You are on page 1of 13

1. Jelaskan apa yang dimaksud dengan nukleosida dan nukleotida!

Nukleotida adalah molekul yang tersusun dari gugus basa nitrogen, gula, dan satu atau lebih gugus fosfat. Basa penyusun nukleotida biasanya adalah berupa purina atau pirimidina, sementara gulanya adalah pentosa (ribosa), baik berupa deoksiribosa maupun ribosa. Nukleosida adalah turunan purin dan pirimidin yang memiliki sebuah gula yang terikat dengan nitrogen cincin. 2. Sebutkan fungsi-fungsi nukleotida! Fungsi Nukleotida adalah : a) Nukleotida berperan dalam metabolisme sel. Contohnya saja nukleotida jenis Adenosin triposphat, yang merupakan pembawa energi utama ke dalam sel tubuh. Sel tubuh tidak akan berfungsi tanpa nukleotida ini. b) Nukleotida juga berfungsi untuk membantu sintesa lemak, karbohidrat, dan protein. c) Nukleotida berperan penting dalan membangun kekebalan tubuh terhadap infeksi.. Hal tersebut merupakan salah satu alasan mengapa anak yang diberikan ASI jarang terkena batuk, pilek, dan berbagai penyakit lain. d) Nukleotida mencegah infeksi saluran pencernaan. Terjadinya diare pada anakanak biasanya disebabkan oleh infeksi virus di saluran perncernaan (gastroenteritis). Terkadang diare juga disebabkan oleh bakteri atau parasit. Nukleotida tidak hanya dapat melindungi anak anda dari infeksi saluran cerna yang parah, tapi juga membantu pencegahan dan penyembuhan diare. 3. Jelaskan peranan nukleotida sebagai “energy currency” di dalam sel! Nukleotida berperan sebagai senyawa penukar energi yang universal. ATP merupakan suatu nukleotida adenin. Rantai respirasi menyediakan sebagian besar energy yang di tangkap di dalam metabolisme ADP merupakan molekul yang ditangkap sebagian energy bebas dalam bentuk fosfat berenergi tinggi, yang di lepas oleh proses katabolisme. ATP yang dihasilkan akan menghanarkan energi.

4. Sebutkan basa purin dan pirimidin pembentuk DNA dan RNA! Basa purin pada DNA: Adenin (A) dan Guanin (G) Basa purin pada RNA: Adenin (A) dan Guanin (G)

6. Apa perbedaan struktur basa purin dan pirimidin pada DNA dan RNA? Jelaskan! DNA mengandung Timin (T) sedangkan RNA mengandung Urasil (U). . Atom pada cincin pirimidin disebutkan 1 sampai 6. bila dua gugus fosfat disebut nukleosida difosfat (NDP) seperti ADP (Adenosin Difosfat). Bila hanya satu gugus fosfat yang terikat pada karbon ke lima dari pentosa. b) Penamaan atom karbon senyawa pentosa pada nukleotida Bila senyawa pentosa tersebut merupakan ribosa. dan derivat tetrahidrofolat. Sebutkan senyawa-senyawa pembentuk atom dari cincin pirin! Cincin purin terdiri dari asam amino (aspartat. Perbedaan antara Timin dan Urasil adalah Timin mengandung gugus metil sedangkan Urasil tidak mengandung gugus metil. Jelaskan ikatan fosfat pada pentosa dari suatu nukleotida! Nukleotida merupakan senyawa nukleosida dengan tambahan satu atau dua gugus fosfat yang terikat pada atom ke lima (5’-OH) dari pentosa. CO2.- Basa pirimidin pada DNA: Sitosin (C) dan Timin (T) Basa pirimidin pada RNA: Sitosin (C) dan Urasil (U) 5. sedangkan dalam purin 1 sampai 9. Sebutkan beberapa contoh basa yang tidak lazim! Cytosine  tidak lazim: N4-Acetylcytosine Uracil  tidak lazim: Pseudoracil Adenine  tidak lazim: N6-N6-Dimethyladenine 7. 9. bila terdapat tiga gugus fosfat disebut nukleosida trifosfat (NTP) seperti ATP (Adenosin Trifosfat). Apabila senyawa pentosa tersebut merupakan deoksiribosa. glisin. maka disebut 5’-deoksiribonukleotida. Terangkan sistem penomoran atom pada cincin basa purin dan pirimidin. 8. serta penamaan atom karbon senyawa pentosa pada nukleotida! a) Sistem penomoran atom pada cincin basa purin dan pirimidin Atom pada cincin basa purin dan pirimidin diberi nomor menurut sistem internasional. maka disebut sebagai 5’ribonukleotida. dan glutamin). maka disebut nukleosida monofosfat (NMP) seperti AMP (Adenosin Monofosfat) dan CMP.

