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cahier d'exercice1

cahier d'exercice1

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FACULTE DE MEDECINE
FACULTE DE MEDECINE
PIERRE & MARIE CURIE
PIERRE & MARIE CURIE
2005-2006
EDITE PAR LES ENSEIGNANTS DE BIOCHIMIE
Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1
Prot\u00e9ine /2
Facult\u00e9 de M\u00e9decine Pierre & Marie Curie
CAHIER D'EXERCICES POUR PCEM1
BIOCHIMIE
I. PROTEINES
S OMMA I R E
Page
1. Techniques d'\u00e9tude des prot\u00e9ines........
3
2. Fonctions des prot\u00e9ines...................
6
3. Structure des prot\u00e9ines...................
9
4. Enzymologie.............................
13
4.1 G\u00e9n\u00e9ralit\u00e9s...........................
13
4.2 Enzyme Micha\u00eblien....................
14
4.3 Enzyme Allost\u00e9rique................\u2026
16
4.4 Probl\u00e8me de r\u00e9vision....\u2026\u2026 .........
17
5. QCM.....................................
19
6. Annales du concours.....................
22
Image de couverture :
Structure d'un cristal de BRCA2, une prot\u00e9ine d\u00e9ficiente dans des formes h\u00e9r\u00e9ditaires de
cancer du sein(Science-13sep2002 : www.sciencemag.org)
Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1
Prot\u00e9ine /3
Facult\u00e9 de M\u00e9decine Pierre & Marie Curie
1. TECHNIQUES D\u2019ETUDE DES PROTEINES
1.1

Le volume n\u00e9cessaire \u00e0 l\u2019\u00e9lution (Vel) d\u2019une prot\u00e9ine sur unecolonne de gel filtration est fonction inverse du poids mol\u00e9culaire(Mr). La courbe d\u2019\u00e9talonnage ci-dessous est trac\u00e9e \u00e0 partir des r\u00e9sultats report\u00e9s dans le tableau :

Prot\u00e9ine
Mr
Vel (ml))
bleu de dextran*
106
85
lysosyme
14 000
200
chymotrypsinog\u00e8ne
25 000
190
ovalbumine
45 000
170
s\u00e9rum albumine
65 000
150
aldolase
150 000
125
ur\u00e9ase
500 000
90
X
?
130
*le bleu dextran est un polym\u00e8re de haut PM
a. Expliquer l\u2019ordre d\u2019\u00e9lution des prot\u00e9ines.
b. Evaluer le PM de la prot\u00e9ine inconnue X.
1.2
Une prot\u00e9ine \u00e9tudi\u00e9e pargel filtration dans un tampon aqueux \u00e0 pH7 pr\u00e9sente un poids
mol\u00e9culaire apparent de 160.000 daltons. Si cette prot\u00e9ine est soumise \u00e0 une
\u00e9lectrophor\u00e8se sur gel en pr\u00e9sence de SDSla r\u00e9v\u00e9lation montre 2 bandes
correspondant \u00e0 des poids mol\u00e9culaires apparents de 50000 et 30000.
\u2022
Expliquer ces r\u00e9sultats.
1.3
Expliquer et commenter ces affirmations.
a.Les prot\u00e9ines sont tr\u00e8s peu solubles \u00e0 leur point iso\u00e9lectrique (pHi).
b.Pour une valeur de pH sup\u00e9rieure \u00e0 son pHi une prot\u00e9ine est charg\u00e9e n\u00e9gativementet
pour une valeur depH inf\u00e9rieure \u00e0 son pHi une prot\u00e9ine est charg\u00e9e positivement.
1.4

Une solution contenant de l\u2019albumine (pHi= 4,6), de la\u03b2-lactoglobuline (pHi = 5,2) et du chymotrypsinog\u00e8ne (pHi= 9,5) est charg\u00e9e sur unecolonne de DEAE cellulose \u00e0 pH 5,4. (Le DEAE est une mol\u00e9cule charg\u00e9e positivement)

La colonne est \u00e9lu\u00e9e par ungradient de NaCl de concentration croissante.
\u2022
Proposer un ordre d\u2019\u00e9lution de la colonne pour ces prot\u00e9ines.
1.5

Soit uneprot\u00e9ine oligom\u00e9rique d\u2019un poids mol\u00e9culaire (PM) de240 000 Daltons. Sa structure quaternaire est \u00e9tudi\u00e9e par la d\u00e9termination des poids mol\u00e9culaires \u00e0 l\u2019issue de divers traitements :

a.Traitement par le mercapto\u00e9thanol 0,1M: donne uniquement des structures
prot\u00e9iques d\u2019un PM de120 000 D.
b.Traitement par l\u2019ur\u00e9e 4M: donne uniquement des structures prot\u00e9iques d\u2019un PM de 80
000D.
c.Traitement par le mercapto\u00e9thanol 0,1M et l\u2019ur\u00e9e 4M: donne uniquement des
structures prot\u00e9iques d\u2019un PM de 40 000 D.
\u2022
Quels sont les effets des diff\u00e9rents traitements ?
\u2022
Quelle est la structure quaternaire de cette prot\u00e9ine ?

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