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Huellas de la Evolución Celular: La Teoría Endosimbiótica.

Huellas de la Evolución Celular: La Teoría Endosimbiótica.

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Published by Carlos de Paz
Versión ampliada de la comunicación a los "XXIII Encuentros de Didáctica de las Ciencias Experimentales" (Almería, Sep. 2008).
Práctica para la introducción de la bioinformática. (NIvel: 2ºBachillerato, Universidad)

La versión reducida está publicada en las Actas de los XXIII Encuentros de Didáctica de las Ciencias
Experimentales.
Almería 9-12 de septiembre de 2008.
www.23edce.com
Editorial: Editorial Universidad de Almería
ISBN: 978-84-691-5088-7
D.L.: Al-963-2008
Versión ampliada de la comunicación a los "XXIII Encuentros de Didáctica de las Ciencias Experimentales" (Almería, Sep. 2008).
Práctica para la introducción de la bioinformática. (NIvel: 2ºBachillerato, Universidad)

La versión reducida está publicada en las Actas de los XXIII Encuentros de Didáctica de las Ciencias
Experimentales.
Almería 9-12 de septiembre de 2008.
www.23edce.com
Editorial: Editorial Universidad de Almería
ISBN: 978-84-691-5088-7
D.L.: Al-963-2008

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1
H
UELLAS
M
OLECULARES
D
E
L
A
E
VOLUCIÓN
C
ELULAR
,
L
A
T
EORÍA
E
NDOSIMBIÓTICA
 
Dr. Carlos de Paz Villasenín & Luís José Míguez Rodríguez
1
 
Resumen
: Se presenta una actividad destinada al alumnado de la asignatura Biología de 2º de Bachillerato. Se pretendeintroducir los procedimientos básicos de la investigación biológica a través de herramientas bioinformáticas, utilizando comoescenario la demostración de la teoría endosimbiótica mediante secuencias disponibles en bases de datos moleculares reales.
Palabras clave
: Biología, 2º Bachillerato, Bioinformática, SIB, Teoría Endosimbiótica.
Introducción
Según el ordenamiento actual, todo organismo vivo pertenece a uno de los tres dominios de la vida:Bacteria (Eubacterias o bacterias “verdaderas”), Archaea (Arqueobacterias, un “anciano” grupo de bacteriasque viven en hábitats con condicionesextremas) y Eukarya (incluyendo hongos,plantas y animales superiores). LasEubacterias (comúnmente llamados“Bacterias”) y las Arqueobacterias, a losque conjuntamente llamamos Procariotas,son organismos unicelulares y son, encuanto a su estructura celular, mucho mássimples que las células eucariotas. Nopresentan compartimentación interna y, lomás significativo, no contienen una envoltura nuclear alrededor de su ADN, es decir, no tienen núcleo.Contrariamente a los procariotas, los eucariotas son unos recién llegados a la Tierra, apenas llevan aquí 2billones de años, en comparación con los 3,5 billones de años de antigüedad de los procariotas. Las célulaseucariotas son frecuentemente más grandes y mucho más complejas que las procariotas; contienen núcleo yorgánulos internos especializados como mitocondrias o cloroplastos. Estos orgánulos cumplen funciones
1
 
IES “A Sardiñeira”. Dpto. de Bioloxía e Xeoloxía. A Coruña (Spain)
 
 
2
específicas. Por ejemplo, la mitocondria produce energía para la célula en forma de ATP. Los eucariotasincluyen tanto organismos unicelulares como pluricelulares, incluyendo, entre otros muchos, plantas, hongosy animales.La Teoría Endosimbiótica de la Evolución fue propuesta por LynnMargulis en 1970. Margulis proponía que las mitocondrias y los cloroplastos decélulas eucariotas eran originalmente procariotas que fueron “engullidos” por otros procariotas. De acuerdo a la teoría, ciertos procariotas adquirieron lahabilidad de utilizar el oxígeno acumulado en la atmósfera en procesos máseficientes de oxidación de compuestos orgánicos proporcionando cantidadesde energía sin precedente. Esto proporcionaba una considerable ventaja a unorganismo hospedador que, en lugar de digerirlo, estableciese con él unarelación de simbiosis en la que uno proporciona nutrientes y protección,mientras el otro produce energía suficiente para ambos.Aunque hoy en día la teoría está generalmente aceptada, fue duramente criticada cuando Margulis lapropuso. Efectivamente, muchos científicos sólo aceptaron sus postulados cuando años después, en 1981,Lynn obtuvo
evidencias moleculares
que apoyaban su teoría a través del uso de herramientasbioinformáticas
2
.Gracias a los avances en genética y tecnología computacional, las herramientas bioinformáticas hancrecido de forma espectacular en velocidad, fiabilidad y disponibilidad, hasta el punto de estar a disposiciónde cualquiera que disponga de un terminal conectado a Internet.En este tutorial se indican los pasos a seguir para obtener evidencias que apoyan la TeoríaEndosimbiótica, usando el
Entorno Educativo de “Biology Workbench”
, traducción al castellano delBiology Student Workbench
(SIB)
de la Universidad de Illinois, que facilita en gran medida el acceso delalumnado de bachillerato a las herramientas más habituales en bioinformática.
2
 
Publicadas en su libro “Symbiosis in Cell Evolution”.
 
 
3
El SIB es la versión Educativa de “Biology Workbench” una colección de herramientas bioinformáticasque, entre otras cosas, permite a los usuarios:
 
La búsqueda de secuencias, tanto de proteínas como de ácidos nucleicos, en diferentesbases de datos moleculares.
 
El análisis de esas secuencias, incluyendo el alineamiento múltiple y la comparacióncuantitativa.
Fundamento
Para generar datos que soporten la Teoría Endosimbiótica, vamos a utilizar herramientasbioinformáticas para buscar secuencias con alto grado de similitud (homología) con genes mitocondriales ycloroplásticos de dos organismos eucariotas simples. El problema al que nos enfrentamos es que lassecuencias de genes eucariotas y procariotas que vamos a comparar han evolucionado de formaindependiente durante 2 billones de años. Incluso si originalmente las mitocondrias o los cloroplastos fueroncélulas procariotas, después de 2 billones de años sus genomas podrían haber sufrido cambios suficientespara que no existiese punto alguno de similitud con el genoma procariota original. Una solución a esteproblema es escoger la secuencia de un gen que sea absolutamente indispensable para la supervivencia dela célula. Con este condicionante habría sido altamente conservado ya que cualquier mutación ocurrida en elmismo, que ocasionase cambios importantes en relación a su función, habría sido letal para la célula.Usaremos por lo tanto secuencias mitocondriales y cloroplásticas de nuestros eucariotas simples y lascorrespondientes de diferentes tipos de procariotas para construir árboles filogenéticos. Asumiendo quecuanto antes divergen dos organismos a partir de un antecesor común, más diferentes serán sus secuencias

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