Specie isotopiche che contribuiscono allo ione a m/z 8681

Numbers of Atoms
Mass
Relative
(m/z) Abundance

12

13

14

15

16

18

17

32

34

8681.1666

0.6

379

586

106

114

.17123

0.6

378

586

105

114

.17295

2.2

378

586

107

114

.17509

0.5

379

586

106

113

.17755

3.4

377

586

106

114

.17991

0.4

377

586

107

114

.18141

1.9

378

586

107

113

.18387

7.4

376

586

107

114

.18474

0.

377

586

107

113

.18679

0.

377

585

107

114

Amino Acid

Monoisotopic
Mass

Average
Mass

Ala A

71.0371

71.0788

Arg R

156.1011

156.1876

Asn N

114.0429

114.1039

Asp D

115.0269

115.0886

Cys C

103.0092

103.1448

Glu E

129.0426

129.1155

Gln Q

128.0586

128.1308

Gly G

57.0215

57.0520

His H

137.0589

137.1412

Ile I

113.0841

113.1595

Leu L

113.0841

113.1595

Lys K

128.0950

128.1742

Met M

131.0405

131.1986

Phe F

147.0684

147.1766

Pro P

97.0523

97.1167

Ser S

87.0320

87.0782

Thr T

101.0477

101.1051

Trp W

186.0793

186.2133

Tyr Y

163.0633

163.1760

Val V

99.0684

99.1326

La tabella mostra i valori di massa dei

comuni residui amminoacidici presenti in un
peptide. La massa monoisotopica calcolata
tenendo conto delle masse atomiche esatte
per ciascun isotopo degli atomi del
frammento (C=12.000 Da, H=1.00783 Da,
N=14.0031 Da, O=15.9949, S=31.9721). La
massa media corrisponde alla massa
ottenuta mediando tutti gli isotopi per
ciascun elemento che compone il
frammento.

Frammentazione N-terminale
a

Massa residuo -27

Massa residuo +1

Massa residuo
+18

Frammentazione C-terminale
x
Massa residuo +45

Massa residuo +19 Massa residuo +2

Frammentazioni interne
Una tipica frammentazione interna pu essere fornita dallo ione Nterminale a che evolve ulteriormente a formare uno ione di tipo
immonio. Alcuni ammino acidi danno ioni immonio molto intensi e
quindi utili per informazioni di sequenza.
O

H2N

CH

H+
N

Residuo

+H2N

CH

R1

Sigla a tre lettere

CH

Sigla a 1

massa ione immonio

lettera

Istidina

His

110

Isoleucina

Ile

86

Leucina

Leu

86

Fenilalanina

Phe

120

Prolina

Pro

70

Triptofano

Trp

159

Tirosina

Tyr

136

Valina

Val

72

Masse e composizioni isotopiche di elementi

comuni nelle molecole organiche
elemento
idrogeno

carbonio
azoto

peso atomico
1,00797

12,01115
14,00670

ossigeno

15,99940

fluoro

18,99840

silicio
fosforo

28,08600
30,97380

nuclidi

massa esatta

%
abbondanza
assoluta

1H

1,007825
2,014102

99,99
0,01

100
0,016

12,000000
13,003354

98,9
1,1

100
1,08

14,003070
15,000108

99,6
0,4

100
0,36

18O

15,994915
17,99916

99,8
0,2

100
0,24

19F

18,998405

100

100

28Si

30Si

27,976929
28,976492
29,973758

92,2
4,7
3,1

100
5,07
3.31

31P

30,973764

100

100

2H
12C
13C
14N
15N
16O

29Si

%
abbondanza
relativa

zolfo

32,45300

32S
33S
34S

cloro

35,45300

35Cl

iodio

cloro

79,90900

126,90400

35,45300

bromo

79,90900

iodio

126,90400

95
0,7
4,2

100
0,78
4,39

34,968851
36,965903

75,5
24,5

100
32,7

81Br

78,918329
80,916344

50,5
45,5

100
97,5

127I

126,904662

100

100

35Cl

34,968851
15,000108

75,5
24,5

100
32,7

81Br

78,918329
17,99916

50,5
45,5

100
97,5

127I

126,904662

100

100

37Cl

bromo

31,972073
32,971463
33,968853

79Br

37Cl
79Br

Giorgio Bonaga

FRAMMENTI CARATTERISTICI
OSSIGENO
M-18 : perdita di
M-28 : perdita di
M-31 : perdita di
M-45 : perdita di
M-59 : perdita di

. H2O
. CO
. OCH3
. COOH
. COOCH3

AZOTO
M-27 : perdita di HCN
M-16 : perdita di . NH2 (ammidi)