salah satu mol glisin. Glycinamide sintase ribotide . GMP. dua mol glutamin. dan IMP yang merupakan senyawa akhir. Para gugus formil dilakukan pada tetrahydrofolate (THF) dalam bentuk N 5. PRPP juga berperan dalam sintesis pirimidin serta jalur reaksi penyelamatan purin dan pirimidin.10. N 10-methenyl-THF dan N 10-formil-THF. Glutamin amidotransferase phosphoribosylpyrophosphate 2. satu mol aspartate dan dua mol formate. Terangkan mekanisme pembentukan senyawa Inosine Monophospate (IMP) ! Sintesis IMP membutuhkan lima mol ATP. Jelaskan secara singkat pembentukan cincin purin! Cincin purin dibentuk pada senyawa ribosa 5-fosfat yang telah ada. Jelaskan secara singkat pembentukan fosforibosilamin! Sintesis 5'-fosforibosilamin terjadi dari PRPP dan glutamin. PRPP (ribosa fosfat pirofosfokinase) diaktivasi oleh Pi dan dihambat oleh nukleosida purin difosfat dan trifosfat. Enzim yang berperan yaitu glutamin:fosforibosil pirofosfat amidotransfease dihambat oleh AMP. 12. Terangkan secara singkat sintesin senyawa PRPP (5 fosforibosil 1 pirofosfat) beserta faktor penghambat dan faktor yang mengaktivasi pembentukannya! Terjadi Sintesis PRPP dari ATP dan ribosa 5-fosfat. satu mol CO 2. Enzim nama: 1. 13. 11. Gugus amida dari glutamin akan menggantikan gugus pirofosfat yang terikat pada karbon 1 dari PRPP. Kecepatan reaksi ini juga tergantung pada konsentrasi PRPP dan glutamin.

yang mengarah ke GMP memerlukan energi dalam bentuk ATP. Sintase ribotide aminoimidazole 6. Succinylaminoimidazolecarboxamide sintase ribotide 8. ada berbagai senyawa inhibitorik dan reaksi yang dihambat senyawa tersebut mencakup azaserin. Jalur yang mengarah ke AMP membutuhkan energi dalam bentuk GTP.3. PRPP. Glycinamide transformylase ribotide 4. Sebut dan jelaskan contoh-contoh inhibitor pada sintesis purin! Beberapa senyawa inhibitor sintesis purin dipakai dalam pengobatan terhadap berbagai mikroorganisme misalnya: sulfonamid. IMP cyclohydrolase Sintesis membentuk nukleotida purin penuh pertama. karena dapat dikonversi menjadi baik AMP atau GMP melalui dua jalur reaksi yang berbeda. Selain itu. glisin dan aspartate IMP ini menghasilkan jalur. 6-merkaptopurin. Senyawa yang merupakan analog dari asam folat yaitu metotreksat banyak dipakai dalam pengobatan kanker. Karboksilase ribotide aminoimidazole 7. Transformylase aminoimidazole ribotide karboksamida 10. monofosfat inosin. enzim ditandai dengan 1 pada Gambar tersebut. dimana senyawa tersebut akan menginterferensi sintesis nukleotida. diazanorleusin. Mengapa IMP disebut sebagai “Parent Purine Nucleotide”? 15. Tingkat membatasi reaksi dikatalisis oleh glutamin amidotransferase PRPP. Melalui serangkaian reaksi menggunakan ATP. . IMP merupakan titik cabang untuk biosintesis purin. glutamin. dan asam mikofenolat. tetrahydrofolate (THF) derivatif. Formylglycinamide sintase 5. Adenylosuccinate lyase 9. IMP dimulai dengan 5-phospho-α-ribosyl-1-pirofosfat. Struktur nucleobase dari IMP (hipoksantin) ditunjukkan. 14.

