P. 1
Struktur Protein

Struktur Protein

|Views: 275|Likes:
Published by Ardiellaputri

More info:

Published by: Ardiellaputri on Apr 03, 2013
Copyright:Attribution Non-commercial

Availability:

Read on Scribd mobile: iPhone, iPad and Android.
download as PPTX, PDF, TXT or read online from Scribd
See more
See less

05/23/2015

pdf

text

original

STRUKTUR PROTEIN

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R

PROTEIN

Dari kata protos (latin : yang paling utama) Merupakan molekul bermassa molekul

STRUKTUR PRIMER
STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER

besar
Polimer dari rantai asam amino Diikat dengan ikatan peptida

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R

PROTEIN

Struktur organik yang mengandung karbon, hidrogen, oksigen dan nitrogen

STRUKTUR PRIMER
STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER

Polipeptida merupakan salah satu bentuk
protein Umumnya protein memiliki berat molekul lebih besar dari 10.000 g/mol

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R PROTEIN STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Asam amino Dipeptida Polipeptida .

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R PROTEIN Protein Primer STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Protein Sekunder Protein Tersier Protein Kuartener .

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R PROTEIN Protein Simpel Protein Protein Konjugasi Protein Gugus Prostetik STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .

gugus karboksil α asam amino terikat pada gugus amino α asam amino lain dengan ikatan peptida secara kovalen membentuk rantai polipeptida .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R IKATAN PEPTIDA Ikatan peptida  menghubungkan dua asam amino STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Pada protein.

wikipedia. STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Ikatan Peptida antara Leu dan Thr dalam struktur protein Hijau = karbon. merah = oksigen. biru = nitrogen.png) . (sumber : http://en.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA IKATAN PEPTIDA Senyawa yang terbentuk  senyawa peptida ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R C(=O)NH.org/wiki/File:Peptide_bond.

id/bitstream/123456789/1932/1/09E01872.bebas di sebelah kanan.pdf Setiap pembentukan dipeptida terjadi pengeluaran 1 molekul air .usu. STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Gambar. Pembentukan ikatan peptida dengan reaksi kondensasi (Sumber: repository.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R IKATAN PEPTIDA Ikatan peptida ditulis dengan asam amino yang mempunyai gugus +NH3 bebas di sebelah kiri dan asam amino dengan gugus CO.ac.

Panjang gelombang absorpsi ikatan peptida : 190230 nm. . yaitu dengan penambahan air  melepaskan 2-4 kcal/mol energi bebas (reaksi lambat).APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA IKATAN PEPTIDA Ikatan peptida dapat diputuskan dengan hidrolisis ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R amida. STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Pada makhluk hidup. pembentukan ikatan peptida difasilitasi enzim proteolitik yang disebut protease atau peptidase.

wikipedia. tidak bermuatan (60%).svg) .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R IKATAN PEPTIDA kaku planar Disebabkan interaksi dari struktur resonansi gugus amida/peptida STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Struktur resonansi gugus peptida.org/wiki/File:Mesomeric_peptide_bond. struktur ikatan rangkap. Pada bagian kanan. Pada bagian kiri. struktur ikatan tunggal. bermuatan (40%). (Sumber: http://en.

gugus karboksil.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Asam amino merupakan unit dasar penyusun protein Suatu asam amino ᾀ terdiri dari gugus amino. atom H dan gugus R tertentu yang semua terikat pada atom karbon ᾀ Pada protein ditemukan 20 jenis rantai samping yang bervariasi dalam ukuran dan bentuk STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .

9 .5 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Glutamat Glu -3.5 Lysin Lys -3.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Nama Simbol Rumus Molekul Hydropobicity Aspartat Asp -3.

2 Tyrosine Tyr -1.3 .5 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Histidine His -3.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Nama Simbol Rumus Molekul Hydropobhicity Arginin Arg -4.

4 .9 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Phenylalanine Phe 2.8 Cysteine Cys 2.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Nama Simbol Rumus Molekul Hydropobhicity Tryptophan Try -0.

8 Threonine Thr -0.9 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Serine Ser -0.7 .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Nama Simbol Rumus Molekul Hydropobhicity Methionine Met 1.

5 .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Nama Simbol Rumus Molekul Hydropobhicity Proline Pro -1.6 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Aspargine Asp -3.5 Glutamine Glu -3.

