Professional Documents
Culture Documents
OBIECTIV ȘI ISTORIE
DEFINITIA MICROBIOLOGIEI
Regnul Protista cuprinde microorganisme a căror celule sunt evoluate, de tip eucariot,
cu nucleu şi organite celulare nespecifice cum sunt reticolul endoplasmatic,
ergastoplasma etc.
Figura 2 – Mycetele
Figura 3 - Protozoarele
Regnul Procariote cuprinde microorganisme a căror celule sunt primitive, de tip
procariot, lipsite de nucleu adevărat şi de organite celulare nespecifice, dar cu un înveliş
suplimentar numit perete celular.
nu au nucleu adevãrat ci un cromozom haploid format dintr-o moleculã circularã
de ADN
lipsite de organite celulare comune cu excepţia ribozomilor
au perete celular rigid
Se divid direct
nu au nucleu adevãrat ci un
cromozom haploid format dintr-o
moleculã circularã de ADN
lipsite de organite celulare comune
cu excepţia ribozomilor
au perete celular rigid
Se divid direct
MORFOLOGIA MICROORGANISMELOR
DEFINITII
Microorganismele constituie un sistem complex de organisme acelulare
și celulare, inzestrate cu un metabolism propriu si continuitate genetica, diferite ca
morfologie, activitate biologica si pozitie sistematica. Cu toate acestea, tuturor
microorganismelor le sunt comune cateva caracteristici: dimensiunile
microscopice, organizarea lor monocelulară si pluricelulară, precum si structura
internă relativ simplă.
In categoria microorganismelor sunt incluse:
1. virusurile – acelulare;
2. bacteriile, drojdiile – monocelulare;
3. mucegaiurile, algele microscopice si protozoarele – monocelulare si
pluricelulare.
reactiilor biochimice din celula avand loc la nivelul acestui complex coloidal.
Organitele reprezinta sisteme structurale subcelulare bine definite ca
structura, forma, specializate in activitati intra si extracelulare. Exista doua
categorii de organite: comune – intalnite in toate celulele organismelor vii,
indiferent de origine, reprezentate prin reticulul endoplasmatic, ribozomii (granulele
lui Palade*), complexul Golgi, mitocondriile, lizozomii si centrozomul – si organite
cu rol specific unor anumite celule specializate sub aspect fiziologic, biologic.
*George Emil Palade – savant roman, laureat al premiului Nobel
pentru medicina, descoperitorul formatiunilor mitocondriale
citoplasmatice si a rolului acestora in celula.
In citoplasma mai pot fi gasite si incluziunile celulare, formatiuni bine
conturate, cu sau fara membrana, cu functii temporare compuse din picaturi de
grasime, granule de proteine sau glicogen, alte substante dizolvate in apa,
reprezentand substante de rezerva si vacuolele , continand substante sub forma
de solutii hidrice.
Reticulul endoplasmatic este o retea canelara ce brazdeaza citoplasma
multidirectional, considerat ca un sistem circulator celular deoarece are rolul
transportorului de produsi celulari. Datorita reticulului endoplasmatic suprafata de
schimb celular intre substantele citoplasmatice si spatiul intercelular se mareste,
imbunatatindu-se astfel calitatea si randamentul acestui schimb. Totodata, reticulul
endoplasmatic poate sintetiza proteine, lipide si hormoni pe care celula le secreta
in lichidul intercelular.
Ribozomii sunt forme granulare sferice in care are loc sinteza proteinelor, fiind
constituite din ARN si proteine.
Lizozomii sunt organite sferice continand enzime digestive, avand rolul apararii
celulelor contra altor microorganisme prin digerarea (liza) acestora.
Complexul Golgi reprezinta formatiuni membranoase sub forma de pachete
asezate in teancuri, amplasate in apropierea nucleului, avand rolul sintetizarii unor
substante celulare specifice si de transfer al acestora prin reticulul endoplasmatic
in spatiul intracelular.
Mitocondriile sunt corpusculi sferici sau ovoidali, granulari, ce contin sisteme
enzimatice care participa la transformarile energetice din celula, deci care produc
energie celulara.
Centrozomul este un constituent celular (organit) care intervine indirect in
diviziunea celulara, vizibil la microscopul electronic in vecinatatea nucleului, cu
deosebire in timpul diviziunii. Impreuna cu masa citoplasmatica din jurul sau
formeaza asa-numita centrosfera. In timpul diviziunii, in jurul centrosferei se
contureaza filamente citoplasmatice radiale denumite aster. Centrozomul lipseste
din celulele in care nu are loc diviziunea celulara.
In interiorul celulelor mai pot fi intalnite organite cu forme variabile pigmentate
diferit, cunoscute sub denumirea de cromoplaste, cloroplaste, s.a., avand culori
specifice, cu deosebire in schimburile energetice si in reactiile redox si de schimb
ionic intra si extracelulare.
Nucleul este o formatiune protoplasmatica a celulei cu o organizare
superioara, continand proteine si acizi nucleici (ADN, ARN), fiind responsabil de
transmiterea caracterelor ereditare, in diviziunea celulara si in metabolismul
70
BACTERIOLOGIE
Acesta este format dintr-un strat bazal sau peptidoglican, asemănător la toate
bacteriile şi un strat al structurilor superficiale, foarte diferenţiat, în funcţie de care
bacteriile manifestă caractere tinctoriale diferite: bacterii Gram - pozitive, Gram -
negative şi acido-alcoolorezistente.
Peptidoglicanul sau mureina este structura chimică responsabilă de rigiditatea
peretelui celular şi care asigură forma şi rezistenţa mecanică a bacteriei. Prezent la toate
bacteriile, el constă dintr-un schelet, format din molecule lungi paralele polizaharidice de
N-acetil-glucozamină şi acid N-acetil-muramic. Moleculele de acid N-acetil-muramic din
lanţurile vecine sunt legate între ele prin punţi polipeptidice, transversale.
La bacteriile Gram - pozitive, peptidoglicanul are o grosime de 15-30 nm şi
conţine până la 200 de lanţuri paralele de mureină.
Stratul structurilor speciale este redus şi alcătuit din polimeri hidrosolubili care
sunt acizii theicoici. Ei reprezintă antigenele de supafaţă ale bacteriilor gram-pozitive.
Peretele celular al bacteriilor gram-pozitive este sensibil la acţiunea lizozimului
care rupe legăturile dintre acidul N-acetil muramic şi N-acetilglucozamină.
La bacteriile Gram-negative, peptidoglicanul are o grosime de 4-5nm. Stratul
superficial este însă mult mai complex decât la bacteriile gram - pozitive fiind alcătuit
dintr-o membrană externă, lipoproteine şi lipopolizaharidul de perete.
70
Membrana citoplasmatică
Pilii bacterieni
Numeroase specii bacteriene gram-negative au pe suprafaţa lor lor nişte apendici
filamentoşi, rigizi, mai scurţi decât flagelii, în număr mare (100-500/celulă) şi cu
dispoziţie în general peritrichă. Ei se evidenţiază numai prin microscopie electronică.
Din punct de vedere funcţional, pilii se împart în:
sex pili codificaţi plasmidic şi care au rol în transferul de material genetic între
bacterii. Sunt prezenţi mai ales la bacteriile gram-negative (Enterobacteriaceae,
Pseudomonas),
pili comuni sau pili de aderenţă (fimbrii), în număr mare, codificaţi cromozomial, şi
care servesc bacteriilor la fixarea fermă de mediul de cultură sau de celulele pe care
se află. Ei constituie, deci, un factor important de virulenţă. În afară de aderenţă,
pilii comuni mai au şi proprietăţi antifagocitare.
