Professional Documents
Culture Documents
Objetivos especficos
1. Describir las caractersticas aminocidos estructurales y funcionales de los
a. Concepto de aminocido, importancia, estructura general, isomera y nomenclatura. b. Criterios de clasificacin: Presencia en la naturaleza Esencialidad nutricional Caractersticas fsico qumicas de la cadena lateral. c. Propiedades fsicas (solubilidad y punto de fusin) y propiedades qumicas (propiedades cido-bsicas, formacin de sales y de steres) de los aminocidos. 2. Describir las caractersticas estructurales y funcionales de los pptidos. a. Formacin y caractersticas del enlace peptdico. b. Concepto de pptidos, nomenclatura, representacin, ejemplos e importancia.
3. Describir las caractersticas estructurales y funcionales de las protenas. a. Concepto de protena, ejemplos e importancia. b. Criterios de clasificacin de las protenas. Solubilidad. Funcin biolgica. Forma. Composicin. c. Niveles estructurales de las protenas. Definiciones, caractersticas, fuerzas que intervienen. d. Desnaturalizacin de una protena. Definicin. Agentes desnaturalizantes. e. Caractersticas estructurales y funcionales de algunas protenas de importancia fisiolgica. Mioglobina, Hemoglobina, Colgeno, Queratina, Actina, Miosina, Inmunoglobulinas y Protenas plasmticas
funcionales de los
a. Bases nitrogenadas pricas y pirimidnicas: estructura y funcin. c. Nucletidos mono, di y trifosfato: estructura y funcin.
Aminocidos
Compuestos orgnicos formados por un grupo amino (NH2) y un grupo carboxilo (COOH). Algunos aminocidos se encuentran libres como neurotransmisores, otros se unen entre s formando pptidos como hormonas, o formando protenas con mltiples funciones.
Estructura General
COO H3N
+
C H R
COO C H R
on hbrido zwitterin Predomina a pH fisiolgico
COO H3N
+
COO H
Carbono asimtrico
C CH3
NH3
CH3
D- Alanina
L- Alanina
Imgenes quirales (no superponibles) Enantimeros o ismeros especulares Poseen actividad ptica: rotan el plano de la luz polarizada hacia la derecha (dextrgiros) o hacia la izquierda (levgiros).
Glicina, Gly, G
Alanina, Ala, A
Prolina, Pro, P
Valina, Val, V
Metionina, Met, M
Leucina, Leu, L
Isoleucina, Ile, I
Triptofano, Trp, W
Glutamina, Gln, Q
Asparagina, Asn, N
Aminocidos cidos:
Aspartato, Asp, D
Glutamato, Glu, E
Aminocidos Bsicos:
3) Esencialidad nutricional
Nutricionalmente esenciales:
no sintetizados por el organismo (valina, leucina, isoleucina, treonina, metionina, lisina, fenilalanina y triptfano).
Nutricionalmente no esenciales:
pueden ser sintetizados por el organismo (glicina, alanina, prolina, serina, glutamato, glutamina, aspartato, asparagina).
Nutricionalmente semiesenciales:
a) Sintetizados a partir de aminocidos esenciales (cistena, a partir de metionina y tirosina, a partir de fenilalanina). b) Se sintetizan en cantidades adecuadas para el estado adulto pero no para el estado de crecimiento o la preez (arginina e histidina).
Los aminocidos son molculas anfteras ya que pueden actuar como cidos o como bases
Las fuerzas relativas de los cidos dbiles se expresan en trminos de la constante de disociacin del cido (KA) o de su pKA pH= - log H+ pKA = - log KA
pKA = Valor del pH en el cual el aminocido se encuentra 50% disociado y 50% no disociado. Presenta mximo poder amortiguador
pKA -COOH
Carga neta= +2
pKA Imidazol
pKA -+NH3
Carga neta= 1
Carga neta= +1
Carga neta= 0
pKA Imidazol
pKA -COOH
Equivalentes de OH
Pptidos
Compuestos nitrogenados formados por 2 ms residuos de aminocidos, unidos por uno ms enlaces peptdicos. Enlace peptdico: Es un enlace amida que se forma cuando el par de e sin compartir del grupo -amino de un aminocido ataca al carbono -carboxilo de otro aminocido.