2 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Alanine Ala 1.8 Leusin Leu 3.8 .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Nama Simbol Rumus Molekul Hydropobhicity Valine Val 4.

4 Isoleusin lle 4.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO ASAM AMINO PEMBENTUK PROTEIN Nama Simbol Rumus Molekul Hydropobhicity PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Glisin Gli -0.5 .

yang akhirnya menentukan urutan asam amino dalam suatu protein Tiap rangkaian 20 asam amino disandi oleh satu atau lebih urutan tiga nukelotida tertentu STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R ASAM AMINO OLEH GEN Urutan nukleotida dalam DNA. menentukan urutan nukleotida komplementer dalam RNA. suatu molekul herediter.

CAG GGA. CAU STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Isoleucine Leucine Methionine AUA. CGA. AGG. GGU CAC. AAU UGC. CGG. GGC. CGU AAC. GCC. GCG. UUA. UUG AUG . AUU CUA. CUU. CUG. CUC. GAG CAA. GCU ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R Arginine Asparagine Cystein Glutamate Glutamine Glycine Histidine AGA. AUC. UGU GAA. CGG. CGC.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA Alanine KODON ASAM AMINO GCA.

AGC. UCU.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R Trytophan KODON ASAM AMINO UGG UUC. UCG. ACC. CCU UCA. CCG. UCC. CCC. GUC. GUG. UUU CCA. ACU AAA. UAC Phenilalanine Proline Serine Threonine Lysine Tyrosine STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Valine GUA. AGU ACA. GUU . ACG. AA UAU.

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA PENGARUH GUGUS SAMPING R Asam amino dapat bersifat asam.COOH CH(OH)CH3 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .COOH CH2CH2COOH • Aspartic Acid NHa – CH – COOH CH2COOH • Cysteine NHa – CH – COOH CH2SH • Threonine (asam lemah) NHa – CH . basa atau netral ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R Contoh asam: • Glutamic Acid NHa – CH .

COOH (CH2)4NH2 STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER • Arginine (basa kuat) NHa – CH .COOH (CH2)3NH-C(NH)NH2 • Histidine (basa lemah) NHa – CH – COOH CH2-C3H3N2 .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA PENGARUH GUGUS SAMPING R Contoh Basa ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R • Lysine (basa) NHa – CH .

COOH CH2OH STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER • Alanine NHa – CH .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA PENGARUH GUGUS SAMPING R Contoh Netral ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R • Serine NHa – CH .COOH CH3 • Glycine NHa – CH – COOH H .

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R PENGARUH GUGUS SAMPING R Kelebihan COOH .: asam Kelebihan NH2 : basa COOH sama banyak dengan NH2 : netral Reaksi – reaksi terhadap protein dapat terjadi pada R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER struktur primer protein merupakan urutan STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER asam amino penyusun protein yang dihubungkan melalui ikatan peptida (amida) .

Ala .Thr .Ser .Thr .Leu .Arg Gly .Ala atau GPTGTGESKCPLMVKVLNAVRGSPA .Gly .Met .Lys .Leu .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Gly .Asp .Cys .Val .Val .Pro .Gly .Val .Pro .Lys .Glu .Ser .Pro .

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER Sifat kovalen pada ikatan peptida → stabil. H. tidak dipengaruhi oleh : pH. pelarut. Atom-atom C. N terletak pada satu bidang datar R diproyeksikan pada arah tertentu pada bidang STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .

. ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER ...APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR PRIMER Perhatikan gambar berikut.

Ikatan yang membentuk struktur ini. .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR SEKUNDER protein yang mengalami interaksi ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R intermolekul melalui rantai samping asam amino. didominasi oleh ikatan hidrogen antar rantai samping yang membentuk pola STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER tertentu yang bergantung pada pengaturan kedudukan ruang residu asam amino.

edu) .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR SEKUNDER Struktur Sekunder Utama ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Struktur Sekunder Protein (Image from uic.

Terbentuk karena adanya ikatan hidrogen antara atom O pada gugus CO dengan atom H STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER pada gugus NH .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ALFA HELIX Terbentuk oleh ‘backbone‘ ikatan peptida yang ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R membentuk spiral. Arah putarannya searah jarum jam menjauhi pengamat (dinamakan alfa).

