Biochemistry 2/e - Garrett & Grisham

Pasos de la Expresin Gentica

Copyright 1999 by Harcourt Brace & Company

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Traduccin del mensaje

Cmo se traduce un mRNA a protenas? Qu es el cdigo gentico? Cmo se convierte el cdigo de 4 letras del mRNA al cdigo de 20 letras de las protenas? Dupletes? Tripletes? Cuadrupletes? Crick propuso que existan molculas adaptadoras para esta descodificacin. Estos adaptadores son los tRNAs
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Naturaleza del cdigo gentico

Un grupo de tres bases codifica un aminocido El cdigo no es traslapado La secuencia de bases se lee desde un punto de inicio fijo, sin puntuacin El cdigo es degenerado (en la mayora de los casos cada aminocido puede ser designado por varios tripletes)
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Cmo se descrifr el cdigo?

Severo Ochoa descubre la polinucletido fosforilasa Marshall Nirenberg y Heinrich Matthaei mostraron que poli-U produca poli-fenilalanina en un extracto libre de clulas de E. coli Poly-A daba polylysina Poly-C daba polyprolina Poly-G daba polyglycina Y los dems aminocidos?
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Descifrando el resto del cdigo

Trabajo con copolmeros (poli (A,C), etc.), revel algunos codones G. Korana us polmeros repetitivos sintticos Marshall Nirenberg y Philip Leder mostraron que trinucletidos unidos a ribosomas podan provocar la unin de aminoacil-tRNAs specficos Usando aminocidos marcados con C-14 y todos los codones posibles llegaron al cdigo final
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Caractersticas del cdigo gentico

Todos los codones tienen significado: 61 especifican aminocidos y los otros 3 son codones sin sentido o de paro El cdigo no es ambiguo cada uno de los 61 codones especifica solo un aminocido El cdigo es degenerado - excepto Trp y Met, cada aminocido es codificado en dos o mas codones Los codones representando el mismo o un aminocido similar son similares en secuencia
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El cdigo gentico

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Activacin de aminocidos y unin a tRNAs

Los codones son reconocidos por aminoaciltRNAs El apareamiento de bases permite que cada tRNA lleve su aminocido particular al ribosoma Los aminoacil-tRNAs hacen algo mas: activan el aminocido para transferirlo a la cadena peptdica en crecimiento Las aminoacil-tRNA sintetasas ligan el aminocido con el tRNA "cognado" La actividad de desacilasa "edita" e hidroliza aminoacil-tRNAs mal cargados
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Reconocimiento de tRNAs
Por las aminoacil tRNA sintetasas La regin del anticodn no es el nico sitio de reconocimiento El interior de la L" y otras regiones del tRNA molcula son tambin importantes

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Degeneracin de la tercera base

Hiptesis del columpio ( Wobble) El apareamiento codn-anticodn es crucial para la especificidad en la lectura del cdigo" La degeneracin ocurre gracias a que un tRNA puede leer ms de un codn La hiptesis Wobble de Crick explica el reconocimiento degenerado
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Estructura y ensamblaje ribosomales

El ribosoma de E. coli mide 25 nm de dimetro, pesa 2,520 kD y consta de dos subunidades que se disocian a < 1mM Mg2+ La subunidad 30S pesa 930 kD, contiene 21 protenas y el rRNA 16S La subunidad 50S pesa 1,590 kD contiene 31 protenas y dos rRNAs: rRNA 23S y rRNA 5S 20,000 ribosomas en una clula, 20% de la masa celular
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Mecanismo de sntesis de protenas

Incluye tres pasos: iniciacin, elongacin y terminacin Iniciacin: Unin del mRNA y el aminoacil-tRNA iniciador a la subundad pequea, seguido por la unin de la subunidad grande Elongacin: Sntesis de todos los enlaces peptdicos - con tRNAs unidos al sitio aceptor (A) y peptidil (P). Terminacin: Ocurre cuando se alcanza el codn de paro
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Inicio en Procariontes
EL tRNA iniciador es: f-Met-tRNAfMet Se usa solo al inicio y Met-tRNAmMet se emplea para adiciones subsecuentes de Met La N-formil metionina es el primer aa de todas las protenas de E.coli, pero es removida en aproximadamente la mitad Una formil transferasa agrega el grupo formilo
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Inicio
El registro correcto del mRNA con el ribosoma requiere el alineamiento de una secuencia rica en pirimidinas del extremo 3 del RNA 16S con una zona rica en purinas del extremo 5 del mRNA El segmento rico en purinas es conocido como sitio de unin al ribosoma o secuencia Shine-Dalgarno (SD) Initiation factor proteins, GTP, N-formyl-MettRNAfMet, mRNA and 30S ribosome form the 30S initiation complex
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Pasos de la Iniciacin
La subunidad 30S con IF-1 e IF-3 se une al mRNA, IF-2, GTP y f-Met-tRNAfMet IF-2 entrega el tRNA iniciador en un paso dependiente de GTP La salida de los factores de iniciacin lleva a la unin de la subunidad 50S Note que el " sitio acceptor " est ahora acomodado para aceptar un aminoaciltRNA entrante
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