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DOSSIER
Troupeaux
sommaire
03 HORIZONS
Penser au-del de lassiette 6e crmonie des Lauriers de lInra
Chers lecteurs,
our clore 2011, dclare anne des Outre-mer au niveau franais, nous vous proposons un dossier sur llevage en rgions chaudes qui fait la part belle aux recherches conduites lInra des Antilles-Guyane. Ce centre a du reste accueilli, les 3 et 4 novembre, un Carrefour de linnovation agronomique (CIAG) consacr l Innovation pour des systmes agricoles durables . En organisant des contacts directs entre les chercheurs et les professionnels, ces CIAG sont des catalyseurs dinnovation dans les deux sens : car si la recherche ouvre des pistes pour les agriculteurs, elle sinspire aussi de leurs pratiques novatrices, comme le montre notre dossier... Des changes fructueux pour cultiver lavenir dans un contexte dincertitude. Qui dit agriculture dit sol cultiv : le monde en perd entre 6 et 12 millions dhectares par an, soit par artificialisation (villes, routes, etc.) soit par dgradation (rosion, salinisation, etc.). La France sest dote dun rseau de sur veillance de ses sols qui a produit un premier tat des lieux aprs dix ans de mesures (voir en pages 6 et 7). Vous trouverez aussi dans ce numro des canards dans les rizires (p. 27-28) et des plantes traire (p. 8-9) Bonne lecture et bonnes ftes de fin danne !
06 RECHERCHES
& INNOVATIONS
Les sols franais surveiller Du labo lindustrie : transfert russi pour les plantes tr aire La reprogrammation du noyau, une affaire de cytoplasme Lait ferment et protection de lintestin : une piste creuser Simuler le fonctionnement des agro-cosystmes
13 DOSSIER
25 REPORTAGE
Larchitecture vgtale dcrypte Canard aux herbes, une recette 100% bio Economiser en achetant : les 10 ans du Service Achats de lInra
La rdaction
Erratum Une erreur sest malencontreusement glisse dans le numro 18 dInra magazine, page 8. La photo prsente ne montre pas une abeille mais un syrphe, insecte de lordre des diptres. Nous nous en excusons auprs de nos lecteurs qui ont t nombreux ragir.
31 IMPRESSIONS 34 REGARD
Poissons OGM, un puzzle disciplinaire
INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE 147 rue de l'Universit 7533 8 Paris Cedex 07
www.inra.fr
Directrice de la publication : Marion Guillou. Directeur ditorial : Jean-Franois Launay. Directeur de la rdaction : Antoine Besse. Rdactrice en chef : Pascale Mollier. Rdaction : Brigitte Cauvin, David Charamel, Nicolas Chauty-Bacchetta, Christine Espinoza, Evelyne Lhoste, Ana Poletto, Ccile Poulain, Grard Simonin. Photothque : Jean-Marie Bossennec, Julien Lanson, Christophe Matre. Couverture : Photo : Jared Wilson/ Fotolia. Maquette : Patricia Perrot. Conception initiale : Citizen Press - www.citizen-press.fr. Impression : Imprimerie CARACTERE. Imprim sur du papier issu de forts gres durablement. Dpt lgal : dcembre 2011.
ISSN : 1958-3923
Christine Cherbut, 51 ans, a t nomme dir ectrice scientifique Alimentation le 1 er octobre 2011. Cette ancienne directrice-adjointe du centre de recherche en nutrition humaine de Nantes v a promouvoir les recherches autour de lalimentation lInr a avec lambition de contribuer la scurit alimentair e mondiale et au dveloppement de systmes alimentaires durables.
Comment va se structurer votre action ? Christine Cherbut : La grande originalit de lInra est sa capacit explorer lensemble de la c hane alimentaire, de la pr oduction la consommation des aliments, le fameux de la fourche la fourchette . Je pense quen sappuyant sur les acquis, nous devons galement remonter la chane en sens in verse, du consommateur au producteur. Nous devons, dautre part, repenser la transformation des agro-ressources et mieux pr endre en compte les qualits intrinsques des produits agricoles et lensemble de leur itinraire de production, en faisant rimer conomie et cologie . Dans cette optique les recherches vont sarticuler en t rois chantiers prioritaires : chantier 1 : les c omportements des consommateurs ; chantier 2 : la nutrition et la sant , et enfin chantier 3 : lco-conception des aliments et les bioraffineries
Dans chaque chantier, quelle sera votre approche ? C. C. : Jessaye dapporter une vision intgrative avec la conviction que nous trouverons de nouvelles rponses en explorant les systmes (rg imes alimentaires, systmes physiologiques ou socio-conomiques). Dautre part, je soutiens fermement la transdisciplinarit qui se construit progressivement grce aux mtaprogrammes. Dans le chantier 1, nous devons explorer au-del de lassiett e, par exemple comprendre comment loffre alimentaire affecte les choix des consommateurs. Cest dailleurs un des mtaprogrammes de lInra. Pour le chantier 2, en nous focalisant sur quelques systmes bien matriss lInra - comme le microbiome intestinal, le stress oxydant, etc.- nous nous attacherons dmontrer les liens entre lalimentation et la sant. Pour cela, il nous faut identifier des indicat eurs objectifs deffets, de prdisposition aux maladies et dexposition au risque.
HORIZONS
3
me
crmonie
des
Lauriers de lInra
Kremer
Un gnticien en chne et en os
59 ans, directeur de rec herche lunit mixte de rec herches Biogeco (Biodiversit, Gnes & Communauts) lInra de Bordeaux. Pionnier, il engage ds les annes 80 des recherches lchelle europenne sur la fort en sappuyant sur la gntique des populations et la biologie volutive. Associant des approches historiques et gntiques sur plus de 2 6 00 forts, il reconstitue le scnario de limplantation des chnes en Europe et claire les mcanismes dadaptation et de migration des espces forestires. Il propose la cration dun rseau dexcellence europen (Evoltree) quil coordonne dsormais. Ses travaux ont t consacrs au plan international par lattribution en 200 6 du prix Marcus Wallenberg, le Nobel de la filire Cest la reconnaissance dune uvre collective rsultant des contributions bois . Antoine Kremer a publi plus de 180 artide plusieurs laboratoires franais et trangers. Les recherches en biologie cles. Il coordonne depuis 2011 un lab oratoire volutive sur les forts ont pu tre menes bien sans contrainte extrieure dexcellence sur lvolution, ladaptation et la gouou intrieure, et jen suis dautant plus reconnaissant aux diffrentes tutelles vernance des cosystmes continentaux et qui nous ont aids. ctiers, financ par les Investissements dAvenir.
Inra / Christian Slagmulder
Les lauriers ?
L AURIER INGNIEUR
Andr
Faur
Inra / Christian Slagmulder
Le cratif de ladministratif
60 ans, directeur des services dappui la recherche du centre de Toulouse, est un homme de lombre qui ne manque pas de lumires. Il est le crateur doutils, dapplications et de solutions pour une administration plus efficace. Aprs un dbut de carrire dans la rec herche en aquaculture, il devient successivement responsable dune unit exprimentale en aquaculture, secrtaire gnral du centre de Tours puis de Toulouse. Il a ensuite t l'acteur de la mise en place de la politique dachat nationale de lInra. Andr Faur excelle par sa capacit dinJe naurais jamais pu obtenir tout seul ces lauriers, cest le rsultat des novation au service dune administration quipes qui travaillent avec moi ! Si jai eu les mains aussi libres pour faire moderne, et sa facult mobiliser pour voluer les choses, cest aussi grce au soutien actif de mes prsidents mettre en place les c hangements ainsi successifs. Cest particulirement rconfortant de se sentir utile. construits collectivement.
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Les lauriers ?
Disdier
Au bonheur des douanes
34 ans, charge de recherche en conomie au sein de lU MR PSE (Paris-Jourdan Sciences Economiques). Ses travaux portent sur les effets des mesures tarifaires et non tarifaires - rglementations sanitaires, phytosanitaires et techniques - sur les changes commerciaux et sur le bien-tre. La chercheuse a publi plus dune dizaine darticles dans des revues acadmiques internationales telles que la Review of Economics and Statistics ou lAmerican Journal of Agricultural Economics. Intervenante dans de nombreux colloques internationaux en sciences conomiques, elle sest aussi implique dans les projets de recherche europens portant sur les changes agricoles et alimentaires, TradeAG et AgFoodTrade.
Inra / Grard Paillard
Jai t surprise et honore. Il faut cependant savoir rester humble. Mes articles ont t publis grce un travail dquipe et des collaborations agrables et profitables. Nos conditions de travail sont trs satisfaisantes et nous donnent les moyens d e raliser une recherche de haute qualit.
Moretti
Inra / Grard Paillard
Andr Moretti a accompagn pendant quarante ans la recherche sur lamlioration des plantes lunit de Gntique et amlioration des fruits et lgumes d Avignon. Il a, en tant quassistant ingnieur, contribu la dcouverte de nouvelles sources de rsistance plusieurs maladies de la tomate et leur introduction dans des lignes obtenues par des croisements interspcifiques. Ce matriel sert de base des programmes de recherches sur les rsistances aux maladies chez la tomate. Plus rcemment par ses travaux sur la tomate mais galement chez lespce modle Arabidopsis thaliana, il a particip la dcouverte dun mcanisme original de rsistance aux virus conserv c hez les plantes. Ses travaux et e xpertises ont largement contribu la reconnaissance internationale de lInra dAvignon.
Les lauriers ?
Jai vraiment cru une blague !!! Cela ma surpris mais jen suis heureux. Je nai jamais cherch les honneurs ni les distinctions pendant ma carrire. J'ai travaill et je travaille toujours avec le souci de rendre service la socit. Passionn, j'aime la recherche et les moments intenses que nous avons la chance de vivre.
Agns Thomas est assistante ingnieur au sein de lquipe Animal, MUscle, VIande (AMUVI) dans lunit des Herbivores Theix, prs de Clermont-Ferrand. Spcialise dans les analyses fines des nutriments chez le Ruminant en production, elle orchestre les analyses dacides gras chane courte du sang et c hane longue des produits carns et de leurs drivs oxyds laide de diffrentes techniques (chromatographie liquide ou gazeuse, spectrophotomtrie). Agns Thomas a rdig personnellement deux publications mthodologiques sur cette thmatique. Investie dans lamlioration des techniques de mesure de la rec herche, elle participe activement la diffusion de la Politique Qualit de lInra et plus rcemment la mise en place de la surveillance des mthodes de mesure. Agns T homas est depuis 200 9 auditrice conseil du Rfrentiel Qualit de lInra.
Les lauriers ?
Elle ne voulait pas, au dpart, les recevoir. Trop dhonneurs pour sa modestie. Pourquoi moi ? Cest tonnant, je nai rien fait dextraordinaire, cest le travail dune quipe, dun collectif.
Les lauriers ?
