Replikasi DNA Sekarang kita telah melihat bagaimana informasi generik yang dikodekan dalam urutan nukleotida DNA

diterjemahkan ke dalam struktur protein yang melakukan sebagian besar fungsi sel, kita dapat menghargai pentingnya penyalinan tepat urutan DNA selama replikasi DNA. Pasangan teratur basa dalam struktur DNA heliks ganda disarankan untuk Watson dan Crick yang untai DNA baru disintesis dengan menggunakan (orang tua) helai yang ada sebagai template dalam pembentukan baru, putri untai komplementer dengan untaian orangtua. Model template dasar pasangan teoritis bisa dilanjutkan baik oleh konservatif atau mekanisme semikonservatif. Dalam suatu mekanisme konservatif, kedua untai putri akan membentuk ganda baru beruntai (dupleks) molekul DNA dan duplex orangtua akan tetap utuh. Dalam suatu mekanisme semikonservatif, alur orangtua secara permanen terpisah dan masing-masing membentuk molekul dupleks dengan dasar untai putri dipasangkan untuk itu. Bukti-bukti pasti bahwa DNA dupleks direplikasi oleh mekanisme semikonservatif berasal dari percobaan sekarang klasik yang dilakukan oleh M. Meselson dan WF Stahl. Menyalin dari template untai DNA menjadi sebuah untai komplementer dengan demikian merupakan fitur umum dari replikasi DNA dan transkripsi DNA menjadi RNA. Dalam kedua kasus, informasi di dalam template adalah diawetkan. Pada beberapa virus, molekul tunggal RNA berfungsi sebagai template untuk sintesis RNA atau untai komplementer DNA. Namun, mayoritas luas RNA dan DNA dalam sel disintesis mondar-mandir, yang sudah ada sebelumnya DNA dupleks. DNA polimerase membutuhkan primer untuk memulai replikasi

dua untai terjalin harus dibatalkan. DNA dupleks dibatalkan. Seperti telah dibahas sebelumnya. DNA disintesis dari prekursor trifosfat deoxynucleoside 5 '(dNTP). untai putri yang terbentuk adalah RNA di ujung 5 'dan DNA pada ujung 3'. mereka memerlukan pendek. mulai dari segmen unik dalam molekul DNA yang disebut asal replikasi. melainkan.Sejalan dengan RNA. Dengan basis primer dipasangkan ke untai template. Setelah helicases telah melakukan pembatalan DNA orang tua di asal. untuk memulai pertumbuhan rantai.Juga seperti sintesis RNA. sebuah DNA polimerase menambahkan deoxynucleotides ke grup kebakaran hidroksil pada ujung 3 'dari primer seperti yang diarahkan oleh urutan untai template. sintesis DNA selalu hasil pada 5 '-> 3' arah karena hasil rantai pertumbuhan dari pembentukan ikatan phosphoester antara 3' oksigen dari untai tumbuh dan fosfat alfa dari sebuah dNTP. sudah ada RNA atau untai DNA. dan untaian anak dibentuk di cabang replikasi DNA Dalam rangka untuk DNA dupleks berfungsi sebagai template selama replikasi. Urutan nukleotida dari asal-usul dari organisme yang berbeda sangat bervariasi. Ini pembalikan dari untai DNA orangtua adalah dengan helicases spesifik. Sebaliknya. sebuah polimerase RNA dapat menemukan memulai situs transkripsi yang sesuai pada DNA dupleks dan memulai sintesis dari RNA komplementer ke untai DNA template. DNA polimerase tidak dapat memulai sintesis de novo rantai. meskipun mereka biasanya berisi urutan AT kaya. calle primer. sebuah polimerase RNA khusus yang disebut bentuk primase primer RNA pendek . atau meleleh. untuk membuat dasar yang tersedia untuk basis pasangan dengan basis dari dNTP yang polimerase ke untai yang baru disintesis putri. Ketika RNA primer. atau asal yang sebenarnya.