Struktur protein) . 2007.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R HELIX CONFORMATIONS STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Ideal – right handed Right handed Left handed Helix conformation (sumber:Mutiara Indah Sari.

(sumber: chem4kids.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA Prolin ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR SEKUNDER  menyebabkan tekukan dlm heliks. Adanya rantai siklik yang terbentuk antara gugus amina dan residu menyebabkan prolin memiliki karakter yang khas (relatif sangat kaku) dan menentukan konformasi protein secara kuat.com) . STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER  asam amino dasar yang memiliki dua gugus samping yang terikat satu-sama lain (hanya memiliki gugus amina sekunder (-NH-)). Prolin.

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR SEKUNDER Ikatan Hidrogen & Van Der Waals stabil α  Atom pada inti α heliks mengalami kontak van der waals antara 1 sama lain melintasi sumbu heliks tsb Amfipatik  Residu bergeser antara hidrofobik & hidrofilik setiap 3 / 4 residu  Terdapat pada lipoprotein plasma samping dlm hormon polipeptida tertentu. STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .

bbk.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R BETA SHEET Terbentuk karena adanya ikatan hidrogen antara dua bagian rantai yang pararel sehingga membentuk lembaran yang berlipat-lipat.uk) STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER . Beta sheet (sumber: www.cryst.ac.

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R BETA SHEET STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Tipe β-sheet.ac.uk) *Garis putus-putus: ikatan hidrogen .bbk. (sumber: www.cryst.

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR TERSIER Terbentuk karena terjadi pelipatan polipeptida sehingga membentuk protein globular. yang didukung oleh beberapa faktor. STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER antara lain : . Protein globular dapat disebut sebagai sebuah kemantapan struktur.

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR TERSIER Interaksi hidrofobik ASAM AMINO Pengelompokan residu-residu R non polar PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Ikatan ionik Residu yang berbeda muatan saling berdekatan Sumber : uic.edu .

edu STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Ikatan hidrogen antar gugus samping oleh residu R tertentu yang berdekatan .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR TERSIER Ikatan Hidrogen ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER Sumber : uic.

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR TERSIER Jembatan Sulfida ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Sumber : altabioscience.bham.uk Ikatan kovalen oleh dua residu cystein yang berdekatan .ac.

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR TERSIER Gaya Dispersi Van der Walls ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R Nilai dipol yang berfluktuatif dari satu gugus samping dapat membentuk ikatan dengan dipol berlawanan pada gugus samping lain STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Sumber : uic.edu .

. ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Sumber : Biokimia Kedokteran Dasar..APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA STRUKTUR TERSIER Perhatikan gambar berikut ini.. 2006 ..

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR TERSIER STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Sumber : Pengantar Kimia Buku Panduan Kuliah Kedokteran. 2004 .

org .APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR TERSIER STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Sumber : sciencecases.

Subunit itu disatukan oleh jenis interaksi nonkovalen yang sama yang berperan pada struktur tersier.APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R Struktur tiga-dimensi suatu protein yang terdiri dari subunit. STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER .

APA ITU PROTEIN? IKATAN PEPTIDA ASAM AMINO PENGARUH GUGUS R STRUKTUR PRIMER STRUKTUR SEKUNDER STRUKTUR TERSIER STRUKTUR KUARTENER Sumber : sciencecases.org .

London : Oxford University Campbell. Biokimia Kedokteran Dasar. Mutiara. 1999. Anatomy and Physiology for Starter. Neil A. Ethel. Jakarta : Erlangga. Klinis. Struktur Protein. Dr. 2006. 2004. Damin. . Jakarta : Erlangga. 2009. Biologi Edisi Kelima Jilid 1. Jakarta : Eralngga. Medan : Universitas Sumatera Utara. Slonane. 2004. Sumardjo.DAFTAR PUSTAKA Indah Sari. Pengantar Kimia Buku Panduan Kuliah Kedokteran.

.Thank you.. .......

pertanyaan: • wira: DNA / RNA protein? • dio: ciri khas senyawa disebut sbg protein? apa semua yang punya CHON protein? .

You're Reading a Free Preview

Download
scribd
/*********** DO NOT ALTER ANYTHING BELOW THIS LINE ! ************/ var s_code=s.t();if(s_code)document.write(s_code)//-->