TPICOS COMPUTACIONAIS

EM

MATERIAIS

ALEXANDRE

SANTO ANDR
2013

DE

FREITAS SILVEIRA

RESUMO
Neste experiment foram realizadas algumas simulacoes, a fim de
se obter o parametro de rede de um solido de Lennard-Jones com
estrutura cristalina do tipo CFC, bem como a expressao para a sua
energia potencial; foram feitas outras simulacoes para se determiner o
tamanho mais eficaz para o Sistema; e tambem uma analise de como
o passo de integracao afeta a dinamica de um sistema.
O parametro de rede encontrado foi de 1,55 e o valor teorico foi
de 1,09, ja o tamanho do sistema que proporcionou menor tempo de
simulacao ainda com uma confiabilidade alta foi o 4x4x4. (256
atomos). Por fim, verificou-se que um passo de integracao grande
influencia em maiores flutuacoes e deslocamentos dos resultados da
grandeza medida.

1. INTRODUO
A dinmica molecular clssica consiste na aplicao das leis da
mecanica classica do movimento para um sistema formado por
moleculas.

Os dados numricos obtidos so decorrentes da soluo

numrica de um sistema de equaes diferenciais acopladas, contendo

em principio trs equaes para cada tomo (uma equao para cada
componente do espao tridimensional) do sistema, que envolve. [1]
O conhecimento do potencial de interao entre as partculas e
as equaes de movimento que regem sua dinmica so elementos
fundamentais

para

realizao

de

uma

simulao.

simulao

computacional nos permite extrair vrias informaes do sistema

como um todo, permitindo, assim, o clculo de diversas propriedades.
A modelagem computacional alm de nos oferecer formas de
resolver

clculos

matemticos,

oferece

tambm

criao

de

laboratrios virtuais no qual estudos podem ser realizados de forma

muito prxima realidade. Sendo assim, a simulao em ambientes
computacionais

permite

que

seja

capaz

entendimento

do

comportamento da matria em uma escala micromtrica, ou ainda em

situaes fsicas impossveis de ser alcanadas em laboratrios (altas
presses ou temperaturas). [2]

2. OBJETIVO
O

experimento

teve

como

objetivos

determinao

do

parmetro de rede para um slido de Lennard-Jones de CFC, utilizandose da simulao de dinmica molecular a fim de determinar um
tamanho de sistema ideal, por fim, ainda analisar o efeito do passos de
integrao em funo do tempo de processamento, a fim de obter um
determinado numero de passos de integrao mnimos que possibilite
a obteno de resultados coerentes e com tempo de processamentos
mnimos.

3. METODOLOGIA
3.1.

Procedimento experimental

1) Parametro de rede
Utilizou-se o programa crystal para similar parametro de rede
de 1,3 ate 1,9. Calculou-se a enrgia total do sistema do solido
de Lennard-Jones e obteve-se um grafico poco de potencial
permitindo-se estimar o valor do parametro de rede e a partir
da equacao da curva gerada.
2) Tamanho do sistema
Gerou-se solidos com tamnhos variados de 1x1x1 ate 7x7x7 e
obteve-se os valores de energia total, temperatura, pressao, energia
potencial instantanos, para poder filtar os valores sem muitas
flutuacoes e poder calcular um valor medio e plotar em um grafico
dessas mesmas propriedades em funcao do numero de atomos no
sistema.
3) Passo de Integrao
Para esta etapa, foi um mesmo tempo total de simulacao para
poder comparar o efeito do passo de iteracao e o numero total de
passos em funcao das propriedades avaliaadas na segunda etapa
(Pressao, Temperatura, Energia Potencial e Total e Energia Cinetica). O
numero de passos que foram encontrados para os passos de
integrao 0.002, 0.005, 0.01, 0.05 sao respectivamente

100.000,

40.000, 20.000, 4.000, o tempo total foi estabelecido como sendo 200.

4. RESULTADOS E DISCUSSO
4.1.

Determinao do parmetro de rede de equilbrio

Com os resultados obtidos para energia potencial para cada

parmetro de rede utilizado na simulao (de 1,3 a 1,9), em unidades
reduzidas, foi plotado o grfico apresentado na Figura 1.
A curva da Figura 1 representa a curva de potencial de LennardJones, na qual o parmetro de rede corresponde distncia onde a
energia potencial mnima (energia de coeso). Desta forma,
derivando a equacao equacao de tendencia da curva obteve-se que o
valor pode-se afirmar que o valor do parmetro de rede corresponde
para o sistema analisado aproximadamente 1,55 (em unidades
reduzidas). Este valor foi utilizado para as simulaes posteriores.
A melhor funo que representa esta curva, com R = 1, uma
funo polinomial de sexta ordem, obtida por mtodo dos mnimos
quadrados, sendo Epotencial a energia potencial e x a distncia entre os
tomos.

