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Los bloques a partir de los cuales se construyen las

biomoléculas
La era genómica

1995
Bacteria,
4 Mb, ~4 mil genes
[Science 269: 1995]

1997
Primer genoma Eukariota,
13 Mb, ~6 mil genes
[Nature 387: 1997]

1998
Primer genoma Animal,
~100 Mb, ~20 mil genes
[Science 282: 1998]

2001 Humano, 2002 Plasmodium 2002 Anopheles gambiae,


~3 Gb, 25-30 mil ~23 Mb, ~5 mil ~270 Mb, ~15 mil genes
genes genes [Science 296, 2002]
[Science 291, 2001] [Nature 419, 2002]
La secuencia como tal carece de significado, es crucial saber cómo está
organizada y cómo funciona
ÁCIDOS NUCLEICOS
EXISTEN DOS TIPOS DE ÁCIDOS NUCLEICOS: ADN Y ARN

ADN:
ADN:bicatenario,
bicatenario,ATCG,
ATCG, ARN:
ARN:monocatenario,
monocatenario,AUCG,
AUCG,
desoxiribosa,
desoxiribosa,núcleo
núcleo ribosa,
ribosa,núcleo
núcleoyycitoplasma,
citoplasma,
tres
tres tipos (ARNm,ARNt,
tipos (ARNm, ARNt,ARNr)
ARNr)
EXPERIMENTOS
EXPERIMENTOSDE
DEAVERY
AVERY
DIFERENTES FORMAS
DE REPRESENTAR LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS
Los
Losácidos
ácidosnucleicos
nucleicosson
sonanisotrópicos,
anisotrópicos,
es
esdecir,
decir,tienen
tienendependencia
dependenciadireccional.
direccional.
En
Enellos
ellosse
sepuede
puededistinguir
distinguirun
unextremo
extremo
3’3’yyun extremo 5’, la información
un extremo 5’, la información
siempre
siemprese selee
leeen
endirección
dirección5’5’->->3’.
3’.
El código genético

Codón: unidad básica del código genético. Representa el conjunto de


bases que codifica para un solo aminoácido.
Se dice que el código genético es degenerado porque existe más de
un codón que codifica para algunos aminoácidos
El código genético
Existen 3 codones de paro (stop).
61 codones con sentido.
Solo triptofano y metionina están
codificados por un solo codón.
Serina, arginina y leucina están
codificados por seis codones c/u.

Codones de terminación: no
codifican para ningún aminoácido,
señalan el fin de la traducción.
Ningún tRNA tiene un anticodón
para ellos.
UAA
UAG
UGA
ESTRUCTURA
ESTRUCTURABÁSICA
BÁSICADE
DEUN
UNGEN
GEN

Elementos de respuesta

5’UTR 3’UTR
5’ 3’
Región codificante (ORF)
Región reguladora
Región transcrita
(Promotor)
Sitio de inicio de la traducción
Sitio de inicio de la transcripción
Definición y estructura del “Gen”
• Definiciones:

– Un gen es la unidad básica de herencia de los seres vivos.

– Un gen es una secuencia de nucleótidos derivada de la molécula de ADN,


que contiene la información necesaria para la síntesis de una
macromolécula con función celular específica (proteína o RNA)

– Un gen es una región localizable de secuencia genómica, correspondiente a


una unidad de herencia, la cual está asociada con regiones reguladoras,
regiones transcritas y/o otras regiones de secuencia funcionales.

– Un gen es la secuencia completa de nucleótidos que es necesaria para la


síntesis de un producto génico funcional (RNA o proteína)
El gen es considerado como la unidad de almacenamiento de información y
unidad de herencia al transmitir esa información a la descendencia.

Los genes se disponen a lo largo de cada uno de los cromosomas.

Cada gen ocupa en el cromosoma una posición determinada llamada locus.

El conjunto de cromosomas de una especie se denomina genoma.

Existen genes en ambas cadenas de ADN genómico.


Definición y estructura del “Gen”
• Estructura:
– MUY VARIABLE

– En general los genes eucariotas se organizan en exones e intrones

– Los genes procariotas carecen de intrones y exones, pero pueden ser


policistrónicos

Gen de albúmina humana (15 exones)

Gen de defensina humana (2 exones)

Gen de D-SCAM de Drosophila (22 exones)


Definición y estructura del “Gen”
• Los exones pueden o no contener información codificante

• Los exones pueden comportarse como intrones y viceversa

Transcritos de la albúmina humana


Definición y estructura del “Gen”
• Puede haber genes localizados en lo que es un intrón de otro gen

