CAPfTULO

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Las proteinas y sus funciones bioleglcas: perspectiva

FIGURA 3-1 Cristales de citocromo c de caballo, proteina que acnia en el trensporte de electrones.

En este capitulo haremos un estudio en perspectiva de la naturaleza qui mica y la biologia de las proteinas. Nuestro proposito es proporcionar una orientacion en este complejo campo y definir algunos terminos y conceptos esenciales, como preparacion para el tratamiento mucho mas detallado de la estructura y fun cion de las proteinas que se desarrolla en los capitulos 4 a 9. Las proteinas son las moleculas orqanicas mas abundantes en las celulas, constituyendo el 50 por ciento 0 mas de su peso seco. Se encuentran en todas las partes de cada celula, ya que son fundamentales en todos los aspectos de la estructura y fun cion celulares. Existen muchas c1ases de proteinas diferentes, cada una de elIas especializada en una funcion bioloqica diferente. Ademas la informacion genetica es expresada en su mayor parte por las proteinas. Por esta razon debemos examinar tambien la naturaleza general de la relacion qenetica entre el acido desoxirribonuc1eico y la estructura de las proteinas, asi como el efecto de las mutaciones sobre la estructura proteica. La estructura de las moleculas de proteina, asi como su relacion con su fun cion bioloqica y actividad constituyen problemas centrales de la bioquimica actual. Composicion

de las proteinas

E. Margoliash

Se han aislado centenares de proteinas diferentes en forma pura y cristalina (fig. 3-1 ). Todas elIas contienen carbone, hidroqeno, nitroqeno y oxigeno, mientras que casi todas contienen azufre. Las hay que contienen algunos elementos adicionales, particularmente fosforo, hierro, cine y cobre. Los pesos moleculares de las proteinas son muy elevados, pero por hidrolisis acida, las moleculas proteicas dan una serie de compuestos orqanicos sencillos de bajo peso molecular; son los a-aminoecidos (figs. 1-3 y 3-2), que difieren entre si en la estructura de sus grupos R 0 cadenas laterales. Por 10 comun, solamente se encuentran 20 la-aminoacidos distintos como sillares de las proteinas (cap. 4). En las moleculas proteicas los sucesivos restos aminoacidos se hallan unidos covalentemente entre si forman do largos polimeros no ramificados. Estan unidos en una ordenacion de cabeza a cola mediante unas uniones amida sustituidas llama ...

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un peso molecular y una secuencia ordenada de sus aminoacidos estructurales y una forma tridimensional (cap. Las proteinas se dividen en dos clases principales basandose en su composicion: proteinas simples y proteinas conjugadas. sino tambien otros componentes orqanicos 0 inorganicos. metalopro~ teinas y glucoproteinas. fijado arbitrariamente. (fig.PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS FIGURA 3-2 Aminoacidos. EI limite superior del pesomolecular de las proteinas solo puede ser establecido arbitrariamente. Estas macromoleculas. Las proteinas simples son aquellas que por hidrolisis producen solamente aminoacidos. Formula estructurel general de los a-eminoecidos hallados en las proteines. que se encuentran entre 1isproteinas pequefias mejor conocidas. En la tabla 3~2 se consignan algunos valores caracteristicos. ya que depende de la definicion de los terminos proteina y molecula. contienen entre 100 y 155 restos arninoacidos. respectivamente. La tabla 3~2 muestra tambien que much as proteinas que poseen pesos moleculares superiores a 36 000 contienen dos 0 mas cadenas polipeptidicas. de citocromo c y de mioqlobine. Las estructures de los eminoecidos de las proteines pueden verse en las paginas 75 a 77. cada cadena polipeptidica posee una especifica composicion quimica. 5). los grupos R son diferentes. De este modo tenemos nucleo~ protein as y lipoprotein as. Contienen habitualmente 50% de carbono. como verernos mas adelante. sin embargo. algunas proteinas poseen cadenas mucho mas largas. de longitud indefinida. pueden contener centenares de unidades de aminoacidos. La porcion sombreada es comtin a todos los emtnoecidos. oscilan desde 5000. Las cadenas polipeptidicas sencillas de ribonucleese. las cuales contienen acidos nucleicos y lipidos. tales como la seroalbumina (aproximadamente 550 restos) y la miosina (aproximadarnente 1800 restos). poseen pesos moleculares que varian desde 12 000 a mas de 1 millen. asi como [osioproteines. 6 se define con mayor exactitud). orqanico 0 inorqanico. Grupo R H- Nombre del arninoacldo Glicocola Alanina Serina Fenilalanina eH. Extremo amino terminal HO Conformaci6n de las proteinas Cada tipo de molecula proteica posee en su estado nativo una forma tridimensional caracteristica que es conocida como su <:C!!!_[otTrla. (en 60 o -CH. Sin embargo. Diferentes enzimas. Tamaiio de las molecules proteicas Los pesos moleculares de las proteinas muy puras pueden determinarse empleando metodos fisicos que se describiran mas adelante. que es el mas bajo. 16 % de nitroqeno y de 0 a 3 % de azufre.ci6n. 23 % de oxigeno. sus grupos R y estruciure de los peptidos. que reciben el nombre de polipeptidos. Grupos R de algunos eminoecides reptesentetivos. Las proteinas conjuqadas pueden clasificarse de acuerdo con la naturaleza quimica de sus gru~ pos prosteticos (tabla 3~1). el cap. Cas cadenas polipeptidicas de las proteinas no son. por ejemplo. HOCH2- C)Estructure CH2- de un tetrepeptido. 3~2) producidas por eliminaci6n de los elementos del agua entre el grupo carboxilo de un aminoacido y el grupo a~amino del siguiente. 7 % de hidroqeno. Las cadenas polipeptidicas individuales de la mayor parte de las proteinas de estructura conocida contienen de 100 a 300 restos aminoacidos (Pm 12 000 a 36 000). La porcion no arninoacida de una proteina conjugada se denomina 9!upo prostetico. sin ninqun otro producto principal. das enlaces~idicos. Las proteinas conjuga~ das son aquellas que por hidrolisis producen no solamente aminoacidos. hasta por encima de 1 000 000. polirneros al azar.D Extremo carboxiloterminal Glicilalanilserilfenilalanina . Aun entre las proteinas que desempefian el mismo tipo de funcion no se pueden establecer generalizaciones sobre el tamafio.