Thomas
Toute en mesures
RECHERCHES
surveiller
& INNOVATIONS
La premire tude microbiologique des sols lchelle nationale montr e que labondance et la biodiversit des microorganismes dpendent du type de sol et de son utilisation, plus que du climat. Ces rsultats no vateurs constituent un des volets du rapport sur la qualit des sols, prsent en novembre 2011 par le Groupement dintrt scientifique sur les sols, coordonn par lInra.
es sols reprsentent un rservoir de biodiversit microbienne indispensable la vie. Ces microorganismes, bactries, champignons, sont des recycleurs de nutriments pour les vgtaux. Sans eux, pas de minr alisation de la matire organique des sols et donc pas de fertilit. Un rseau de mesures national de la qualit des sols (RMQS) a mesur ltat microbiologique des sols franais. Ses premires conclusions dvoilent des nouveauts parfois inattendues sur lassemblage des communauts microbiennes du sol et leur organisation spatiale. Les chercheurs de lInra de Dijon (1) ont dvelopp une mthodologie qui permet de caractriser la microflore du sol, la fois en quantit et en qualit, sur plus de 2 000 c hantillons correspondant un maillage systmatique du territoire franais de 16km x 16km. Les travaux font apparatre un rsultat nou veau et remarquable : les communauts microbiennes ne sont pas distribues alatoirement, mais sous for me de patchs dassez grande taille, jusqu
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plusieurs centaines de km, qui correspondent une organisation t erritoriale prcise (voir les cartes). Cest ainsi que certaines rgions sont trs riches en biomasse micr obienne : le Nord-Est, le Sud-Est par exemple, alors que dautres sont plus pauvres : le SudOuest, lIle-de-France. Il ny a quun facteur dix entre les zones les plus riches et les zones les plus pau vres, dtaille Lionel Ranjard, responsable du projet. La gamme stend entre 3 et 30 microgrammes dADN total par gramme de sol, ce qui cor respond une quant it de bactries comprise entre 100 millions et 1 milliard et une quantit de champignons entre 100 000 et 1 million . Quant la di versit des microorganismes (2), on observe le mme phnomne de distribution spatiale, avec des zones homognes : le Centre, les Landes, le Sud de la B retagne, et des zones de plus g rande variabilit des communauts : le Sud-Est. Les cls de la distribution des microorganismes dans le sol Nous avons bien sr cherch comprendre quels paramtres rgissaient cette distribution organise, poursuit
Lionel Ranjard, en faisant des corrlations statistiques avec tout un ensemble de donnes : le climat, les caractristiques physicochimiques des sols, la gomorphologie, le mode dusage des s ols, etc. En ce qui concerne la biomasse, le paramtre dterminant est le type de sol : sa texture (argileuse ou sableuse), sa teneur en carbone, et dans une moindre mesure, son pH. Le deuxime paramtre est le mode dusage des sols : la biomasse est plus abondant e sous les forts (surtout de feuillus) et les prairies que dans les sols cultivs et particulirement les monocultures. Cest ce qui explique que la rgion des Landes, avec son sol sableux et acide couvert de fort de pins, est plus pauvre en biomasse. En Ile-de-France, le type de sols est plus favorable (argileux ou limoneux), mais le mode doccupation du sol lest moins, avec des monocultures de crales et/ou dolagineux. La vigne gnre aussi des sols r elativement pauvres en biomasse, car cest une culture peu couvrante avec une rhizosphre rduite qui nalimente pas beaucoup le sol. Cest ce que lon voit sur la carte autour de Bordeaux ou dans la rgion mditerranenne.
A GAUCHE, la biomasse microbienne (zones les plus pauvres en bleu, zones les plus riches en marr on fonc). A DROITE, la biodiversit microbienne : la carte ne montr e quune partie de la v ariance biologique, qui sanalyse selon diffrents axes.
Source : UMR MSE - Plateforme Genosol - Inra Dijon
Curieusement, le climat semble navoir que peu dinfluence sur labondance de la biomasse microbienne. En ce qui concerne la diversit des organismes, le Sud-Est est une des rgions o lon t rouve des communauts microbiennes trs diversifies, ce qui concide avec un usage des sols en mosaque : forts, grandes cultures, vignes, prairies. Alors qu loppos, les rgions du Nord-Est ou des Landes ont une c omposition
microbienne peu varie. Il y a donc une corrlation entre la diversit des paysages et la diversification des communauts microbiennes telluriques lchelle rgionale et nationale. Vers un rfrentiel de la biodiversit des sols Pour vrifier et prciser ces relations de cause effet, les chercheurs vont maintenant identifier les espc es microbiennes et en dr esser un inventaire
taxonomique prcis pour deux rgions extrmes du point de vue de la biodiversit : les Landes et le Sud-Est. Les rsultats, qui ncessitent un investissement en squenage et en mtagnomique, sont attendus fin 2012. Lobjectif est de c onstruire un rfrentiel dindices de biodiversit qui sera gr au sein de la plat eforme GenoSol (3). Ltape suivante consistera tablir les liens ent re cette biodiversit et les fonctions biolog iques du sol. On pourra alors dresser des cartes daptitude des sols fournir des services cologiques, en termes de fertilisation et de recyclage de la matire organique par exemple. Ce qui pourrait clairer les choix agronomiques des agriculteurs ou guider les politiques damnagement du t erritoire pour adapter les modes dusage des sols leur potentiel. Grard Simonin et Pascale Mollier
(1) UMR Microbiologie du sol et environnement , (MSE). (2) Pour tudier la diversit microbienne dun sol, lADN total de lchantillon, aprs extraction, est soumis une PCR qui fait apparatre des fragments caractristiques, spars ensuite par lectrophorse (technique dite de Fingerprints ). On obtient ainsi un code barre gntique correspondant la composition de la communaut microbienne (bactries, champignons, virus) prsente dans lchantillon. Celle-ci est plus ou moins riche en espces diffrentes selon les sols. On applique alors un traitement statistique pour classer les chantillons selon leur degr de similitude. (3) GenoSol est le dispositif consacr ltude microbiologique des sols au sein de lU MR MSE de Dijon, www.dijon.inra.fr/plateforme_genosol).
+dinfos
lionel.ranjard@dijon.inra.fr Dominique.Arrouays@orleans.inra.fr
RECHERCHES
Du labo lindustrie
transfert russi pour les
& INNOVATIONS
plantes traire
Depuis sa cration, il y a six ans Nancy , Plant Advanced Technologies ne cesse de dvelopper de nouvelles technologies efficaces pour la pr oduction dactifs vgtaux. Cette start-up, ne dans une unit mixte de r echerche Inra/Institut national polytechnique de Lorraine (INPL), est un bel exemple de valorisation de la recherche publique lchelle industrielle.
out a commenc dans les locaux du laboratoire Agronomie et environnement, dans la banlieue de Nancy. Ds 1996, Frdric Bourgaud et Er ic Gontier, tous deux enseignants-chercheurs Inra-INPL, y exprimentent un nouveau procd de production de principes actifs vgtaux. Ils cultivent les plantes en hydroponie, cest--dire sans terre, sur milieu liquide et en serre, ce qui permet la fois de stimuler la production de mtabolites secondaires et de les rcolter plus facilement. Ce procd permet ainsi dexploiter au mieux la biodiversit vgtale pour produire des molcules aux pr oprits remarquables (anticancreuses, antineurodgnratives...). On valorise la plante sans la rcolter de manire destructrice explique
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Frdric Bourgaud, soulignant l un intrt majeur de la dcouverte. En effet, les racines, suspendues dans un brouillard nutritif, font plusieurs cycles de production successifs, permettant dobtenir entre trois et huit rcoltes par an sur une mme plante, do le nom de plantes traire . Il faudra trois ans, jusquen novembre 1999, pour que c ette exprimentation en laboratoire fasse lobjet dun dpt de brevet co-dtenu par lInra et lINPL. Forts de ce brevet, Frdric Bourgaud et Eric Gontier obtiennent en 2001 une aide financire dOSEO pour le transfert de cette technologie vers le priv. Ils embauchent alors Benot Mignard en qualit dingnieur. Mais lide est daller enc ore plus loin pour valor iser ce travail lchelle industrielle.
Un projet long terme, une aventure passionnante En 2004, les deux c hercheurs rencontrent Jean-Paul Fvre, ancien directeur de recherche dune socit franaise internationale, spcialiste de lamlioration des plantes. Il a t notre business angel , dit aujourdhui de lui F rdric Bourgaud. Effectivement, Jean-Paul Fvre, qui souhaite monter sa propre socit dans le domaine des biotechnologies vgtales, est sduit demble par le projet : Cest un ami cher cheur lInra qui mavait parl dInra transfert, filiale assurant la promotion de la cration dentreprises par tir des innovations issues des laboratoires de lInra. En explorant leur site, je suis tomb sur cette annonce qui ma sembl trs intressante .
: PAT
De l, les nou veaux associs se tournent vers lIncubateur Lorrain, organisme habilit par le ministre de la Recherche pour accompagner les porteurs de projets dans la cration dentreprises innovantes issues de la recherche publique. Cest ainsi que se cre le lien entre le monde de la recherche et celui de lentreprise pour la technologie des plant es t raire. Lincubation va durer un an, priode durant laquelle Frdric Bourgaud, Eric Gontier et J ean-Paul Fvre sont accompagns sur les plans technique, stratgique et juridique. Ils bnficient galement de moyens logistiques et dun accueil dans les locaux de lIncubateur, ainsi que daides hauteur de 80 000 euros via lIncubateur et OSEO, ce qui leur permet de conserver les fonds propres pour la cration de lentreprise. Plant Advanced Technologies (PAT SA) nat le 1 er juillet 2005 avec un capital de 90 000 euros, quelques mois aprs a voir remport le concours de cration dent reprise innovante du ministr e de la Recherche et le c oncours TremplinEntreprises organis par le Snat. Encourags par ces succs, les trois associs en oublier aient presque les quelques nuits blanches et week-ends difficiles traverss jusque-l, mme si la validit du projet a toujours fait lunanimit partout o il a t
: PAT
CULTURE EN SERRE HORS SOL : les racines des plantes (sous le plan de tr avail) sont suspendues au-dessus dun bac solv ant, y exsudent les mtabolites synthtiss qui peuvent ainsi tre facilement recueillis.
prsent. Il faut de la patienc e, poursuit Frdric Bourgaud, mais cest une aventure passionnante, dans laquelle jai beaucoup appr is sur le plan humain et la conduite de projets, au-del de la recherche . Cration demplois et entre en bourse Plant Advanced Technologies symbolise donc aujourdhui, six ans aprs sa cration, un passage russi du labora-
toire au systme industriel : On joue fond la carte des partenariats publicpriv pour le bnfice de tous et dans le respect de la recherche publique souligne Frdric Bourgaud. Une dmarche qui a dj permis la cration dune vingtaine demplois. Benot Mignard, embauch comme ingnieur en 2001 avant mme la cration de la socit, en est aujourdhui le responsable de la production. Jean-Paul Fvre, Frdric Bourgaud et Eric Gontier, les membres fondateurs, assurent toujours la direction, mme si ce dernier intervient dsormais depuis Amiens o il occupe de nouvelles fonctions la Facult des sciences. Preuve de lessor pr is ces dernires annes par le projet, PAT SA a fait son entre en bourse en juillet 2009. La socit compte aujourdhui plus de 2 000 actionnaires. Et son activit sest aussi largie avec le dveloppement rcent dune seconde technique dans le laboratoire de Frdric Bourgaud (voir lencadr). Lobjectif est le mme : asseoir la dimension industrielle de Plant Advanced Technologies. Aujourdhui, nous avons plus dides que de chercheurs , concluent les associs, toujours optimistes. Nicolas Chauty-Bacchetta et Ana Poletto
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Ocontacts :
RECHERCHES
& INNOVATIONS
Des chercheurs de lInra et du CNRS ont montr que des extraits dufs de crapaud multipliaient par 40 le taux de reprogrammation de cellules de peau de souris en cellules souches embryonnaires. Pour Jean-Paul Renard, laurier dexcellence de lInra 2010 et co-auteur de ces tr avaux, ces rsultats permettent de mieux compr endre la reprogrammation nuclaire et le dveloppement embryonnaire prcoce.