AMP + ATP  2 ADP ( adenilat kinase ) GMP + ATP  GDP + ADP ( guanilat kinase ) Adenilat kinase sangat aktif dihati dan otot. Enzim apa yang terlibat dalam jalur penyelamatan purin? Enzim yang terlibat dalam jalur penyelamatan purin yaitu: Adenin fosforibosil transferase (APRT) Hipoxantin guanin fosforibosil transferase (HGPRT) . GDP + ATP  GTP + ADP CDP + ATp  CTP + ADP 18. Jelaskan proses konversi NMP menjadi NDP dan NTP! NMP akan diubah menjadi NDP oleh enzim nukleosida monofosfat kinase dimana AT P berperan sebagai sumber fosfat.16. 17. Sintesis nukleotida dalam otak dengan bantuan enzim APRT (adenin fosforibo sil transferase) dan enzim HGPRT (hipoxantin guanin foaforibosil transferase). 19. Apa yang dimaksud dengan jalur penyelamatan purin? Menyelamatkan purin dari basis yang berasal dari degradasi asam nukleat me lalui pembalikan jalur katabolisme yang dapat diubah kembali menjasi NTP. Interkonversi antara NDP dan NTP dilakukan oleh enzim nukleo sida difosfat kinase. sebaliknya pembentukan GMP memerlukan ATP. Jelaskan proses konversi IMP menjadi AMP dan GMP! Pembentukan AMP memerlukan GTP sebagai sumber energi. dimana proses pertukaran energi dari AT P berlangsung cepat.

Sebagian mamalia (tidak termasuk manusia) dapat mengoksidasi asam urat menjadi allantonin. Berikan beberapa contoh kelainan genetik yang berhubungan dengan proses degenerasi purin! 25. Apa hasil akhir dari katabolisme purin pada manusia? Hasil akhir dari katabolisme purin pada manusia adalah Asam Urat 23. yang selanjutnya akan dioksidasi kembali oleh enzim yang sama menjadi asam urat yang merupakan produk akhir dari proses degradasi purin pada manusia. 24. Jelaskan secara singkat pembentukan asam urat! Gugus amino akan dilepaskan dari AMP membentuk IMP atau dari adenosin membentuk inosin (hipoxantin) IMP dan GMP oleh enzim 5’-nukleotidase akan diubah ke bentuk nukleosida yaitu inosin dan guanosin. Nucleosida phosphorylase menghasilkan basa dan andribose-1- . 22.20. Terangkan degradasi asam nukleat di saluran pencernaan? Di dalam usus halus terjadi pemutusan ikatan fosfodiester oleh endonuklease(pankreas) menjadi oligonukleotida. Dipecah lebih lanjut fosfomonoesterase dikenal sebagai nukleotidase menghasilkan nukleosida and orthophosphate. Dipecah lebih lanjut dengan fosfodiesterase (ensimexonuclease non spesifik) menjadi monofosfat. Jelaskan yang saudara ketahui tentang sindrom Lesch Nyhan! Sindrom Lesch Nyhan adalah kelainan yang deisebabkan oleh defisiensi HGPRT yaitu Hipoxantin Guanin Fosforibosil Transferase yang merupakan enzim yang terlibat dalam jalur penyelamatan purin. Purine nukleosida fosforilase akan mengubah inosin dan guanosin menjadi basa purin yaitu hipoxantin dan guanin. yang selanjutnya dapat didegradasi menjadi urea dan amonia. Guanin akan mengalami deaminasi menjadi xantin Hipoxantin akan dioksidasi oleh enzim xantin oksidase membentuk xantin. Terangkan jalur degradasi nukleotida purin! Pada manusia hasil akhir katabolisme purin ialah asam urat. 21.

