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Institut Pasteur d’Algérie
Techniques Microbiologiques
Examen Cytobactériologique des Urines
(E.C.B.U)
F. Djennane D. Mohammedi D. Tiouit D. Touati K. Rahal 
Edition 2009 
 
IPA – Techniques Microbiologiques
 
 
Examen Cytobactériologique des Urines
Ed. 2009
2
 Déja parus dans la collection : Institut Pasteur d’AlgérieTechniques Microbiologiques:
- M.N Ouar-Korichi-H.Senouci-K.Rahal
Diagnostic bactériologique et sérologique de la brucellose.
ANDS 1998, 1
ere
édition, 33pages- R.Bellouni-H.tali-Maamar-K.Rahal
Etude cytobactériologique et biochimique du liquide céphalorachidien.
ANDS 2000. 52pages- A.Benslimani-K.Rahal.
Prélèvements génitaux.
ANDS 2001. 128 pages.- A.S Merad-H.Tali-Maamar-K.Rahal
Diagnostic bactériologique et antibiothérapie des infections oculaires .
ANDS 2003 . 40 pages.- M.N Ouar-Korichi-H.Senouci-K.Rahal
Diagnostic bactériologique et sérologique de la brucellose humaine.
ANDS 2005 2eme édition. 58 pages- N.Ramdani-Bouguessa-K.Rahal
Diagnostic bactériologique des infections respiratoires 
ANDS 2006 . 48 pages.- M.Azouaou.M.Lazri.S.Mahrane.H.Senouci
Diagnostic de la diphtérie 
ANDS 2007 . 94 Pages
 
IPA – Techniques Microbiologiques
 
 
Examen Cytobactériologique des Urines
Ed. 2009
3
SOMMAIRE
CHAPITRE I................................................................................................................4  INTRODUCTION..........................................................................................................5GENERALITES.............................................................................................................6RAPPEL ANATOMOPHYSIOLOGIQUE..................................................................................7
Rappel anatomique...............................................................................................7Portes d'entrées..................................................................................................10Facteurs favorisants l’infection urinaires....................................................................11Moyens de défense de l’hôte..................................................................................12
RAPPEL CLINIQUE..................................................................................................... 14
Cystite.............................................................................................................14Pyélonéphrite....................................................................................................14Prostatite.........................................................................................................14
LE PRELEVEMENT...................................................................................................... 16
Indications de l’E.C.B.U........................................................................................16Les conditions du prélèvement................................................................................17Le matériel....................................................................................................17Moment du prélèvement....................................................................................18Toilette........................................................................................................18Recueil des urines...........................................................................................18Prélèvement d’urine pour des recherches spécifiques.................................................23Transport......................................................................................................24Conservation..................................................................................................24
CHAPITRE II.............................................................................................................25  Examen cytobactériologique des urines...........................................................................
26
 Examen macroscopique...............................................................................................
26
 Détermination du PH urinaire...................................................................................... 26Examen microscopique.............................................................................................. 27
Examen à l’état frais............................................................................................27Examen direct après coloration...............................................................................33
Culture.................................................................................................................. 35
Techniques d’ensemencement................................................................................351- Méthode de référence : Méthode de KASS Modifiée.................................................352- Méthode à l’anse calibrée...............................................................................363- Lames immergées.........................................................................................374- Tests rapides..............................................................................................385- Techniques à base de milieux chromogéniques......................................................40Choix des milieux de culture...................................................................................441- Milieux pour numération bactérienne.................................................................442- Milieux d’isolement......................................................................................44Incubation.........................................................................................................45Aspect des colonies..............................................................................................45Identification biochimique des colonies......................................................................481- Caractéres biochimiques d’orientation rapide.......................................................482- Identification classique..................................................................................493- Identification rapide (API system)......................................................................504- Identification des colonies sur milieux chromogènes...............................................515- Identification antigénique...............................................................................526- Antibiogramme...........................................................................................52
Chapitre III..............................................................................................................53  Interprétation de l’ECBU............................................................................................ 54Interprétation selon la bactériurie et la leucocyturie......................................................... 55Interprétation selon les germes................................................................................... 60Interprétation chez le transplanté rénal......................................................................... 62Chapitre VI.............................................................................................................63  Epidémiologie.......................................................................................................... 64Annexe..................................................................................................................70  Références bibliographiques.......................................................................................74
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