Ces rsultats reprsentent-ils une rupture dans lobtention de cellules souches partir de cellules diffrencies ? Jean-Paul Renard : Une rupture non, mais une avance, srement. On savait dj reprogrammer des cellules diffrencies en cellules de type embryonnaire par au moins deux mthodes. La premire, dcrite en 2006 par des c hercheurs japonais, consiste injecter dans le no yau de cellules de peau de souris un cocktail de quatre gnes bien spcifiques. Certaines de ces cellules, au bout de plusieurs divisions, donnent lieu des lignes dites iPS (induced pluripotent stem cell). Il a t dmont r chez la souris que le no yau de ces cellules, une fois transfr dans un o vocyte nucl, pouvait conduire au dveloppement dun individu normal comme aprs fcondation. Lautre mthode, que nous utilisons dans not re laboratoire (1), consiste transfrer le noyau de cellules de peau directement dans un ovocyte nucl. Mais dans les
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deux cas, le pourcentage de dveloppement terme est relativement faible. Ce quapportent les extraits dufs de crapaud, cest une augmentation spectaculaire de ce taux de russit e et ce, avec les deux mthodes. Cela signifie quil y a dans le cy toplasme des ufs de crapaud, des facteurs, encore inconnus, qui aident les no yaux diffrencis de souris retrouver un tat embryonnaire. Et, deuxime point important, ces facteurs fonctionnent entre des espces aussi loignes que des souris et des batraciens. Que nous apprennent ces travaux sur les mcanismes de la reprogrammation ? J.-P. R. : Ils raffirment le rle fondamental du cytoplasme de lovocyte dans la reprogrammation de lactivit des gnes. On peut dfinir la r eprogrammation comme la squence dvnements molculaires qui permet un gnome de retrouver un tat embryonnaire puis de donner tous les types cellulaires dun organisme. La
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Orfrence :
Olivier Ganier, Stphane Bocquet, Isabelle Peiffer, Vincent Brochard, Philippe Arnaud, Aurore Puy, Alice Jouneau, Robert Feil, Jean-Paul Renard, and Marcel Mchali. Synergic reprogramming of mammalian cells by combined exposure to mitotic Xenopus egg extracts and transcription factors, PNAS, 9 septembre 2011. Ovido : - Voir aussi une vido sur les cellules pluripotentes induites : www.universcience-vod.fr/tag/cellulepluripotente.html Ocontact : Jean-Paul.Renard@jouy.inra.fr
Aprs un brevet pris en 2010 sur un peptide issu de laits f erments qui agit sur certains facteurs de la dfense intestinale, les recherches se poursuivent sur lanimal pour vrifier les proprits protectrices et cicatrisantes du peptide en conditions pathologiques et v alider lnorme potentiel de cette nouvelle molcule en sant humaine.
a paroi intestinale assure un rle de filtre par rapport au reste de lorganisme : elle laisse entrer les nutriments qui proviennent de la digestion des aliments, et au contraire, elle fait offic e de barrire vis--vis des pathognes et daut res agresseurs tels que les enzymes digestives, les toxines, lacidit. Le mucus qui tapisse la paroi de lintestin joue un rle trs important dans cette fonction de barrire intestinale. Deux quipes de r echerche, R ennes et Lyon (1), ont montr quun peptide du lait stimule la production de ce mucus, et donc lacti vit protectrice de lintestin. Ce peptide est un fr agment de la bta-casine, lune des protines du lait de vache. Il est libr lors de la fermentation du lait. Un double effet protecteur Chez le rat, le peptide administr par voie orale agit sur deux types de cellules de lpithlium intestinal : celles qui produisent du mucus protecteur
et celles qui scrtent des molcules anti-bactriennes. Il exerce donc un double effet de r enforcement de la barrire protectrice et ce, des doses relativement faibles. Cette dcouverte a abouti la prise dun brevet en 2010. Actuellement, les recherches se poursuivent sur cette squence de trente acides amins pour v oir si son rle bnfique, dmontr sur des animaux sains, stend dans des situations pathologiques daltration de la barrire intestinale. Passer dun lait ferment un aliment fonctionnel ou un mdicament Laction combine de certaines souches de fermentation aboutit la production de concentrations suffisantes du peptide dans des laits fer ments, ce qui devrait permettre dobtenir des aliments fonctionnels. Cependant, il reste dmontrer que le peptide conserve bien son activit lorsquil est administr dans un aliment complexe
comme peut ltre un lait fer ment. Dans le cas dune valor isation mdicamenteuse, il est ncessaire de dterminer quelle est la squence minimale active pour pouvoir synthtiser des analogues stables. Un tel mdicament prendrait alors place dans la panoplie de prvention ou de soin des inflammations intestinales, notamment de type chronique, des infections ou encore des ulcres duodnaux. Brigitte Cauvin
(1) UMR Inra/Agrocampus Rennes Science et technologie du lait et de l'uf et U MR Inserm/Universit Lyon1/Inra/Insa Lyon/Hospices Civils de Lyon Cardiovasculaire, Mtabolisme, Diabtologie et Nutrition .
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- Brevet : Peptides increasing the secretion and/or expression of at least one gastronintestinal mucin and/or inducing an increase in the population of mucus cells or paneth cells (WO2010130956). - Programme ANR Emergence betaACTIPROD. Ocontacts : Joelle.Leonil@rennes.inra.fr pascale.plaisancie@inserm.fr
COUPE EN MICROSCOPIE LECTRONIQUE de la paroi de lintestin grle de rat. Les noyaux des cellules pithliales sont colors en bleu. Le mucus est color en rouge.
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RECHERCHES
& INNOVATIONS
Aprs quatre ans de dveloppement, une quipe de l'unit de Biomtrie et Intelligence artificielle base Toulouse lance RECORD. Cette plateforme propose un ensemble d'outils informatiques ddis la modlisation des agr o-cosystmes et leur exprimentation virtuelle. Elle ambitionne in fine de devenir un outil majeur pour l'tude et la gestion des agro-cosystmes.
ujourd'hui, la modlisation est devenue incontournable dans l'tude des ag ro-cosystmes. En effet, les modles sont des outils scientifiques qui permettent de structurer les connaissances sur ces systmes complexes et d'en simuler le comportement sans avoir besoin de tout exprimenter. Ils sont aussi une aide pour la gestion durable de ces agro-cosystmes. Ainsi, on va pouvoir exprimenter virtuellement l'impact de diffrents scnarii de changement climatique , explique Jacques-Eric Bergez, directeur de recherche l'Inra, animateur du rseau des utilisateurs de la plateforme RECORD (REnovation et COoRDination de la modlisation de cultures pour la gestion des agro-cosystmes). La cration de la plateforme rpond un bes oin de partager un cadre commun de modlisat ion . Tout l'enjeu de ce projet est de capitaliser les travaux de diffrentes quipes et de simplifier les processus de mod-
lisation en proposant une sorte de bote outils cls en main. Concrtement, c'est un logiciel libre en open source, que l'on p eut tlcharger et installer sur son or dinateur pour crer des modles, utiliser ceux de la bibliothque, les connecter des bases de donnes et fair e des simulations. Crer des modles complexes L'application fonctionne avec des modules de base grce auxquels l'utilisateur peut v isualiser son modle sous forme d'une reprsentation graphique. L'outil permet ainsi de structurer des modles complexes hirarchiss intgrant toutes les composantes de l'ag ro-cosystme, de l'chelle de la plant e au territoire en passant par les pratiques ou le climat. Exprimenter virtuellement RECORD produit des simulations en fonction de diffrentes variations :
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Oweb :
www.inra.fr/record
Ocontacts :
Helene.Raynal@toulouse.inra.fr jacques-eric.bergez@toulouse.inra.fr
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Troupeaux
L
William Beaucardet
es productions animales au Sud se trouvent dans une situation paradoxale : dune part, rpondre une demande croissante, surtout dans les pays mergents, et dautre part, ne pas trop empiter sur les cultures alimentaires humaines et matriser les impacts de llevage sur lenvironnement. Des levages intensifs aux troupeaux du Sahel, la palette des systmes dlevage est large. Cest de cette diversit que sinspir e la recherche pour proposer des pistes damlioration t ant en efficience quen durabilit, pistes adapter au c as par cas. Ce dossier montre des exemples de travaux mens conjointement par lInra et le Cirad qui allient leurs comptences complmentaires : connaissances gnriques, expriment ations, mais aussi enqutes sur le terrain et formation.
ans la plupart des pays, on observe que laugmentation de la consommation de viande est directement proportionnelle laugmentation des revenus. Ce phnomne gnral est particulirement marqu depuis vingt ans dans des pa ys mergents tels que la Chine, le Brsil et lInde. Le doublement des productions animales anticip pour 2050 permettra seulement aux habitants du Sud datteindre un tiers de la consommation des habitants du Nord.
Llevage gagne du terrain et sintensifie au Sud Llevage au Sud tend sintensifier et se spcialiser, ce qui rpond des
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finalits dconomie dchelle et daccs au march. La taille moyenne des levages augmente rapidement dans de nombreuses rgions tandis que le nombre dleveurs diminue (FAO, 2009). Les levages se spcialisent et tendent se concentrer la priphrie des v illes au dtriment des zones rurales. Ce sont les levages de monogastriques qui se dv eloppent le plus vite : +280% et +200% respectivement pour les effectifs de volailles et de por cs, depuis 1960, contre seulement +50% pour les ruminants. Lintensification induit divers effets ngatifs selon les rgions, tels que : surpturage en terres semiarides (Afrique et Inde), dforestation en Amazonie, accumulation
Chiffres cls
70% des animaux dlevage sont chez des leveurs hors pays industrialiss La moiti des cultures vivrires dans les agricultures familiales des pays en dveloppement utilise des animaux de trait Llevage emploie 1,3 milliard de personnes dans le monde et contribue faire vivre 1 milliard de pauvres dans les pays du Sud
deffluents dlevage (Asie du Sud-Est, rgions insulaires) ou encore rgression des systmes polyculture/levage dans les rgions tropicales daltitude (Afrique centrale, corne de lAfrique, Indonsie, Npal). Llevage remis en question Deux consquences apparaissent critiques. Dune part, laugmentation prvisible des surfaces consacres llevage, dans un c ontexte de comptition possible avec les cultures alimentaires humaines. Car il faut compter non seulement les pturages, qui occupent dj prs de 30% des terres merges hors gel, mais aussi les cultures pour nourrir les animaux (un tiers des t erres cultives sont ddies la pr oduction daliments pour le btail). Dautre part, au Sud comme au Nord, les impacts dfavorables de llevage sur lenvironnement sont points du doigt depuis les annes 90, avec un point dorgue lors de la parution dun rapport de la FAO (1), selon lequel les activits dlevage contribueraient elles seules 18% des missions de gaz effet de serre dorigine humaine (2). Plus rcemment, deux autres rapports majeurs (3) nuancent ce constat en prenant en compte les services cologiques offerts par llevage, son rle conomique et social, et les bienfaits des produits animaux sur la sant humaine, en particulier sur le dv eloppement des enfants (voir tableau). Llevage ne sert pas qu produire des aliments La logique de lintensification rpond principalement la fonction produc-
Pour une vision densemble des impacts de llevage (cas des ruminants)
IMPACTS POSITIFS Source de protines animales Valorisation des espaces prairiaux et des vgtaux non consommables par lhomme Pourvoyeur majeur de fertilisation organique IMPACTS NGATIFS Consommation de ressources : eau, nergie, phosphates, etc. Comptition animal/humain pour les ressources alimentaires Pollution des eaux et des sols (nitrates) Emissions de gaz effet de serr e (CH4, CO2, N2O) Prairies : stockage de carbone Traction pour lagriculture Scurisation montaire, valeurs culturelles, religion Selon les systmes : maintien de la biodiversit et entretien du paysage Selon les systmes : dgradation de la biodiversit et du paysage Dforestation : mission de C O2 Compaction et dgradation des sols
LA COMPLEXIT des impacts contrasts de llevage fait quil est trs difficile d en tablir un bilan global positif ou ngatif, et ce dautant plus quil existe une grande varit de systmes prsentant des impacts galement trs divers.
