciente para realizar en él la
(suero) confirmación mediante técnica confirmatoria
WB
Sangre en tubo Presencia de Ac Mínimo: 1 días Se requiere un segundo suero del
tapón amarillo mediante ELISA y Máximo: 15 días paciente para realizar en él la
(suero) confirmación mediante técnica confirmatoria
WB
MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES
REFERENCIA RESPUESTA
Orina Infección aguda: Mínimo: 1 días
Presencia de Ag Máximo: 3 días
Aspirado Infección aguda: Mínimo: 1 días
nasofaringeo Presencia de Ag Máximo: 3 días
Orina Infección aguda: Mínimo: 1 días
Presencia de Ag Máximo: 3 días
Heces Infección aguda: Mínimo: 1 días Adjuntar datos
Presencia de Ag Máximo: 10 días epidemiológicos y heces
 recién emitidas
Se confirma mediante
PCR en Majadahonda
Rotavirus y adenovirus Heces Infección aguda: Mínimo: 2 horas En pacientes pediátricos
- Inmunocromatografía Presencia de Ag Máximo: 1 día o en adultos solicitándolo
en la petición
Plasmodium Sangre en tubo Infección aguda: Mínimo: 1 días Adjuntar datos
- Inmunocromatografía tapón violeta Presencia de Ag Máximo: 3 días epidemiológicos
(EDTA)
Helicobacter pylori Heces Infección: Presencia Mínimo: 1 días
- Inmunocromatografía de Ag Máximo: 3 días

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

REFERENCIA RESPUESTA
IGRA Tres tubos de Infección tuberculosa: Mínimo: 2 días Se necesitan tubos
- Quantiferon sangre recién Positividad de la Máximo: 30 días especiales. Recoger en
extraída (1 ml) prueba Microbiología

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Determinaciones enviadas a REFERENCIA RESPUESTA
laboratorios de referencia
Ac Ricketsia conorii Sangre en tubo Infección aguda: Mínimo: 3 días Adjuntar datos
- Ig G (IFI) tapón amarillo Presencia de IgM y Máximo: 30 días epidemiológicos
- Ig M (IFI) (suero) seroconversión
II.-DETERMINACIONES ANALITICAS PARA EL DIAGNOSTICO DE INFECCIONES POR BACTERIAS

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Microorganismos del tracto REFERENCIA RESPUESTA
gastrointestinal
Coprocultivo y antibiograma Heces Aislamiento de Mínimo: 2 días Indicar datos epidemiológicos
Salmonella, Shigella, Máximo: 5 días
Yersinia, Vibrio
Aeromonas, E. coli
O157, Campylobacter
Plesiomonas,
Edwarsiella, etc

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Microorganismos en tracto REFERENCIA RESPUESTA
urinario
Sedimento Orina Infección: Presencia Mínimo: 1 días
de leucocitos Máximo: 2 días
Tinción de gram Orina La presencia de 1 Técnica urgente
microorganismo x Mínimo: 30 ‘
campo (1000x) se Máximo: 1 hora
correlaciona con más
de 100.000 UFC/ml
Urocultivo y antibiograma Orina Infección: Presencia Mínimo: 1 días El número de UFC/ml
de más de 100.000 Máximo: 5 días necesario para diagnosticar
UFC/ml infección de orina puede ser
menor en determinados casos
(en función del paciente y del
microorganismo)

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Microorganismos del tracto REFERENCIA RESPUESTA
respiratorio superior e inferior
Tinción de Gram Muestras del Presencia de Mínimo: 30’ En ocasiones puede ofrecer una
tracto leucocitos y flora Máximo: 2 horas información importante de
respiratorio predominante forma rápida
inferior
Cultivo y antibiograma de Muestras Aislamiento de Mínimo: 2 días Si se trata de esputo, BAS o
bacterias habituales respiratorias bacterias patógenas Máximo: 5 días aspirado traqueal hay que
- Streptococcus pneumoniae valorar la calidad de la muestra
- Haemophilus influenzae mediante Gram
- Moraxella catarrhalis
- Staphylococcus aureus
- Bacilos Gram Negativos
- Streptococcus pyogenes
Cultivos especiales y antibiograma Exudados Aislamiento de estos Mínimo: 2 días Indicar sospecha clínica
- Neisseria meningitidis nasofaringeos patógenos Máximo: 15 días
- Bordetella
-SARM
Legionella, Nocardia, Rhodococcus Esputo, BAS, Aislamiento de este Mínimo: 5 días Indicar sospecha clínica
BAL, cepillado patógeno Máximo: 15 días
 ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES
Microorganismos que se encuentran en REFERENCIA RESPUESTA
exudados, líquidos y tejidos
Cultivo de bacterias habituales Exudados Aislamiento de Mínimo: 2 días
Liquidos bacterias patógenas
Biopsias
Catéteres
Cultivo de bacterias poco frecuentes Exudados Aislamiento de Mínimo: 2 días Indicar sospecha clínica
- Brucella sp. Liquidos bacterias patógenas
- Actinomyces sp Biopsias
- Nocardia sp.
- Eikenella corrodens
Examen directo de las muestras Exudados Visualización de Mínimo: 1 día
- Tinción de Gram Liquidos bacterias Máximo: 2 días
Biopsias