Figura 1 - Grfico da energia potencial (E*) do slido de Lennard-Jones em funo da

distancia interatmica (em unidades reduzidas).

O valor do parmetro de rede CFC terico corresponde a 1,09

(em unidades reduzidas), o resultado obtido nesta simulao supera
5

em 0,46 unidades o valor terico o que corresponde a 42,2%, sendo

esse erro devido ao algoritmo que usa o raio de corte para poder
ganhar tempo de simulacao.

4.2.

Anlise

do

efeito

do

nmero

de

tomos

nos

resultados
Na Figura 2 encontram-se os grficos dos valores mdios da
temperatura, energia cintica, potencial e presso em funo do
nmero total de tomos no sistema (todas as grandezas encontram-se
em unidades reduzidas). Os valores medios foram obtidos apos a
compilacao dos graficos individuais de cada uma dessas propriedades
avaliadas e foi calculada a mdia dos valores da propriedade avaliada
apos a escolha do intervalo de valores onde no havia muitas
flutuaes nos valores obtidos, com isso, foram gerados os quatro
imagens ilustradas abaixo, aps a obteno da mdia de cada um
desses valores.
A partir da analise das figuras abaixo, observa-se que para
sistemas contendo 256 tomos ou mais, ilustrado pelo quarto ponto da
curva, os valores das grandezas convergem para um resultado que se
mantem constante mesmo quando ha aumento do numero de tomos
adicionados ao sistema.

Figura 2 - Grficos da temperatura, energia cintica, potencial e presso em funo

do nmero total de tomos.

Mantendo o numero de passos de iterao constante e variandose o numero de atomos simulados observou-se que o tempo de de
processamento aumentou consideravelmente para sistemas contendo
mais de 500 tomos.
Pelo algoritmo utilizada nessa atividade, que baseia-se no calculo
da

fora

de

interao

entre

todas

as

partculas

no

sistema

independentemente da distncia entre elas, isso pode tornar o tempo

de simulacao impraticvel, tornando-se ineficiente quando o nmero
de partculas no sistema elevado, assim, uma forma de reduzir o
tempo de processamento seria estabeler uma distncia mxima para o
clculo de foras de interao, visto que a partir de uma dado valor o
peso que esse resultado traria para o valor final e infimio. Assim, o
algoritmo utiliza-se de uma tcnica de raio de corte (cut-off) e utiliza
valores menores ou igual a 2.5.
7

Portanto, um sistema contendo 256 tomos (sistema com

tamanho para a clula CFC de 4x4x4 ) o que apresenta um resultado
coerente com um tempo de processamento combativel e executavel e
este sera o tamanho de sistema utilizado para o calculo de tempo de
iteracao.
4.3.

Anlise do passo de integrao

No geral, mesmo que muito sutil, foi observado que quanto

menor o passo de integrao menor sero as flutuaes obtidas e
observadas no grfico. Analisando a Figura 3, verificamos que o
tamanho do passo no afetou a flutuao dos valores para a
temperatura. Em todos os passos usados, a temperatura oscila em
torno de 0,006 e 0,008.

Figura 3 - Grfico dos valores da temperatura em funo do tempo (em unidades

reduzidas) com diferentes passos de integrao.

Figura 4 - Grfico dos valores da energia cintica em funo do tempo (em unidades
reduzidas) com diferentes passos de integrao.

Figura 5 - - Grfico dos valores da energia potencial em funo do tempo (em

unidades reduzidas) com diferentes passos de integrao.

Figura 6 - Grfico dos valores da energia potencial em funo do tempo (em

unidades reduzidas) com diferentes passos de integrao.

Figura 7 - Grfico dos valores da presso em funo do tempo (em unidades

reduzidas) com diferentes passos de integrao.

10

5. CONCLUSO
O valor do parmetro de rede CFC obtido supera em 0,46
unidades reduzidas do valor terico (cerca de 42,2%), diferena
relacionada ao erro introduzido ao usar o raio de corte na simulao.
Um sistema contendo 256 tomos (4x4x4) foi o que se mostrou a
configurao mais eficiente (menor tempo de processamento e
convergncia dos resultados) para calcular temperatura, energia
cintica, energia potencial e presso. Em geral, um passo de
integrao grande leva a maiores flutuaes e deslocamentos dos
resultados da grandeza. Nas simulaes realizadas a grandeza
temperatura no foi influenciada pelo tamanho do passo usado.

11