formando fibras 0 laminas largas. 3~3). Peso molecular 5700 12600 Protefna Insulina (bovina) Ribonucleasa (pancreas bovino) Lisozima (clara de huevo) Mioglobina (corazon de caballo) Outmotripstnoqeno (pancreas bovino) . manosa. tales como el c." de cedenes 2 1 1 1 1 2 4 13900 16900 23200 35000 64 500 102000 159000 310000 370000 592 000 7000000 40000000 2 4 12 4 12 160 2130 Las proteinas pueden clasificarse en dos clases principales. Iipidos neutros Hexosamina.1 2 2 23 M etelproteines Ferritina Cttocromo-oxtdasa Aleohol-deshidrogenasa Xantinoxidasa 0. coli) Complejo de la plruvato-deshidroqenasa (rifi6n de buey) Virus rnosaico del tabaeo N. Las proteinas Iibrosas son los elementos basicos estructurales en el tejido conjuntivo de los animales superiores.8.8-Laetoglobulina (bovina) Hemoglobina (humana) Hexoquinasa (levadura) Trtptofano-sintetasa (E. Fe y Cu Zn Mo y Fe a restos 2 40 4 4 3.(! (pag. acido Nsaceulneuramtnlco Fosfato estertficado de serina Ferroprotoporfirina Ferroprotoporfirma Ferroprotoporfirina Flavln-nucleotido Flavtn-nucleottdo Fe(OH). gaiactosa.4 • TABLA 3-2.3 0. Son materiales Iisicamente resistentes. Pesos moleculares de algunas proteinas .-Lipoproteinas del plasma Glucoproteines '1-Globulinas Orosomueoide del plasma Fosfoproteinas Caseina (leehe) Hemoproteines Hemoglobina Citocromo c Catalasa Fleooproteines Succlnatc-deshidroqenasa D:-Aminoacido-oxidasa 79 Galactosa._(Jl?J1~n. Porcentaje aproximado en peso 50-60 5 Clase Sistemas nucleoproteinicos Ribosornas Grupo ptostetico RNA RNA Fosfolipidos. N -acetilq alactosamina. Algunas proteinas conjugadas. coli) Gluc6geno-fosforilasa (higado buey) Glutamlna-smtetasa (E. insolubles en el agua 0 en las disoluciones salinas diluidas.3 0. 137) de los tendones y la matriz de los huesos. coli) Aspartato-transcarbarnilasa (E. la a:SLll_e_: 61 . acido sialico Virus mosaico del tabaco Lipoproteines . Las proteinas_j_iJzrosas se hallan constituidas por cadenas polipeptidicas ordenadas de modo paralelo a 10 largo de un eje. segtin su conformaci6n (fig. colesterol.Capitulo 3 Las ptoteines TABLA y sus [unciones bioloqices: perspective 3-1. rnanosa.

Puesto que las proteinas oliqomericas contienen dos 0 mas 62 . Las proteinas globulares. y el iibrinogeno. 3~3). en las que las cadenas polipeptidicas poseen una conformaci6n extendida 0 arrollada Ionqitudinalmente: 10 mismo ocurre en seqmentos de cadenas polipeptidicas de las proteinas globulares. alqunas hormonas y muchas proteinas que desempefian una fun cion de transporte. formando un conjunto globular compacto de considerable estabilidad a pesar de la carencia de enlaces covalentes entre elIas. por otra parte. EI termino mas general de conjormecion. Generalmente desempefian una funcion movil 0 dinamica en la celula. Las proteinas oliqomericas contienen habitualmente un numero par de cadenas polipeptidicas. contienen dos 0 mas cadenas polipeptidicas. Se encuentran entre ellas la miosine. 3~3). La mayor parte de las proteinas globulares son solubles en los sistemas acuosos. La estructura secunda!1ia se refiere a la ordenaci6n regular y pe~ riodica en el espacio de las cadenas polipeptidicas a 10 largo de una direcci6n. y a las proteinas globulares. El terrnino estructura primar'ia se refiere al esqueleto covalente de la cadena polipeptidica. elemento estructural importante del musculo. que pueden ser identicas 0 diferir en longitud 0 secuencia aminoacida. tales como la seroalbumina y la hemoglobina. por ser solubles en las disoluciones acuosas salinas. entre las cuales pueden no existir enlaces covalentes (fig. que esta constituido por cuatro cadenas polipeptidicas acopladas Intimamente. 128) del cabello. y establece de modo especifico la secuencia de sus restos aminoacidos. (Cap. puede haber desde dos a doce cadenas. 3~3). ya sean fibrosas 0 globulares. ufias y plumas. pareciendose a las proteinas fibrosas por sus largas estructuras cilindricas. Un ejemplo bien conocido de proteina oliqomerica es la hemoglobina. El termino estructura terciaria se refiere al modo como la cadena polipeptidica se curva 0 se pliega para formar la estructura estrechamente plegada y compacta de las proteinas globulares (fig. terciaria y cuaternaria de una proteina. precursor de 1a fibrina. se emplea para referirse a la estructura combinada secundaria. y la elastina del tejido conjuntivo elastico. cuero. estan constituidas por cadenas polipeptidicas plegadas estrechamente de modo que adoptan formas esfericas 0 globulares compactas (fig. 3~3) se definiran de un modo mas completo y preciso en el capitulo 5. Las proteinas con dos 0 mas cadenas polipeptidicas se conocen por el nombre de proteinas oligomericas y sus cadenas componentes se llaman subunidades 0 protometos. La mayor parte de las grandes proteinas. pigmento respiratorio de los eritrocitos de la sangre. EI termino estructura cuaternaria pone de manifiesto c6mo se disponen en e1 espacio las cadenas individuales polipeptidicas de una proteina que posee mas de una cadena. 6). De los casi dos millares de en~ zimas diferentes conocidos hasta ahora casi todos son proteinas globulares.PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS ratina [paq. elemento estructura1 de los coaqulos sanguineos. como tambien 10 son los anticuerpos. La estructura secundaria es sobre todo evidente en las proteinas fibrosas. En las subunidades de las proteinas oliqomericas mas pequefias. Algunas proteinas se hallan situadas entre los tipos fibroso y globular. cuerno. Los terminos especificos empleados corrientemente para designar los diferentes aspectos 0 niveles de la estructura proteica (fig.