Flagelii sunt formatiuni filamentoase prezente la unele bacterii, denumite mobile,
ca organe de locomotie. Unele bacterii au un singur flagel sau un manunchi de
flageli polarizat la un capat al celulei, la altele flagelii sunt amplasati pe intreaga
suprafata a celulei in numar foarte mare (de ordinul 100 si 1000), iar lungimea lor
poate atinge si 20 de micrometri, caz in care sunt cunoscuti sub numele de cili.
Cel mai adesea nu există simultan cili si flageli.
Ca structura, flagelii sunt alcatuiti dintr-o proteina specifica, cu structură
helicoidală denumită flagelină. Ca urmare a structurii helicoidale și a specificitatii,
flagelina este contractilă, fixându-se în spatiul periplasmic cu ajutorul unor
formatiuni denumite cârlig și discuri.
Flagelii se pot roti cu 40-60 de rotatii pe secunda in ambele sensuri de
rotire (dreapta, stanga), imprimand datorita structurii helicoidale o miscare de
deplasare a celulei bacteriene cu viteze de 2 pana la 100 de ori mai mare ca
lungimea celulei intr-o singura secunda (spre comparare, campionul mondial la
100 m plat este de numai 5-6 ori mai rapid in raport cu inaltimea sa). Celulele
mobile cu un singur flagel sunt numite monotriche, cele cu doi flageli, amfitriche,
multiflagelate polare, lofotriche, iar ciliatele peritriche.
Pilii sunt structuri proteice care acopera complet suprafata bacteriilor; pilii
70
ligaze.
Enzimele pot aparea in fiziologia si metabolismul bacteriilor prin inductie,
ele numindu-se enzime inductive, existand numai la comanda si in prezenta
inductorilor specifici sau ca o zestre celulara, acestea fiind cunoscute sub numele
de enzime constitutive.
Glucidele reprezintă 15-20% din masa substantei uscate a bacteriilor, in
compozitia acesteia fiind cuprinse toate tipurile de glucide: omogene sau
neomogene, simple si complexe. Ele sunt foarte importante pentru bacteriile
anaerobe pentru care constituie singura sursa de nutritie. Rolul glucidelor in celula
bacteriana este plurivalent si anume: energetic, structural, antigenic, patogenic
sau de rezistenta celulara, etc. Este evident ca ele prezinta importanta capitala ca
sursa de energie si ca substanta plastica ce intra in constitutia cvasitotalitara a
tuturor partilor morfologice celulare. O caracteristică specifica bacteriilor Gram-pozitive
este prezenta complexului poliglucidic neomogen – mureina.
Lipidele din bacterii variaza in limite foarte largi in raport cu specia
microorganismelor, dar si cu conditiile de mediu (metaboliti, substrat etc.) sau
stadiul de maturitate. In general, continutul de lipide este de 2-14% din substanta
uscata celulara, dar unele mycobacterii (Mycobacterium tuberculosis Koch)au si
mai mult(30%).
Lipidele bacterine sunt omogene (acizi grasi, gliceride, ceruri)
si complexe (fosfolipide, lipoproteine, lipogliceni, etc.). Ceea ce-i specific
bacteriilor este prezenta in celulele lor, in peretele mycobacteriilor, a acizilor grasi
micoici (ac. Tuberculostearic , ac. Dicolipenic , ac. Micocerosic ) componenti ai
cerurilor. Pentru bacterii este caracteristica lipsa steridelor (esteri ai alcoolilor
policiclici numiti steroli). Totusi in Azobacter chroococcum, fixator de azot, s-a gasit
un sterol (Schifferd, Anderson, 1936) cu structura neprecizata.
Rolul lipidelor este divers, dar functiile energetice si de permeabilitate par a
fi preponderente in fiziologia celulara bacteriana. Lipidele complexe, cum sunt
fosfatidele, contin elemente structurale atat hidrofile, cat si lipofile, astfel ca
solutiile lor apoase, de natura coloidala, joaca un rol important in reglarea
permeabilitatii celulare. Fosfatidele pot absorbi glucide si protide, care pot fi
eliberate dupa nevoie, prin desorbtie. In acest fel, ele pot functiona si ca
transportori de substante in celulele bacteriene, iar alaturi de acizii ribonucleici au
rol in biosinteza proteinelor.
Continutul de substante minerale reprezinta 3-30% din substanta uscata a
bacteriilor, acesta variind in functie de specie si de varsta. Rolul substantelor
minerale rezida in primul rand din faptul ca formarea compusilor la nivel molecular
se face sub forma unor complecsi ce contin obligatoriu elemente minerale sub
forma ionica. Acestia (de ex. Ca, Mg) intra in structurile celulare, deci au rol
plastic, ori activeaza sistemele enzimatice (citocromoxidazele cu fier), participa la
formarea si transformarile acizilor nucleici (fosforul), regleaza presiunea osmotica
celulara si permeabilitatea celulara (sodiul, potasiul, sulful), precum si potentialul
de oxido-reducere la nivelul celular, etc.
Oligo si microelementele minerale, caracterizate prin reactivitate chimica ori
labilitate electronica ridicate, sunt prezente frecvent in celulele bacteriene (de ex. K, Na,
Fe, Ca, Mg, S, Cu s.a.).
70
Pentru organismul uman, bacteriile sunt o bogata sursa de vitamine, deoarece ele
sunt capabile sa sintetizeze aceasta categorie de substante, cu deosebire vitaminele
hidrosolubile din grupul B. Astfel, vitamina B1 (tiamina) este sintetizata de bacterii in
oxidarile intracelulare si metabolismul glucidelor, ca de altfel si vitaminele B2
(riboflavina) si B3 (vitamina PP), vitamina B4 (adenina) ce participă in calitate de cofactor
in reactiile nucleatidelor.
Acidul folic (vitamina B9) este cunoscut ca un factor de crestere pentru mai
multe specii de bacterii (B.subtilis, Lactobacillus sp. etc.) fiind cofactor necesar
biosintezei compusilor purinici. Cresterea unor microorganisme bacteriene, ca de
exemplu Lactobacillus lactis Dorner, nu ar fi posibila fara prezenta vitaminei B12
(ciancobalamina). Vitamina H, acidul para amino benzoic, este denumit si
“vitamina vietii bacteriilor”, deoarece reprezinta pentru acestea un metabolit primar
absolut necesar vietii si inmultirii lor ,fiind si un factor de crestere.
În functie de specie, bacteriile pot sintetiza pigmenti, ce se intalnesc in
celulă (bacterii cromofore), legati endocelular de perete, ca in cazul stafilococilor
(bacterii paracromofore) sau la exteriorul celulei bacteriene, ca la Pseudomonas,
bacteriile din aceasta grupa fiind numite cromopare.
Pigmentii pot fi sintetizati pentru un anumit scop (de protectie, ca de
exemplu carotenoizii, pentru functia de coenzima in sistemele transmitatoare de
electroni si de fosforilare oxidativa, de structura, pentru elementele functionale ale
mitocondriilor*, ca factor de crestere pentru unele bacterii) sau pot rezulta din
procesele catabolice.
* mitos – fir; chondros – graunte; mitocondrie – organit subcelular in
care se regaseste sediul fosfonilarii oxidative, absenta la procariote
Bacteriile mai pot avea o serie de substante cu rol bactericid sau
bacteriostatic asupra altor specii sau chiar impotriva propriei specii (substante
purtand numele de bacteriocine).
METABOLISMUL BACTERIAN
Bacteriile sunt niste fiinte vii si, astfel, ele cresc, se inmultesc si mor. Acest
proces complex nu se refera numai la indivizi, ci si la populatia bacteriana in
totalitate. In primul caz biologia cresterii si dezvoltarii este dirijata ereditar, in cel de
al doilea aceste fenomene depind cu precadere de conditiile de mediu.