basa akan lebihlanjut didegradasi menjadi asam urat (purin). . Merupakan senyawa berenergi tinggi.  Sedangkan enzim karbamoil fosfat sintetase II.phosphate. Sebutkan sumber atom karbon dan nitrogen dari cincin pirimidin! Dalam reaksi pertama jalur. penambahan gusus ribosa-P tersebut sudah berlangsung ditahap awal. Reaksi ini menghasilkan Nitrogen 9 cincin purin. merupakan enzim pengatur. molekul ini dapat dipandang sebagai p emberi gugus karbamoil yang telah aktif kepada ornitin untuk membentuk sit rulin dan membebaskan fosfatnya. tidak memerlukan N-asetil glutamat 29. Apa perbedaan pembentukan cincin pirimidin dan cincin purin? Pada saat terjadinya penambahan gugus ribose –P (pada biosintesis purin) . 26. Dikatalis oleh ornitin transkarbamoilase y ang terdapat pada bagia mitokondria sel hatinya dan memerlukan Mg2+. Jika basa atau nukleosida tidak digunakan kembali utk salvage pathways. 28. Karbon 2 oleh formil tetrahidrofolat. Dalam reaksi kedua. Sedangkan pada biosintesis pirimidin berlangsung setelah perjalanan beberapa tahap jauh. 27. Glisin menyediakan Karbon 4 dan 5. keseluruh an gugus glisin ditambahkan ke prekursor yang sedang tumbuh. PRPP bereaksi dengan glutamin membentuk fostoribosil amin. Terangkan kelainan “orotic aciduria”? Enzim apa yang terlibat? Dan jelaskan akibat nya! Orotic aciduria adalah kelainan yang terjadi karena defisiensi enzim orotat fos foribosil transferase dan orotidilat dekaroksilase Enzim yang terlibat adalah orotat fosforibosil transferase dan orotidilat dekar oksilase. Jelaskan perbedaan enzim karbomil fosfat sintetase I dan karbomil fosfat sintetase II !   Enzim karbamoil fosfat sintetase I. Karbon 8 diswdiakan oleh metenil tetrahidrofolat. Karbon 6 oleh O2. serta Nitrogen 7 pada cincin purin. ureidopropionat (pyrimidine). Nitrogen 3 oleh glutamin. memakai glutamin dan. dan Nitrogen 1 oleh aspartat. enzim ini me merlukan N-asetil glutamat sebagai modulator positif (perangsangnya).

Karbamoilfosfat digunakan untuk sintesis nukleotida pirimidin berasal dari glutamin dan bikarbonat. Basis menyelesaikan pertama adalah berasal dari 1 mol glutamin. yang bertentangan dengan siklus karbamoil fosfat urea berasal dari amonia dan bikarbonat dalam . Sebuah mol tambahan glutamin dan ATP yang diperlukan dalam konversi UTP untuk CTP adalah. Jelaskan tentang jalur penyelamatan pirimidin! Sintesis dari pirimidin kurang kompleks dibandingkan dengan purin. dll. struktur cincin dipasang sebagai basa bebas.- Mengakibatkan pertumbuhan yang abnormal. membentuk orotate monophosphate (OMP). anemia. tidak dibangun di atas PRPP. Akhirnya UTP aminated oleh aksi sintase CTP. Kedua. 30. Jalur biosintesis pirimidin yang digambarkan di bawah ini. 31. dalam sitosol. Fosforilasi pertama adalah dikatalisis oleh kinase uridylate dan kedua oleh nukleosida difosfat kinase mana-mana. UMP adalah terfosforilasi dua kali untuk menghasilkan UTP (ATP merupakan donor fosfat). PRPP ditambahkan ke dasar pirimidin pertama sepenuhnya terbentuk (asam orotic). karena dasar jauh lebih sederhana. menghasilkan cytidine triphosphate (CTP). salah satu mol ATP dan satu mol CO 2 (yang merupakan karbamoilfosfat) dan satu mol aspartate. Pertama. tidak ada cabang di jalur sintesis pirimidin. Jelaskan pembentukan cytidine triphosphate (CTP) Sintesis pirimidin berbeda dalam dua cara yang signifikan dari yang purin. yang kemudian dekarboksilasi untuk UMP.