tive de llevage (viande, lait, ufs, laine). Mais llevage possde bien dautres rles qui sont de plus en plus considrs dans les rfle xions internationales. Dabord, particulirement au Sud, il reprsente un capital sur pied qui participe la scurisation des familles. Nombre dleveurs ne sinscrivent pas dans une logique de march o primerait la productivit, mais dans des stratgies de prservation de leur troupeau face aux alas pour
garder une rserve montaire. De plus, les formes de polyculture/levage, souvent moins productives que les levages spcialiss, ont un rle c onomique indirect en modelant les paysages et en maintenant une diversit de ressources, l encore bnfique en cas dalas. Ces fonctions supplmentaires de llevage diffrent selon les rg ions, Sahel, Amazonie, Vietnam, etc. La recherche les prend en compte, ainsi
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DOSSIER
Exemples de programmes en cours (Inra et/ou/Cirad) dans les domaines des systmes dlevage (en orange) et de la sant (en vert)
Zone mditerranenne : Vulnrabilit de llevage des petits ruminants Sngal : Adaptation au changement chez les leveurs Peuls Guadeloupe : Mesure des missions de mthane Carabes : Rseau cariben de sant animale et vtrinaire (CaribVET) Sahel : Rle de llevage dans la scurisation des exploitations Vietnam : Observatoire des productions animales Afrique : Vaccins contre les maladies ngliges La Runion : Effet dun antioxydant du curcuma dans lalimentation du poulet
que leur influence sur lvolution des systmes dlevage et lacceptabilit des innovations. Que fait la recherche ? Dans ce contexte, la recherche semploie explorer et valuer les diffrents systmes dans t outes leurs composantes et leur diversit (lanimal et son adaptation, son alimen-
tation, sa sant, les produits et la qualit, le march et les filir es) plusieurs chelles : animal, exploitation, territoire, sans oublier la dimension sociale. Il sagit de dgager des pistes pour concevoir des systmes dlevage durables, partir des situations locales. Une des voies consiste remettre en synergie lagriculture et llevage dans des systmes c ombi-
La complmentarit Inra/Cirad
Jean-Baptiste Coulon, chef de dpartement adjoint du dpartement Physiologie animale et systmes dlevage lInra et Philippe Lecomte, directeur de lUMR Selmet* au Cirad, coordonnent le chantier de recherche Inra/Cirad sur les productions animales en rgions chaudes**. Ils expliquent tout le bnfice de cette association. J.-B. Coulon : il y a un besoin de connaissances gnriques pour lever des verrous relevant de la physiologie, de la gntique, de la sant ou lis aux systmes de production. Pour cela, les comptences disciplinaires de lInra peuvent tre mises profit au Sud comme au Nord. Rciproquement, les connaissances progressent mieux quand on largit la gamme des situations tudies : par exemple, tudier la robustesse des animaux dans les pays du Sud peut permettre de dcouvrir de nouveaux mcanismes biologiques dadaptation. Le Cirad, quant lui, possde des terrains dobservation et denqutes dans de nombreuses rgions du monde ainsi quune bonne connaissance des contextes et des acteurs locaux. P. Lecomte : il y a aussi des synergies dans le champ de lexprimentation. En effet, nous avons de plus en plus besoin de mesures pour valuer des impacts conomiques, environnementaux et dresser des bilans. Et nous navons pas toujours les moyens de le faire dans certains pays. Par exemple, la mesure de lmission de mthane est techniquement peu ralisable dans les levages en Afrique. Par contre, nous pouvons le faire dans les installations exprimentales de lInra en Guadeloupe par exemple, dont le climat tropical est comparable celui de lAfrique sub-saharienne. De plus, lassociation Inra/Cirad, qui apporte une masse critique de comptences ainsi que la volont de maintenir des systmes dobservation en situations difficiles, est trs attractive, tant pour les organismes internationaux (FAO, ILRI), que pour les instituts du Sud. Dans le cadre du consortium Agreenium*** qui rapproche recherche et enseignement agr onomiques, elle augmente le pool de c hercheurs impliqus, donc le potentiel dc hanges et de formation, particulir ement en Afrique francophone. Mais aussi ailleurs le Brsil par exemple sapprte envoyer 250 doctorants en France.
*Systmes d'levage mditerranens et tropicaux pour le ple arc mditerranen. ** Un autre chantier Inra/Cirad est en cours sur les questions de sant animale (voir partie 3). *** Agreenium : consortium national pour l'agriculture, l'alimentation, la sant animale et l'environnement, cr en 200 9 runissant lInra, le Cirad, les Ecoles suprieures agronomiques de P aris, Montpellier et Rennes ainsi que lEcole nationale vtrinaire deToulouse.
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durable et locale
De lanimal son alimentation et son mode de conduite, la r echerche sintresse toutes les composantes de llevage. Les travaux conduits au centre Inra des Antilles-Guyane en sont une bonne illustration.
ans la Carabe comme dans dautres rgions du Sud, llevage oscille entre des systmes modernes et des systmes plus traditionnels. Ces derniers concernent aux Antilles un plus grand nombre dleveurs et ont une forte porte sociale dans c ette rgion o le taux de chmage est particulirement lev. Cette situation offre aux chercheurs lopportunit dtudier, dans les mmes conditions, les deux modles et t ous leurs intermdiaires. LInra possde aux Antilles une de ses trois units ddies llevage en rgions chaudes (1). Situe en Guadeloupe, lunit de recherches zootechniques (URZ) regroupe une cinquantaine de personnes. LURZ possde une plateforme exprimentale trs bien quipe et dploye sur deux sites, lun en zone sche et lautre en zone humide, ce qui permet
dtudier une diversit de milieux physiques et de systmes (ptur ages ou hors-sol). Les exprimentations en milieu tropical ralises lURZ compltent les tudes de terrain effectues par les autres units et inversement. Ladaptation, critre cl de recherche On est all, dans les annes 70, jusqu importer en Guadeloupe la chvre alpine, le cochon chinois e t la vache frisonne ! analyse Danielle ClestineMyrtil-Marlin, prsidente du centre Inra Antilles-Guyane. Les objectifs de la recherche taient alors dadapter e t dimplanter les espces de mt ropole aux cosystmes tropicaux. Mais beaucoup ne rsistaient ni au climat tropical, ni au parasitisme ou aux maladies prsentes, et ne sadaptaient pas aux r essources alimentaires disponibles. La
recherche sest alors tourne vers ltude et la valorisation des ressources locales . Tout en conservant des comptences dans ltude des systmes dle vage intensifs, les chercheurs caractrisent depuis quinze ans la gntique des races locales Croles porcines, bovines, ovines et caprines. Ils traquent les mcanismes physiologiques de ladaptation. Face aux contraintes des rgions chaudes (temprature, humidit, maladies), les races Croles ont en effet dvelopp dimportantes capacits dadaptation. Avec le changement climatique et les cr ises sanitaires, ces races locales constituent un rservoir de gnes dun intrt majeur. Par ltude des comportements et de la gntique des porcs Croles et non Croles, lInra explore actuellement des outils de slection gntique pour amliorer la rsistance des levages la chaleur, contrainte majeure pour le
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bien-tre et la pr oductivit animale. David Renaudeau, chercheur lURZ, explique actuellement, la recherche des zones du gnome impliques dans le dterminisme de laptitude tolrer la chaleur est en cours. Ces travaux permettront terme de dvelopper des mthodes de slection plus efficaces, bases sur les marqueurs molculaires. Dbuts en 2011, ils reposent sur un dispositif bas sur des croisements entre des porcs Crole et Large White . Les chercheurs se sont ainsi aperus que la temprature rectale du porc, critre le plus frquemment utilis pour caractriser la sensibilit des animaux la chaleur, est un caractre partiellement hritable gntiquement qui pourrait devenir un critre de slection pour amliorer la productivit porcine en rgions tropicales humides. Les races Croles ont aussi dvelopp des rsistances aux maladies, nombreuses en climat t ropical. Les chercheurs tudient depuis 2000 les gnes impliqus dans la rsistance des petits ruminants aux strongles gastro-intestinaux (parasites du tube digestif occasionnant des pertes de production importantes). Ils tudient galement le dterminisme gntique de la sensibilit la cowdriose, maladie mortelle dorigine bactrienne et transmise par des tiques. Ces recherches sur les populat ions animales indignes restent cependant insuffisantes dans de nombreuses zones tropicales analyse Maryline Boval, directrice de lURZ. En 2007, la FAO a identifi 7 045 races locales et 1 051 races transfrontires. Deux tiers de ces races sont localiss dans les pa ys
De nouvelles ressources alimentaires locales pour plus dautonomie Alors que les donnes abondent sur les proprits nutritives des grandes matires premires dexportation : mas, soja, sorgho, que sait-on des ressources des rgions chaudes telles que les tubercules et fruits amylacs, les protagineux, les gramines et les lgumineuses indignes de ces rgions qui pourraient servir aussi dans lalimentation animale ? C ar pour utiliser de faon optimale ces ressources locales pour nourrir ses btes, lleveur a besoin de connatre plusieurs paramtres, tels que la valeur nutritive de laliment (sa composition chimique, en protines, sucres, fibres, etc.), sa digestibilit (proportion ingre qui est retenue par lanimal), son ingestibilit (quantit pouvant tre ingre
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PORCS CROLES.
par lanimal). Cest pourquoi lInra, le Cirad et lAssociation franaise de zootechnie se sont associs dans un programme de quatre ans pour fournir ces donnes sous forme de tables dalimentation en rgions chaudes, linstar des tables vertes bien connues pour les rgions tempres. Pour cela, les chercheurs collectent le maximum dinformations partir de la bibliographie et de leurs contacts dans diffrentes rgions du monde, Asie, Afrique, et Amrique latine. Ces informations primaires sont rassembles dans un premier temps sous forme dune base de donnes, qui sera hberge sur le sit e de la F AO. Partie prenante de c e projet dampleur internationale, la FAO en finance une partie. 700 fiches descriptives daliments seront disponibles en 2013. Outre les donnes de n utrition de base, elles contiendront dautres types dinformations pour une valuation multicritre plus complte, par exemple, les proprits mdicinales ou la valeur environnementale (consommation dnergie et dintrants pour produire laliment, consquences de leur utilisation sur la composition des effluents mis par les animaux). La synergie levage/agriculture Les chercheurs de lURZ de Guadeloupe ont braqu leur loupe sur les systmes traditionnels de polycul-
BOVINS CROLES en saison sche, levage au piquet, complmentation avec feuilles de canne sucre (en arrire-plan).
ture/levage qui concernent 80% des exploitations antillaises. Grce une approche biotechnique fouille, ils mettent en valeur les pot entialits de ces systmes et pr oposent des pistes
pour les valoriser au mieux. Le principe de base est la c omplmentarit entre culture et levage : les animaux sont nourris par les rsidus agricoles et fournissent en retour lamendement organique du sol par leurs djections. Il en est ainsi par exemple des exploitations combinant la canne sucre et des troupeaux mixtes porcs-ruminants ou encore de plantations de banane associe llevage de porcs. Vritables banques dnergie, la canne sucre et la banane prsentent lavantage dtre disponibles pendant toute la priode dengraissement des animaux. Les chercheurs ont montr rcemment que le jus de canne ou la banane peuvent couvrir tous les besoins nergtiques des porcs sans recourir lusage de crales importes. En ajoutant du tourteau de soja (pour linstant incontournable pour lapport azot), on obtient le mme taux de croissance quavec un aliment industriel complet (crales/tourteau de soja), avec un cot nergtique divis par deux, du fait de lconomie ralise sur la fabrication et le transport des aliments. De plus, ces systmes peuvent valoriser le porc Crole, bien adapt au climat et la chair particulirement goteuse. En effet, avec une nourriture optimale, son taux de croissance, situ habituellement autour de 150-300 g/j , peut
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atteindre 600 g/j. (2). En conditions exprimentales, 0,5 ha de canne ou de banane peut engraisser 30 porcs. Lintroduction de ruminants permet de valoriser toutes les parties de la canne sucre (y compris bagasse et tte de canne), condition pour la rentabilit de lexploitation. La banane est moins chre que la canne car on utilise des bananes dclasses, qui reprsentent jusqu 15 20% de la production. Lensemble des donnes ac cumules sur ce type dexploitations a permis aux chercheurs de les modliser et de calculer, entre autres, les quilibres optimums entre les surfaces cultives et les effectifs danimaux. Les recherches se poursuivent pour utiliser dautres ressources alimentaires locales, en particulier pour lapport en azote : feuilles de manioc, de patate, etc. Sont tudis, entre autres, les ventuels facteurs antinutritionnels et les traitements biotechnologiques qui pourraient les rduire, rendre ces produits plus ingestibles et digestibles (schage, ensilage, conversion en farine). Pour Harry Archimde, directeur de recherche lURZ, il y a des obstacles surmonter pour que ces innovations soient acceptes par les agriculteurs, par exemple le cot en travail ou la rputation de toxicit de certains vgtaux, comme le manioc. Mais pas seulement... Le progrs est toujours plus rapide sur les critres biotechniques que sur lappropriation de nouvelles pratiques. Il faut aussi considrer les critres
sociologiques. Une dmarche de recherche plus participative pourrait contribuer rduire les dlais .