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Microorganismos que se REFERENCIA RESPUESTA
encuentran en el tracto
genitourinario
Cultivo Muestras del tracto genital Aislamiento de bacterias Mínimo: 2 días
patógenas Máximo: 5 días

Screening portadoras de
Strepococcus agalactiae (cultivo) y Exudado vaginal y rectal (en Aislamiento de Streptococcus Máximo 1 día
sensibilidad a macrólidos escobillones diferentes) agalactiae
Chlamydia Muestra endocervical, Escobillón especial,
- Detección de antígeno exudado uretral contactar con
microbiología
Examen directo de muestras Muestras del tracto genital Visualización de Mínimo: 1 día
- Tinción de Gram bacterias patógenas Máximo: 2 día

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Microorganismos anaerobios REFERENCIA RESPUESTA
Cultivo Muestras adecuadas Aislamiento de Mínimo: 2 días
para anaerobios bacterias patógenas Máximo: 10 días
Examen directo Muestras adecuadas Visualización de Mínimo: 1 día
- Tinción de Gram para anaerobios bacterias patógenas Máximo: 2 días
III.- PRUEBAS DE SUSCEPTIBILIDAD BACTERIANA A LOS ANTIBIÓTICOS

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Pruebas de susceptibilidad antibiótica REFERENCIA RESPUESTA
bacteriana
Estudios de sensibilidad in vitro Cepas Normas de la NCCLS Mínimo: 2 días
- Difusión con disco bacterianas
- Dilución en placa
- Microdilución
- Betalactamasas
- E-test
- BLEAS
- SARM
- Carbapenemasas
IV.- INFECCIONES CAUSADAS POR HONGOS

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Diagnóstico de infecciones REFERENCIA RESPUESTA
causadas por hongos
Cultivo Muestras adecuadas para Aislamiento de hongosMínimo: 2 días Los hongos tardan en
hongos patógenas Máximo: 30 días crecer
Detección directa Muestras adecuadas para Visualización de Mínimo: 1 hora
- Tinción de Gram hongos elementos fúngicos Máximo: 2 días
- KOH
Identificación Hongos de muestras clínicas Criterios de la Mínimo: 2 días
- Hongos filamentosos Sociedad Americana Máximo: 30 días
- Hongos levaduriformes de Microbiología
-Hongos dermatofitos
Sensibilidad de levaduras Levaduras de muestras Normas de la NCCLS Mínimo: 2 días
clínicas Máximo: 5 días
V.- INFECCIONES CAUSADAS POR PARASITOS

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Diagnóstico de infecciones causadas REFERENCIA RESPUESTA
por parásitos
Parásitos gastrointestinales Heces Visualización de losMínimo: 1 día
- Estudio en fresco Aspirado duodenal parásitos Máximo: 15 días
- Concentración
- Tinción con lugol
- Tinción de Ziehl (Cryptosporidium y
Cyclospira)
- Tinción para Microsporidium
- Técnica de Graham
Paludismo y otros parásitos hemáticos Tubo tapón violeta Visualización de losMínimo: 1 día
- Tinción de Giemsa (sangre con EDTA) parásitos Máximo: 2 días
Helmintos Heces Visualización de los Mínimo: 3 día
- Técnica de Harada Mori parásitos Máximo: 15 días
- Siembra en agar
Parásitos urinarios Orina para parásitos Visualización delMínimo: 1 día
- Concentración y visualización parásito Máximo: 2 días
Parásitos del tracto genital Muestras del tracto Aislamiento o Mínimo: 1 día
- Fresco genital visualización del Máximo: 3 días
- Cultivo Trichomonas parásito
VI.- INFECCIONES CAUSADAS POR MICOBACTERIAS

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Diagnóstico de infecciones causadas REFERENCIA RESPUESTA
por micobacterias
Detección directa Muestras para Visualización de los Mínimo: 1 día
- Tinción de auramina micobacterias microorganismos Máximo: 3 días
- Tinción de ziehl
Cultivo Muestras para Aislamiento de los Mínimo: 7 días
- Medios sólidos micobacterias microorganismos Máximo: 60 días
- Medios líquidos
Identificación de las cepas aisladas Cepas aisladas en Criterios de la Mínimo: 2 días
muestras clínicas Sociedad Americana Máximo: 30 días
de Microbiología
Antibiograma Cepas aisladas en Normas de la NCCLS Mínimo: 7 días
- Medio sólido muestras clínicas Máximo: 30 días
- Medio líquido
VII.- DETERMINACIONES ANALITICAS REALIZADAS MEDIANTE TÉCNICAS DE BIOLOGÍA
MOLECULAR