El termino estructura secundaria se refiere a las ordenaciones arrolladas 0 en zig-zag de la cadena polipeptidica a 10 largo de una dimension. Esqueleto de la cadena polipeptidica en una proteine fibrosa tipica. 63 .Capitulo 3 PIGURA Las protein as y sus [unciones bioloqicesi perspective Protein a Iibrosas 3-3 Pmteinas [ibroses y globulares. Los tramos cortos de la cadena polipeptidica de proteina globular pueden tener tembiett estructura secundaria helicoidal 0 en zig-zag. • Ovillo a-helicoidal Superenrollamiento de ovillos a-helicoid ales formando cuerdas Proteinas globulares La cadena polipeptidica se halla plegada en una forma globular compacta Ilamada estructura terciaria. la a-queretine. En las proteinas oliqomerices la ordenecion empaquetada tridimensional de las cadenas polipeptidicas se conoce por el nombre de estructura cueternerie. Estructura terciaria de proteina globular de una sola cadena Estructura cuaternaria de proteina globular oligomeric a 0 de cadenas multiples.

se ha IIegado a la conclusion que la estructura primaria permanece intacta. es decir 2 millones. posee un peso de particula de aproximadamente 40 millones. y hablar de su «peso molecular». el efecto mas visible del cual. Sin embargo. las particulas virales se comportan como estructuras aisladas homogeneas que poseen un peso molecular definido. llamado agrupaci6n supra. poe exposici6n a un pH bajo 0 pot: tratamiento con urea-. La formacion de un coaqulo insoluble blanco cuando se hierve la clara de huevo es un ejemplo comun de desnaturalizacion termica. que por 10 general no estan unidas covalentemente entre si. Despues que la cadena peptidice ha sido desplegada -pOl' acci6n del calor. Asociaciones supramoleculares de las proteinas Algunas veces aparece en las' celulas un conjunto de molecuIas de proteina actuando conjuntamente. en muchas proteinas oliqomericas las cadenas Individuales se hallan tan estrechamente unidas que la particula completa se suele comportar en disolucion como una sola molecula. constituida por un as 2200 cadenas polipeptidicas identicas. Los restantes 38 millones son aportados por la porcion proteica. consiste en un descenso de su solubilidad. Este complejo puede ser aislado de las celulas de levadura en forma homogenea (tabla 3~2). complejos de proteinas y de acidos nucleicos: algunos virus contienen tambien lipidos e iones metalicos. Sin embargo. Ademas. al calentar los enzimas se suele perder su capacidad catalitica. todas las subunidades componentes de las proteinas oliqomericas son necesarias para su fun cion bioloqica. les hace experimentar un cambio conocido como desneturelizecion. Forma nativa • Arrollamiento al azar Forma nativa . Los mayores complejos proteicos supramoleculares son los virus. Puesto que los enlaces quimicos covalentes del esqueleto peptidico de las proteinas no se rompen durante este tratamiento relativamente suave. La consecuencia mas siqnificativa de la desnaturalizacion es que las proteinas pierden su actividad bioloqica caracteristica. La desnaturalizacion consiste en el desplegamiento de la 3-5 Desnaturalizacion y renetureiizecion de una proteine globular. uno de los virus menores. estan constituidos por acido ribonucleico. a modo de aqrupacion 0 de complejo que puede aislarse en forma homoqenea e incluso cristalina. con [recuencie se rep/iega esponteneemente y adopta la forma nativa. El virusl del mosaico del tabaco (fig. La mayor parte de las proteinas globulares experimentan el proceso de desnaturalizacion cuando se calientan por encima de 60~70 °C. 3~4).PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS cadenas polipeptidicas. puede parecer impropio. Por ejemplo. de los cuales alrededor del 5 por ciento. molecular 0 complejo. que contiene una molecula de cada uno de los siete enzimas dilerentes que se precisan para la biosintesis de los acidos grasos (paq. 672). Un ejemplo de aqrupacion de macromoleculas relacionadas funcionalmente. 0 al menos ambiguo referirse a las proteinas oliqomericas como «moleculas».~ FIGURA 3-4 Porci6n de una perticule del virus del mosaico del tebeco. debido a que sus subunidades componentes se haIIan empaquetadas muy intimamente. La exposicion de proteinas solubles 0 globulares a pH extremes 0 a temperaturaselevadas. ordenaci6n supremolecular de -2200 cadenas polipeptidicas y una molecule de RNA. FIGURA Desnaturalizacion Muchas moleculas proteicas solo retienen su actividad biologica dentro de una fluctuacion muy limitada de temperatura y de pH. es el complejo de la sintetasa de los acidos grasos.