Les pratiques traditionnelles sont efficientes Les chercheurs ont revisit llevage au piquet, qui concerne encore actuellement 90% des le vages de bovins en Guadeloupe. Maryline Boval, qui a effectu sa thse sur cette pratique traditionnelle, rsume : avec un piquet et une chane, lleveur utilise moindre cot des sur faces rduites et diversifies (en friche, pentues, les arrires de mangrove...) parfois non valorisables autrement. De plus, contrairement aux apparences, le systme est intensif, on peut e n effet conduire des troupeaux de plus de 40 ttes et atteindre des vitesses de croissance leve (700 g/j) ainsi que des niveaux de charge impor tants (4 bovins par ha) . Lleveur conomise les cltures et les intrants et surtout bnficie de la fle xibilit du systme : il peut jouer sur le nombre de dplacements par jour, sur la longueur de la c hane, sur le dlai de retour sur une parcelle pour optimiser la fois son ptur age et sa pr oduction de viande.
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La flexibilit, un concept du Sud qui inspire le Nord La flexibilit est lun des matres-mots de llevage au Sud. Car prser ver le potentiel de son t roupeau dans des conditions parfois difficiles savre plus important que maximiser la production. Les leviers sont varis selon les systmes. Au Sahel par e xemple, les leveurs prennent en pension les animaux dune autre famille, ce qui permet de renforcer les liens de solidarit et de minimiser les alas climatiques locaux grce une plus grande dispersion gographique. La gestion de leur troupeau est galement souple, la transhumance par exemple dpend de la disponibilit en herbe. Les bliers et les taureaux sont prsents demeure dans le troupeau, ce qui permet dtaler les mises bas, toujours en prvision de priodes climatiques dfavorables. Les chercheurs de lInra ont galement tudi des le vages en Uruguay et en Argentine, pour lesquels on distingue des leviers de flexibilit externes (pluriactivit, gestion collective) et internes (extensivit, diversification des priodes de mises bas et des produits, larges possibilits dadaptation des itinraires techniques selon le c ontexte). Pour Benoit Dedieu (3) cette notion de flexibilit gagne les levages du Nord, qui ont aussi besoin de marges de manu vre dans
ARCHTYPE DE BIODIVERSIT VGTALE, les jardins croles qui bordent de nombreuses habitations font office la fois de garde-manger et de pharmacie : ici, igname, malanga, canne sucre. Quelques animaux au piquet (porcs, c hvres) profitent de lombre des arbres et entretiennent la fertilit.
un contexte de plus en plus incertain : volatilit des prix mondiaux, diminution des soutiens lagriculture en Europe et affirmation des risques climatiques .
(1) Les deux autres sont : - lunit SELMET Systmes d'levage mditerranens et tropicaux, base Montpellier : unit mixte Cirad/ InraSupAgro de Montpellier qui regroupe une soixantaine de personnes, dispose de plusieurs sites exprimentaux prs de Montpellier ainsi que de terrains en Mditerrane, au Sngal et La Runion.
- le laboratoire de recherche sur le dveloppement de llevage (LDRE) de Corte en Corse, qui tudie les parcours mditerranens et les dispositifs de qualification. (2) Ce taux de croissance reste cependant infrieur celui du porc Large White, moins bien adapt au climat mais prfr dans les systmes intensifs (850 g/j). (3) Directeur de recherche lunit METAFORT Mutations des activits, des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux, Inra de Clermont-Ferrand.
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Les conditions climatiques, environnementales, socio-conomiques et sanitaires des rgions chaudes favorisent le dveloppement dun ensemble de maladies inf ectieuses au sein des levages. Quelles soient uniquement animales, ou tr ansmissibles lhomme (zoonoses), ces maladies reprsentent un risque sanitaire et conomique important tant pour les pays du Sud que pour ceux du Nor d. Depuis les pizooties de grippe aviair e et de fivre catarrhale ovine, les pouvoirs publics questionnent la recherche pour comprendre les mcanismes biologiques et cologiques mis en jeu dans la diffusion des pathognes et mettr e au point des outils de contrle des pizooties plus efficaces, bass sur des rseaux de surv eillance plus performants.
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prs trois ans de vac cination systmatique des vingt millions de ttes de son cheptel, le Maroc vient en 2011 de contrler la peste des petits ruminants sur son t erritoire. Cette victoire est par tage par lUMR de lInra-Cirad Contrle des maladies animales exotiques et mergentes (CMAEE) de Montpellier. Laboratoire mondial de rfr ence pour la peste des petits ruminants, lUMR a paul le Maroc dans sa lutt e en lui fournissant ds 2008 des outils de diagnostic rapide, des souches vaccinales et des technologies.
La peste des petits ruminants aux portes de lEurope Maladie trs contagieuse et souvent ltale, elle touche principalement les chvres, les moutons, mais aussi les dromadaires et les espc es sauvages. Dcouverte en 1942 en Cte dIvoire, la peste des petits r uminants sest dveloppe sur une grande partie du territoire africain, atteignant le Moyen-Orient et lAsie du Sud-Ouest. Avec lintensification des changes commerciaux et interrgionaux, le virus est encore en extension et la distribution gographique des lignes virales change. Aux portes de lEurope,
il menace ses levages : lAlgrie et la Tunisie viennent leur tour de dclarer en 2011 des fo yers sur leur territoire. LUMR CMAEE t ravaille aujourdhui sur de nouveaux vaccins et stratgies de contrle contre ce virus : Nous amliorons les vacc ins pour quils soient plus facilement utilisables sur le ter rain et que la rpons e immunitaire quils entranent puisse tre distingue de celle confre par les virus sauvages, explique Renaud Lancelot, pidmiologiste au Cirad. Nous aidons au dveloppe ment des rseaux nationaux et rgionaux de surveillance, et nous dveloppons des
modles pidmiologiques permettant de tester des st ratgies de cont rle au niveau international. Ces travaux se font en collaboration avec nos partenaires du Sud dont nous contribuons dvelopper les comptences . La fivre catarrhale ovine contenue La fivre catarrhale ovine (FCO), encore appele bluetongue ou maladie de la langue bleue, est une autre de ces menaces. Considre comme une maladie exotique avec une rpartition tropicale jusquen 1998, la FCO a cependant fait son appar ition au Sud de lEurope, o plusieurs sr otypes (1) ont t identifis (1, 2, 4, 9 et 16, sur les 26 srotypes viraux rpertoris dans le monde). Maladie virale transmise par des mouc herons du genre Culicodes, elle touche les ruminants domestiques et sauvages. La FCO atteint la Corse en 2000, et en 2006, un srotype absent du t erritoire europen apparat aux Pays-Bas et en Belgique. La recherche franaise a anticip : elle sest depuis cinq ans attele mieux c onnatre le v irus. Stphan Zientara, directeur de l'UMR Anses/Inra/ENVA Maisons-Alfort, dtaille : cest un v irus que nous avions dj identifi comme une
menace pour lEurope. Les quipes franaises ont dmarr un programme de recherche sur la FCO en 1995, sur la physiopathologie de la maladie, sur la gnomique du v irus et la biolog ie de son vecteur et sur ltude du comportement hte-pathogne. Elles ont galement modlis mathmat iquement le comportement du vecteur pour crer un outil de dtection de la FCO sensible et efficace . LUMR Anses-Inra-
cole vtrinaire devient un laboratoire de rfrence en FCO partag avec le Cirad. Les mesures de lutte sont prises par la Direction gnrale de lAli mentation : une vaste campagne est lance en 2010 pour vac ciner lensemble du cheptel franais de bovins, ovins et caprins. Aujourdhui la situation semble sous contrle : aucun nouveau cas na t rpertori en France en 2011, et les pa ys transfrontaliers recensent beaucoup moins de foyers. Mais la surveillance est toujours dactualit : de nouveaux srotypes peuvent apparatre dans les rgions ou pays encore infects en Europe et dans le pourtour mditerranen. Un cortge de maladies surveiller Foyers de g rippe aviaire toujours latents en Asie (voir encadr), incursions rgulires du moustique vhiculant la fivre de la valle du Rift en Egypte, invasion du Sud de lEurope par un moucheron vecteur de la fivre catarrhale ovine et de la peste quine, progression de la peste porcine africaine vers les tats balt es Les conditions climatiques des rgions chaudes favorisent le dveloppement dun ensemble de parasites et darthropodes vecteurs de maladies infectieuses et parasitaires. La prsence de ces maladies reprsente pour les pays du Nord un risque constant dint roduction
ECOUVILLONNAGE sur le terrain pour un diagnostic rapide de la peste des petits ruminants.
