ATELIER4 : Métabolisme

Niveau : L2 et 3
BIOCHIMIE
UE LV 205 ; LV 303 ; LV 311

Atelier Biochimie : Métabolisme

Cet atelier correspond à l'enseignement dispensé en L2 dans l'UE LV 205 (Biochimie) et sert
de remise à niveau pour les étudiants de L3 (UE LV 303 et LV 311). Il vous propose de revoir
certaines grandes voies du métabolisme du carbone.
Différents liens vous permettront d'accéder à des parties de cours, à des documents de travail ou à
des exercices.

La glycolyse

La voie de la glycolyse correspond à une série de réactions catalysées par des enzymes qui
dégradent une molécule de glucose en deux molécules de pyruvate.

Cours, documents de travail

http://calamar.univ-ag.fr/deugsv/Documents/Cours/Bioch-Zinsou/glycoly2.pdf
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/glyco1.html
Les différents types de réaction impliqués dans la glycolyse :
- Simple transfert ; http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/glyco4.html
- Oxydo-réduction ; http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/reac4.html
- Isomérisation ; http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/reac6.html
- Rupture/Synthèse de squelette carboné ; http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/reac3.html
- Addition/Elimination ; http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/reac5..html

Exercices
http://webpublic.ac-dijon.fr/pedago/stl_bjb/bioch/bglycolyse.htm
http://ead.univ-
angers.fr/~jaspard/Page2/TexteTD/1SV2H2/3GlycolysePFK/1EnonceFigures/1GlycolysePFK.htm
(exercices 1 et 2)
http://ead.univ-
angers.fr/~jaspard/Page2/TexteTD/1SV2H2/3GlycolysePFK/2CORRECTION/1Exercice1/1CorrecE
xo1.htm (corrigé exercice 1)
http://ead.univ-
angers.fr/~jaspard/Page2/TexteTD/1SV2H2/3GlycolysePFK/2CORRECTION/2ExoAldolase/1Corre
cExo2.htm (corrigé exercice 2)

Le destin du pyruvate
Le pyruvate, produit final de la glycolyse, suit des voies cataboliques différentes selon la
nature de l'organisme et les conditions métaboliques.
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/pyr.html
http://www.chups.jussieu.fr/polys/biochimie/OCbioch/POLY.Chp.5.html

Le cycle de Krebs
Cette étape finale du catabolisme oxydatif des carbohydrates, des acides gras et des acides
aminés assure la plus grande part des besoins énergétiques de la cellule grâce à la formation de
coenzymes réduits qui seront réoxydés dans la chaîne respiratoire.

http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/ck1.htm
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/ck2.html
Les différents types de réaction impliqués dans le cycle de Krebs:
Oxydo-réduction : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/orck.html
Rupture/Synthèse de squelette carboné ; http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/rusyck.html
Addition/Elimination ; http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/adelick.html

La chaîne respiratoire
Une grande partie de l'énergie produite dans les voies cataboliques se retrouve contenue dans
le NADH et le FADH2 ; elle sera convertie en ATP dans la mitochondrie par la chaîne respiratoire.

Cours, documents de travail

http://www.ulysse.u-bordeaux.fr/kramer1i/biocell_diffusion/gbb.cel.fa.105.b3/content/access.htm
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/ch.%20resp.html
http://calamar.univ-ag.fr/deugsv/Documents/Cours/Bioch-Zinsou/Phoscell.pdf
http://www.unine.ch/bota/bioch/cours/ATPsynthase.html (pour les étudiants des UE LV 303 et LV
311)

Cours et exercices
http://webpublic.ac-dijon.fr/pedago/stl_bjb/bioch/bmrespir.htm

La voie des pentoses phosphates

La voie des pentoses phosphates (ou voie du phosphogluconate) génère du NADPH,
indispensable aux réactions réductrices de biosynthèse.
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/pentosep.html
http://calamar.univ-ag.fr/deugsv/Documents/Cours/Bioch-Zinsou/Pentphos.pdf

La néoglucogenèse
La néoglucogenèse est la formation de glucose à partir de précurseurs non glucidiques tels
que le pyruvate, le lactate, le glycérol et la plupart des acides aminés.
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/neoglu.html
Pour en savoir plus sur le métabolisme
http://www.genome.jp/kegg/pathway/map/map01100.html

Fiche atelier des intervenants de cours: Jean-Renaud Garel, Codjo Hountoundji, Jean-
Christophe Larcher, Pierre Sarthou, Daniel Vergé, préparée par Caroline Benlot et Nicole
Blanchoin.

Avec la participation du service BioMedia