Creșterea individului bacterian se caracterizeaza prin adaugarea de
protoplasma, ca rezultanta a fenomenelor predominant anabolice in raport cu cele
catabolice si are ca efect o crestere a suprafetei si a volumului sau. Intre aceste
doua caractere exista un raport strans corelat cu etapa de dezvoltare in care se
afla bacteria: pe masura ce bacteria creste, se mareste si volumul sau, in timp ce
suprafata sa devine proportional mai mica (ipoteza Leuckart – Spencer). Cand
acest raport creste in favoarea volumului, celula bacteriana tinde sa se divida, sa
70
se multiplice. Cum aparatul nuclear este activ mai ales in momentul diviziunii
celulei, volumul bacteriei creste semnificativ in perioada in care aparatul nuclear
este in repaus.
Raportul volum/suprafata al bacteriei se schimba in favoarea
suprafetei odata ce diviziunea a luat sfarsit, dupa care se pregateste un nou ciclu
de crestere.
Multiplicarea bacteriilor inseamna cresterea numarului de indivizi intr-un
mediu de viata favorabil si se realizeaza prin diviziune. Populatia care rezulta prin
diviziunea bacteriilor creste in progresie geometrica cu ratia 2, timpul necesar
pentru dublarea populaţiei numindu-se timp de dublare sau timp de generatie. In
raport cu specia bacteriana, multiplicarea atinge un maximum de populatie care se
poate mentine o perioada oarecare dupa care incepe declinul ei. Multiplicarea se
petrece in faze succesive. Acestea sunt:
faza de lag* sau faza de ajustare, ce se caracterizeaza prin diminuarea
numarului de indivizi care constituie inoculul, prin cresterea dimensiunilor
germenilor viabili.
*engl. Lag – intarziere, captusire
Este o faza de acomodare a germenilor la noile conditii de viata. Durata de lag
este, in general, apreciata pentru bacterii la aproximativ 2 ore, dar ea este in
functie de specia bacteriana, cantitatea initiala de inocul si conditiile de mediu. De
exemplu, bacteriile termofile si Escherichia coli au o faza de lag scurta (15-20
minute), in timp ce Mycobacterium are una mai lunga. In faza de lag cantitatea de
N-total, P-organic, ARN si O2 consumat cresc.
faza logaritmica (exponentiala) de multiplicare este o faza de crestere
rapida, in progresie geometrica, a bacteriilor si se caracterizeaza printr-o serie de
manifestari cunoscute sub numele de “tinerete fiziologica"; microorganismele sunt
mai permeabile si mai sensibile la factorii de mediu. Faza dureaza in medie 2-3
ore (M. tuberculosis). Curba de multiplicare evolueaza exponential pana in
momentul in care una din substantele nutritive din mediu este consumata, iar in
mediu se acumuleaza metaboliti toxici. Metabolitii consumati si produsi in mediu
se numesc factori limitanti. In timpul acestei faze caracterele morfologice ale
bacteriilor se omogenizeaza, activitatea si echipamentul enzimatic sunt mai bine
dezvoltate, proprietatile biochimice si de metabolism se manifesta la parametrii
optimi, rezistenta germenilor la agentii fizici, chimici si biologici devine
caracteristica speciei.
faza stationara caracterizata prin faptul ca raportul dintre germenii care
se divid si cei care mor ramane relativ constant, astfel incat numarul bacteriilor se
stabilizeaza. Faza de stationare este denumita si faza de concentratie “M”,
deoarece in aceasta etapă populația bacteriană atinge un maximum in cultură.
faza de declin (faza de moarte logaritmica) este etapa in care numarul
germenilor morti intrece numarul germenilor vii, deoarece consumarea substratului
nutritiv si acumularea de metaboliti toxici duc la moartea majoritatii bacteriilor, iar
timpul de generatie creste la cateve zile; celulele vii imbatranesc, nu-si mai
pastreaza caracteristicile, speciile patogene isi pierd patogenitatea si virulenta. In
aceasta faza apar tendintele de sporulare. Ea nu este valabila in cazul culturilor
bacteriene continue, caracterizate prin reinnoirea continua a substratului nutritiv si
70
METABOLISMUL MICROBIAN
METABOLISMUL ENERGETIC
Metabolismul energetic (catabolic) se desfasoara in doua faze:
1. faza descompunerii enzimatice a macromoleculelor in partile lor constitutive:
aminoacizi, monoglucide, acizi grasi, etc., fara producere de energie utilizabila;
2. faza degradarii exergonice a constituientilor formati in prima faza, cu
producerea unor cantitati importante de energie, utilizabila in alte reactii
biochimice; energia este inmagazinata in compusi macroergici de tipul
nucleotid fosfatilor.
Degradarea are loc prin reactii de oxido-reducere in care o substanta donor
doneaza un electron sau un ion de hidrogen unui acceptor, care astfel sufera o
reducere. Reactiile redox sunt reversibile si catalizate enzimatic.
Metabolismul catabolic (energetic) este cunoscut si sub denumirea de
respiratie celulara si are urmatoarele caracteristici:
• se desfasoara etapizat (in trepte);
• energia se elibereaza in fractiuni, prin reactii de tip redox;
• energia eliberata este inmagazinata in compusi chimici macroergici de tipul
nucleotid fosfatilor si utilizata in reactii de biosinteza (anabolice), energie
echivalenta cu 7.3 kcal/mol;
• reactiile din metabolismul catabolic sunt juxtapuse celor anabolice;
• celula microorganismului se "incarca" cu o cantitate de energie specifica,
cunoscuta ca incarcare energetica sau energie potentiala, ce este data de
suma concentratiilor compusilor chimici macroergici inmagazinati (de ex.: ATP
+ ADP + AMP care reprezinta cca 15 micromoli / g.s.n. celulara) putand fi
70
TRANSPORTUL SUBSTANTELOR
Transportul substantelor de la exterior in interiorul celulei
microorganismului are loc selectiv si in dublu sens, prin mai multe mecanisme,
principalele fiind:
1. Difuzia pasiva, care este mecanismul de trecere lenta a substantelor din afara
in interiorul celulei si invers, fara consum de energie, pe baza gradientului de
concentratie, de la o concentratie mai mare la una mai mica, pana cand
concentratiile se echilibreaza. Prin acest mecanism se transfera putine
substante, printre care apa, O2, CO2, acizii grasi, unele substante liposolubile
prin membrana plasmatica.
2. Transportul prin transportor este mecanismul prin care un transportor
specific (carrier), de natura proteica, situat in plasmalema, fixeaza substanta si
o transporta in partea cealalta a membranei. El se realizeaza prin trei
modalitati, si anume:
• prin difuzie facilitata, transportul substantei fixate pe carrier avand loc, ca si
la difuzia pasiva, pe baza diferentei de concentratie dintre cele doua fete ale
membranei plasmatice, fara consum de energie, pana la echilibrarea
concentratiei.
• prin transport activ, realizat cu consum energetic, impotriva gradientului de
concentratie. Energia necesara este cuplata la transportorul proteic ce contine
un cuplaj complementar pentru substratul respectiv. Aceasta modalitate de
70
(H sau h2) si se defineste ca fiind raportul dintre variatia genetica aditiva (VA) si
variatia biologica:
A B A G M h2 =V V =V V +V
Mutatiile, care presupun modificarea secventei bazelor azotoase, astfel
incat numarul celulelor descendente difera de cel al celulelor mama, apar in
perioada de diviziune celulara exponentiala, din cauza ritmului foarte rapid de
crestere in timpul autoreplicarii. Celula care a suferit mutatia se numeste mutant.