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

REFERENCIA RESPUESTA
Tipificación molecular de Aislados clínicos En función de la Mínimo: 30 días Sólo a nivel de
Mycobacterium tuberculosis técnica aplicada Máximo: 60 días investigación
Identificación de micobacterias no Aislados clínicos Secuenciación 16 S Mínimo: 7 días
tuberculosas Máximo: 30 días
Tipificación genómica de cepas de Aislados clínicos En función de la Mínimo: 30 días Sólo a nivel de
Salmonella técnica aplicada Máximo: 60 días investigación
Cuantificación del virus HCV Sangre obtenida en Límite de detección: 15Mínimo: 3 días Se necesita extraer la
- PCR a tiempo real tubo de con UI/ml. Por debajo de Máximo: 15 días muestra en un tubo
separador y EDTA esta cantidad, no es especial
de 4,5 ml (tubo posible la
violeta o cuantificación, pero sí
blanco/violeta) la detección
Genotipos de HCV Sangre obtenida en Patrones Mínimo: 3 días Se necesita extraer la
- LIPA tubo de con internacionales Máximo: 15 días muestra en un tubo
separador y EDTA especial
de 4,5 ml (tubo
violeta o
blanco/violeta)
Cuantificación del virus de la hepatitis Sangre obtenida en Límite de detección: 12Mínimo: 3 días Se necesita extraer la
B tubo de con c/ml. Por debajo deMáximo: 15 días muestra en un tubo
- PCR a tiempo real separador y EDTA esta cantidad, no es especial
de 4,5 ml (tubo posible la
violeta o cuantificación, pero sí
blanco/violeta) la detección
Detección y genotipado de Muestra Patrones Mínimo: 3 días Se debe tomar con una
papilomavirus endocervical internacionales Máximo: 30 días torunda especial y
-Arrays resuspender la muestra
en un líquido de
conservación
Identificación bacteriana mediante Cepas bacterianas Secuencias del Gen Mínimo: 3 días
estudio del 16S Bank Máximo: 30 días
- Secuenciación
Detección de virus influenza Muestras Presencia de ácidos Mínimo: 1 días Se debe tomar con una
estacional y nueva variante H1N1 respiratorias nucleicos Máximo: 3 días torunda especial y
- PCR a tiempo real resuspender la muestra
en medio de transporte
para virus

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Determinaciones enviadas a centros REFERENCIA RESPUESTA
de Referencia
Detección de herpervirus LCR, orina, sangre Presencia de ácidos Mínimo: 7 días
- PCR obtenida en tubo nucleicos, Ag Máximo: 30 días
tapón violeta, BAL, Aislamiento viral
exudados de
lesiones, etc.
Confirmación de la identificación de Cepas bacterianas Mínimo: 7 días Determinadas cepas de
bacterias Máximo: 15 días dudosa identificación
Confirmación de la identificación de Cepas de hongos Mínimo: 7 días Determinadas cepas de
hongos Máximo: 30 días dudosa identificación
Confirmación de la identificación de Cepas de levaduras Mínimo: 7 días Determinadas cepas de
levaduras Máximo: 15 días dudosa identificación
Sensibilidad de hongos filamentosos Cepas de hongos Mínimo: 7 días Determinados hongos
Máximo: 30 días sistémicos significativos
Sensibilidad de levaduras Cepas de levaduras Mínimo: 7 días Determinados levaduras
Máximo: 15 días significativas
Detección de Mycobacterium LCR Presencia de ácidos Mínimo: 7 días
tuberculosis nucleicos Máximo: 30 días
- PCR
VIII.- ESTUDIOS EPIDEMIOLOGICOS MEDIANTE METODOS CLÁSICOS

ANÁLISIS MUESTRA VALORES DE TIEMPO DE OBSERVACIONES

Determinaciones enviadas a centros REFERENCIA RESPUESTA
de Referencia
Serotipificación y fagotipificación de Aislados clínicos Criterios del Instituto Mínimo: 7 días
Salmonella Carlos III Máximo: 30 días
Fagotipificación de S. aureus Aislados clínicos Criterios del Instituto Mínimo: 7 días
Carlos III Máximo: 30 días
Serotipificación de S. pneumoniae Aislados clínicos Criterios del Instituto Mínimo: 7 días
Carlos III Máximo: 30 días