Glicina
Alanina
Enlace peptdico
Agua
Glicilalanina, Gli-Ala, GA
Formacin de un dipptido
COOH HOH O C COOH
COOH
N C H H CH H2N C H 3 H
Glicil-alanina, Gly-Ala
Alanil-seril-(cisteinil-lisil-fenilalanil)-histidil-treonina
Representacin de un tripptido
OH
O C C H
CH2 N H C
H3N+
H C O
H N C
C O H
CH2 OH
DYS
Aspartil-tirosil-serina
Funciones:
H N H
Descomposicin del H2O2. Metabolismo de sustancias txicas. Antioxidante intracelular. Transporte de aminocidos
Hormonas pancreticas
Insulina: Conformada por 2 cadenas, con un total de 51 aminocidos, responsable de la entrada de glucosa en las clulas del tejido muscular y adiposo. Glucagn: Es una cadena de 29 aminocidos, aumenta los niveles de glucosa en sangre.
Insulina Humana:
S S S S S S Gli-Ile-Val-Glu-Gln-Cis-Cis-Tre-Ser-Ile-Cis-Ser-Leu-Tir-Gln-Leu-Glu-Asn-Tir-Cis-Asn
Fen-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cis-Gli-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tir-Leu-Val-Cis-Gli-Glu-Arg-Gli-Fen-Fen-Tir-Ter-Pro-Lis-Ala
Insulina Bovina:
S S S S S S Gli-Ile-Val-Glu-Gln-Cis-Cis-Ala-Ser-Val-Cis-Ser-Leu-Tir-Gln-Leu-Glu-Asn-Tir-Cis-Asn
Fen-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cis-Gli-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tir-Leu-Val-Cis-Gli-Glu-Arg-Gli-Fen-Fen-Tir-Ter-Pro-Lis-Ala
Hormonas hipotalmicas
Hormona liberadora de tirotropina (tripptido).
Hormona liberadora de gonadotropina (decapptido). Hormona liberadora de corticotropina (41 aminocidos). Hormona liberadora de la hormona de crecimiento (44 aminocidos).
Hormonas hipofisiarias
Vasopresina u hormona antidiurtica: nonapptido, promueve la resorcin de agua desde los tbulos renales distales. Oxitocina: nonapptido, promueve la expulsin de leche de las glndulas mamarias y la contraccin del msculo liso uterino.
Protenas
Cadenas polipeptdicas de mas de 100 aminocidos, con estructuras primaria, secundaria y terciaria por lo menos (algunas tambin cuaternaria). Compuesto orgnico nitrogenado formado por aminocidos, que cumple mltiples funciones en los seres vivos.
1)Segn su forma
a) Globulares:
b) Fibrosas:
Relacin longitud/ancho > 10 Insolubles en soluciones salinas acuosas. Ejemplos: Colgeno, queratina.
2) Segn su funcin
a) Cataltica (enzimas) b) Transportadoras (hemoglobina, lipoprotenas) c) Almacenadoras (mioglobina, ferritina) d) Protectoras (inmunoglobulinas) e) Estructurales (colgeno) f) Reguladoras (hormonas, protenas unidas a ADN) g) Contrctiles o de movimiento (actina, miosina)
3) Segn su composicin
a) Simples: formadas aminocidos. Ejemplo: Albmina solamente por residuos de
b) Complejas: Contienen residuos de aminocidos y otro (s) componente (s) Apoprotena: parte proteica Grupo prosttico: parte no proteica Ejemplos: glucoprotena (glcido) lipoprotena (lpido) metaloprotena (metal) fosfoprotena (PO4H3)
5) Segn su solubilidad
a) Solubles en soluciones salinas acuosas: Protenas globulares (albmina, globulinas) b) Insolubles en soluciones salinas acuosas: Protenas fibrosas (colgeno, queratina)
Estructura Terciaria:
Niveles estructurales:
Estructura primaria
Lys Lys Gly Gly Leu Val Ala His
Estructura secundaria
Estructura terciaria
Estructura cuaternaria
Puentes de hidrgenos
Entre el grupo hidroxilo de un alcohol y el agua Entre el grupo carbonilo de una cetona y el agua Entre los enlaces peptdicos de polipptidos Entre bases complementarias del ADN
Timina
Adenina
Estructura Primaria
Es la secuencia lineal de los residuos de aminocidos Esta secuencia es la que determina la estructura tridimensional y la funcin de la protena Est especificada por la informacin gentica Las alteraciones en la estructura primaria provocan enfermedades moleculares Enlaces que la conforman: Enlace peptdico Puente disulfuro (si lo hubiera).