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dagents pathognes e t de vecteurs remarque Renaud Lancelot. Quelles soient uniquement animales, ou quelles soient transmises lhomme (zoonoses) ces maladies dorigine exotique prsentent un risque sanitaire et conomique important. Les pouvoirs publics lont compris : microorganismes et pathognes ne connaissent pas de frontires. Malgr les restrictions budgtaires fortes, les maladies mergentes infectieuses - particulirement les maladies vector ielles (2)- sont lune des pr emires priorits du ministre des Affaires trangres, lorsquil intgre le Sud dans ses proccupations analyse Dominique Martinez directeur de lUMR CMAEE. Il observe : Suite lmergence de la fiv re catarrhale ovine et du virus H5N1, les ministres de lAgriculture et de la Sant se sont rapprochs de la r echerche pour t rouver des solutions aux problmes sanitaires. Leffectif de not re unit de r echerche sur la sant animale a doubl de puis 2005 : il faut pou voir rpondre au mieux aux risques causs par ces maladies mergentes et proposer des mthodes de lutte . Car la seule mise au point du vaccin nest pas suffisante : entre la dcouverte du vaccin contre la peste bovine et son radication mondiale en 2011, il sest coul une cinquantaine dannes pendant lesquelles les quipes sur le t errain diagnostiquaient, vaccinaient, surveillaient. Les rseaux de surveillance La surveillance sanitaire est aujourdhui lun des points clefs de la lutte contre les maladies animales mergentes. Le rseau CaribVET cr par le Cirad en 1998 pour sur veiller et contrler les maladies animales dans la rgion Carabe est un modle que les organisations internationales essayent de rpliquer dans daut res rgions du monde. Depuis une trentaine dannes, le rseau Cirad travaille sur le vecteur de la cowdriose, la tique Amblyomma variegatum qui infecte et tue (jusqu 90% de mortalit) les ruminants domestiques sensibles. La cowdriose est rpandue dans la presque totalit des pays dAfrique subsaharienne et est prsente depuis 1928 dans les Carabes do elle me nace le continent amricain. Pour rpondre ce problme sanitaire, la recherche sest intresse aux questions de terrain et a tiss des partenariats en sant animale avec les vtrinaires et les laboratoires de la rgion Carabe. Cela a abouti en 1998 la c ration de Car ibVET
explique Renaud Lancelot. Cette russite dans lpidmio surveillance a t duplique sur le pourtour de locan indien avec Animal Risk, en Mditerrane avec le rseau mditerranen en sant animale R emesa Pour Dominique Martinez, la cration de rseaux rgionaux de surveillance contribue transmettre des alertes rapides que lon connecte la recherche et dont on ex ploite directement les donnes. Les allers-retours entre la recherche et la sur veillance vtrinaire sont de plus en plus encourags et bnfiques pour lensemble de la filire animale
Dossier rdig par Ccile Poulain et Pascale Mollier Responsables scientifiques : Jean-Baptiste Coulon et Philippe Lecomte
(1) Serotype : ensemble des caractristiques antigniques de certains micro-organismes permettant de diffrencier des souches appartenant une mme espce. (2) Maladies vectorielles : virus ou bactrie hberg par un vecteur (tiques, moustiques) quil transmet un organisme vivant. La plupart sont des zoonoses, maladies qui peuvent tre transmises de lanimal lhomme.
+dinfos
Oweb :
Rapport de la FAO : World Livestock 2011Livestock in food security, www.fao.org Voir les vidos du Carrefour de linnovation agronomique Antilles, 3-4 novembre 2011 : www.inra.fr/audiovisuel/web_tv/ciag/ciag_ antilles_guyane_2011
Opublications :
Inra Productions animales, numro spcial : Elevage en rgions chaudes, 2011, volume 24, numro 1. Cahiers Agricultures 2010. Transformation des systmes d'levage extensif dans les territoires ruraux. n 19 (2). Cahiers Agricultures 2010. Transformations des systmes dlevage et du travail des leveurs. n19 (5).
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dcrypte
Larchitecture vgtale
Nous avons ainsi pu dmontrer, contrairement aux modles thoriques admis, que lors de lorganogense, ce nest pas la couche extrieure de la cellule qui se dforme et devient plus lastique, mais les couches lintrieur . Cest une cascade de ractions physico-chimiques lintrieur de la paroi des cellules en diffrenciation qui aboutit la croissance diffrentielle des tissus. En observant ce changement de proprits chimiques et mcaniques, Alexis Peaucelle, dtach pour loccasion dans le laboratoire de physique Matires et systmes complexes de luniversit Paris Diderot, a dmontr que cest essentiellement la modification de forme de la pectine qui provoque le changement dlasticit de la paroi. Et ce ramollissement serait un vnement ncessaire et suffisant la cration de nouveaux organes vgtaux. Ce phnomne se vrifie chez des plantes aussi diffrentes que la vigne, le pin ou le Ginkgo Biloba... Alors que dans ce domaine les recherches investissent surtout la biochimie, ltude des phnomnes mcaniques pourrait ouvrir dautres pistes dtudes, tant sur le contrle de la phyllotaxie des plantes que sur le contrle de croissances pathologiques ; certains insectes ravageurs provoquent la surface des feuilles des excroissances dans lesquelles se dveloppent leurs larves. Nous esprons quen comprenant comment fonctionne la rgulation de la formation des organes, notre travail apportera un clairage nouveau sur les capacits de rsistance aux pathognes des plantes conclut Alexis Peaucelle. La nouvelle utilisation de lAFM pour les fruits, par exemple, permettrait de visualiser les mcanismes de maturation lintrieur des parois mais aussi les forces cohsives entre les plantes et leurs ravageurs. Le chercheur et ses partenaires ont pu dmontrer que cette mthode dobservation fonctionne sur les cellules vgtales mais aussi sur des organismes animaux, comme les tentacules en formation des mduses, ou le systme nerveux central des poissons.
Les dcouvertes dAlexis Peaucelle, chercheur de lInra, rendent possible la mesure des caractristiques mcaniques dun tissu vivant en croissance. Cette approche, associant gntique du dveloppement, biochimie et biophysique, permet de dmontrer le rle clef de la mcanique des parois cellulaires dans les processus de croissance et de gnration de nouveaux organes.
mpossible prdisent plusieurs physiciens Alexis Peaucelle lorsquil dcide en 2006, dans le cadre de son doctorat, dutiliser lAFM, microscope force atomique, pour observer et mesurer les proprits mcaniques dune paroi dune cellule vgtale en croissance. Et pourtant. De ttonnements en partenariats transdisciplinaires, ce bouillant cratif a russi bouleverser quelques dogmes en phyllotaxie - discipline tudiant la disposition des organes chez les vgtaux - et faire avancer les recherches sur la croissance cellulaire par lutilisation dun nouveau mode dobservation. Ce microscope parcourt la surface des chantillons tudis l'aide d'une pointe effile munie dun ressort trs
souple. Les dplacements de cette pointe dans les trois plans de l'espace permettent de reprsenter aussi bien des structures biologiques complexes que des atomes. En imposant des pressions varies de la pointe sur la surface de lchantillon, lAFM peut estimer les proprits mcaniques de diffrentes zones. En jouant sur les caractristiques techniques de lappareil, Alexis Peaucelle a prouv quil est possible, laide dune certaine combinaison de gomtrie de la pointe, de mesurer llasticit dune surface, mais galement celle dune zone en-dessous. Cette technique novatrice permet de nouvelles observations biophysiques de lintrieur des tissus dans les organes vivants. Cest une premire mondiale !
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Q REPORTAGE
Alexis Peaucelle
Leve dinhibition
Photo dun mristme floral aprs leve dinhibition de la mthylestrase. Des boutons floraux se forment immdiatement, ne respectant plus la forme originale de la plante, sa phyllotaxie.
Echelle : photo de 400 m de ct Microscopie lectronique balayage
Ce travail montre limportance inattendue du changement dtat de la pectine dans la formation des organes. Son rle est aussi fondamental que lauxine, hormone jusqu prsent beaucoup plus tudie dans ces phnomnes de cration de nouveaux organes.
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Orfrence :
Peaucelle A., Braybrook S.A., Le Guillou L., Bron E., Kuhlemeier C., Hfte H. Pectin-Induced Changes in Cell Wall Mechanics Underlie Organ Initiation in Arabidopsis. Curr Biol. 2011 Oct 4. Ocontact : Alexis.Peaucelle@versailles.inra.fr
Ccile Poulain
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Alexis Peaucelle
Les canards, friands de jeunes pousses de mauv aises herbes, pourraient tre une solution alternative la lutte chimique dans les rizir es de Camargue !
a panisse (Echinochloa crus galli) et le t riangle (Cyp races) sont deux btes noires des riziculteurs camarguais. Ces mauvaises herbes infestent les rizires, rendant trs difficile la culture de riz bio deux annes suc cessives : elles peuvent faire chuter jusqu 80% les rendements. Jean-Claude Mouret, chercheur lUMR Innovation de Montpellier prcise : pour tre rentable, une production de riz biologique doit atteindre un rendement minimum qui se situe, compte tenu du prix actuel, autour de 4 tonnes/ha soit 8 t/ha sur deux annes conscutives. Mais cet objectif est
difficile atteindre la deuxime anne du fait dune trop forte infestation par les adventices. Malgr la rotation, le stock de graines de mauvaises herbes peut compromettre durablement la production de riz. . Sinspirant de pratiques observes en Asie et exprimentes au Japon, lUMR Innovation a test sur une exploitation rizicole biologique, lassociation de canards la cultur e du riz. Consommant les graines et les jeunes pousses dadventices, les canards pourraient contrler linfestation des mauvaises herbes dans les rizires.
Lexprimentation a dmarr en 2011 avec lappui de F ranceAgriMer dans le cadre du plan dadaptation de la filire rizicole. a cancane en Camargue Sur sept hectares de riz de deuxime anne , le riziculteur Bernard Poujol a fait pturer 300 canettes mulardes pendant un mois et demi, de mi-juin fin juillet, lors du tallage du riz : les canards ont t achets lge de t rois jours et levs dans une serre amnage avant leur introduction dans les rizires. Jai apprivois les canards et les ai habitus pntrer dans les r izires, se familiariser avec les cltures lectriques . Lagriculteur a ralis un semis enfoui en lig nes en remplacement dun semis la vole, pour permettre aux canards de se frayer un passage plus facilement. Je les accompagne dans la rizire et
volff - Fotolia.com
BERTRAND POUJOL, install sur son exploitation depuis 2006, teste diffrents itinraires techniques agrocologiques pour le dsherbage de ses cultures de riz. Linfestation des rizires par les mauvaises herbes est le premier facteur qui impacte les rendements de riz tant en culture biologique quen culture conventionnelle.
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REPORTAGE
les change de parcelles quand il le faut. Ce sont des btes trs faciles manuvrer, des partenaires trs intelligents, cest un plaisir ! L es canards font peu de dgts sur le riz, circulent et nettoient linter-ligne : ils fouillent la terre et ttent panisses, triangles et autres herbes, leur faisant ainsi perdre leffet de concurrence sur le riz. Ils ont une relle efficacit de dsherbage . Un herbicide qui a dj ses palmes Les premiers rsultats, collects suite la rcolte doctobre 2011, sont concluants : en consommant les jeunes plantules de mauvaises herbes, les canards ont rduit la biomasse des adventices de lordre de 20 % et permis une augmentation du rendement de 26 % par r apport une par celle sans dsherbage. Le riziculteur est trs satisfait et compte renouveler lexprience : Grce au broutage des canards, il est possible de cultiver du riz deux annes de suite en atteignant une moyenne annuelle de 5 t/ha ! Cela scurise les revenus de lexploitation. Dautant plus que les cots du dsherbage sont absorbs par la ve nte des canards : jai prvu de vendre 75 % des canards, le reste servant lducation des jeunes : cest un dsherbant qui me permettra au final de gag ner de largent ! . Lexprimentation sera poursuivie en 2012, pour affiner litinraire technique. Des flamants roses en adjuvant Dj, dans les r izires, les canards saffairent. Ils assainissent la rizire des graines d'adventices et leurs djections fertilisent le sol a vant les prochains semis. Lagriculteur les a rintroduits une fois la rcolte finie, sinspirant de lactivit des flamants roses quil avait observe un an aupar avant. Pendant
leur sjour de quelques semaines sur lune de ses par celles en eau, les oiseaux avaient consomm des graines dadventices et ar la t erre par leurs pitinements et coups de becs. Les mesures de lUMR I nnovation semblent confirmer ces observations : les stocks de graines dadventices du sol sont plus faibles sur les deux parcelles mises en eau pendant lint erculture que sur les autres. LUnit tudie dautres techniques alternatives pour lutter contre lappa-
rition de mauvaises herbes dans les rizires de Camargue. Tester des techniques de faux semis , augmenter la densit de semis, introduire des lgumineuses dans la rotation, tudier linfluence du surpturage des brebis dans les parcelles en rotation avec le riz Jean-Claude Mouret a dores et dj discut du protocole pour raliser un nouveau prototype avec l'ensemble des riziculteurs biologiques intresss par la dmarche en 2012. Ccile Poulain
Orfrence : Jean-Claude Mouret, Roy Hammond, Gatien Falconnier et al. Conception et valuation participatives ditinraires techniques alternatifs la lutte chimique pour contrler les mauvaises herbes dans les rizires de Camargue. Compte rendu dtude scientifique : convention Inra/FranceAgriMer ( paratre). Oweb : A voir le reportage sur cette exploitation au journal de Tf1 : http://videos.tf1.fr/jt-20h/des-canardspour-desherber-les-rizierescamarguaises-6638562.html A suivre galement : Premire Confrence internationale sur Les systmes de production rizicole biologique , Montpellier, du 27 au 30 aot 2012. www1.montpellier.inra.fr/orp2012
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Economiser en achetant
Christine Espinoza, qui dirige le Service A chats de lInra, explique sa stratgie pour acheter de faon la fois conome et adapte aux b esoins diversifis de tous les corps de mtiers de lInstitut.
os activits de directeur dunit font que v ous devez vous inscrire un colloque ? Utilisez la Carte Achats pour payer ! Vous devez partir en tant quexpert scientifique en mission ltranger ? Prenez un billet FRAM pour le dplacement ! Vous grez lunit en tant que secrtaire et avez besoin de fournitures de bureau ? Passez votre commande auprs dOffice Dpt Autant doutils qui facilitent la v ie quotidienne, chaque fois que lon doit acheter une fourniture ou faire raliser une prestation de service.