Karbamoil fosfat digunakan dalam sintesis nukleotida pirimidin berbeda dari yang disintesis pada siklus urea. melainkan disintesis dari glutamin bukan amonia dan disintesis dalam sitosol. karbamoilfosfat kemudian kental dengan aspartat dalam reaksi dikatalisis oleh enzim yang membatasi laju biosintesis nukleotida pirimidin. ATCase Karbamoil dehydratase aspartate Dihydroorotate dehidrogenase Orotate fosforibosiltransferase -5'-fosfat karboksilase orotidine Sintesis UMP dari karbamoilfosfat. Synthesis of carbamoyl phosphate by CPS II Sintesis karbamoilfosfat oleh CPS II Enzim: Aspartate transcarbamoylase. transcarbamoylase aspartate (ATCase). Reaksi siklus urea dikatalisis oleh sintetase karbamoilfosfat I (CPS-I) sedangkan prekursor nukleotida pirimidin disintesis oleh CPS-II. Reaksi ini dikatalisis oleh sintetase karbamoil fosfat II (CPS-II). Selanjutnya karbamoilfosfat .mitokondria.

PRPP is added to the first fully formed pyrimidine base (orotic acid). 33. Para nukleotida timin pada gilirannya diturunkan oleh sintesis de novo dari DUMP atau dengan jalur penyelamatan dari deoxyuridine atau deoxythymidine. yang kemudian dekarboksilasi untuk UMP. Yang pertama adalah fosforilasi dikatalisis oleh kinase uridylate dan yang kedua oleh nukleosida difosfat kinase mana-mana. Terangkan proses konversi riboknukleotida menjadi deoksiribosanukleotida ! . struktur cincin dipasang sebagai basa bebas. juga merupakan prekursor untuk sintesis de novo dari nukleotida timin. Finally UTP is aminated by the action of CTP synthase. 32. Akhirnya UTP aminated oleh aksi sintase CTP. forming orotate monophosphate (OMP). Tempatkan mouse di atas nama menengah hijau untuk melihat struktur. Second. Selain itu. Kedua. yang seperti pada jalur penyelamatan purin. there is no branch in the pyrimidine synthesis pathway. juga memerlukan PRPP sebagai sumber ribosa 5-fosfat. Sintesis pirimidin berbeda dalam dua cara yang signifikan dari tahun purin. ATCase (enzim # 1) yang adalah tingkat membatasi langkah dalam biosintesis pirimidin. The first phosphorylation is catalyzed by uridylate kinase and the second by ubiquitous nucleoside diphosphate kinase.Pertama. UMP is phosphorylated twice to yield UTP (ATP is the phosphate donor). generating CTP. which is subsequently decarboxylated to UMP. Setelah penyelesaian sintesis UMP dapat difosforilasi menjadi UTP dan digunakan sebagai substrat untuk sintase CTP untuk sintesis nukleotida CTP uridin. dan diubah menjadi nukleotida oleh enzim pirimidin fosforibosil transferase. membentuk monofosfat orotate (OMP). Jelaskan tentang jalur penyelamatan pirimidin! Cincin pirimidin dapat mengalami degradasi menjadi senyawa yang soluble (larut dalam air). menghasilkan CTP.dimasukkan ke dalam jalur biosintesis nukleotida pirimidin melalui aksi transcarbamoylase aspartat. pirimidin dapat memasuki jalur penyelamatan pirimidin (Salvage Pathway). tidak dibangun di atas PRPP. The thymine nucleotides are in turn derived by de novo synthesis from dUMP or by salvage pathways from deoxyuridine or deoxythymidine. tidak ada cabang di jalur sintesis pirimidin. PRPP ditambahkan ke base pirimidin terbentuk penuh pertama (asam orotic). UMP adalah fosforilasi dua kali untuk menghasilkan UTP (ATP merupakan donor fosfat).