adalah kemudian memanjang oleh polimerase DNA. menyalin untai cetakan yang sebagian harus bagaimana terjadi dalam arah yang berlawanan dari pergerakan garpu replikasi. garpu tumbuh dan protein yang terkait menjauh dari titik asal. masih bergantung dipasangkan untuk untai DNA komplementer. disebut untai terkemuka. dapat dilanjutkan terus menerus dari sebuah primer RNA tunggal dalam 5 '-> 3' arah.melengkapi untaian template dibatalkan. Seperti disebutkan sebelumnya. Masing-masing primer. Daerah DNA di mana semua protein datang bersama-sama untuk melaksanakan sintesis untai putri disebut garpu replikasi. yang memanjang di 5 '-> 3' arah. dasar dipasangkan untuk untai template mereka. membentuk segmen yang disebut fragmen Okazaki terputus setelah mereka . Sebagai hasil replikasi. Sebuah sel menyelesaikan prestasi ini dengan mensintesiskan primer baru setiap beberapa ratus basa atau lebih pada untai orangtua kedua. Primer tersebut. yang disebut untai tertinggal. Sebuah komplikasi utama dalam pengoperasian garpu replikasi DNA timbul dari dua sifat: dua untai dari DNA duplex parental antiparalel. unwinding (tidak melepaskan) lokal DNA dupleks menghasilkan tegangan torsional. arah yang sama dengan pergerakan garpu replikasi. Sintesis satu untai putri. yang lega oleh topoisomerase 1. Agar DNA polimerase bergerak sepanjang dan salinan DNA dupleks. dan DNA polimerase (seperti polimerase RNA) dapat menambahkan nucleotudes ke untai baru tumbuh hanya dalam 5 '-> 3 'arah. Karena pertumbuhan untai tertinggal harus terjadi dalam 5 '-> 3' arah. sebagai lebih dari untai terkena oleh unwinding. helikase berurutan harus bersantai dupleks dan topoisomerase harus menghapus supercolls yang membentuk. sehingga membentuk untai putri baru. atau tumbuh garpu. Masalah muncul dalam sintesis untai putri lain.

Primer RNA dari setiap fragmen Okazaki akan dihapus dan diganti dengan pertumbuhan rantai DNA dari fragmen Okazaki tetangga. akhirnya sebuah enzim yang disebut DNA ligase bergabung dengan fragmen yang berdekatan. Primer tersebut diperpanjang menjadi DNA untai putri oleh Teta DNA polimerase (Teta pol). genom melingkar sebuah virus kecil yang menginfeksi monyet. Dalam mesin molekul yang mereplikasi DNA SV40. dan protein lain berpartisipasi dalam replikasi DNA Pemahaman rinci protein eukariotik yang berpartisipasi dalam replikasi DNA telah datang sebagian besar dari studi dengan DNA virus samll. dan DNA polimerase alfa (alfa pol).Primer untuk memimpin dan lagging putri untai DNA disintesis oleh kompleks Primase. yang mensintesis primer RNA pendek.penemunya Reiji Okazaki. yang memperpanjang primer RNA dengan deoxynucleotides. DNA polimerase. Gambar 4-34 menggambarkan beberapa protein yang mengkoordinasikan penyalinan DNA SV40 pada garpu replikasi. membentuk primer RNA DNA campuran. helikase. Semua protein lain yang terlibat dalam replikasi DNA SV40 disediakan oleh sel inang. Protein berkumpul di sebuah garpu replikasi lebih lanjut menggambarkan konsep dari molekul mesin molekuler diperkenalkan dalam bab 3. sebuah heksamer protein virus yang disebut besar T-antigen unwinds untaian orangtua pada garpu replikasi. terutama SV40 DNA. Multikomponen kompleks ini memungkinkan sel untuk melaksanakan memerintahkan urutan peristiwa yang mencapai fungsi sel penting. Primase. yang kurang cenderung untuk membuat kesalahan saat .