Estructura secundaria
Plegado local, el la conformacin que se repite de modo regular en la cadena polipetdica. Los tipos de estructura secundaria que se observan con ms frecuencia son la - Hlice y la lmina -plegada. Ambas conformaciones se encuentran estabilizadas por puentes de hidrgenos entre los grupos carbonilo (C = O) y el imino (N H) del esqueleto plipeptdico y por interacciones de Van der Waals.
Alfa-hlice (-hlice)
Hlice derecha Puentes de hidrgeno Fuerzas de Van der Waals Longitud: entre 4 y 50 residuos (12) 3,6 residuos por vuelta Se repite cada 18 residuos Grupos R dirigidos hacia afuera
Hlice 310
Hlice
Hlice
Cadenas plegadas en abanico. Esqueleto peptdico extendido casi por completo. Implican tramos de 5 a 10 aminocidos. Puentes de hidrgeno, Fuerzas de Van der Waals. Las tiras pueden ser paralelas (igual direccin) o antiparalelas (direcciones opuestas). Los Grupos R alternan hacia arriba o hacia debajo de la cadena principal.
Lminas -plegadas
a) Paralelas b) Antiparalelas
Las lminas -antiparalelas son ms estables debido a que se forman puentes de hidrgenos colineales
Estructuras supersecundarias
Son combinaciones de estructuras secundarias de hlices alfa y lminas beta
Unidades : Estn constituidas por dos lminas -plegadas paralelas interconectadas por un segmento de -hlice Unidades : Meandros: Estn constituidas por dos -hlices separadas por un segmento no helicoidal. sucesivas
Estn constituidos por lminas -plegadas antiparalelas interconectadas por segmentos de aminocidos polares y glicina que producen un cambio brusco de la direccin de la cadena polipeptdica Se produce cuando varias configuraciones de lminas -plegadas se repliegan sobre ellas mismas. Se producen cuando una lmina -plegada antiparalela se dobla sobre s misma.
Estructuras supersecundarias
Unidades : Unidades : Meandros:
Barril :
Llave Griega:
Estructura terciaria
Es la configuracin tridimensional nica que asume una protena globular al plegarse sobre s misma.
Caractersticas: 1. Aproximacin de las cadenas laterales de aminocidos distantes en la estructura primaria. 2. Empaquetamiento compacto de la cadena polipeptdica. 3. Presencia de segmentos estructuralmente independientes con funciones especficas. Estabilizada por: 1. Interacciones hidrfobas 2. Interacciones electrostticas o puentes salinos 3. Puentes de hidrgenos 4. Enlaces covalentes (Puentes disulfuro)
Puente disulfuro
Puente de hidrgeno
Estructura Cuaternaria
Es el ensamble de dos o ms cadenas polipeptdicas separadas que se unen por medio de interacciones no covalentes y por entrecruzamientos covalentes. Fuerzas que la estabilizan:
1. Interacciones hidrfobas 2. Interacciones electrostticas o puentes salinos 3. Puentes de hidrgenos 4. Enlaces covalentes (Puentes disulfuro, entrecruzamientos de desmosina y de lisinonorleucina)
Estructuras Cuaternarias
Hemoglobina
Inmunoglobulina
Lys Lys Gly Gly Leu Val Ala His Estructura primaria Estructura secundaria Estructura terciaria Estructura cuaternaria
Configuracin nativa
Protena desnaturalizada
Protenas Fibrosas
Protenas alargadas, de varias cadenas estrechamente entrelazadas. Contienen proporciones elevadas de estructuras secundarias regulares como hlices y laminas plegadas. Tienen funciones estructurales.
Ejemplos:
Queratinas
-QUERATINA: protena fibrosa estructural.
Ubicacin: pelo, lana, piel, cuernos y uas. Estructura primaria: abundante en alanina, leucina y cistena (puentes disulfuro). Estructura secundaria: alfa-hlice derecha estabilizada por enlaces de hidrgeno, puentes disulfuro y fuerzas de Van der Waals. Estructura terciaria: dmero (2 cadenas enrrolladas). 2 dmeros enrrollados helicoidalmente de forma antiparalela forman un protofilamento superenrollado (4 cadenas). 8 protofilamentos enrrollados a derecha forman un filamento o microfibrilla (16 dmeros o 32 cadenas). Cientos de filamentos forman una macrofibrilla.