como la DNA polimerasa y los enzimas activadores de aminoacid os. La tabla 3~3 da algunos ejernplos representativos de los diferentes tipos de proteinas. desprovistas de actividad bioloqica. Cuando la agitaci6n termica provoca que la estructura nativa plegada se desarrolle 0 se distienda. originando una cadena libremente ondulada. por tanto. que la secuencia de aminoacidos en la cadena polipeptidica contiene la informaci6n requerida para especificar su conformaci6n plegada nativa. gracias a las interacciones reciprocas entre las cadenas laterales de aminoacidos. Son extraordinariamente especificos en su funci6n. asi como entre el disolvente y solutos. la renaturalizaci6n de una proteina desnaturalizada no desarrolla ninguna actividad bioloqica que no se hallase ya presente en la proteina original. El enzima hexoquinasa cataliza la transferencia de un grupo fosfato desde . veremos que la secuencia aminoacida determina en Ultimo extreme la actividad biol6gica de la proteina ya que de ella depende la conformaci6n nativa 0 estado de pleqamiento de la molecula proteica. participan en la bicsintesis de los componentes celulares. en un proceso que recibe el nombre de renaturalizaci6n (fig. Muchos enzimas contienen una sola cadena polipeptidica. como por ejemplo. asl como una determinada secuencia. y que esta conformaci6n nativa determina su actividad biol6gica (cap. que origina formas enroll ad as al azar. no es un proceso irreversible como se creia. Si la proteina desnaturalizada fuese un enzima. puede tambien recuperar su actividad catalitica por renaturalizaci6n. Se han observado muchos casos en que una molecula des pie gada recupera su forma nativa en el tubo de ensayo. Sin embargo. 3~5). de que la desnaturalizaci6n 0 desplegamiento de las proteinas nativas. 0 bien. cIasificados de acuerdo con su funci6n. el trifosfato de adenosina (ATP) a la glucosa. el citocromo C. sin ninqun cambio en la especiIicidad de la reacci6n catalizada. Diversidad funcional de las protein as Las proteinas poseen muy diversas funciones biol6gicas diferentes. pero en otras hay varias 0 muchas cadenas. Los enzimas poseen extraordinaria potencia catalitica. Y otras. establecida durante su biosintesis. Otros enzimas deshidrogenan moleculas de combustible.Capitulo 3 Las ptoteines y sus [unciones bioloqices: perspective estructura nativa plegada caracteristica de la cadena polipeptidica de las moleculas de las proteinas globulares (fig. Algunos enzimas se hallan mas especializados y desempeiian una funci6n regula dora adem as de su actividad catalitica: son los -llamados enzim as reguladores 65 . Estos hechos indican. 6). mucha mas que los catalizadores fabricados por el hombre. Sin embargo. Cada tipo de molecula de enzima tiene un centro activo al que se une su sustrato especifico durante el ciclo catalitico. cada uno de los cuales cataliza un tipo diferente de reacci6n quimica. Esta conclusion es consecuencia del descubrimiento. 3~5). Los enzimas representan la clase mas amplia. la secuencia amino acid a no confiere directemente a la proteina su funci6n biol6gica 0 actividad. siendo la primera etapa del metabolismo de la glucosa. Se conocen cerca de dos millares de enzimas diferentes. transfieren electrones hacia el oxigeno molecular durante la respiraci6n. la proteina pier de su actividad biol6gica. Aunque cada tipo de proteina posee una composici6n Hja de aminoacidos.

en O2 en acidos lipidos hierro Cu en la sangre de los vertebrados la sangre de algunos invertebrados el musculo grasos en la sangre en la sangre en la sangre la sangre 0 TABLA 3-3. plumas. ufias. Virtualmente. f1uido sinovial Toxinas T oxina de Clostridium botulinum Toxina diftertca Venenos de serpiente Ricina Gosipina Hormonas Insulina Hormona Hormona adrenocorticotr6pica del crecimiento viral Proteinas estructureles Proteinas recubrimiento Gl ucoproteinas a-Queratina Esclerotina Fibroina Colaqeno Elastina Mucoproteinas o elostericos. pezufias Exoesqueletos de los insectos Seda de los capullos. la caseina de la leche y la glia~ dina de las semillas de trigo. La seroelbiunine se une estrechamente a los acidos grasos libres. y de este modo trans- 66 . -Algunas proteinas desempefian una funci6n de transporte. la ovoal~ himJina de la clara de huevo.PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES LAS CELULAS DE Claslftcaclon de las proteinas por su funcion bioloqica. Como los enzimas catalizan las reacciones quimicas constituye uno de los problemas principales de la bioquimica moderna. cartilago) Tejido conectivo elastico (ligamentos) Secreciones mucosas. telarafias Tejido conectivo fibroso (tendones. para 10 cual son capaces de unirse y transportar tipos especificos de moleculas por la sangre. como se dijo ya anteriormente. hueso.-Lipoproteina Globulina que liga hierro Ceruloplasmina Proteines contrectiles Miosina Actina Dlneina Proteines protectores de los vertebredos Anticuerpos Complemento Fibrin6geno Trombina en la sangre [uncion '0 Filamentos estacionarios en las miofibrillas Filamentos m6viles en las miofibrillas Cilios y flagelos Forman complejos con proteinas extrafias Complejos con algunos sistemas antiqeno-anticuerpo Precursor de la fibrina en la coagulaci6n sanguinea Componente del mecanismo de coagulaci6n Origina envenenamiento bacteriano de los alimentos Toxina bacteriana Enztrnas que hldrolizan los fosfoqliceridos Proteina t6xica de la semilla del ricino Protein a t6xica de la semilla del algod6n Regula el metabolismo de la glucosa Regula la sintesis de corticosteroides Estimula el crecimiento de los huesos Cubierta alrededor del cromosoma Recubrimientos celulares y paredes Piel. por ejemplo. todos los enzimas son proteinas globulares. Locelizecion Fosforila glucosa Deshidrogena lactato Transfiere electrones Replica y repara DNA Proteina de la clara de huevo Proteina de la leche Reserva de hierro en el bazo Proteina de la sernilla de trig6 Proteina de la semilla de maiz Transporta Transporta Transporta Transporta Transporta Transporta Transporta O2 en 0. Tipos y ejemplos Enzimas Hexoquinasa Lactato-deshidroqenasa Citocromo c DNA-polimerasa Proteinas de teserue Ovoalbiimina Caseina Ferritina Gliadina Ceina Proteinas transportadoras Hemoglobina Hemocianina Mioglobina Seroalbumina !3. Otra clase importante de proteinas desempefia la Iuncion de almacenar aminoacidos como elementos nutritivos y como sillares para el embri6n en crecimiento.

0 coil otros cuerpos que se han introducido en la sangre 0 en los tejidos de un vertebra do determinado. es la principal proteina estructural extracelular en el tejido conectivo y en el hueso. una hormona de la glandula pituitaria anterior. 27). En realidad el estudio de los anticuerpos ha conducido a la conclusion de que cada especie de organismo posee su propio conjunto especifico de moleculas proteicas (pag. mencionada anteriormente. En los musculos. En los vertebrados. constituida por dos cadenas polipeptidicas entrelazadas helicoidalmente. constituida por muchas cadenas globulares polipeptidicas y ordenada como una sarta de cuentas. el higado y los tejidos adiposos (grasos).Capitulo 3 Las ptoteines y sus [unciones biol6gicas: perspective porta sus mole cul as entre el tejido adiposo y otros organos de los vertebrados. del tejido elastico amarillo. Otros tipos de proteinas actuan como elementos esenciales de los sistemas motiles y contractiles. contractiles del musculo: la actina es una proteina filamentosa. Otras dos proteinas de los vertebrados son la elastina. La actina y la miosina son los dos elementos proteicos principales de los sistemas. Entre las proteinas mas interesantes se hall an aquellas que actuan como hormonas. la proteina Iibrosa coleqeno. es una hormona que regula el metabolismo de la glucosa. que es responsable de alqunos tipos de envenenamiento por alimentos. pero las proteinas protectoras mas importantes son los anticuerpos 0 inmunoglobulinas las cuales se combinan con las proteinas extrafias y asi las neutralizan. a la toxina difterica y a la toxina de la bacteria anaerobia Clostridium botulinum. La insulin a. Las toxinas. 0 sea. estas proteinas estan ordenadas en disposiciones paralelas y se deslizan unas a 10 largo de las otras durante la contraccion. sustancias que son extremadamente toxicas para los animales superiores en cantidades muy pequefias. que incluye a la ricina de la semilla del ricino. La hemoglobina de los eritrocitos de los vertebrados transporta oxigeno desde los pulmones a los tejidos. Las arafias y los gu~ 67 . Ademas de estas clases principales de proteinas. Otra clase de proteinas comprende a las que actuan como elementos estructurales. (cap. representan otro grupo de proteinas. tales como la hormona del crecimiento 0 sometotropine. Iarqa. segregada por ciertas celulas especializadas del pancreas. Las lipoproteinas del plasma sanguineo transportan lipidos entre el intestine. que confieren propiedades lubricantes y deslizantes a las secreciones mucosas y al £luido sinovial de las articulaciones de los vertebrados. Algunas proteinas desempefian una Iuncion protectora 0 de£ensiva. y la miosina es una molecula semejante a una larga varilla cilindrica. Las proteinas sanguineas trombina y [ibrinogeno participan en la coaqulacion de la sangre e impiden de este modo la perdida de sangre del sistema vascular de los vertebrados. los invertebrados poseen otros tipos de moleculas proteicas transportadoras de oxigeno. 114). Las fibrillas de colaqeno colaboran tambien en la Iormacion de un continuo estructural uniendo entre si grupos de celulas para formar un tejido. El cartilago contiene no solamente colaqeno sino tambien qlucoproteinss. y la a-queretine. su deficiencia en el hombre provoca la enfermedad conocida como diabetes melitus. tales como las hemocienines. algunas otras tienen funciones poco habituales. a la gosipina de las semillas de alqodon.

La estructura y el origen de las inmunoglobulinas se describen mas detalladamente en el capitulo 35. Los centres coloreedos sobre la molecule del enticuerpo son estructurelmente complementarios con los centres determinenies del antigeno. Los antieuerpos son muy espectficos para las proteinas extrafias que inducen su formaci6n. Un anticuerpo de conejo. Las moleculas de anticuerpo aparecen en el suero sanguineo y en ciertas celulas de un vertebra do en respuesta a la introducci6n de una protein a u otra macromolecula extrafia a aquella especie. por tanto. La conformaci6n tridimensional es la que confrere a cada proteina su actividad biol6gica especifica: la conformacion. Si el microorqanismo tuviera acceso a la sangre 0 la linfa en cualquier ocasi6n Iutura. Un anticuerpo especifico 0 inmunoqlobulina se forma como respuesta al antigeno extrafio y puede persistir en la sangre durante mucho tiempo. cuando se desnaturaliza no conserva su sabor dulce. Las moleculas del anticuerpo especifico. los antieuerpos asi formados pueden neutralizar 0 inactivar al microorganismo al combinarse con sus componentes antiqenicos. La sangre de algunos peces que habitan en las aguas antarticas. 6). a temperaturas inferiores a cero grados. recibe el nombre de precipitina (fig.PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS FIGURA 3-6 sanos de seda segregan [ibroine. Anticuerpos y respuesta inmuner de especie de las proteinas especificidad Entre la gran variedad de diferentes proteinas de los orqanismos vivos los enticuerpos 0 inmunoglobulinas han sido de la maxima importancia en la demostraci6n de que las proteinas son especificas de cada especie de organismo. encontrada en algunos frutos. dado que en ultimo termino precipita del suero. La molecula del anticuerpo posee dos centres de uni6n que hacen poslble la formaci6n de una red tridimensional de moleculas alternantes de antigeno y de antieuerpo. La respuesta inmune aparece solamente en los vertebrados y constituye. R. un producto bastante reciente de la evoluci6n biol6giea. Tal especie de macromolecula extrafia se denomina antigeno. y que recibe. por su parte. La inmunidad frente a las enfermedades infecciosas puede conferirse. antigenos) del microorganismo 0 del virus causante. 68 . 3~6). la cual se solidi fica rapidamente una disoluci6n espesa de la protein a forman do un Filamento insoluble de fuerza tensil excepcional y que sirve para Iormar telarafias y capullos. Es extraordinario que todas las proteinas incluso las que ejercen efectos biol6gicos 0 t6xieos intensos. inyectando cantidades muy pequefias de ciertos componentes macromoleculares (es decir. el nombre de protein a «antieongelante». Las moleculas de anticuerpo poseen centres de uni6n que son especificos para las caracteristicas estructurales del antigeno que indujo su formaci6n y complementarios respecto a elIas. contiene una proteina que impide la congelaci6n de la sangre. Esta reacci6n se llama respuesta inmunitaria y constituye la base de todo el campo de la inmunologia. muy adecuadamente. frecuentemente. La monelina es una proteina de sabor dulce. Los centres coloreados sobre el antigeno son los determinentes de la especijicided antigenic.eaccion entiqeno-enticuerpo. los cuales por si mismos no poseen sino poco 0 ninqun efecto biol6gico y t6xieo. HI enticuerpo es dioelenie pero el antigeno puede set multivelente. esta determinada por la secuencia especifica de los aminoacidos en sus cadenas polipepttdicas (cap. engendradas de este modo pueden combinarse con el antiqeno que indujo su formaci6n y constituir un complejo antigeno~anticuerpo. esten constituidas por los mismos 20 aminoacidos.

la vaca. reaccionan al maximo con hemoglobina de caballo pero son mucho menos activas con hemoglobinas de otros vertebrados. O. aunque los anticuerpos formados por el conejo frente a la hemoglobina de caballo reaccionaran mejor con hemoglobina de caballo. * Datos de W. no obstante. Las proteinas homoloqas de especies estrechamente relacionadas tienen una identidad mas aproximada que las de especies muy distintas (tabla 3A). con mucho. Las diferencias estructurales que existen entre las proteinas homolog as de las diferentes especies. formado frente a albumina de huevo de gallina. que fueron reveladas en un principio por la reaccion antiqeno-anticuerpo. frente a seroalbumina bovina. mientras que las hemoglobinas de roedores. 88: 9 (1962). tarnbien 10 haran con las hemoqlobinas de aquellas especies mas estrechamente relacionadas con el caballo. como la hemoglobina humana. menos reactivas. cuatro anillos porfirinicos y cuatro cadenas peptidicas. Reaccionabilidad de las seroalbuminas de diferentes especies con anticuerpo de conejo.* Especie Vaca Oveja Cerdo Gato Caballo Humana Hamster Rata perro Raton Reaccionabilidad en el ensayo de la precipitine (100) 76 32 25 16 15 15 14 14 9 [. a partir de solamente 20 aminoacidos distintos? Es posible contestar a esta pregunta par- 69 . 0 si es modificado quimicamente. ASi. Asi. Isomeria secuencial en las cadenas polipeptidicas En paqinas anteriores calculabamos que el mimero total de clases diferentes de proteinas en todas las especies de orqanismos vivos es del orden de 1010 a 1012• LPuede construirse este enorme numero de proteinas diferentes. pero no con proteinas no relacionadas. 115). Aunque las hemoglobinas de los diferentes mamiferos poseen la misma fun cion y aproximadamente el mismo peso molecular. Tal anticuerpo es especifico para la estructura tridimensional de la albumin a de huevo de gallina. de modo que si este ultimo es calentado 0 desnaturalizado para desplegar sus cadenas polipeptidicas. tales como las hemoglobinas de distintas especies de vertebrados. se combinara con la ultima. tanto mas sernejantes son las secuencias aminoacidas de sus proteinas homoloqas (pag. antlqenoanticuerpo al estudio de divers as proteinas de diferentes especies de organismos ha permitido obtener cierto numero de conclusiones importantes. es que las proteinas homologas de especies diferentes no son identicas inmunologicamente.. Son proteinas homoloqas aquellas que poseen funciones similares. cada una con su secuencia aminoacida propia. los anticuerpos formados precipitaran la hemoglobina de caballo. altamente especifica. Una tercera conclusion consiste en que la especificidad como anticuerpo refleja relaciones filoqeneticas. son moleculas inmunoloqicamente distintas. el cerdoy otros ungu~ Iados. La segunda conclusion principial. Immunol.Capitulo 3 Las proteines y sus [unciones biol6gicas: perspective TABLA 3-4. pero no de cualquier otra proteina del caballo. Los anticuerpos producidos por el conejo despues de la inmunizacion con hemoglobina de caballo. con implicaciones biologicas de largo alcance. La aplicacion de la reaccion. por ejemplo. tales como la cebra. Cuanto mas estrechamente relacionadas se hallen dos especies de organismos. pajaros y anfibios seran. y asi todas contienen cuatro atom os de hierro. La primera es que proteinas Iuncionalmente diferentes de una misma especie conducen a la formacion de anticuerpos diferentes. Weigle. cuando un conejo se inmuniza frente a hemoqlobina de caballo. por ejemplo. son resultado de diferencias entre sus secuencias aminoacidas (capitulo 5). el anticuerpo ya no se combinara con el.

. A~B y B~A. el numero de ordenaciones secuenciales posibles es de 20!. asi los 20 aminoacidos diferentes pueden utilizarse para construir un numero casi ilimitado de proteinas distintas. 20 X 19 X 18 X 17 X 16 X . En un tripeptide que contenga tres aminoacidos diferentes. y en la evolucion de las moleculas proteicas. A y B. 4! = 4 X 3 X 2 X 1 = 24 secuencias diferentes posibles. son posibles dos isomeros secuenciales. dificilmente podriamos discutir las proteinas y sus actividades bioloqicas sin poseer al menos un conocimiento rudimentario de la naturaleza de la relacion molecular entre genes y pro~ teinas. de acuerdo con el axioma central de la genetica molecular. Esta informacion instruye a cada celula para producir un conjunto caracteristico de proteinas. especificando una cadena polipeptidica completa se llama cistr6n 0 gen. Cada aminoacido se halla codificado por tres restos nucleotidicos sucesivos en el DNA. Codificaci6n qenetica de las proteinas de las secuencias aminoacidas Debido a que la estructura y funcion de las proteinas son en ultimo termino un reflejo "de su secuencia aminoacida. que es la macrornolecula informativa de los cromosomas. los 70 . y cada uno de los aminoacidos aparece una sola vez. es decir. En un dipeptide que contenga unicamente dos aminoacidos diferentes. A~C~B. B~A~C. St consideramos ahora una proteina de peso molecular 23 000 que contenga 12 aminoacidos diferentes en mimeros iguales. La. a saber. con junto que se llama triplete codificador. en la que n es el numero de objetos diferentes. viene dada por la expresion n! [factorial de n}. lladamente en la parte 4. informacion genetica esta contenida en el acido desoxirribonucleico (DNA). que se describiran mucho mas deta-. Sin embargo. La secuencie aminoacida de la cadena polipeptidica de cada tipo de proteina es la que resulta especificada 0 codificada en ultimo termino por la secuencia de restos nucleotidicos en el acido desoxirribonucleico (DNA). B~C~A CA~B y C~B~A. constituyen los objetivos principales de la bioquimica contemporanea. es decir: la informacion genetica circula en la direccion DNA ~ RNA ~ ~ proteina. Descifrar las secuencias aminoacidas de diferentes proteinas y relacionarlas con las propiedades y funciones de la proteina y con la Iiloqenetica del orqanismo.. En la teoria de las permutaciones. son posibles seis ordenaciones distintas de la secuencia de los tres aminoacidos: A~B~C. proporcionan una vision penetrante en la bioquimica comparativa de las proteinas en las diferentes especies.. El segmento de una molecula de DNA. la expresion general para el numero de posibles ordenaciones secuenciales de objetos diferentes. se ha calculado que son posibles unos 10300 isomeros secuenciales. en el que cada uno de los aminoacidos aparece una sola vez.PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS tiendo solo de consideraciones matematicas. Lo mismo que el alfabeto inqles de 26 letras puedeser ernpleado para confeccionar un numero enormemente grande de palabras escritas. Estas relaciones. Para un polipeptido de 20 aminoacidos diferentes. la cual asciende a la sobrecogedora cifra de 2 X 1018• Pero se trata solamente de una pequefia cadena polipeptidica (peso molecular ~ 2600). Para un tetrapeptide que posea cuatro aminoacidos diferentes.

