P. 1
Alignment Dengan ClutalX NEW

Alignment Dengan ClutalX NEW

|Views: 9|Likes:
Published by Ki Soewarsono

More info:

Published by: Ki Soewarsono on Apr 08, 2013
Copyright:Attribution Non-commercial

Availability:

Read on Scribd mobile: iPhone, iPad and Android.
download as PDF, TXT or read online from Scribd
See more
See less

01/27/2014

pdf

text

original

A. Membuat Fasta File 1. Buat fasta file dari program notepad [*.

fasta]

2. Copy-paste fasta view sekuens DNA/protein dari NCBI

3. Lakukan pengeditan dengan menghapus beberapa informasi yang tidak diperlukan setelah tanda “>”

Melakukan Alignment dengan Clustal X2 1. NB : pemberian/pengaturan nama dalam edit/penambahan data harus berbeda-beda. Buka Program Clustal X2 2. Buka data melalui File>Load Sequences 3. Pilih format yang akan digunakan [optional] . Atur output file melalui Alignment>Output Format Option [optional] 4. Simpan fasta file. Lakukan penambahan data dalam fasta file yang sama dengan menggunakan langkah 1-4. sesuai dengan kebutuhan. B. 5.4.

.5. Lakukan alignment dengan perintah Alignment>Do Complete Alignment 6. Simpan hasil alignment dengan perintah File>Write Alignment as Postscript NB : salah satu cara membaca File postscript adalah dengan memasang program GhostGum. GhostScript dan GhostWord.

You're Reading a Free Preview

Download
scribd
/*********** DO NOT ALTER ANYTHING BELOW THIS LINE ! ************/ var s_code=s.t();if(s_code)document.write(s_code)//-->