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Análisis Filogenético.

• Se usaron métodos de alineación de
secuencias de ADN como SATe, MAFFT
y un herramienta externa de
secuenciación llamada RaxML.
• Simultáneamente la alineación y el
árbol filogenético son un procedimiento
automatizado gracias al ADN y arboles
filogenéticos de base además de la
probabilidad de los mismos.

• Tomando en cueenta la maxima probabilidad y la inferencia Bayesian analizaron cada secuencia primeramente en el gen/locus de modo separado concentrandolos en un conjunto de datos para su posterior analisis ayudado de una particion por gen y por codon. .• Seaview y MESQUITE estos dos programas mejoraron la alineacion.

• El analisis computacional se llevo a cabo por GARLI-PART ayudado de ML y BP asi mismo paso a paso los datos se analizaron. . • Se realizo dos analiss paralelos de 25 millones de generaciones y tomando muestras generacion mil eliminando asi 20% de los datos analizados debido a al parentezco entre Hypomyces aurantius. Sphaerostilbella aureonitrens con Trichoderma.

• Trichoderma evoluciono gracias a su estado endofitico muy por encima de los homgos saprofitos. . • Es asi que el objetivo de este estudio es la reconmtruccion filogenetico de Trichoderma e inferir en la evolucion de esta.Compatibilidad de Datos. • El ambiente asi como el ecosistema influyen en la adaptacion en este caso de Trichoderma habita en todas partes es decir es cosmopolita.

DNA ribosomal de transcribcion 4. Alfa-actina 2. Calmodulin 3. • Los datos de las matrices fueron 143 taxones de Trichoderma donde se tomaron en cuenta 5 disasociados locis: 1. RNA polimerasa 5. Y el factor 1-alfa Entre otras describciones .Muestreo de Taxon.

Origen de las cepas de hongos • La ventaja de Trichoderma es que crece y se adapta para subsistir en cualquier terreno dentro o fuera para obtener alimentos y recursos. . • Se guardan en glycerol al 20% a temperatura de -80 grados celsius.