-queratina
Hlice
Dmero enrollado
Protofilamento superenrollado:
Colgeno
Funcin: Glucoprotena fibrosa estructural del tejido conjuntivo. Ubicacin: piel, tendones, huesos, dientes, crnea y vasos sanguneos. Estructura primaria: Principalmente glicina (cada 3 residuos), prolina, hidroxiprolina e hidroxilisina (glicosilada y no glicosilada). Estructura secundaria: hlices 310 izquierdas, estabilizadas por puentes de hidrgeno. Estructura terciaria: Triple hlice (tropocolgeno), estabilizada por enlaces de hidrgeno (hidroxilisina). Enlaces cruzados entre varias molculas de tropocolgeno formando la fibra de colgeno, mediante unin de 2 molculas de alisina, aumentando la dureza y disminuyendo la elasticidad. Aumentan con la edad.
Sntesis de Colgeno
Protenas Globulares
1. Forma esfrica 2. Interior hidrfobo y exterior hidrfilo 3. Solubles en agua (polares) 4. Mltiples funciones (catlisis, transporte, regulacin, proteccin), excepto la funcin estructural
Mioglobina
(monomrica)
Hemoglobina
(multimrica)
Mioglobina
Hemoprotena globular monomrica Funcin: Almacena oxgeno en las mitocondrias del msculo esqueltico y cardaco. Estructura primaria: 153 aminocidos Estructura secundaria: el 75% corresponde a -hlices (A,B,C,D,E,F,G,H). Estructura terciaria: Superficie polar e interior no polar, excepto las 2 histidinas cercanas al Hemo. Un grupo hemo en el centro de la molcula.
Estructura de la Mioglobina
Grupo hemo
Hemoglobina
Hemoprotena polimrica de los eritrocitos
Funcin: Transporte del oxgeno desde los pulmones hacia los tejidos y del CO2 y protones desde los tejidos hacia los pulmones para ser excretados. Ubicacin: Eritrocitos. Estructura primaria: rica en todos los aminocidos Estructura secundaria: 8 alfa hlices (75%). Estructura terciaria: globular, superficie polar e interior no polar, excepto las 2 histidinas cercanas al grupo hemo. Un grupo hemo en el centro de cada monmero. Estructura cuaternaria: tetrmero, 2 cadenas alfa (141 aa) y dos cadenas beta (146 aa) Fija 4 molculas de oxgeno (una por cada Hemo). Efecto cooperativo: La oxigenacin de 1 cadena altera la conformacin de la segunda cadena favoreciendo su oxigenacin y as sucesivamente.
Consta de un anillo de porfirina, formado por cuatro pirroles, con un tomo de Fe+2 en el centro.
La cada del pH en los capilares sanguneos reduce la afinidad de la hemoglobina por el oxgeno (protonacin de la histidina)
Protenas Plasmticas
Albmina Globulinas (alfa, beta y gamma) Fibringeno
Fibringeno
Albmina
Protena simple globular monomrica de 585 aa.
Ubicacin: plasma sanguneo (la ms abundante, 4 mg/dL). Lugar de sntesis: hgado. Funciones: a) Ayuda a mantener la presin osmtica de la sangre. b) Transporta cidos grasos libres, algunas hormonas esteroideas por la sangre, bilirrubina y una porcin del triptfano plasmtico y una gran variedad de frmacos (aspirina, penicilina G, sulfonamidas, etc). c) Fija el calcio (50%) en la sangre y alrededor del 10% de cobre. Estructura primaria: rica en aminocidos proteicos. Estructura secundaria: Predominantemente lminas beta antiparalela.
Globulinas
Protenas plasmticas globulares complejas.
Lugar de sntesis: hgado. Clasificacin: Alfa-1: lipoprotena de alta densidad (HDL:transporta colesterol) Alfa-2: Haptoglobulina, ceruloplasmina (transporte plasmtico de cobre). Pre-beta: lipoprotena de muy baja densidad (VLDL:transporte de triglicridos). Beta-1: Transferrina(transporte plasmtico de hierro), lipoprotena de baja densidad (LDL: transporte de colesterol). Gamma: anticuerpos
Inmunoglobulinas plasmticas
(gamma globulinas)
Glucoprotenas de por lo menos 4 cadenas. Ubicacin: plasma sanguneo. Lugar de sntesis: linfocitos B. Funcin: anticuerpos (proteccin contra agentes extraos). Estructura secundaria: predominantemente lminas beta antiparalelas. Estructura terciaria: por 2 cadenas ligeras y 2 pesadas (L2P2) unidas por enlaces disulfuro.
Tipos de Inmunoglobulinas
El tipo de cadena H determina la clase de la inmunoglobulina.
IgG: 1 tetrmero (anticuerpos plasmticos mas abundantes) IgA: 2 tetrmeros (secreciones corporales) IgE: 1 tetrmeros (respuestas alrgicas) IgM: 5 tetrmeros (respuesta inicial al microorganismo invasor) IgD: 1 tetrmero
Inmunoglobulina G
2 cadenas ligeras y 2 cadenas pesadas
Inmunoglobulina M (pentamrica)
Fibringeno
Glucoprotena alargada plasmtica, soluble en agua.
Lugar de sntesis: hgado Composicin: por 6 cadenas (tres pares), unidas por puentes disulfuro. (A)2; (B)2; (Gamma)2 Funcin: al transformarse en fibrina, se polimeriza formando un cogulo insoluble y evitando la hemorragia.
A 66 KD B 52 KD 46 KD
Actina
Polmero de doble hlice (actina F) de una protena globular (actina G) Ubicacin: tejido muscular, forma parte de filamentos delgados de la miofibrilla. Sitios de unin: 1. Con el ATP por un monmero de actina G, conduciendo a la polimerizacin, hidrolizndose el ATP. 2. Con la miosina en cada subunidad. Funcin: contraccin muscular. los
Miosina
Protena muscular, conforma el grueso de la miofibrilla muscular. filamento
Composicin: Formada por 6 cadenas polipeptdicas (2 pesadas y 4 livianas). Estructura terciaria: 2 grandes subunidades: 1 cabeza globular y 1 cola fibrosa. El complejo actina-miosina (actomiosina) aumenta la actividad intrnseca de ATPasa. Funcin: contraccin muscular.
Molcula de Miosina
2 grandes subunidades 6 cadenas polipeptdicas (2 pesadas y 4 ligeras, unidas por interacciones debiles)
Cabeza globular
Cola fibrosa
Nucletidos
Compuestos nitrogenados orgnicos, formados por una base heterocclica aromtica, un monosacrido y por lo menos un cido fosfrico. Cumplen funciones importantes en la transferencia de energa, en la regulacin metablica y/o como sillares estructurales de los cidos nucleicos.
Estructura de un nucletido
Adenina
(Base aromtica nitrogenada)
(Azcar C5)
N C C
7 8
C N
C
3 4 5
C C
N
Pirimidina
Purina
Bases Nitrogenadas
Pricas
NH2
Adenina
C C N CH HN C H2N
Guanina
C C N CH
C
N HC N
N H
N H
O
C C CH C N Timina
CH3
Bases nitrogenadas O
CH3 H3C
C
N C C C N CH3
N CH
Caf
Cafena (1, 3, 7- trimetil-xantina)
O H3C
C
N C C C N CH3
N CH
T
Teofilina (1, 7- dimetil-xantina)
O O CH3 C C N CH3 N CH C O N
N H
C
HN
Cacao
Teobromina (3, 7- dimeti-xantina)
NH 2 CH3 C C O 5-metil-citosina
CH3 O C C N CH HN C H2N N CH3 C C N CH N
C N C N C C
CH2OH
H 5-hidroximetil-citosina
C
N HC N
N H
Dimeti-Adenina
7-metil-guanina
syn-Adenosina
anti-Adenosina
C
N HC N
O
C C
N CH N H
Adenina
Adenosina
C
HN C H2N N C C
N CH N H
Guanina
Guanosina
O C HN N C O N NH 2 C N C O N CH C C CH C CH C
Uracilo
Uridina
Citosina
Citidina
O
C HN C C CH C N
CH3
Timina
Timidina
1. Nuclesidos:
2. Nucletidos:
Adenosina
Guanosina
Funciones: Principal transductor energtico. Precursor de coenzimas. Adenosina 5 trifosfato ATP El AMP es componente de los cidos nucleicos.
R
Metionina* Aminocido SO3-2 H
R
H H H H H
R
H H
n
0 1 1
PO3-2 PO3-2
H H H
2 2 2 2
PO3-2
H H
PO3-2
Guanosina
Funciones: Succinil CoA Succinato (ciclo Krebs) Regulador y fuente de energa para la sntesis de protenas. El GMP es componente de los cidos nucleicos.
Segundos mensajeros
AMPc
GMPc
Funciones: Interviene en la sntesis de fosfoglicridos. El CMP es componente de los cidos nucleicos. Citidina 5 Trifosfato CTP
Funciones: Intervienen en el metabolismo de los glcidos. Interviene en reacciones de conjugacin del cido glucurnico. El UMP es componente del ARN.
Timidina Funcin:
ACIDOS NUCLEICOS
Polmeros de nucletidos monofosfatos pricos y pirimidnicos, unidos por enlaces fosfodiester.
ribosa
Desoxirribosa
ADN circular