‫‪01/05/08‬‬

‫ביולוגיה מולקולרית – שיעור ‪14‬‬
‫שבבים ‪ -‬המשך‬
‫כל גן בשבב מיוצג על ידי שורת גלאים שמולה יש שורת ביקורת עם שינוי בבסיס‬
‫אחד מ – ‪ 25‬הבסיסים של הגלאי‪.‬‬
‫בשבב יש את האזורים המקדדים של הגנום (ללא פרומוטורים‬
‫וכו')‪.‬‬
‫לכל ריבוע בשבב עושים מיצוע של הפלורסנציה שלו בסריקה‪.‬‬
‫כשבודקים את הגן‪ ,‬בוחרים אזורים שיותר קרובים לאזור של‬
‫קצה '‪ 3‬כי התוצרים מיוצרים מהכיוון הזה ויש יותר סיכוי‬
‫למצוא את האזורים האלא‪.‬‬
‫בוחרים אזורים שייצגו את הגן הכי טוב מבחינת שוני בינן לגנים אחרים‪.‬‬
‫יש לפעמים תקלות בייצור השבב או בעבודה עליו‪ ,‬חשוב להכיר את הבעיות האלא‬
‫כי לרוב לא ניתן לראות את התקלה בעין‪.‬‬
‫כדי לקבל תוצאות גם משבבים פגומים‪ ,‬הגלאים מפוזרים בצורה אקראית ולא‬
‫ברצף כדי שלא נאבד אזור שלם עם משמעות מסויימת‪.‬‬
‫על השבב יש את השם שלו ומספרו ועוד ביקורות שונות שצריכות לתת לנו תוצאות‬
‫ידועות (בהוספת תוספים לדגימה הנבדקת) כביקורת‪.‬‬
‫השבב מסודר כך שהטורים ממוספרים והשורות מסומנות באותיות‪,‬‬
‫הטורים נותנים לנו את המיקום על הרצף שאותו אנחנו בודקים‬
‫(המקום בו הבסיסים משתנים) והשורות נותנות לנו את הבסיסים‬
‫השונים‪.‬‬

‫לפי הגלאים שהוארו‪ ,‬ניתן לומר מה הרצף שלנו לפי ההומולוגים שלהם‪.‬‬
‫הקביעה אם יש היברידיזציה או לא מבוצעת עם השוואה בין הריבוע עם הגלאים‬
‫לריבוע של הביקורת הצמוד לו‪ ,‬יכול להיות שריבוע מסויים ייתן לנו צבע שדומה‬
‫לצבע שנמצא בשורת הביקורות‪ ,‬אבל כל עוד הוא יותר בהיר מריבוע הביקורת‬
‫הצמוד לו‪ ,‬זה נחשב שהגלאי עבר היברידיזציה‪.‬‬

‫‪-1-‬‬

‫‪01/05/08‬‬

‫ביולוגיה מולקולרית – שיעור ‪14‬‬

‫‪-2-‬‬

‫‪01/05/08‬‬

‫ביולוגיה מולקולרית – שיעור ‪14‬‬
‫ניתן גם לסמן ‪ RNA‬בשני צבעים שונים (לדוגמה‪ RNA ,‬מתא‬
‫בריא וחולה) ולהכניס אותם לשבב‪.‬‬
‫כתוצאה אפשר לקבל ‪ 3‬סוגי צבעים‪ ,‬אחד מכל צבע וערבוב‬
‫של שני הצבעים‪.‬‬