Tous les agents de lInra sont des acheteurs potentiels De fait, les achats atteignent 163 millions deuros, soit 17,8% du budget de lInstitut (donnes 2010). Il y avait dj un Ser vice des Marchs et de la rg lementation
lInra, mais cest en 2001 (dix ans dj !) que le Service des Achats actuel a t cr pour rflc hir aussi aux gains que lon peut obtenir en achetant, ainsi quaux outils, entre autres informatiques, que lon peut mett re en uvre pour aider acheter. Cette rflexion a pris alors la for me dun vritable credo servi par une politique dachat en trois priorits : 1 Il faut veiller ce que lachat soit correctement tabli, cest--dire selon les rgles de scur it juridique qui ont t mises en plac e ds lor igine dans la passation des marchs. 2 Il faut tre efficace conomiquement. Cest possible, soit en ralisant des gains, soit en rduisant les fr ais. Par exemple, le march de billetterie nationale FRAM a permis dconomiser 270K/an sur un total de 7 millions deuros et de rduire les cots avec des relevs doprations mensuels et non plus des factures au cas par cas.
Par exemple, nous avons mis en place la Car te Achats qui per met un paiement direct.
Des conomies substantielles Sur ces bases, un nouveau service est n en 2007, le SCAMER , Service Coordination Achats-Marchs Et Rglementation, pour organiser au mieux les marchs, ce qui a amen aux marchs nationaux dinformatique, de car burants, de revues lectroniques, jusquaux rcents marchs de tlphonie o le gain optimum de 50% dconomies sur trois ans est atteint, soit 1,7 million deuros dconomie, avec la combinaison des marchs de tlphonie fix e (Completel et France Telecom) ainsi que mobile (SFR). Ces rsultats permettent lInra de se positionner favorablement dans le contexte actuel de la Rv ision
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REPORTAGE
Gnrale des Politiques Publiques (RGPP) o le Ser vice des Achats de lEtat (SAE) prconise 15% dconomie sur trois ans. En ce sens, le SCAMER, en per ptuelle recherche de la meilleure stratgie dachat, a entrepris de concert avec les autres EPST et les Universits, une refonte de la nomenclatur e des produits et ser vices (le rfrentiel inter-EPST actuel) pour atteindre une meilleure compatibilit des achats avec les ralits du t errain, la fois pour les scientifiques des units de recherche et pour les services dappui
la recherche. Lapproche Dveloppement Durable, avec entre autres ltude de la consommation nergtique des matriels scientifiques, doit tre galement une faon de mieux valoriser lachat aussi bien t echniquement quconomiquement. Lachat dcrypt et ddramatis Le SCAMER sest fait une spcialit de mettre son portail achat disposition de tous, en internet auprs des fournisseurs pour les publicits, et en intranet auprs des agents de lI nra
Humour et pragmatisme
Ptillante et dynamique, mais aussi modeste, Christine Espinoza dtourne bien vite les questions sur son parcours personnel vers les proccupations professionnelles qui sont les siennes depuis quelle dirige le Service Achats de lInra : rendre lachat intelligent, en dfinissant mieux les besoins de chacun et en simplifiant les procdures. Elle nous dmontre que mieux acheter peut tre un gain dans tous les sens du terme. Arrive lInra en 1990 aprs une formation de droit priv et une premire exprience des marchs lInserm, elle dirige actuellement une quipe de trois juristes et de deux acheteurs. Son entre lInra satisfait son attirance pour la recherche, et, conclut-elle avec humour, le choix dun Institut dagronomie fait parfaitement cho mon ct terre--terre !
pour la rglementation des marchs publics et des achats. Nul besoin cependant dtre juriste ou conomiste pour tre au courant des procdures suivre pour les achats. Par exemple, un synoptique des seuils et en consquence des formalits respecter pour acheter est accessible t out un c hacun de manire concise : il sagit des rgles de publicit et de mise en concurrence. Pour le reste, savoir recommandations et conseils aviss, lditorial humoristique propose chaque mois une revue de lactualit des achats et marchs : chacun peut y trouver linformation espre aussi bien sur les nouvelles dispositions du c ode des Marchs Publics que sur la der nire enqute concernant lhbergement. Il est loin le temps o le march reprsentait une fin en soi, dsormais lachat est considr avant tout comme un moyen de satisfaire un besoin qui doit tre bien dfini en c ette priode de vigilance budgtaire ! Christine Espinoza
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Ocontact : Oweb :
Pascale Mollier
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Veterinary Research
Vous tes rdacteur en chef de la revue depuis presque trois ans, parlez-nous de lobjet de cette revue ? Michel Brmont : Veterinary Research est une revue scientifique en langue anglaise, soutenue depuis trs longtemps par le dpartement de Sant animale de lInra. Elle accueille tout article novateur concernant la bactriologie, la parasitologie, la virologie, limmunologie, lpidmiologie et les maladies prion. Nous privilgions les tudes vis ant comprendre les mcanismes mis en jeu dans les interactions htes-pathognes lors des processus infectieux. Les publications port ant sur les maladies zoonotiques, cest--dire celles qui touchent aussi lhomme, et les maladies mergentes sont galement prises en compte. Comment sont choisis les articles que vous publiez ? M. B. : Un bureau ditorial slectionne les articles parmi la trent aine de propositions qui lui parviennent chaque mois. La moiti des soumissions est rejete pour ne garder que les communications de haute qualit qui seront envoyes des relecteurs, experts de leur domaine. Quarante experts internationaux constituent notre bureau consultatif. Je suis second par une secrt aire de rdaction, Elodie Coulamy, et par Wendy Brand Williams qui assure la correction linguistique des manuscrits. Cinq rdacteurs associs europens prennent en charge chacun lune des disciplines couvertes par la revue, et, en t ant que virologiste, je suis le sixime, en plus de ma fonction de rdacteur en chef.
Pourquoi dites-vous que la revue est numro 1 de son secteur ? M. B. : Il sagit du classement international des revues, labor par spcialit scientifique. Veterinary Research est visite mensuellement par 5 000 scientifiques provenant dune centaine de pays. Ses articles les plus populaires sont consults environ 700 fois dans les deux mois qui suivent leur publication. Sur les 14 0 revues du domaine des sciences vtrinaires, son facteur dimpact est pass de 2,3 3, 7 en six ans, la hissant la toute premire place de sa spcialit. Ce rsultat est essentiellement le fruit du travail des rdacteurs en c hef prcdents. Avec louverture en libre accs sur le web, nous avons aussi mis au point une nouvelle formule auteur-payeur en relation avec notre diteur BioMed Central. Nous esprons que ces nouveaux modes de consultation vont permettre de conforter notre rang. Propos recueillis par Brigitte Cauvin
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Ocontact : Oweb :
Michel.Bremont@jouy.inra.fr www.veterinaryresearch.org
I NRA MAGAZINE N18 OCTOBRE 2011 I NRA MAGAZINE N19 DCEMBRE 2011
IMPRESSIONS
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IMPRESSIONS
en bref
la biodiversit ?
OPeut-on prserver
Bruno Fady, Frdric Mdail
Cette synthse, ralise par un chercheur et un enseignant, nous claire sur les multiples facettes de la conservation des espces. Dans un langage direct et clair, parfois interrogatif, elle permet de percevoir la ralit et les enjeux de ce sujet qui nest simple quen apparence.
ditions Le Pommier, collection Les Petites Pommes du savoir, septembre 2011, 64 p., 4,90
Ce livre est la restitution de textes ns dateliers et de dbats tenus depuis 18 mois par une runion dacteurs, publics et privs, en prise avec des chercheurs de lInra et du Cirad. Une mine pour comprendre les points essentiels de systmes alimentaires durables.
ditions Qu, collection Matire dbattre et dcider, dcembre 2011, 248 p., 32
Quest-ce que lamlioration des plantes ? Pourquoi et comment cre-t-on une varit ? Lauteur explique les diffrentes mthodes de slection et de cration de varits, et les nouveaux outils tels lhaplodiplodisation et les marqueurs molculaires. Cet ouvrage prcis et didactique est destin aux tudiants et aux professionnels du secteur.
ditions Qu, collection Savoir faire, octobre 2011, 280 p., 19 (13,30 en pdf)
OPLUMES ET PINCEAUX HISTOIRES DE CANARDS Denis Chavigny EDITIONS QUAE, COLLECTION BEAUX LIVRES, OCTOBRE 2011, 144 P., 29 (20,30 en pdf)
ODU CACAO LA VANILLE, UNE HISTOIRE DES PLANTES COLONIALES Serge Volper EDITIONS QUAE, COLLECTION BEAUX LIVRES, OCTOBRE 2011, 144 P., 26
ette histoire des oiseaux deau est conte par un naturaliste et peintre animalier. Le livre prsente une centaine dillustrations, choisies parmi plus de 20 000 croquis et aquarelles raliss par lauteur au cours de ses recherches esthtiques et thologiques. Les commentaires invitent la dcouverte des murs de ces animaux : morphologie, r eproduction, nutrition, communication, rites de toilette, techniques de vol Des vies doiseaux aquatiques saisies sur le vif, couc hes sur le papier en direct de la nature.
rachide, caoutchouc, banane, caf, coton nombreux sont les produits de plantes tropicales qui font partie de notre quotidien. Ce livre retrace lge dor de ces productions agricoles et leur importance dans les pays dAfrique jusqu la priode rcente. Son iconographie exceptionnelle est tire du fonds de la bibliothque historique du Cirad. Cest aussi un livre qui allie la grande histoire aux petites, avec notamment des rcits sur quelques personnalits marquantes de cette poque.
ORUSTICIT : LANIMAL, LA RACE, LE SYSTME DLEVAGE ? Bernard Hubert, Thomas Romagny, coord. ASSOCIATION FRANAISE DE PASTORALISME - AGROPOLIS - CARDRE EDITEUR, 120 P., JUILLET 2011, 20
es douze communications rassembles dans ce livre, fruit dun sminaire tenu Montpellier en 2010, permettent dapprocher la notion de rusticit dun animal : gntique de races petits ou grands effectifs, systmes pastoraux, pr ojets territoriaux, changements techniques ou sociaux, relations homme-animal dlevage Un moyen de comprendre une chane conomique : le point de dpart est un cosystme exploit par un animal dit rustique, sillonnant des espaces pour en tirer son alimentation, avec pour rsultante la prsence dune activit humaine qui entretient des ptures et des estives, ou encore des territoires parfois peu accessibles et dlaisss.