Mutatiile pot fi spontane, ce apar ca greseli de copiere in timpul autoreplicarii,
datorita vitezei de autoreplicare, sau induse de catre factori inductori (agenti
mutageni), ce pot fi fizici (radiatii u.v., X, gamma, etc.), chimici (ex. aminopurina) si
biologici (de ex. gene supresor non sens care permit inserarea unui aminoacid in
lantul polipeptidic al mutantului).
Schimbarile ce pot aparea in cursul mutatiilor sunt variate, multiple si de
multe ori imprevizibile deoarece actioneaza intr-un lant polimolecular cu sute si mii
de secvente diferite, prin inlocuirea, inserarea, surprinderea sau inversarea ordinii
bazelor azotoase.
Transferul si recombinarea genetica este cea de a doua cale de a obtine
mutanti, prin care, o celula donoare face transfer de material genetic la o celula
receptoare, prin transmiterea unor fragmnte de ADN sau al intregului genom al
celulei donoare la celula receptoare.
Transferul si recombinarea genetica pot fi realizate prin trei modalitati:
transformare, transductie si conjugare, pe care le vom descrie in continuare.
In cazul transformarii, mutantul preia ADN-ul din cromozomul donorului, in
starea fiziologica numita starea de competenta, in care ADN-ul transformat
strabate peretele si membrana plasmata. Este un mecanism genetic care
determina, de exemplu, rezistenta la antibiotice.
Transductia este un fenomen descoperit de Zinder si Lederberg in 1952,
care consta in transmiterea caracterelor de la o cultura bacteriana la alta cu
ajutorul bacteriofagului, prin inocularea ADN-ului acestuia in celula bacteriana.
Dar transductia poate avea loc si dupa urmatorul scenariu: bacteriofagul poate
ramane intr-o stare neinfectioasa (stare de profag) cand se fixeaza de cromozomul
bacteriei si se divide sincron cu aceasta, comportare numita lizogenie. Genele
bacteriene pot fi transferate de la o celula la alta de catre fagii nevirulenti
(temperati), caz in care au fost denumiti si fagi transductanti.
In fine, cea de-a treia metoda de transfer si recombinare genetica o
constituie conjugarea*, care reprezinta un proces ce determina unirea (sinapsa)
unor cromozomi in meioza** de la materialul donor la acceptor prin episomi F+ si F-
(plasmide autonome libere in citoplasma cu functii sexuale). Celula donoare
poseda factorul “F+” pe care il trece in celula receptoare care contine factorul “F-”,
prin pilii sexuali. Spre deosebire de celulele fiintelor superioare, la care zigotul*** se
formeaza din genoamele integrale ale celor doi parteneri, la bacterii, donorul lasa,
de obicei, numai o parte din genomul sau acceptorului. In acest caz, fenomenul de
transfer partial genetic se numeste meromixis****, iar zigotul partial merozigot.
*lat. conjugatio – impreunare, unire
**grec. meion – mai mic; meioza (diviziune
reductionala) este totalitatea fenomenelor complexe
premergatoare formarii gametilor (celule sexuale
70
mature)
***grec. zygotos –imperechiat, unit
****grec. meros - parte
Conjugarea este calea cea mai frecventa de castigare a rezistentei la
antibiotice.
Bacteriile, dupa cum se stie, nu au cromozomi in sensul clasic al notiunii, ci
ele poseda o singura formatiune cromozomiala circulara alcatuita din ADN dublu
catenar cu o lungime de 1000-1400 micrometri care formeaza un singur grup de
linkage.
In general, bacteriile sunt complet haploide numai in anumite circumstante,
de exemplu atunci cand sunt sub forma de spori. In restul ciclului vital ele sunt
partial diploide datorita replicatiei ADN - ului care face ca unele gene sa se
regaseasca intr-o singura doza, altele in doua sau chiar patru doze, aceasta
deoarece, uneori, inainte de terminarea primei replicatii a ADN - ului, incepe al
doilea sau chiar al treilea ciclu de replicatie. Atunci cand replicatia ADN - ului nu
are loc, celulele bacteriene sunt haploide, partial diploide sau diploide in functie de
momentul cand sinteza ADN - ului a fost blocata.
70
SPOROGENEZA BACTERIILOR
Dupa cum se arata la morfologia bacteriilor, anumite specii de bacterii (de
exemplu familia Bacillaceae) au o forma de rezistenta cunoscuta sub denumirea
de spor. Forma sporului este sferica sau elipsoidala, dar pot exista mai rar si alte
forme (suveica, maciuca), având dimensiuni reprezentând 5-15% din celula
mamă.
Aceste bacterii se transformă în spori, forme primitive de diferenţiere celulară, cu
rezistenţă crescută la factorii de mediu şi care apar endocelular în condiţii nefavorabile de
viaţă. Aceștia au un inveliş rezistent, format din mai multe straturi datorită căruia rezistă
în mediul extern zeci de ani. Sporogeneza se întâlneşte numai la 2 genuri de bacterii
gram-pozitive de interes medical, Clostridium şi Bacillus.
Poziţia sporului bacterian constituie un caracter taxonomic. Poate fi centrală,
subterminală şi terminală.
Etapele sporogenezei
Structura sporului
Structură – densitatea este mai mare decât la celula vegetativă.
1) Inima sporului (sâmbure/core) – protoplast
sporoplasma corespunzătoare citoplasmei –alcătuită din granule
de 10nm (ribozomi)
nucleoplasma – material nuclear ADN
2) Membrana internă (intină) ~ membranei citoplasmatice
3) Cortex (strat gros) extern membranei interne format din peptidoglican
4) Înveliş extern (exină/tunici sporale) – structură polilamelară
5) Exosporina (înveliş suplimentar) la anumite specii– rol de anvelopă laxă
6) Apendicii sunt expansiuni exterioare ale sporului, sub formă de smoc, cu
lungimea 2-3 ori mai mare de decât lungimea sporului
7) Corpii parasporali sunt formaţiuni cristaloide – aflate pe suprafaţa
sporului
Particularităţile sporogenezei
1. Particularităţi biochimice:
Cantități reduse: apa liberă şi sărurile de P şi K
enzime metabolice lipsesc
concentraţi mari de Ca2+, Mg2+, Mn2+, cisteină
2. Particularităţi fiziologice
procese metabolice reduse
schimburi de substanţe nutritive (nu există)
3. Particularităţi biologice:
termorezistentă – căldură umedă (120oC) sau uscată (180oC)
Germinarea sporului
Fazele germinării
iniţierea germinării –transformarea sporului – creşterea volumului prin
absorbţia de apă însoţită de pierderea însuşirilor specifice
creşterea postgerminativă – redobândirea însuşirilor morfologice
70
VIRUSURILE
mai multe caractere combinate. De exemplu: togavirus, lat. toga = roba este un
virus care are o anvelopa ca o manta; adenovirus, gr. aden = glanda, descoperit
pentru prima data in vegetatiile adenoide; herpesvirus, numit dupa caracterul de
raspandire al eruptiei herpetice, gr. herpes = a se furisa, etc.
BACTERIOFAGII
VIROIZII SI PRIONII
de functiile gazdei.
Existenta viroizilor ridica mai multe probleme interesante si intrigante in
legatura cu boala pe care o reproduc. Localizarea viroizilor, in principal, in nucleul
celulei gazda, impreuna cu capacitatea lor de a servi ca matrita ARN-ului,
sugereaza ca simptomele de boala pot rezulta din interferenta viroidului cu
mecanismele genetice si functiile metabolice ale gazdei. O asemenea interferenta
poate determina producerea unor proteine "gresite".
In mod cert, viroizii sunt sisteme genetice independente, cu proprietati
determinate de secventa nucleotidica a acizilor ribonucleici respectivi.