‫אנליזה ביואינפורמטית‬
‫מערכת הסריקה יודעת לקרוא את השבב ולתת לנו את תוצאותיו‪.‬‬
‫בנוסף‪ ,‬התוכנה מעודכנת ומתעדכנת ברצפים גנטים קיימים שמצאו כבר והיא יכולה‬
‫לחבר בין הרצף שנסרק לרצף קיים ותפרט לאיזה בעלי חיים הרצף יכול להיות‬
‫שייך‪.‬‬
‫יש תוכנות שמנהלות את המידע במעבדה ומאכסנות אותו‬
‫בבסיסי נתונים‪.‬‬
‫יש תוכנות שנכנסות לבסיסי המידע האלה ויכולות להוציא‬
‫משם מידע שמתאים למי שמחפש‪.‬‬
‫כמובן שיש חשיבות להכניס מידע נכון‪ ,‬מדוייק ובסורה‬
‫מסודרת כדי שיהיה אפשר להוציא מידע נכון‪.‬‬
‫שיטות מיון‬
‫‪ – Cluster analysis.1‬מיון על פי צברים‪ ,‬רצפים דומים יאורגנו בקבוצה‪.‬‬
‫‪ – )Self organizing analysis (SOM.2‬התוכנה ממיינת את הנתונים לפי‬
‫פרמטרים שמגדירים לה‪ ,‬נתונים שלא ברור למערכת איפה לשים היא‬
‫תנתח לבד או שתדרוש נתונים נוספים לניתוח‪.‬‬
‫המערכות יכולות לסדר את הנתונים כך שיהיה לנו נוח לקרוא ולהבין אותם‪.‬‬
‫לדוגמה‪ ,‬במחלת סרטן לילדים‪ ,‬מצאו ‪ 6‬קבוצות של מאפיינים‬
‫שמגדירים את שלבי המחלה‪ ,‬נתונים אלא הוזנו למערת ה – ‪.SOM‬‬
‫המערכת בדקה דגימות ומצאה קבוצות אחרות שהיא שייכה לקבוצות‬
‫הקיימות‪.‬‬

‫יכולות שבבים‬
‫‪.1‬קביעת רמת ביטוי וסוגי גנים – מיון וסיווג‪.‬‬
‫‪.2‬פולימורפיות גנטית – אבחון מחלות‪ ,‬בחירת טיפול מתאים‪ ,‬קביעת מקור‬
‫וזמן אבולוציוני של רצפים וגנים‪.‬‬
‫‪.3‬קביעת רצף או מבנה של חלבון – קביעת תפקיד ביולוגי והשוואת רצפים‬
‫בין אורגניזמים שונים‪.‬‬
‫‪.4‬ניבוי סיכונים להדבקות במחלות‪.‬‬

‫‪-3-‬‬

‫‪01/05/08‬‬

‫ביולוגיה מולקולרית – שיעור ‪14‬‬

‫‪-4-‬‬

‫‪01/05/08‬‬

‫ביולוגיה מולקולרית – שיעור ‪14‬‬
‫‪Genotyping‬‬
‫שיטה שמופעלת בעיקר בחברות תרופות‪ ,‬בדיקת תגובה של אדם לטיפול תרופתי‬
‫מסוים (תגובה טובה‪ ,‬גרועה‪ ,‬תופעות לוואי וכו')‪.‬‬
‫לפי הפרופיל הגנטי אפשר לומר איזה תרופות מותר ‪ /‬אסור ‪ /‬כדאי לקחת‪.‬‬

‫שיבוט‬
‫לצרכי רביה (טכנולוגיית מיקרומניפולציה) וריפוי (טכנולוגיית תאי גזע)‪.‬‬
‫מיקרומניפולציה‬
‫לדוגמה בהפריה חוץ גופית‪ ,‬שליפת ביציות ישירות מהשחלה והזרקת תא זרע‬
‫ישירות לביצית‪.‬‬
‫אפשר לשלוף תא אחד מעובר ולבדוק אותו למחלות גנטיות‪.‬‬
‫מכאן באה המחשבה על חיות טרנסגניות‪ ,‬בע"ח שהוחדר להם גן של מין אחר‬
‫(הורמון גידול של בן אדם בעכבר‪ ,‬לדוגמה)‪.‬‬
‫חיות טרנסגניות חשובות למחקרים או לייצור תרופות‪.‬‬
‫הגן מוחדר לביצית על ידי הזרקת ‪ DNA‬והפריית הביצית‪ ,‬כתוצאה יהיו לנו‬
‫צאצאים שחלקם או כולם יכילו את הגן שהוחדר‪.‬‬
‫במקום ‪ DNA‬ניתן גם להזריק לביצית תאים עובריים שמגיעים מהורים רבים‪.‬‬
‫שיבוט אדם‬
‫ניתן להוציא ביצית מהאם וגרעין מתא סומטי של האדם שרוצים לשבט‪ ,‬באמצעים‬
‫שונים ניתן לאחות ביניהם‪.‬‬
‫את העובר שנוצר ניתן להשתיל באם פונדקאית ויוולד ילד משובט‪.‬‬
‫תאי גזע‬
‫מתאי גזע ניתן לייצר תאים שונים (דם‪ ,‬עצב ושריר) ואיתם אפשר לתקן רקמות‬
‫שנפגעו‪.‬‬

‫‪-5-‬‬

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful