Ancaman serangan penyakit ini bisa disebabkan oleh beragam faktor diantaranya adalah, pertama, mobilitas manusia dan

barang yang makin mengglobal menyebabkan virus menyebar secara cepat dan luas. Kedua, virus dapat datang sebagai serangan senjata biologis musuh. Berbeda dengan senjata nuklir yang membutuhkan teknlogi canggih, senjata biologis sebaliknya, dengan teknologi yang sangat sederhana, bahkan dengan cara yang sederhana seperti pengiriman virus atau bakteri melalui jasa pengiriman barang. Serta ketiga, strategi pembangunan ekonomi negara yang tidak merata ke seluruh wilayah.

Saat ini di Indonesia ada beberapa daerah yang rawan terhadap separatisme yaitu, Aceh, Maluku, dan Papua. Gerakan separatisme tersebut muncul terutama disebabkan oleh kekecewaan terhadap pemerintah terkait dengan ketimpangan distribusi ekonomi, diskriminasi politik dan peminggiran sosial-budaya masyarakat setempat.57 Perdamaian yang tercapai antara GAM-RI merupakan salah satu contoh keberhasilan penyelesaian masalah separatisme di Aceh. Namun pencapaian tersebut juga harus dibarengi sejumlah penyelesaian lain, khususnya terkait dengan penyelesaian akar masalah konflik yang berupa ketimpangan ekonomi, diskriminasi politik dan peminggiran sosial-budaya masyarakat setempat, serta kekerasan dan pelanggaran HAM. Hal ini harus menjadi perhatian penting dalam penyelesaian separatisme di Indonesia, apalagi jika menilik pola pikir pemerintah yang cenderung parsial dan tak terarah

Konflik perbatasan dapat menjadi persoalan serius bagi Indonesia di masa depan jika melihat belanja militer yang terus meningkat dan tren modernisasi persenjataan negara-negara tetangga Indonesia yang makin beorientasi ke laut (sengketa perbatasan Indonesia sebagian besar berada di laut). Konflik perbatasan, eskalasinya dapat saja berkembang menjadi perang terbatas karena peningkatan kekuatan militer yang dimiliki oleh negara-negara tetangga tersebut tentu saja akan meningkatkan kemampuan dan rasa percaya diri mereka untuk melakukan perang memperebutkan klaim wilayah, apalagi jika Indonesia tidak mampu menjalankan strategi penggentaran.

Pencurian pun dilakukan hampir setiap hari.70 Selain merugikan negara, pencurian ikan tersebut juga merugikan nelayan-nelayan Indonesia yang melaut di perairan tersebut. Sehingga pencurian ikan tersebut juga menyebabkan akses ekonomi nelayan indonesia tertutup.

Ditengarai kerugian negara akibat penyelundupan ini sangat besar. Sebagai contoh, penyelundupan satwa liar saja diperkirakan nilainya lebih tinggi dari nilai penyelundupan kayu71 dimana dalam penyelundupan kayu Indonesia mengalami kerugian rata-rata sebesar Rp 30-45 triliun per tahun.72 Selain itu, pembalakan dan penyelundupan kayu juga mengakibatkan hilangnya sumber penghidupan bagi penduduk di lingkungan sekitarnya, maraknya kebakaran, tanah longsor, dan banjir. Penebangan liar dan penyelundupan kayu juga mengancam eksistensi banyak spesies hewan dan tumbuhan yang terancam punah.

Di Asia Tenggara, Indonesia merupakan salah satu negara yang menjadi target serangan jaringan terorisme internasional. Wilayah operasi para teroris ini menyebar ke seluruh wilayah Indonesia, Masalah global lainnya yang potensial menjadi ancaman bagi indonesia adalah terorisme. Sebagai dampak tragedi 9/11 di AS, dunia disibukkan oleh isu ancaman terorisme global. Berdasarkan penyelidikan FBI paska Tragedi 9/11 disinyalir Al-Qaeda telah memperluas jaringannya operasinya ke wilayah Asia Tenggara. Fokus perhatiannya adalah negara-negara Asia Tenggara yang mayoritasnya beragama Islam seperti Indonesia dan Malaysia.25 Selain persoalan mayoritas masyarakat Indonesia beragama Islam, pilihan Indonesia untuk menjadi target serangan kemungkinan juga dipengaruhi lemahnya sistem keamanan serta kurang maksimalnya pengawasan negara terhadap mobilitas orang dan barang di wilayah-wilayah perbatasan dan pintu-pintu masuk negara seperti bandara dan pelabuhan laut. Selain juga adanya faktor domestik, seperti ketidakjelasan policy politik pemerintah dan DPR di bidang keamanan, ketiadaan profesionalitas aparat keamanan, korupsi dan sistem pemerintahan yang tidak berjalan dengan baik.

Kegiatan ilegal dan kejahatan lintas negara seperti penyelundupan manusia, senjata, perdagangan obat-obatan terlarang, pencucian uang, imigran gelap, menunjukan peningkatan yang tajam. Tindakan ilegal dan kejahatan lintas negara umumnya menimbulkan kerugian terhadap negara lain, dan sangat mungkin berkembang mengganggu keamanan kawasan sera mengganggu hubungan antar bangsa. Peningkatan tersebut antara lain didorong oleh masalah politik, kesenjangan ekonomi, serta adanya jaringan kejahatan lintas negara berskala internasional. Pergolakan politik dan disparitas ekonomi di beberapa negara telah menimbulkan migrasi berskala besar yang berusaha mencari peluang kerja dan iklim kehidupan yang lebih baik di negara lain. Di samping itu, dampak kesulitan ekonomi yang menyebabkan kesulitan mendapatkan lapangan kerja, juga mendorong manusia untuk melakukan segala cara agar dapat bertahan hidup. Kejahatan lintas negara dilakukan secara terorganisasi dalam suatu jaringan antar negara, digerakkan oleh aktor dengan dukungan teknologi dan finansial sehingga diperlukan upaya yang sistemati dan kerjasama antar negara untuk mengatasinya.

Penambangan pasir laut di perairan sekitar Kepulauan Riau yakni wilayah yang berbatasan langsung dengan Sinagpura, telah berlangsung sejak tahun 1970. Kegiatan tersebut telah mengeruk jutaan ton pasir setiap hari dan mengakibatkan kerusakan ekosistem pesisir pantai yang cukup parah. Selain itu mata pencaharian nelayan yang

semula menyandarkan hidupnya di laut, terganggu oleh akibat penambangan pasir laut. Kerusakan ekosistem yang diakibatkan oleh penambangan pasir laut telah menghilangkan sejumlah mata pencaharian para nelayan. Penambangan pasir laut juga mengancam keberadaan sejumlah pulau kecil karena dapat menenggelamkannya, misalnya kasus Pulau Nipah. Tenggelamnya pulau-pulau kecil tersebut menimbulkan kerugian besar bagi Indonesia, karena dengan perubahan pada kondisi geografis pantai akan berdampak pada penentuan batas maritim dengan Singapura di kemudian hari.