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Banco de Dados biológico

Banco de Dados biológico

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Published by Diana Santos
Trabalho sobre fundamentos e aplicações dos bancos de dados biológicos na atualidade.
Trabalho sobre fundamentos e aplicações dos bancos de dados biológicos na atualidade.

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Recife, 10 de junho de 2009
BANCO DE DADOS BIOLÓGICO
EQUIPE:CleytonDanielDaniloDianaGlaydsonHauryMarcosVictor
 
Banco de Dados Biológicos
 2
Índice
Visão Geral……………………………………………………………………………
.....
……….
3Recursos Principais
……………………………………………………………………
.....
….
.5Exemplos e Softwares
…………………………………………………………………
.
....7Conclusão
…………………………………………………………………………………
.
….
....10Bibliografia
…………………………………………………………………………………
...
….
10
 
Banco de Dados Biológicos
 3
Banco de Dados Biológicos
 –
Visão Geral
O que é Banco de Dados Biológico?
Um Banco de dados biológico constitui um grande conjunto de dados persistentes,geralmente associado a um software projetado para atualizar, consultar e recuperarcomponentes dos dados armazenados no sistema.Geralmente são tabelas que contêm uma grande quantidade de registros. Porexemplo, um registro associado a uma seqüência de nucleotídeos, contémnormalmente uma descrição do tipo de molécula, seu nome científico, além dissocitações na literatura correspondentes a esta seqüência.Para os pesquisadores que se beneficiam com os dados guardados em um banco dedados, dois requisitos são precisos:
 –
Fácil acesso às informações. (Eficácia)
 –
Métodos para extrair somente as informações necessárias para responder a umaespecífica pergunta biológica. (Objetivo)
O objetivo
O principal objetivo é permitir integrar e consultar, de forma otimizada, dados deseqüências de DNA, padrões de expressão de genes, estrutura de proteínas,conseqüências clínicas, dentre outros elementos resultantes de pesquisas efetuadasem um
projeto genoma*
.
*Projeto Genoma é o nome de um trabalho conjunto realizado por diversos países visando desvendar o código genético de um organismo (podendo ser animal, vegetal,de fungos, bactérias ou de um vírus) através do seu mapeamento. Seu marco inicial é considerado o Projeto Genoma Humano.
Projeto GMOD
“O Generic Model Organism Database Project é um projeto open source, cujo objetivo
é desenvolver um conjunto completo de softwares para a criação e administração de
um banco de dados biológico”. GMOD (2004). Financia
do pelo NIH (National Instituteof Health) e pelo USDA Agricultural Research Service.
Citrina:
 –
O Citrina consiste em uma ferramenta de gerência que permite automatizar oespelhamento e processamento de bancos de dados que estão distribuídos através dediversos servidores FTP. A mesma foi desenvolvida através da tecnologia Java Ant, oque a torna mais flexível e portável.
 –
Um exemplo de uso para o Citrina seria a transferência de Chado SQL entre váriossites de organismos e a população automática dos diversos bancos de dadosPostgreSQL através dos recursos de SQL fornecidos pela tecnologia Java Ant.

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