Replikasi DNA umumnya terjadi bidireksional dari asal masing-masing Sebagaimana ditunjukkan dalam gambar 4-33 dan 4-34. DNA replikasi dari asal tunggal bisa melibatkan satu garpu replikasi yang bergerak dalam satu arah. asosiasi topoisomerase A dengan DNA orang tua menjelang helikase untuk menghilangkan stres torsi diperkenalkan oleh unwinding dari untaian orangtua. itu pasti oleh banyak salinan dari RPA (replikasi protein A). sehingga mencegah kompleks Teta PCNA-RFC-Pol dari memisahkan dari template. Seperti digambarkan dalam gambar 4-34b. Secara teori.menyalin dari untai template daripada alfa pol. sebuah protein heterotrimeric. Atau. yang menggantikan alfa Primase-pol sintesis primer kompleks berikut. Bound RPA protein copot dari untai parental oleh alfa Pol dan Pol Teta saat mereka mensintesis dasar untai komplementer dipasangkan dengan untaian orangtua. Teta Pol membentuk kompleks dengan RFC (replikasi faktor C) dan PCNA (berkembang biak sel antigen nuklir). PCNA merupakan protein hormotrimeric yang memiliki lubang centarl melalui mana DNA dupleks putri berlalu. Setelah DNA orang tua adalah sepaarted menjadi beruntai tunggal template pada garpu replikasi. Beberapa protein eukariotik yang berfungsi dalam replikasi DNA tidak digambarkan dalam gambar 4-34. Berturutturut Okazaki fragmen yang digabungkan dengan ligase DNA melalui 5 standar '-> 3' obligasi phosphoester. Mengikat RPA mempertahankan template dalam konformasi optimal seragam untuk menyalin oleh DNA polimerase. kedua untai DNA orang tua yang terkena oleh lokal unwinding pada garpu replikasi akan disalin ke dalam untai putri. . Ribonuklease H dan FEN 1 menghapus ribonucleotides di ujung 5 'fragmen Okazaki. ini digantikan oleh deoxynucleotides ditambahkan oleh DNA polimerase Teta karena memperpanjang fragmen Okazaki hulu. dua garpu replikasi akan berkumpul di asal tunggal dan kemudian bergerak dalam arah berlawanan.

sama. garpu replikasi kiri meluas sintesis DNA dalam arah ke kiri. Ini kemudian pindah dari asal SV40 dalam arah yang berlawanan dengan terkemuka dan sintesis lagging strand terjadi di garpu keduanya.mengarah ke pertumbuhan dua arah dari kedua untai putri. molekul DNA eukariotik kromosom mengandung asal beberapa replikasi dipisahkan oleh puluhan hingga ratusan kilobases. mengikat asal masing-masing dan yang terkait dengan protein lain yang diperlukan untuk memuat selular protein MCM h helicases hexameric terdiri dari enam homolog. Dalam kasus SV40 DNA. untuk kompleks asal rekognition. memberikan bukti awal untuk mendukung pertumbuhan untai dua arah. sehingga angka-angka yang tepat dari sel-sel yang merupakan jaringan masing-masing dihasilkan selama pembangunan dan sepanjang kehidupan organisme. Beberapa jenis percobaan. Tidak seperti SV40 DNA. garpu replikasi sintesis DNA yang tepat meluas ke arah kanan. Replikasi DNA selular dan acara lainnya menyebabkan proliferasi sel yang diatur secara ketat. replikasi diawali dengan mengikat dua antigen T besar helicases hexameric ke asal SV40 tunggal dan perakitan protein lain untuk membentuk dua garpu replikasi. Dua menentang MCM helicases memisahkan untai parental di sebuah asal dengan protein RPA mengikat DNA beruntai tunggal yang dihasilkan. Konsensus umum adalah bahwa semua sel prokariotik dan eukariotik menggunakan mekanisme dua arah replikasi DNA. pengendalian langkah intitiation adalah mekanisme utama untuk mengatur replikasi DNA . termasuk yang ditampilkan dalam gambar 4-35. Sebuah protein subunit enam disebut ORC.Seperti dalam transkripsi gen yang paling. Seperti yang ditunjukkan pada gambar 4-36. Sintesis primer dan langkah-langkah subseqquent dalam replikasi DNA selular dianggap analog dengan orang-orang dalam replikasi DNA SV40.

Aktivasi kegiatan helikase MCM. termasuk proses kompleks mitosis di mana sebuah sel eukariotik terbagi menjadi dua sel anak. makan tambahan aspek proliferasi sel.selular. kinase cyclin lain tergantung regul. diatur dengan protein kinase spesifik disebut S kinase cyclin fase dependen. Kami membahas mekanisme berbagai regulasi yang menentukan tingkat pembelahan sel dalam bab 21. yang diperlukan untuk memulai replikasi DNA selular. .

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful