TRANSCRIPCION DEL RNA

INTRODUCCION
La expresin de la informacin gentica contenida en un segmento de DNA siempre requiere la sntesis de una molcula de RNA. Durante el proceso de transcripcin , una enzima, llamada RNA polimerasa, convierte la informacin gentica de un segmento de DNA en una hebra de RNA con una secuencia complementaria a una de las hebras del DNA.

Estructura y propiedades del RNA

El RNA , al igual que el DNA es un polmero lineal de nucletidos unidos por enlaces fosfodiester 3',5' , a diferencia del DNA los nucletidos en el RNA son ribonucletidos, y se encuentra la base uracilo en lugar de la timina. La presencia caracterstica en el RNA del grupo hidroxilo 2' (2'OH) en la ribosa hace que la molcula de RNA sea ms susceptible a la hidrlisis

Estructura y propiedades del RNA

El RNA normalmente esta compuesto de una sola hebra, pero puede formar regiones de doble hlice intramolecular que le dan una conformacin tridimensional. El RNA es la nica molcula que tiene funciones informacionales y catlticas.

Tipos de RNA
1.
RNA mensajero (mRNA), lleva la informacin que codifican para la secuencia de aminocidos de uno o ms polipptidos especificados por un gen o conjunto de genes hacia los ribosomas donde se realiza la sntesis de las protenas. Tienen una vida media que va de minutos a horas. RNA de Transferencia (tRNA), es una molcula adaptadora que lee la informacin codificada en el mRNA y transfiere el aminocido apropiado a la cadena polipeptidica 1. en crecimiento durante la sntesis de protenas. Tiene una vida media que va de horas a das.

Tipos de RNA
1. RNA ribosomal (rRNA), molculas que asociadas con protenas forman el ribosoma. Tienen una vida media que va de horas a das. 2. RNA pequeo del ncleo (snRNA), se encuentran formando complejos con protenas conocidas partculas ribonucleoproteicas pequeas del ncleo o "snurps". Estas se encuentran en el ncleo de las clulas eucarioticas y participan en el procesamiento de los pre-mRNA.

Tipos de RNA
3. RNA de virus, muchos virus de bacterias, plantas y mamferos tienen RNA como material gentico. 4. Ribozimas, algunas enzimas tienen RNA como una parte integral de sus sitios activos. Tambin hay enzimas que son puro RNA.

TRANSCRIPCION EN PROCARIONTES
La bacteria E. coli una sola RNA polimerasa es la responsable de toda la transcripcin que ocurre en la clula. Tiene las siguientes caractersticas estructurales y funcionales. Tiene 6 subunidades funcionales: 2 subunidades alfa, una subunidad beta, una subunidad beta prima , la subunidad o factor sigma y una subunidad omega

Formas de la RNA polimerasa

La enzima ncleo, compuesta de 2 subunidades alfa, una subunidad beta y una subunidad beta prima. Es capaz de copiar ambas hebras del DNA pero carece de especificidad. La RNA polimerasa holoenzima, es la forma totalmente funcional de la enzima. Consiste de la enzima ncleo ms el factor sigma. Tiene especificidad y reconoce seales especficas de inicio de transcripcin en el DNA conocidas como regiones promotoras, debido a la presencia del subunidad o factor sigma que reconoce las regiones promotoras y que luego de la iniciacin se disocia.

RNA Polimerasa
la sntesis de RNA llevada a cabo por la RNA polimerasa es semejante a la sntesis del DNA. sintetiza una hebra de RNA aadiendo unidades de ribonucletidos al extremo 3' terminal de una cadena de RNA, construyendo una cadena de RNA en direccin 5'->3.

Requerimientos de la RNA polimerasa

Para su actividad la RNA polimerasa requiere: Un DNA molde Mg ++ o Mn++ Los cuatro ribonuclesidos trifosfatos (ATP, GTP,UTP,CTP)

Mecanismo general de la transcipcion

La RNA polimerasa requiere un DNA de doble cadena como molde. Sin embargo durante la transcripcin de un gen en particular, slo una de las hebras del DNA llamada hebra anti-sentido o hebra molde (antisense strand) , es copiada a RNA. La hebra de DNA complementaria a la molde se le llama hebra con-sentido (sense strand).

Mecanismo II
La direccin de la transcripcin es 5'->3', lo que significa que la hebra molde es leda en direccin 3'->5'. A diferencia de las DNA polimerasas , las RNA polimerasas no requieren RNA cebadores o primers. Durante la transcripcin , la RNA polimerasa desenrolla parcialmente la doble hlice del DNA.

Mecanismo III
Conforme se mueve a lo largo del DNA una regin de aproximadamente 17 pares de bases se mantiene desenrrollada. Debido a que los nucletidos son incorporados al RNA teniendo como regla el apareamiento de bases con la hebra molde del DNA, se forma un hbrido transitorio DNA-RNA de 12 pares de bases justo detrs del sitio de polimerizacin.

Mecanismo IV
Posteriormente , el RNA se libera del molde y las dos cadenas del DNA se unen. La RNA polimerasa aade entre 40 - 50 nucletidos por segundo.

PROMOTORES
La sntesis del RNA se inicia en un promotor PROMOTORES. Un promotor es una secuencia de DNA a la cual la RNA polimerasa se une, para posteriormente iniciar la transcripcin.

Pasos de la Transcripcin
La RNA polimerasa se desliza a travs del DNA buscando promotores. Cuando encuentra un promotor migra a la regin -35, formando lo que se conoce como "complejo cerrado".

Pasos II
Luego el DNA es desenrrollado en aproximadamente 17 pares de bases formando un "complejo abierto" que empieza en la regin -10, y que descubre la hebra molde en el sitio de iniciacin. Despus de la iniciacin la subunidad sigma se disocia de la RNA polimerasa y la enzima ncleo con el proceso de elongacin de la transcripcin.

Terminacin
1. Terminacin independiente de factor, que consiste en una secuencia de nucleotidos que permite la formacin de una region apareada con forma de alfiler en el mRNA seguida de un tramo de residuos de uracilo (U). 1. Terminacin dependiente de factor, requiere de un factor proteico. El sitio de terminacin llamado rut (el nombre viene de rho utilization) , es reconocido por un factor especfico llamado rho.

RIBOSOMAS
TRADUCCIN O SNTESIS DE PROTENAS

INTRODUCCIN
La clula necesita miles de protenas diferentes en un determinado momento. Las protenas son sintetizadas de acuerdo a las necesidades de la clula. Una vez sintetizadas son transportadas a un sitio apropiado dentro de la clula.

INTRODUCCIN
Son degradadas cuando ya no se necesitan. En las clulas eucariticas intervienen ms de 300 macromolculas . Se utiliza casi un 90% de la energa celular para la sntesis de polipptidos.

INTRODUCCIN
La traduccin es la sntesis de protenas dirigida por RNA. Se requiere la participacin de 3 clases de RNA. El proceso que lleva a la capacidad de formar un enlace peptdico es muy complejo.

CDIGO GENTICO
Es la relacin que hay entre la secuencia de bases en el DNA y la secuencia de aminocidos en las protenas. Fue descifrado en 1961. El cdigo gentico usa codones o tripletes de nucletidos, los cuales corresponden a un aminocido.

CARACTERSTICAS DEL CDIGO GENTICO

Un grupo de 3 bases codifican para un aminocido. Se le denomina codn. Tiene 64 tripletes o codones. 61 de los 64 codifican para aminocidos, UAA, UAG , UGA son seales de terminacin.

CARACTERSTICAS DEL CDIGO GENTICO

Es degenerado, varios codones pueden codificar para un mismo aminocido. No tiene comas, a un triplete le sigue otro. No se traslapa, es decir, el marco de lectura lo establece el pirmer tRNA. Es casi universal para todos los organismos .

RNA de transferencia (tRNA)

Las protenas son sintetizadas de acuerdo al mensaje gentico en forma de secuencia de codones a lo largo del mRNA. El tRNA es el interprete entre las 2 formas de informacin. El tRNA alinea los aminocidos apropiados para formar un nuevo polipptido.

tRNA. Caractersticas
Son especficos para un aminocido en particular. Un extremo de la molcula del tRNA se une a un aminocido especfico. El otro extremo se une al codn del mRNA mediante el apareamiento de bases con el anticodon. El anticodon es un triplete de nucletidos en el tRNA que se aparea con un triplete de codones complementarios (codn) en el mRNA.

Aminoacil tRNA sintetasas

El enlace entre el tRNA y su correspondiente aminocido debe ocurrir antes que el anticodon se aparee con el codn complementario del mRNA. Este proceso de la correcta unin del tRNA con su aminocido apropiado es catalizado por la aminoacil-tRNA sintetasa.

RIBOSOMAS
Son partculas ribonucleoproteicas que coordinan el apareamiento de los anticodones del tRNA con los codones del mRNA. Es un componente mayoritario en la clula. Hay unos 20,000 ribosomas en la clula bacteriana. Tiene el 10% de la protena bacteriana. 80% de la masa total del RNA celular.

ESTRUCTURA DE LOS RIBOSOMAS

Son partculas ribonucleoproteicas grandes que contienen ms RNA que protenas y que se disocian en 2 subnidades. Los ribosomas de eucariontes y de procariontes difieren en tamao y estructura de las subunidades.

SITIOS FUNCIONALES DEL RIBOSOMA

1. El sitio de unin del mRNA, es una hendidura localizada cerca de las interfase de las dos subunidades El sitio A, por donde ingresan los aminoacil tRNA trayendo el prximo aminocido a ser aadido y donde el tRNA se aparea con el correspondiente codon en el mRNA.

SITIOS
El sitio P, donde se ubica el tRNA que tiene la cadena polipptidica en crecimiento. El sitio E o sitio de salida, a donde se mueve el tRNA deacilado (descargado) despus de transferir el pptido en crecimiento al tRNA ubicado en el sitio A. Un tunel para el polipptido en crecimiento, que oculta 40 aminocidos de la protena dentro del ribosoma. Sitios de unin para los factores de iniciacin, elongacin y terminacin.

REGLAS BSICAS
Dos reglas bsicas: 1. El mRNA es traducido en direccin 5-- 3. 2. Las protenas son sintetizadas a partir del extremo N-terminal hacia el extremo C-terminal.

SNTESIS DE PROTENAS ETAPAS

Ocurre en 3 etapas: 1) iniciacin, 2 ) elongacin y 3) terminacin. Todas las etapas requieren enzimas y otros factores proteicos. La iniciacin y elongacin tambin requieren energa suministrada por GTP.

INICIACIN
Unin del met-tRNA iniciador colocado sobre el codon de inicio en el sitio P. Unin de la subunidad 50S.

COMPONENTES DE LA INICIACIN
1. Las 2 subunidades ribosomales, 30S y 50S. 1 mRNA 3 factores de iniciacin: IF1, IF2(GTP) IF3 Un aminoacil-tRNA especial modificado.

ELONGACIN , PASOS
1) Unin del nuevo aminoacil tRNA al sitio A.
2. Formacin del enlace peptdico Es mediado por la peptidil transferasa.

ELONGACIN , PASOS
3. Translocacin del ribosoma El ribosoma se mueva a lo largo del mRNA en direccin 5 3 moviendo el peptidil tRNA localizado en el sitio A al sitio P. Un nuevo codon se ubica en el sitio A. El tRNA deacilado se mueve al sitio E y es liberado del ribosoma.

TERMINACIN
Ocurre cuando un codn de terminacin se coloca en el sitio A del ribosoma. No hay tRNA que reconozcan los codones de pare. Estos son reconocidos por los factores de liberacin. RF1 reconoce los codones UAA y UAG. RF2 reconoce los codones UAA y UGA. RF3(GTP), estimula la unin de RF1 y RF2. Hidrlisis del peptidil tRNA.