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ditions Qu
A partir des travaux des philosophes des sciences, lauteur montre que la science, ne dans une culture, en est lexpression ou le visage. Louvrage, construit pour sensibiliser les chercheurs la rflexion philosophique, invite le lecteur assumer son s avoir scientifique dans la socit qui est la sienne et le dpasser .
ditions Qu, octobre 2011, 168 p., 29
Ce livre apporte une premire synthse nationale sur les sols, leur proprit et leur rpartition. Sur cette composante essentielle de notre environnement, il reprend les travaux dinventaires, de cartographie et dtudes pour les proposer sous forme illustre : schmas, cartes, photographies intgrs dans un CD-rom. Il permet galement la corrlation entre la taxonomie franaise et le rfrentiel international.
ditions Qu, collection Synthses, octobre 2011, 624 p., 48
Cette nouvelle dition du guide aborde les tapes de la description des sols et de leur environnement : choix des emplacements tudier, matriel utiliser, acquisitions et traitement des informations. Cest un livre pour bien mener les investigations et les interprter en termes de pdogense, et de diagnostic agronomique ou forestier.
ditions Qu, collection Savoir faire, novembre 2011, 432 p., 38
www.quae.com
c/o Inra - RD 10 F-78026 Versailles Cedex
sur le web
e dictionnaire, de prs de 600 mots relatifs au vocabulaire et aux concepts de lagronomie francophone, est un projet fonctionnant sur le mode collab oratif : un comit ditorial anime la collecte de textes auprs de spcialistes et les valide avant leur mise en ligne. L e projet, coordonn par Pierre Morlon (Inra Dijon), vient douvrir son site web et pr opose ses premires dfinitions. A vos claviers !
OLE GIS RELANCE AGRONOMIQUE www.gis-relance-agronomique.fr
Association Franaise dAgronomie, association cre en 2008 pour regrouper une communaut scientifique et technique par-del les mtiers dagronomes, propose sa nouvelle revue. Le premier numro est consacr au Grenelle de lEnvironnement et il est disponible en ligne. LAFA, prside par Thierry Dor enseignant-chercheur lAgroParisTech, est un cercle dchanges et de dbats sur le thme agronomie et socit . Elle organise tous les deux ans les Entretiens du Pradel.
e Groupement dIntrt Scientifique est un lieu de concert ation et d'orientation sur la stratgie, les mthodes et les actions conduites dans les c hamps de la recherche, de lexprimentation, du conseil et de la formation agricole. Le rseau est constitu de six membr es fondateurs : le ministre de lAgriculture, lInra, AgroParisTech, lActa, lApca, lOnema ; sy sont joints en t ant que membres associs : Coop de France, le rseau TRAME et le rseau RAD -CIVAM. Il est ouvert dautres membres qui souhaiteraient sassocier cette dmarche collective.
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REGARD
o Coutellec, jeune chercheur en philosophie des Sciences lInsa de Lyon, a conduit avec lInra un travail dinter disciplinarit sur les poissons gntiquement modifis. Le projet Dogmatis a permis de rflchir au processus dlaboration des connaissances et danticiper sur des stratgies daction futur es.
Quel est le point de dpart et la finalit de ce chemin collectif adopt par les partenaires ? Lo Coutellec : Loriginalit, cest la cration dun vritable labo ratoire de sciences interdisciplinaires autour des poissons transgniques. Les OGM vgtaux, tudis depuis la fin des annes 70, sont mdiatiss depuis plus de quinze ans. On se souvient de la Confrence des citoyens du snateur Le Daut en 1998 pour fair e partager des connaissances au public, mais aprs ? Le poisson transgnique (appel PoGM) est en revanche peu connu. A part des poissons daquarium commercialiss aux USA et Tawan, aucune espc e de consommation na encore t autorise. Rel pour le c hercheur, virtuel pour le consommateur, ce poisson nest pas encore devenu un fait public. Ce qui permet de rflchir prven-
tivement sur la faon dapprhender ce nouvel objet technique , en sortant des cadres controverss et des oppositions qui se rptaient depuis longt emps selon les mmes termes. Pour cela, chaque spcialiste - sociologue, juriste, conomiste, biologiste, philosophe - peut apporter ses connaissances ou laborer des discours. Chacun dtient une partie des dimensions de l'objet, mais une partie seulement. Tous vont questionner leur discipline pour y dnicher les lacunes, les opacits, ce que l'on peut appeler des non-savoirs. A partir de ce matriau, nous avons construit un processus interdisciplinaire pour faire merger de nouvelles questions de r echerche et clairer les dcisions. Que savions-nous de ltat des connaissances ? L.C. : Les PoGM, sils nexistent pas pour le public, sont bien des ralits dans les labor atoires. Nous nous sommes appuys sur environ 400 publications internationales, concernant une trentaine despces dlevage. En rapprochant plusieurs donnes - tat de la recherche, du march, de la lgislation des pays producteurs - nous avons estim que des lignes de cinq espc es pourraient faire lobjet dune demande de c ommercialisation, dont quatre sont prsentes sur le march franais : la carpe, la truite, le saumon et le tilapia, ces deux dernires espces tant importes. Laquaculture est au cur des enjeux alimentair es mondiaux : elle reprsente aujourdhui la moiti de la consommation mondiale de poisson, mais cest une pratique trs rcente. Pour donner une image, on peut dire que llevage de poissons a fait, en 25 ans, le mme chemin que
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lagriculture depuis le Nolithique. Or nous avons constat que la proposition de PoGM pour l'aquaculture ne va pas de soi. Elle demande t re instruite bien en amont de toute dcision de commercialisation. A la lumire des turbulences survenues autour des OGM vgtaux, dautres pays ont-ils questionn les disciplines de la mme manire que vous ? L.C. : Jai donn un argument de poids la dmarche de Dogmatis en tudiant de faon dtaille les quinze ans du processus dvaluation de la demande de commercialisation dun saumon transgnique aux USA, processus qui dure encore aujourd'hui. Cette tude m'a permis de constater les faiblesses et l'impr oductivit, tant scientifique que sociale, des cadres actuels de l'valuation des nouveaux objets techniques. Au sein de Dogmatis, nous avons choisi de ne pas nous engager directement vers lvaluation des risques, sanitaires comme environnementaux, et de partir dun point zr o : dabord dfinir collectivement lobjet, puis en explorer toutes les dimensions. Chacun a questionn sa discipline sans en altrer lintgrit, revisitant au besoin ses mthodes. La dmarche de Dogmatis est assez diffrente de celle de lexpertise qui convoque les disciplines sur un objet dj connu, pour faire merger des convergences de vues et par tager les derniers acquis scientifiques. Nous nous situons lamont de lanalyse des risques, pour construire une interdisciplinarit sur les lacunes plutt que sur les certitudes. Quels sujets avez-vous abords ou restent approfondir dans le projet ? L.C. : Le collectif a t en mesur e de mieux valuer plusieurs domaines comme celui de la ralit de la pr oduction, des risques de prsence fortuite dans les circuits commerciaux, de la per ception, de la dt ection et de la traabilit ou encore de llaboration dun droit par anticipation. Nous avons fait progresser la rflexion plus loin que nous ne lavions imagin, sur la conceptualisation du processus dinterdisciplinarit, sur la modification de notre conception des sciences. Nous avons aussi trait des questions relatives la structuration et lconomie des filires aquacoles, au dveloppement de certains pays par rapport dautres, la brevetabilit des animaux ou des gnes Nous nous sommes interrogs sur la construction de la dimension thique en regard des processus dlaboration des savoirs. Et puisque notre sujet tait un animal, nous avons galement ouvert la problmatique du bien-tre de ce nouvel animal dlevage. Que retirez-vous personnellement de ce travail ? L.C. : Une satisfaction norme et, en tout premier lieu, celle davoir conduit une thse en philosophie des sciences au cur d'un pr ojet interdisciplinaire sur un objet au devenir incertain. Au dpart, je ne savais presque rien au plan scientifique sur la question des P oGM, mais jai ralis aprs coup que ctait un atout plus quune faiblesse pour tenir ma place dans un tel projet. Un savoir commun s'est construit progressivement. Satisfaction de g roupe
Gntique/Philo, aller-retour
Dogmatis (Dfi des OGMs Aquatiques, Impacts, Tendances et Stratgies) est un rseau de recherches pour construire une interdisciplinarit sur le thme des poissons gntiquement modifis. Soutenu par lAgence Nationale pour la Recherche (20072010), il runit six partenaires : lInra, AgroParisTech, lUniversit de Nice-Sophia Antipolis, lInsa de Lyon, lUniversit de Toulouse Le Mirail, et le CN RS. Dix-huit spcialistes ont rassembl leurs comptences en gntique, dtection dO GM, droit, conomie, sociologie, philosophie et pistmologie. Ils ont organis une restitution fin 2010, et rdigent actuellement un ouvrage qui sera publi en 20 12 aux ditions QUAE. Le projet a t coordonn par Muriel Mambrini, gnticienne des poissons. Pour Lo Coutellec, ce fut le terrain dtude de sa thse en philosophie des sciences, supervise par Anne-Franoise Schmid (philosophe et pistmologue lInsa de Lyon) et soutenue Lyon en dcembre 2011.
galement, pour avoir montr quil est possible de faire travailler ensemble des disciplines diffr entes, dans un esprit collectif et ouvert, avec des rsultats tang ibles et publiables. Linterdisciplinarit nest pas un m ythe ni une injonction, elle est une ralit quand on part sur de bonnes bases et que l'on abolit les hirarchies pour atteindre une sorte de dmocratie des disciplines ! Muriel Mambrini, qui a pens le projet, lui a donn une impulsion fondamentale en veillant ce que chaque discipline ait le mme poids. La dmarche que nous avons conduite est reproductible pour bien dautres sujets. Elle permet douvrir les possibles a vant que les pr oblmes ne se posent directement. Propos recueillis par Brigitte Cauvin
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AGENDA
15 dc 2011
PARIS - COLLGE DE FRANCE
24/26 janvier
NARBONNE
Paul Colonna, dlgu scientifique au dveloppement durable lInra, assurera la leon inaugurale de la Chair e Dveloppement durable - environnement, nergie et socit. Il dispensera galement un cours sur les bioner gies, de janvier mars 2012, et un sminaire sur les biotechnologies vertes et blanches, en fvrier 2013. WWW.college-de-france.fr/default/EN/all/act_agenda/index.jsp
Lobjectif de ces 5 es journes est de runir des acteurs dhorizons et de cultures diffrents sur la thmatique des biofilms microbiens. Organises par le Rseau national biofilms et l'Inra. WWW.montpellier.inra.fr/montpellier/toute_l_actu/biofilms
6/8 fvrier
RENNES
7/8 fvrier
PARIS
VIIe
Les interactions durables sont les interactions interspcifiques qui persistent dans le temps t ant lchelle des espces quau niveau de la vie des individus. Parmi elles, on retrouve les systmes hte-parasite ou hte-mutualiste. Le but de ce rseau est de crer un espace dmulation au sein de la communaut concerne. Or ganisation : Inra/Agrocampus Ouest/Universit Rennes 1. https://colloque.inra.fr/reid2012
L'objectif est de permettre la diffusion rapide auprs des partenaires de la filire, des rsultats de la recherche qui peuvent avoir des applications directes. Ceci pour contribuer la comptitivit de cette filir e, tout en rpondant aux demandes socitales (respect de l'environnement et du bien-tre des animaux, scurit alimentaire des produits). WWW.journees-recherche-porcine.com
19 janvier
PARIS MAISON DE LA CHIMIE
26 janvier
PIERROTON (33)
Le mme jour seront inaugurs de nouveaux btiments du programme Contrat de Projet Etat Rgion Ple FortBois de Pierroton Cestas.
www.inra.fr