Transpozoni

Elemente genetice mobile,care dovedesc PLASTICITATEA genomului

TRANSPOZITIA
 

SCHIMBAREA LOCALIZARII UNEI SECVENTE DE adn IN GENOM ARE LOC recombinarea genetica DESI NU SE PRODUCE UN SCHIMB DE MATERIAL GENETIC 1948 BARBARA McCLINTOCK descoperea “genele saritoare” investigand porumbul 1983 este rasplatita cu Premiul Nobel

 

ELEMENTUL MOBIL produce o ruptura cromozomiala la nivelul situsului de insertie al unei gene determinand mutarea locusului acesteia = TRANSPOZITIE .

nici fix .nici imuabil .Genom dinamic Adica un genom sigur nu este: .

.

efectul fiind asemanator mutatiilor La om elementele transpozabile sunt de tip: transpozoni si retrotranspozoni Al treilea mecanism il reprezinta secventele de inserat. .Transpozonii pot fi o sursa majora de modificari evolutive in genom   Rearanjamentele creeaza secvente noi si schimba functia secventei initale/tinta Uneori pot aparea maladii ca urmare a insertiei intr-o gena functionala.

Integrarea segmentelor IS (inserted sequence) in ADNul cromozomial .

I . SECVENTE DE INSERAT Secventa de inserat (IS) este flancata de 9 – 13 pb. „ repetitii inversate‟ Repetitiile directe si inverse/inversate indica prezenta elementelor genetice mobile .

.

rezistenta la antibiotice . gena pt.o regiune unica codanta pt.o zona centrala ce poate fi utilizata ca marker genetic. enzima transpozaza si .Transpozaza Secventa de inserat contine: . de ex.

paste . se copiaza. Mecanism: copy .iar copia este inserata la alt nivel  creste nr.de copii ale Tn in genom.replicative 1.II. TRANSPOZONII (Tn) comporta 2 tipuri de transpozitii: replicative si non . Tn original ramane la locul sau.

tinta Integrare Element transpozabil Donor Recipient . Replicare Segm.1. copia se insera in segmentul cromozomial tinta. Transpozitie replicativa (~Copyand-paste)  Elementul transpozabil este copiat.

Transpozitia conservativa      Mecanism: cut and paste Tn insusi – ca entitate fizica – se muta direct pe alt situs Transpozaza (se leaga de capetele transpozonului original.2.si alipeste Tn in alt loc al genomului) ADN polimeraza umple golurile dintre capetele ramase „lipicioase‟ ADN ligaza inchide scheletul glucidofosforic .le sectioneaza – lasand in urma “sticky ends” .

dar si pt ADN polimeraza .Transpozaza   Se leaga: Specific de un situs Oriunde in ADN Secventele repetitive scurte directe si inverse sunt importante in excizia transpozonilor de catre transpozaza.

Element transpozabil Segment tinta Excisie & Integrare Donor Recipient . Transpozitia conservativa (~Cutand-paste)  Elementul se muta prin excizie si integrare.2.

Retrotranspozonii .III.

Retrotranspozitia – apare cel mai frecvent la om 1. Transcriere RNA Target Revers transcriere ADNc Integrare Donor . ADN-ul elementului mobil este transcris in RNA. ARN-ul este revers-transcris in ADNc. care este apoi inserat in segmentul cromozomial acceptor. 2.

au revers-transcriptaza fiind capabili de transpozitie independenta Retro-pseudogenele = pseudeogene procesate. Ex. fara reverstranscriptaza.redus de copii (LINEs) cu nr. dar nu pot infecta celule noi avand actiune limitata la un singur genom. nu transpozeaza independent.Exista 3 clase importante de retrotranspozoni la mamifere:    - Retrovirusurile endogene au secvente asemanatoare retrovirusurilor. sunt de 2 tipuri: cu nr. fam. inalt de copii: SINEs. au revers-transcriptaza si LTR Retrotranspozonii nevirali. Alu . fara 3‟LTR (long terminal repeats).

.

.

repetate de 300.000-100.5 kb (majoritatea prezinta deletii).L-1 LINEs (long-interspersed sequences): elemente lungi de spatiere Elemente de 6.000X. dispersate in intregul genom in medie o copie la 5000pb.000X (~5% of genom). reprezinta 10% din genomul uman Enzima de restrictie al carei nume il poarta provine de la Arthrobacter luteus . repetate de 50. SINEs (short-interspersed sequences) < 500 pb. Alu = 300pb.000-500.

Gregor Kreth. Speicher. Thomas Crèmer).Wikipedia (Andreas Bolzer. Christine Fauth. Daniela Koehler. Stefan Müller. Cromozomi hibridizati cu probe pt secvente Alu (verzui). Irina Solovei. Roland Eils. oarece corespondenta cu benzile R . Kaan Saracoglu. Michael R. Christoph Cremer.

.   Densitatea elementelor repetitive variaza in diferite regiuni genomice Elementele LINE se acumuleaza in regiuni bogate in AT Elementele Alu se acumuleaza in regiuni bogate in GC.

inversii. •Cresc dimensiunea genomului (in special la plante). •Genele sau secvente genice se muta in alte regiuni ale genomului. •Se creeaza pseudogene. prin amplificarea si dispersia lor.Concluzii Element Transpozabil: element genetic mobil al cromozomului care are capacitatea de a-si modifica pozitia in genom. Eucariote-transpozitie in cadrul aceluiasi cromozom sau pe un altul. •Determina rearanjamente cromozomiale (deletii. duplicatii. • Elementele transpozabile produc modificari genomice. Procariote-transpozitie de la/catre cromozomul celulei. prin rearanjamentele induse de excizie/insertie au o contributie importanta in evolutia genomului speciilor. plasmidic. •Deseori creste nr. . fagic. de copii ale elementului mobil in genom. • Sunt componente normale si ubicuitare ale genomului procariot si eucariot. translocatii).

Duplicatii genice si exonice datorita elementelor repetitive Defecte de aliniere in cursul meiozei crossing over “inegal” Little Alberts 9-5 © Garland Cromozom fara gene globinice .

Alterarea secventelor reglatoare →modificari de expresie genica Crearea de noi introni. Agenti mutageni biologici: modifica structura/ expresia genelor .Alterari la nivel genic      Inactivarea genelor prin insertii. Crearea unor secvente noi in cadrul genelor care pot determina modificarea functiei . Asamblarea de noi gene prin componentele purtate de un element mobil.

.

Retrotranspozonii: elemente transpozabile a caror mobilitate este ARN-mediata Reverse transcriptase encoded by the LINE-1 element Little Alberts 6-34 © Garland .

Flancate de repetitii de 7-20 pb.000-500. . repetate de 300. dispersate in intregul genom in medie o copie la 5000pb Unele sunt transcrise prin intermediul unui ARN .Retrotranspozomi umani: Alu SINEs (short-interspersed sequences) • • • • ~300 pb.000X. AluI SINEs depistat in neurofibromatoza (inactivarea genei) .

migreaza in genom prin intermediul ARN  Unele cazuri de hemofilie apar prin insertia unui element L1 .   L-1 LINEs (long-interspersed sequences): elemente lungi de spatiere Contin gene cu valoare functionala cum sunt cele ce codifica polimeraza (pol) si transcriptaza.

090.000 copies (1) marime: ~ 300 bp (2) Reprezinta ~ 13% din genom (3) Transpozitia implica prezenta reverstranscriptazei in celula gazda si formarea unui ARN intermediar. (4) Apare in special in regiunile bogate in –GC- .Elemente transpozabile SINE: familia Alu 1.