GDP.yang kemudian akan membentuk ikatan disulfida. CDP. 35. Senyawa apa yang diperlukan untuk mereduksi thioredoksin? Gugus pereduksi berasal dari NADPH + H+ dan dikatalisa oleh tioredoksin reduktase.dCDP. Apa peranan senyawa thioredoxin pada enzim ribonukleotida reduktase? Sebagai donor gugus pereduksi (ko-enzim) yang berfungsi aktif membentuk deoksiribonukleotida. Donor atom hydrogen untuk proses reduksi ini ialah gugus sulfhidril dari enzim tersebut. dan dUDP). GDP. dan UDP) menjadi bentuk deoksi (dADP. 34.yang kemudian akan membentnuk ikatan disulfida.yang dihasilkan dari ribonukleosida difosfat. - Riboknukleotida reduktase (ribonukleosida difosfat reduktase) berperan dala proses reduksi nukleosida difosfat (ADP.dCDP. dan UDP). . dGDP. 36. menjadi bentuk deoksi (dADP.dan dUDP) - Donor atom hydrogen untuk proses reduksi ini ialah gugus sulfhidril dari enzim tersebut.CDP.- Nukleotida untuk sintesis DNA adalah 2’-deoksiribosanukleotida.dGDP. Jelaskan yang saudara ketahui mengenai enzim ribonukleotida reduktase ! Enzim Riboknukleotida Reduktase berperan dalam proses reduksi nukleosida difosfat (ADP.

dan dUDP). dan UDP) menjadi bentuk deoksi (Dadp. karena kelarutan dengan-produk katabolisme pirimidin. CDP. 38. Terangkan mekanisme pembentukan dTMP . Urasil dapat diselamatkan untuk membentuk UMP melalui tindakan bersama dari fosforilase uridina dan uridina kinase. Pembentukan dTMP. Donor atom hidrogen untuk proses reduksi ini ialah gugus sulfhidril dari enzim tersebut. seperti ditunjukkan: urasil fosfat + ribosa-1  uridina + P i uridina + ATP  ADP + UMP Deoxyuridine juga merupakan substrat untuk fosforilase uridina. dGDP. dengan menyelamatkan dari dTMP membutuhkan fosforilase timin dan sebelumnya dihadapi kinase timidin: timin + deoksiribosa-1-fosfat  timidin + P i timidin + ATP  ADP + dTMP Sisa barang dari deoxycytidine ini dikatalisis oleh kinase deoxycytidine: . yang kemudian akan membentuk ikatan disulfida.37. GDP. senyawa apa yang dapat menghambat pembentukannya ? Katabolisme dari nukleotida pirimidin akhirnya menyebabkan β-alanin (ketika CMP dan UMP yang rusak) atau β-aminoisobutyrate (ketika dTMP diturunkan) dan NH dan CO 2. Sisa barang dari basa pirimidin memiliki signifikansi klinis kurang daripada purin.Reaksi selanjutnya mengubah produk untuk malonyl-KoA (yang dapat dialihkan ke sintesis asam lemak) atau methylmalonyl-KoA (yang dikonversikan ke succinyl-KoA dan dapat didorong dengan siklus TCA). dCDP. Namun. seperti yang ditunjukkan di atas. Jelaskan mekanisme regulasi enzim ribonukleotida reduktase! Ribonukleotida reduktase berperan dalam proses reduksi nukleosida difosfat (AGD. jalur penyelamatan untuk sintesis nukleotida timidin sangat penting dalam persiapan untuk pembelahan sel. 3 The β-alanin dan β-aminoisobutyrate berfungsi sebagai donor-NH 2 di transaminasi dari α-ketoglutarate untuk glutamat.

deoxycytidine + ATP  dCMP + ADP Deoxyadenosine dan juga substrat untuk kinase deoxycytidine. rendah. karena keseluruhan selular dan konsentrasi plasma dari pirimidin nukleosida. serta mereka yang ribosa-1-fosfat. meskipun substrat ini jauh lebih tinggi daripada deoxycytidine. Namun. . sisa barang dari pirimidin oleh kinase ini relatif tidak efisien. m K untuk Fungsi utama dari kinase pirimidin nukleosida adalah untuk menjaga keseimbangan selular antara tingkat pirimidin nukleosida dan monophosphates pirimidin nukleosida.