• Puede haber genes traslapados

• Se pueden generar transcritos con segmentos fusionados de dos genes diferentes


Definición y estructura del “Gen”
• La densidad de genes varía entre organismos
Marco abierto de lectura
(ORF, Open Reading Frame)
Después del codón de inicio, los otros codones se leen en grupos sucesivos de
tres nucleótidos.
Ninguna base es “saltada” durante la traducción.
Marco abierto de lectura
(ORF, Open Reading Frame)
En un segmento cualquiera de RNAm se pueden identificar 3 posibles marcos de
lectura.
Un marco de lectura traslapado es aquél en el que un nucleótido está incluido
en más de un codón.
Un marco de lectura NO traslapado es aquél en el que un nucleótido
pertenece a un solo codón.
Con los marcos de lectura traslapados, se pueden generar proteínas
diferentes a partir de la misma secuencia de RNAm.
Marco abierto de lectura
(ORF, Open Reading Frame)
En un segmento cualquiera de DNA se pueden identificar 6 posibles marcos de
lectura, 3 en cada cadena.
Cada marco de lectura generará un secuencia de aminoácidos diferente.
INICIACIÓN
TRADUCCIÓN
– En PROCARIOTAS, la a secuencia Shine-Dalgarno posiciona el ARNm y su
codón de inicio. Es complementaria a una secuenca del RNAr 16S
(componente de la subunidad pequeña)
TRADUCCIÓN
INICIACIÓN
• Diferencias entre procariotas y eucariotas:

1. En eucariotas NO hay una secuencia homóloga a la secuencia Shine-Dalgarno, en su


lugar el cap es reconocido por la subunidad pequeña del ribosoma, la que escanea al
ARNm hasta localizar el codón AUG.

2. En eucariotas, la identificación del codón de inicio se facilita por la secuencia Kozak


que rodea al codón de inicio
EL
ELPROCESO
PROCESODE
DEEXPRESIÓN
EXPRESIÓNGENÉTICA
GENÉTICA
Tiene la misma
secuencia que el
RNAm

Tiene la secuencia
complementaria al
RNAm
GENES PROCARIOTAS
GENES EUCARIOTAS
GENES EUCARIOTAS
Marco abierto de lectura
(ORF, Open Reading Frame)
Es la región del RNAm que contiene la información para sintetizar una proteína.
Empalme alternativo
REGIÓN REGULADORA: elemento clave en la expresión genética

REGIÓN REGULADORA

5’ 3’

Región transcrita
Definición y estructura del “Gen”

PROMOTOR

5’ 3’

Región transcrita
EL FLUJO DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA
TRANSCRIPCIÓN

• Síntesis de RNA a partir de DNA.

• La transcripción es el principal punto de control de la expresión


genética

• Principales tipos de RNA que se generan durante la transcripción:


– RNAm
– RNAr
– RNAt
– microRNAs

• Se pueden transcribir genes codificantes (protein-coding) y no


codificantes (RNAt, RNAr, microRNAs)
TRANSCRIPCIÓN
• Es catalizada por la enzima RNA polimerasa

• La bioquímica de las síntesis de RNA es común para procariotas y eucariotas,


pero la regulación de la transcripción es más compleja en eucariotas.

• La síntesis siempre ocurre en dirección 5’ → 3’

• Ocurre en tres fases


– Iniciación
– Elongación
– Terminación
TRANSCRIPCIÓN
• Durante la transcripción, la RNA polimerasa realiza las siguientes funciones:

– Busca en el DNA los sitios de inicio de la transcripción (SITs), señalados por el promotor
(elementos con actividad en cis).

– Separa un segmento de ADN de doble cadena para generar el molde monocatenario del cual
recibe instrucciones para la síntesis

– Selecciona el dNTP correcto y cataliza la formación del enlace fosfodiéster Este proceso lo
repite varias veces conforme se mueve unidireccionalmente a lo largo del molde de ADN.

– Es completamente procesiva: un transcrito se sintetiza de principio a fin por la misma RNA


polimerasa.

– Detecta señales de terminación que especifican donde termina el transcrito

– INTERACTÚA con proteínas co-activadoras y represoras que modulan la transcripción


(factores de transripción o elementos con actividad en trans)
TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIOTAS
INICIACIÓN:

Las regiones -10 y -35 varían ligeramente en su secuencias y esto se asocia con la
“fuerza” del promotor.
TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIOTAS
INICIACIÓN:

Las regiones -10 y -35 varían ligeramente en su secuencias y esto se asocia con la
“fuerza” del promotor.
TRANSCRIPCIÓN EN EUCARIOTAS
PROMOTOR BASAL :
TRANSCRIPCIÓN EN EUCARIOTAS
TRANSCRIPCIÓN EN EUCARIOTAS

Los factores de transcripción y co-activadores pueden ser vistos como llaves que
cooperativamente abren diferentes tipos de candados, dando a la RNA pol II
acceso a tipos específicos de genes.
RNA de transferencia (tRNA)
Existen de 30 a 50 diferentes tRNAs.
Cada uno se une a un solo tipo de aminoácido.
Funcionan como moléculas adaptadoras que llevan y liberan los aminoácidos en
ribosoma.
RNAt’s diferentes que aceptan el mismo aminoácido pero que poseen distinto
anticodón se denominan tRNAs isoaceptores.
TRADUCCIÓN
• El ribosoma se une cerca del extremo 5’ del RNAm y se mueve hacia el extremo 3’,
traduciendo los codones conforme avanza.

• La síntesis de proteínas inicia por el extremo amino y la proteína crece por adición
de nuevos aminoácidos en el extremo carboxi-terminal.
MUTACIONES
TRADUCCIÓN
EFECTO DE LAS
MUTACIONES

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