Prionii reprezinta extrema cealalta fata de viroizi, luand in consideratie
parametrii care definesc virusurile. Ei au o forma extracelulara distincta, dar forma
extracelulara este reprezentata in intregime de proteina. Cu toate acestea,
particula de proteina este infectioasa si sunt cunoscuti diferiti prioni care produc o
varietate de boli la animale si la om. Termenul de prion a fost introdus de Prusiner
S.B., care in 1980 propune ipoteza prionului, pentru a distinge, de viroizi si
virusuri, particulele infectioase proteice ce determina un grup de boli
neurodegenerative. Bolile neurodegenerative determinate de prioni sunt in prezent
clasificate impreuna, deoarece etiologia si patogeneza lor implica modificarea unei
proteine celulare normale numite Prusiner PrP (proteina prionica). Aceste boli se
manifesta ca boli infectioase, ereditare si sporadice. Acestea includ: encefalopatii
transmisibile, encefalopatii spongiforme, etc. Boli reprezentative: scrapia oilor,
boala "vacii nebune", boala Creutzfeld - Jacob, insomnia familiala fatala, etc.
Pe lânga boala cu urmari grave, infectia prionică are ca rezultat producerea
mai multor copii ale proteinei prionice. Aceasta proteina trebuie sa fie codificata de
acid nucleic, altfel, existenta prionilor ar pune sub semnul intrebarii modelul central
al fluxului de informatie genetica.
Cunoasterea viroizilor si prionilor prezinta interes din mai multe motive:
• extind definitia data virusurilor, fata de care sunt caracterizati;
23
• demonstreaza existenta atat a unor modalitati neasteptate prin care elementele
genetice se pot replica, cat si a unor modalitati neasteptate prin care pot
supune celulele gazda;
• determina boli grave care la om au un caracter unic prin aceea ca sunt atat boli
genetice (ereditare) cat si infectioase.
Biologia prionilor, cu radacini in virologie, neurologie si neuropatologie, a
devenit mai recent corelata cu disciplinele de biologie celulara si moleculara, ca si
de chimie a proteinelor. Cunoasterea exacta a modalitatilor de multiplicare a
prionilor si de producere a bolii vor deschide cu siguranta noi perspective in
biochimie si genetica.
70
CIUPERCI MICROSCOPICE
Structura celulară
Punctul de plecare este sporul care dezvoltă → hife submerse + hife absorbante +
hife de extindere → în final, hife aeriene cu aspect pufos, lânos, catifelat.
Miceliul se dezvoltă sub formă de raze – aspectul fungilor fiind de colonii extinse
cu filamentele tinere spre exterior, iar cele bătrâne şi/sau moarte în centru.
Spre final, se dezvoltă organele de reproducere, iar sporii sunt pigmentaţi în
culoarea caracteristică.
Caracteristici generale
Tipuri de microorganisme:
psihrofile (criofile, frigofile) – au un conţinut ridicat în lipide, capsula de
natură poliglucidică (colonii mucilaginoase) mobile, pot prezenta pigmenţi,
biotopul este constituit din sol, ape reci şi aer. Ex. bacterii – (Pseudomonas,
Achrobacter, Aerobacter, Alcaligenes )+ fungi – (Candida, Rhodotorula,
Cladosporium, Penicillum, Geotrichum)
mezofile, sunt numeroase, în sol, apă, sunt macroorganisme homeotrofe,
conduc la putrefacţie şi sumt patogene.
termofile, au un metabolism foarte rapid, modificări structurale la proteine şi
enzime termostabile, în structura lor sunt prezente complexe termostabile
(poliamide) formate din acizi nucleici cu procent ridicat în citozină, timină,
Mg, Ca. Biotopul este constituit din izvoare termale, gunoi de grajd, sol
(bacteriile Streptomyces thermophille, B. sthearothermophyllus, Cl.
nigricans; fungi Candida tropicalis, Aspergillus fumigatus)
2. Umiditatea- cea din sol are cea mai mare importanţă, umiditatea redusă
determină dezvoltarea mare a actinomicetelor şi fungilor; inhibă dezvoltarea
microorganismelor (bacterii foarte sensibile – celulozolitice, nitrificatoare,
fixatoare de azot). Seceta mare determină dezvoltarea redusă a
microorganismelor, favorizând apariția formelor de rezistenţă (chişti/spori) ex.
actinomicetele – genuri eliminate; ex. Rhizobium, beijerinkia.
MICROFLORA AERULUI
MICROFLORA APEI
MICROFLORA SOLULUI
INTERRELAŢII DE NEUTRALISM
INTERRELAŢII SINERGICE
Sunt relaţii benefice uneia sau tuturor părţilor participante. Astfel două sau mai
multe specii de microorganisme pot coopera în procese unde o singură specie nu ar putea
atinge rezultatele scontate. Aceste interrelaţii se întâlnesc în diferite forme şi grade de
manifestare.
– Relaţii de comensualism
– Relaţii de mutualism
– Relaţii de simbioză
Relaţia de simbioză este o relaţie de ajutor reciproc. Este deci un raport mutual
favorabil între două unităţi de microorganisme diferite. Asocierea aceasta are scopul unor
beneficii reciproce. Simbioza propriu-zisă presupune permanenţa relaţiei dintre parteneri,
ei neputând exista independenţi.
De Bary este primul microbiolog care a formulat conceptul de simbioză prin care
definește viața împreună la licheni.
Simbioza este în fapt o coabitare de lungă durată între două sau mai multe specii
aflate în imediată apropiere, ceea ce conduce la obținerea de beneficii reciproce.
Clasificarea simbiozelor se poate face după următoarele criterii:
Tipul organismelor asociate: a) între două specii de microorganisme; b) între un
microorganism și un macroorganism.
Localizarea microorganismelor asociate: a) ectosimbioze, caz în care
microorganismul este situat exterior celulelor sau țesuturilor gazdei (bacteriile inclavate
în teaca gelatinoasă a cianobacteriilor sau la suprafața frunzelor sau organelor luminoase
la pești sau în cavitățile corpului); b) endosimbioze, apar și se dezvoltă atunci când un
microorganism în interiorul celulelor sau țesuturilor gazdei
Gradul de dependență: a) facultative atunci când sunt libere sau asociate în
natură ( așa de exemplu, relația dintre bacteria Rhizobium și plante leguminoase este
posibilă în funcție de cantitatea de N anorganic; b) ecologic obligate (așa de exemplu,
relațiile dintre bacteriile și protozoarele din rumen-obligate ereditar; algele endosimbiote-
nevertebrate marine)
Natura relației: a)mutualistă- se produce atunci când ambele organisme
participante se adaptează mai bine împreună; b) parazitară- se produce atunci când unul
din parteneri este mai bine adaptat într-o asociație
Condițiile de realizare a simbiozei
Grad de permanență în cea mai mare parte a vieții organismului
Specificitate desemnată ca fiind capacitatea de recunoaștere reciprocă a
simbionților, realizată pe baza complementarității particularităților partenerilor.
Semnificație ecologică-schimb de nutrienți și dispozitive comune de recunoaștere,
apărare și favorizarea prădării, așa de exemplu, transferul de materii organice
fotosintetizate la heterotrofe.
70
Un caz interesant de simbioză este cel din chefir, o băutură acidulată din lapte, care
este produsă prin simbioza între bacterii lactice şi drojdii. Acest produs conţine acid
lactic, alcool şi bioxid de carbon. Drojdiile se dezvoltă în mod obişnuit în mediu acid,
deci acidularea laptelui creează condiţii favorabile pentru rezvoltarea acestora. Drojdiile,
consumând acidul lactic produs de către bacteriile lactice, favorizează dezvoltarea
acestora, deoarece aciditatea ridicată le este vătămătoare. Pe lângă aceasta, drojdiile
produc vitamine, de care bacteriile lactice au nevoie.
Relaţii de simbioză între bacterii şi drojdii se întâlnesc şi în aluatul de pâine, sau în
bragă.
Simbioza se întâlneşte şi între bacterii şi protozoare, caz în care simbioza este
intracelulară.
– Interrelaţii antagonice
tulpina tip si serveste ca tulpina purtatoare de nume pentru specie. Tulpinile tip
ale speciilor sunt depozitate in asa numitele colectii de culturi (colectii de tulpini).
De aici ele pot fi obtinute si utilizate ca tulpini de referinta pentru compararea
directa cu izolatele noi in vederea identificarii lor corecte.
Genul bacterian este un grup taxonomic bine definit, alcatuit din specii, in
mod clar separate de alte genuri.
DESEMNAREA NUMELUI STIINTIFIC AL SPECIILOR
Pentru desemnarea numelui stiintific sau specific este utilizat sistemul
binominal (cu doua nume) al nomenclaturii. Numele stiintific este intotdeauna o
combinatie a numelui de gen, urmat de numele de specie (epitetul specific). Initiala
genului din numele stiintific este scrisa intotdeauna cu litera mare, iar a speciei cu
litera mica. Ambele nume sunt scrise cu caractere italice sau subliniate. Epitetul
specific se scrie cu initiala mica si nu se prescurteaza. Pentru denumirile stiintifice
se utilizeaza limba latina sau greaca. Numirea unui organism nou descoperit este
supervizata de un grup international de experti care verifica daca au fost urmate
procedeele standard si ca nu exista deja un nume dat anterior organismului sau un
alt organism cu acelasi nume. Denumirea unui numar de specii a fost data dupa
numele unui microbiolog care a descoperit microorganismul respectiv sau a adus
contributii importante in domeniu. Alte nume provin de la o particularitate a
microorganismului (forma, culoare), locul unde poate fi gasit sau boala pe care o
produce. Exemplificam cu cateva nume specifice:
• Pseudomonas tomato - Gr. pseudo = fals; monas = unitate; tomato = fruct.
Deci o bacterie care infecteaza tomatele.
• Lactobacillus sanfrancisco - L. lacto = lapte; bacillus = bastonas mic. O specie
utilizata in asociere cu o drojdie ( Saccharomyces exiguus) pentru fabricarea
unui tip de paine din San Francisco.
• Giardia lamblia - de la Alfred Giard, un microbiolog francez si Vilem Lambl, un
medic din Boemia, ambii cercetand micoorganismul, care determina o infectie
intestinala severa.
SISTEMUL NATURAL, FILOGENETIC, DE ORGANIZARE A LUMII
VII
Celebrul botanist Carl Linnaeus, in opera sa "Systema naturae" (1735) a
reunit toate microorganismele intr-un singur grup numit semnificativ "Chaos".
Robert Whittaker a propus un sistem de organizare format din cinci regnuri
de baza:
1. Procaryotae (Monera);
2. Protista;
3. Fungi;
4. Plantae;
5. Animalia.
Constituirea acestor regnuri se bazeaza pe: tipul si structura celulara,
organizarea si tipul de nutritie.
Regnul Procaryotae - include organisme unicelulare de tip procariot. El cuprinde
bacteriile si are doua subgrupe principale: eubacterii - bacterii cu structura
celulara procariota caracteristica si archaebacterii - bacterii cu structura celulara
si functii atipice.
70
Criterii de clasificare:
Regnul Procariota:
- Photobacteria;
- Scotobacteria:
CLASA BACTERIA:
Ordinul Pseudomonales:
Familia Pseudomonaceae;
Familia Nitrobacteriaceae;
Familia Thiobacteriaceae;
Familia Spirillaceae.
Ordinul Eubacteriales:
Familia Azotobacteriaceae
Familia Rhizobiaceae
Familia Holobacteriaceae
Familia Achromobacteriaceae
Familia Baccilaceae
70
Familia Enterobacteriaceae
Familia Microccocaceae
Familia Lactobacillaceae
Familia Propirenibacteriaceae
Ordinul Actinomycetales:
Familia Mycobacteriaceae
Familia Actinomycetaceae
Familia Streptomycetaceae
Familia Corynebacteryaceae
Ordinul Chamydobacteriales:
Familia Chamydobacteriaceae
Familia Beggiatoaceae
Ordinul Ricketsiales:
Familia Ricketsiacae
Ordinul Myxobacteriales:
Familia Myxobacteriaceae
Ordinul Chaulobacteriales:
Familia Chaulobacteriaceae
Ordinul Spirochetales:
Familia Spirochetaceae
70
fasole, soia, mazare, lucerna, trifoi, aceste plante fiind numite " plante prima etapă, cu
obtinere de acid azotos, se realizeaza de catre bacteriile
nitroase, NITROSOBACTERII (genul Nitrosomonas, genul Nitrospira, genul
Nitrosocystis);
- a doua etapa, cu obtinere de acid azotic, se realizeaza de catre bacteriile
nitrice, NITROBACTERII (genul Nitrobacter).
• denitrificarea - a treia faza in care sarurile azotate sunt reduse la azot
molecular, sub actiunea microorganismelor: Bacillus subtilis, Bacillus
mycoides, Bacterium denitrificans, Pseudomonas denitrificans, Thiobacillus
denitrificans.
• fixarea azotului molecular - ultima veriga, care duce la imbogatirea solului in
azot, fenomen foarte important, determinat de faptul ca plantele verzi nu pot
asimila singure azot atmosferic. Astfel, prin acest proces, se mentine echilibrul
in azot. Fixarea azotului molecular se face cu ajutorul bacteriilor fixatoare de
azot nesimbiotice si simbiotice.
ce
imbogatesc solul in azot".
Circuitul sulfului - proces cu obtinere de acid sulfuric, este important prin faptul
ca formarea H2SO4 usureaza trecerea sarurilor minerale in stare solubila, crescand
astfel cantitatea de compusi minerali accesibili plantelor. Procesul este produs de
sulfo-bacterii si tiobacterii.
Circuitul fosforului - se realizeaza in trei etape:
• mineralizarea fosforului organic prin trecerea in fosfati - are importanta
deoarece compusii organici cu fosfor nu pot fi utilizati de catre plante;
• "mobilizarea fosforului" - se face prin actiunea bacteriilor nitrificatoare, a
tiobacteriilor;
• reducerea fosfatilor de catre bacteriile anaerobe, cu formare de acid fosforos,
acid hipofosfor si hidrogen sulfurat.
Acest proces duce la pierderea unor fosfati, elemente nutritive pentru plante;
poate fi evitat printr-o aeratie buna a solului. In acest sens, se poate folosi un
preparat cu bacterii, care imbunatateste nutritia cu fosfor a plantelor. Preparatul se
numeste "Fosfobacterin" si transforma fosforul din compusii organici in forma
minerala.
Circuitul fierului - fierul intra in constitutia tesuturilor vegetale sub forma de
compusi organici. Dupa moartea plantelor, prin diverse procedee de fermentare
conduse de microorganisme, compusii organici sunt mineralizati si apoi oxidati de
catre bacterii in fier feric, Fe3+, care poate fi din nou folosit de catre plante. Astfel,
se realizeaza circuitul complet al fierului.
Dintre elementele chimice biogene carbonul este cel mai important deoarece intră
componenţa tuturor substanţelor organice. Circuitul carbonului se realizează printr-o
mare diversitate de mecanisme, care comportă patru etape principale:
70
Cantitatea cea mai mare de carbon din natură se află sub formă de CO2, care
provine din erupţii vulcanice, prelucrări industriale sau ca produs de catabolism al
organismelor vii. Rezervorul carbonului este atmosfera unde acest element se găseşte sub
formă de CO2 în proporţie de 0,032%.
Circuitul carbonului este întreţinut de două procese contradictorii: fotosinteza care
scoate carbonul din rezervor şi-l fixează şi respiraţia care restituie bioxidul de carbon
atmosferei. Fotosinteza este întotdeauna mai mai intensă decât respiraţia. Circuitul
carbonului nu se compensează exact. Carbonul nerestituit imediat prin respiraţie, intră în
formarea biomasei în cadrul ciclurilor trofice. În felul acesta, întoarcerea sa în atmosferă
este încetinită. Restituirea sa atmosferei se face prin descompunerea microbiologică –
mineralizarea materiei organice moarte de origine vegetală şi animală. Cantitativ, această
restituţie prin mineralizarea substanţei organice reprezintă 90% din cantitatea total de
bioxid de carbon restituit atmosferei. O parte din substanţele organice ies pentru un timp
din circuitul intern al carbonului şi se depozitează ca zăcăminte de combustibil organici şi
zăcăminte de carbonat de calciu. Mobilizarea din aceste zăcăminte se face de obicei fără
intervenţia microorganismelor, cel mai frecvent prin activitate antropogenă.
Toate substanţele organice, după moartea organismelor a căror corp le-a format,
cât şi dejecţiile eliminate în timpul vieţii, ajung în sol sau în bazinele acvatice unde sunt
supuse unor procese de biodegradare prin variate mecanisme biochimice în care sunt
incriminate microorganismele. Biodegradarea are ca ultim scop mineralizarea totală a
70
substanţelor organice şi eliberarea de CO2, indiferent de procesele prin care are loc şi de
produşii intermediari rezultaţi.
Marea diversitate de substanţe organice acumulate în sol şi ape presupune existenţa
a numeroase organisme de mineralizare. O importanţă deosebită prezintă biodegradarea
resturilor vegetale în hidraţi de carbon şi substanţe aromatice.
Glucidele simple (ozele) şi oligozaharidele vegetale sunt mineralizate cu mare
uşurinţă de toate microorganismele heterotrofe care le utilizează ca unică sursă de carbon
şi energie. Mai greu mineralizate sunt unele polizaharide şi substanţe organice complexe
macromoleculare.
– Celulozoliza
Celuloza, fiind componenta principală a ţesuturilor vegetale, va fi şi cel mai
important compus cu carbon din sol şi ape. Biodegradarea celulozei pâna la CO2 şi apă se
numeşte celulozoliză şi este realizată de o mare varietate de microorganisme
celulozolitice, aerobe şi anaerobe, aparţinând bacteriilor şi ciupercilor.
Agenţi de biodegradare. Cele mai importante genuri şi specii de bacterii sunt:
Vibrio, Cellvibrio, Cellfacicula, Cellulomonas, Cromobacterium, Bacillus
termocellulolyticus, Bacterium albidum, Streptomyces, Micronospora, Cytophaga,
Sporocytophaga, Clostridium termocellum, C. cellulosolvens. Ele sunt aerobe şi
anaerobe.
Dintre ciupercile micromicete (mucegaiuri) cele mai active genuri sunt:
Trichoderma, Aspergillus, Penicillium, Vetricillium,Sporotrichum, Monosporium,
Alternaria, Cladosporium.
Factorii de influenţă. În natură, descompunerea microbiologică a celulozei este
foarte mult influenţată de factorii de mediu, printre care potenţialul de oxido-reducere,
pH-ul şi conţinutul solului în azot asimilabil sunt cei mai importanţi.
În general, celulozoliza este mai activă în orizonturile superioare ale solului, acolo
unde potenţialul redox este mai ridicat.
Bacteriile celulozolitice au activitatea optimă la pH = 5,7 – 7, actinomicetele la pH
= 4,6 – 9,5, iar dintre mucegaiuri unele sunt mai active la pH acid, altele la pH neutru.
În ce priveşte necesarul de azot, folosesc azot organic, săruri de amoniu, azotaţi.
Biochimism. Toate microorganismele celulozolitice se caracterizează prin sinteza
şi eliminarea extracelulară a celulazei, un complex enzimatic format din mai multe
componente (celulaze, celobiază, beta-glucozidază). Toate aceste enzime hidrolizează în
trepte celuloza la glucoză. Celulaze extracelulare care pot ataca fibrele celulozice naturale
sunt produse numai de unele microorganisme. Celulazele produse de alte vieţuitoare pot
acţiona numai asupra celulozei parţial transformate pe cale chimică sau mecanică.
70
– Pectinoliza
Substanţele pectice sunt substanţe de legătură din scheletul celulozic din tulpinile,
frunzele şi fructele plantelor. Din punct de vedere chimic, sunt poliuronide cu greutate
moleculară mare, formate din polimeriai acidului galacturonic asociaţi cu pentoze şi
hexoze.
Agenţii de degradare. Descompunerea substanţelor pectice este realizată de bacterii
anaerobe şi aerobe: Bacillus, Pseudomonas, Flavobacterium, Streptomyces, Nocardia şi
mucegaiurile: Fusarium, Penicillum, Aspergillus, Botrytis, Alternaria.
Biochimism. Toate aceste microorganisme conţin complexul enzimatic pectinază
format din: pectinmetilesterază, poligalacturonază, polimetilgalactunorază,
pectintranseliminază.
– Chitinoliza
Chitina este uncompus organic complex care se găseşte în peretele celular al
mucegaiurilor şi în carcasele insectelor. Din punct de vedere chimic, chitina este un
polimer de betagluozamidă, cu un conţinut de azot de 6,9%.
Agenţi de degradare. Chitina poate fi degradată de bacteria din genul Pseudomonas
chitinivarus, Bacillus, Flavobacterium, Pseudomonas, Arthrobacter şi majoritatea
speciilor de actinomicete. Dintre mucegaiuri active sunt: Trichoderma, Penicillum,
Fusarium, Mucor.
Biochimism. Descompunerea chitinei se face sub acţiunea chitinazei. Glucoza şi
acidul acetic rezultat sunt apoi oxidate până la CO2 şi apă.
70
– Amiloliza
Amidonul se întâlneşte ca substanţă de rezervă în diferite părţi ale plantelor. În sol
se acumulează împreună cu aceste resturi vegetale.
Agenţii de degradare. Degradarea amidonului este realizată de microorganismele
producătoare de alfa- şi beta-amilaze. Ele sunt reprezentate de mucegaiuri: Aspergillus
niger, A. oryzae, A. usami, Rhyzopus oryzae, Amylomyces rouxi. Mucegaiurile mai
produc amilogalaucozidază (glucoamilază). Amilaze sunt produse şi de bacteria:
Bacillus subtilis.
Microflora amilolitică nu este specifică deoarece microorganismele care produc
amilaze sunt extrem de variate şi numeroase: bacterii Gram negative şi positive, sporulate
şi nesporulate, aerobe şi anaerobe, actinomicete şi mucegaiuri.
Amilazele sunt enzime hidrolizante. După formarea compuşilor simpli (maltoză,
glucoză) aceştia reprezintă substraturi nutritive pentru alte specii de microorganisme
dependente de aceste mucegaiuri amilolitice.
Procesul natural de degradare al amidonului este nedorit, întrucât conduce la
alterarea cerealelor şi a cartofilor.
– Mineralizarea substanţelor aromatice
Substanţele aromatice acumulate în sol provin fie din organismele vegetale, fie
sunt sintetizate de unele microorganisme (mucegaiuri). Ele conţin un singur nucleu
benzenic (fenoli, acizi fenolici, acid benzoic, cumarine), doi nuclei de benzen (flavone,
antociani) sau mai mulţi compuşi fenolici condensaţi (lignină, taninuri, substanţe
humice).
Substanţa aromatică cea mai importantă din punct de vedere cantitativ este lignina.
Mineralizarea ligninei este deci deosebit de imporatntă în circuitul carbonului. Ea se
găseşte, după celuloză, în cantitatea cea mai mare, în vegetale, mai ales în cele lemnoase.
Lignina este una din substanţele cele mai rezistente la biodegradare.
Taninurile, substanţe larg răspândite în regnul vegetal, sunt mineralizate în sol.
Agenţi de degradare. Compuşii fenolici sunt mineralizaţi de bacterii.
Pseudomonas, Arthrobacter, Bacillus şi de mucegaiuri.
Lignina este mineralizată de mucegaiuri: Aspergillus, Trichoderma,
Trichothecium, Alternaria, Fusarium şi de bacterii: Pseudomonas, Flavobacterium,
Agrobacterium.
Taninurile sunt mineralizate de mucegaiuri: Penicillium, Aspergillus, Fusarium,
Cylindrocarpon, Gliocladium.
– Biodegradarea hidrocarburilor
Unele microorganisme sunt capabile să degradeze hidrocarburile alifatice alifatice
şi aromatice din sol şi ape.
Mai rezistente la biodegradare sunt hidrocarburile ramificate (detergenţii).
Hidrocarburile aromatice (benzen, toluen, xilen) sunt degradate de un număr mic de
microorganisme deoarece numai puţine sunt capabile să deschidă molecula ciclică.
Agenţi de degradare. Se cunosc mai multe specii de bacterii care folosesc ca unică
sursă de carbon şi energie metanul: Methanomonas metanica sau propanul,
Pseudomonas propanica. Alte hidrocarburi cu moleculă mică pot fi descompuse de
70
– Biodegradarea lipidelor
Lipidele simple şi complexe se găsesc în materia organică vegetală şi animală. Ele
pot fi transformate în compuşi mai simpli, sau oxidate la CO2 şi H2O.
Agenţii de dagradare sunt mucegaiurile lipolitice: Aspergillus, Penicillum,
Cladosporum, Rhyzophus, Geotrichum şi bacteriile: Bacillus, Pseudomonas,
Achronobacter care produc lipaze.
Biochimism. Sub acţiunea lipazelor, lipidele sunt transformate în acizi graşi şi
glicerol. Glicerolul, după fosforilare, este metabolizat prin ciclul EMP (glicoliză), iar
acizii graşi suferă o β-oxidare, în ciclul lui Lynen, până la CO2 şi H2O. Prin oxidarea
completă a acizilor graşi se obţine o cantitate mare de energie.
Rezervele de carbon
Unele fracţiuni din resturile vegetale (taninuri, lignină) şi unii compuşi rezultaţi
din metabolismul microorganismelor, în anumite condiţii, pot să sufere transformări care
dau naştere la substanţe mai mult sau mai puţin polimerizate, rezistente la acţiunea
microbiană. Aceste substanţe nou formate, în general de culoare închisă, stabilizate şi
rezistente formează humusul, care reprezintă rezerva de carbon organic a solului.
Humusul nu este însă inert deoarece, în contact cu aerul poate fi oxidat spontan sau este
lent dar progresiv mineralizat de microorganisme.
În afară de aceste rezerve, carbonul organic s-a depozitat sub formă de cărbuni şi
petrol. Cărbunii s-au format probabil din lignină, iar petrolul din acizii graşi, prin procese
fizico-chimice şi microbiologice, în perioade îndelungate de timp, în anaerobioză, de
presiune ridicată şi la temperaturi mici.
O altă rezervă de carbon sunt carbonaţii insolubili din rocile solului.
Numai o parte din carbonul fosil este redat atmosferei, în special în urma arderilor
industriale ale hidrocarburilor şi cărbunilor.
70
ROLUL MICROORGANISMELOR
ÎN CIRCUITUL NATURAL AL
AZOTULUI
– Amonificarea
Iniţial, substanţele proteice, ureea, bazele azotate, după moartea organismelor, sunt
descompuse de către bacteriile amonificatoare la amoniac prin procesul de amonificare.
Amoniacul rezultat în urma activităţii bacteriilor amonificatoare recţionează cu apa,
formând ionul amoniu.
Acest proces are loc în orizonturile superficiale ale solului, unde azotul se găseşte
în cea mai mare parte sub formă organică de proteine, acizi nucleici, glucide aminate,
îngrăşăminte artificiale (uree, cianamidă de calciu).
Proteinele pot fi degradate sub acţiunea enzimelor proteolitice, care sunt enzime
extracelulare, produse de bacterii şi mucegaiuri, microorganisme care produc în natură
putrefacţia şi putrezirea materiei organice moarte.
Aceste enzime proteolitice sunt proteaze, ele determinând hidroliza proteinelor.
Prin hidroliza proteinelor de către proteazele extracelulare rezultă peptide şi aminoacizi.
Existenţa lor este efemeră, întrucât suferă o serie de transformări imediate:
dezaminare microbiologică cu eliberare de amoniac,
sunt asimilaţi de către microorganisme,
sunt absorbiţi de către plante,
sunt absorbiţi pe argile sau încorporaţi în fracţiunea humică a solului.
Când degradarea proteunelor are loc în anaerobioză (putrefacţia) rezultă amine cu
miros specific (putresceină, cadaverină), care apoi se oxidează în anaerobioză eliminând
amoniacul.
Agenţii de degradare. Amonificarea proteinelor (proteoliza) este realizată de
bacterii şi mucegaiuri.
Agenţii tipici ai putrefacţiei, care produc endo şi exoproteaze extracelulare, sunt
bacterii răspândite în sol şi ape. Ele se caracterizează printr-o activitate fiziologică foarte
diversă.
Bacteriile de putrefacţie pot fi sporulate sau nesporulate, Gram pozitive sau
negative. Pentru a fi active, necesită un pH de 7, dezvoltarea lor fiind inhibată la pH sub
70
4,5. Ele pot produce şi degradarea amidonului. Sunt bacterii rezistente la plasmoliză şi se
pot dezvolta în medii cu o concentraţie de 7% clorură de sodiu.
Bacterii de putrefacţie aerobe Pseudomonas fluorescens este o bacterie Gram
negativă, nesporulată, care poate produce lichefierea gelatinei. Se dezvoltă la temperaturi
mai mici. Genul Bacillus cu aproximativ 25 de specii are activitate proteolitică intensă.
B. Subtilis, B. mycoides, B. megatherium, B. mesentericus, B. licheniformis, B.
coagulans, B. putrificus, B. cereus sunt bacterii Gram negative, sporulate, foarte
răspândite în natură. Genul Proteus, cuprinde bacterii Gram negative, sporulate şi mobile
(P. vulgaris, P. mirabilis). prin degradarea proteinelor produce şi degradarea
aminoacizilor cu formare de H2S.
Bacterii facultativ anaerobe: Escherichia coli, Streptococcus faecalis, Enterobacter.
Bacterii anaerobe: Staphylococcus albus, Micrococcus flavus, Bacillus putrificus,
Clostridium sporogenes, Clostridium putrificum, Clostridium perfrigens, Bacillus
pestorium.
Dintre mucegaiuri, amonificatoare active sunt: Trichoderma, Köningii, Oidium
lactis, Aspergillus niger, A. terricola, A. fumigatus, Penicillum intricatum, Mucor
hiemalis, Rhizophus nigricans, Botrytis.
Biochimism. degradarea proteinelor sub acţiunea echipamentului enzimatic are loc
în trepte.
Amonificarea ureei
– Nitrificarea
– Denitrificarea