resulta alterada o se cambia. estan constituidas por un conjunto basico de 20 arninoacidos. os tripletes de las unidades nucleotidices n el DNA detetminen la secuencia de as eminoecidos en las proteines or formaci6n intermedin de RNA. en tanto que las protein as conjugadas contienen un metal 0 un grupo prostetico orqanico. Los tripletes codificadores del mRNA. independientemente de la funci6n que desernpefian 0 de la especie de origen. G. en el RNA complementario y en la secuencia aminoacida de la cadena polipeptidica resultante aparece esquematicamente en la figura 3~7. cuya secuencia nucleotidica es complementaria con la del DNA del gen. DNA. IIGURA y sus [unciones biol6gicas: perspective Cadena polipeptidica mRNA DNA Amino Extremo 3' Extremo 5' terminal G C A I C I G U Arginina I genes permanecen en los cromosomas normalmente y no actuan directamente como matrices de codificacion durante la biosintesis de las proteinas. por ejemplo. I. la cual a su vez codifies una cadena polipeptidica alterada. Son insolubles y c C T A T I G G A U A C A C U U U U I I Glicocola I I G T I Tirosma Treonina I I G A A A A I I I Fenilalanina I G G c I I G C C I I Alanina I I I A A c I G U U U C U Valin a A I G A Serina Carboxilo terminal I I Extremo 5' Extremo 3' I 71 . puede revelar cuales son los restos aminoacidos de una cadena polipeptidica que son esenciales para la estructura y la Iuncion de una proteina (caps. C. el ual posee tripletes nucleotidicos (codones) omplementarios con los del DNA. unidos entre si covalentemente por enlaces peptidicos. a veces puede verificarse la inserci6n de un nucleotide nuevo. 0 codones. podemos ahora proceder a examinar la estructura de las proteinas mas detalladamente. Resumen Las protein as se hallan constituidas por una 0 varias cadenas polipeptidicas. es decir. Todas las proteinas. En una cadena polipeptidica anormal pueden resultar sustituidos uno 0 varios aminoacidos de su secuencia especifica por otros. para ernpezar.es letras simbolizan las diierentes bases omponentes de los restos nucleotidicos en 1 DNA y en el RNA. radiactividad 0 acci6n de algunos agentes quirnicos. la cual tiene lugar en los ribosomas. cada una de las cuales posee muchos restos e-aminoactdos. ya que.Capitulo 3 Las ptoteines 3-7 :olinealidad de las secuencies nucleotidicas 'el DNA y el mRNA y secuencie minoecide de las cadenas polipeptidices. Como resultado la secuencia continua normalo sin coma de los tripletes codificadores del RNA resulta alterada y produce una alteracion correspondiente en la secuencia nucleotidica del mRNA. La secuencia de los tripletes codificadores en el DNA se corresponde de un modo lineal 0 secuencial. A. que son complementarios de los del DNA. poseen cadenas peptidicas paralelas y relativarnente extendidas. Mutaciones A veces un gen especifica a unaproteina determinada. Las proteinas simples producen por hidrolisis solamente a-aminoacidos. Las proteinas fibrosas aparecen en forma de cilindros 0 de laminas. guanina. actuan como matriz inmediata y proporcionan la informacion genetica que especifica la secuencia de los aminoacidos durante la biosintesis de proteina en los ribosomas. citosina. La relaci6n codificadora entre la secuencia de los nucleotidos en el. gra~ cias a la actuaci6n intermedia del RNA como matriz. urscilo. rayos X. y por consiguiente puede resultar defectuosa para efectuar su fun cion bioloqica. es colineal con la secuencia aminoacida de la cadena polipeptidica a la cual codifica. ordenados en divers as secuencias especiflcas. 6 y 8). " timina. el mensaje genetico del gen se trans mite primero enzimaticamente para formar un tipo especifico de acido ribonucleico llamado RNA mensajero (mRNA). Con este esbozo sobre la estructura y la biologia de las proteinas como orientacion. . experimenta un cambia quimico como resultado de una acci6n fisica. Sus pesos moleculares varian desde alrededor de 5000 hasta 1 000000 6 mas. Las proteinas se clasifican de acuerdo con su conformaci6n tridimensional. adenina. En su lugar. de modo que una de las tres bases de un triplete codificador para un resto aminoacido. EI estudio experimental de las proteinas alteradas mutacionalmente es de gran importancia.

C. R. WOOD. WATSON. California. Inc . 1973. En ultimo terrnino. 72 . W. Las proteinas globulares poseen cadenas polipeptidicas con plegamiento compacto. NEURATH. B. 2. es decir.PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS actuan como elementos estructurales. a sustancias extrafias a las especies. Texto elemental que proporciona una vision excelente de la respuesta inmune y de la biologia de la reaccion antiqenoanticuerpo. que contienen dos 0 mas cadenas polipeptidicas. Academic Press. H.• vols. H.: The Proteins. N.: Principles of Microbiology and Immunology. D. Y W.: The Molecular Biology of the Gene. La estructura secundaria es la constituida por la ordenacion extend ida 0 helicoidal de las cadenas polipeptidicas a 10 largo de un eje simple y prolong ado como en las proteinas fibrosas. Menlo Park. la desnaturalizaclon es totalmente reversible.. y tambien actuan como hormonas y como elementos de proteccion. Descripcicn elemental del fundamento qenetico de la sintesis de proteinas.' ed. 3. 1-4. formados por los vertebrados en respuesta a los antiqenos. y su forma es esferica 0 globular y desempefian funciones dinamicas. EI segmento de DNA que codifica una cadena polipeptidica recibe el nombre de gen. como reserva de elementos nutritivos y como vehiculos de transporte. La estructura terciaria se refiere al modo mediante el cual las cadenas polipeptidicas se pliegan para formar proteinas globulares. es complementario de la secuencia nucleotidica en el DNA.• Nueva York." ed. Libros DAVIS. B. J. Benjamin. La desnaturallzacion determina que las proteinas pierdan su actividad biolagica. Las proteinas se desnaturalizan 0 despliegan sin que se rompa el enlace peptidico de su cadena fundamental por accion de valores de pH 0 de temperatura extremes. 1975. 1963-66. Bibliografia Al final de los capitulos 4 a 9 se da bibliografia de aspectos mas especiHcos de la bloquimica de las protein as. Amplia y autorizada monografia sobre las protein as. en ciertos casos. D. GINSBERG. DULBECCO. En las proteinas oliqomericas. Las proteinas desempefian gran diversidad' de funciones: actuan como catalizadores. Los estudios de especifictdad antiqeno-antlcuerpo han conducido a la conclusion de que las proteinas homolog as de especies diferentes son especiftcas de la especie. como elementos estructurales. Nueva York. el termino «estructura cuaternaria» se refiere a la manera con que las cadenas individuales pollpeptidicas se agrupan conjuntamente. H. 0 de otros agentes. a su vez. En esta ultima categoria se hall an las inmunoglobulinas 0 anticuerpos. A. La secuencia aminoacida de una protein a queda especlficada durante su biosintesis por una secuencia colineal de tripletes consecutivos de mononucleotidos en la molecula del RNA. en los sistemas contractiles. La estructura primaria de una protein a es su secuencia aminoaclda especifica. que. la secuencia aminoacida es la que determina la conformacion tridimensional de las moleculas de proteina.• Harper & Row. JR. EISEN.