Biosíntesis de mRNA

   
Preguntas abiertas

En un mamífero una célula cualquiera puede expresar

unas 5000 protíenas diferentes a partir de ~35000 genes.

La mayor parte de estas proteínas son necesarias para

cualquier tipo celular y normalmente se expresan en forma
constitutiva (housekeeping proteins- housekeepingen).

Otras solo se encuentran presentes en algunos tipos celulares.

Cómo se regula este proceso?

 Interpretar expresión diferencial de genes

   
Eucarionte Procarionte

1. Exon-intron-exon
2. 5’ cap
3. 3’ poli AAAA
4. Núcleo-citoplasma
5. 3 tipos de RNA polimerasa
   
 Composición RNA y plegamiento

   
 Mecanismo de transcripción

Producto
RNA polimerasa y definición de elmentos

ME síntesis rRNA

   
 Globalidad del proceso

   
 Factores Sigma

• Escherichia coli

• sigma70/D

• sigma32/H: heat shock

• sigma24/E: ECF

• sigma28: flagelo

• sigma38/S:fase estacionaria,stress

• sigma54/N: nitrógeno y otros

• fecI: hierro

• Pseudomonas putida: > 15

• Streptomyces: > 30

   
 Inicio de la Transcripción

   
 Elongación de la Transcripción

   
 Dirección de síntesis mRNA

   
 Transcripción en Bacterias: Operones

   
Operón Inducible: Lactosa
 Operón Represible: Triptofano

   
 Tipos de RNA polimerasas en Eucariontes

• RNA polimerasa I:  sintetiza el ARN de la subunidad grande 
de los ribosomas, en el nucleolo.

• RNA polimerasa II : transcribe todos los genes que codifican 
para proteínas.

• RNA polimerasa III: sintetiza el ARN de la subunidad 
pequeña del ARN ribosomal 5S y todos los ARN de 
transferencia.
   
 Maquinaria Transcripcional en Eucariontes
(B)
Composición y estructura tridmensional
yRNAPII
(A)

(C)

LeRoy, G. et al (1998)
Science  282, 1900-1904.  
Cramer, P., Bushnell, D.A., Kornberg, R.D. (2001) Science
 Esquema del sitio activo de RNAPII, presente
en un complejo en transcripción

  Klug, A. (2001)  Science 292,

1844-1846.
 Al interior de la enzima

(a) (b)

(c)

   
 Motivos de secuencias consenso que contribuyen
a la transcripción basal de un promotor tipo II

Smale, S.T, Kadonaga, J.T. (2003) Annual Review of Biochemistry 72, 449-479.
   
 Caracterización de los
Factores Generales de Transcripción
(GTFs) Humanos

LeRoy,  G., Orphanides, G., Lane, W.S., Reinberg,

  D. (1998) Science 282, 1900-1904.
 Identificación promotor por proteína
de unión a caja TATA

   
Complejos remodeladores de cromatina- enancers

   
 Modelo de formación de PIC.
Transición entre la etapa de iniciación y elongación
y reciclaje de la maquinaria basal de transcripción de RNAPII
IIF
+1 5’
GMP
Rpb1
TATA
FCP1
~-26

AAAAn

TBP

5’
GMP
FCP1
IITBP
F IIE IIF
IIB TATA Rpb1
IIH
Rpb1 +1 P
P P
Ribonucleósidos trifosfatos P P
P P
P P
Mg+2, GTP

ATP
IIB IIE IIH
   
>+1/+2 +10 >+30
Modificaciones que sufre el transcrito primario

Capping en extremo 5’

   
 Maduración  Transcrito primario: 
remoción exones y empalme de intrones

   
Modificaciones que sufre el transcrito primario

   
Regulación de la expresión por “splicing” alternativo