BIOSNTESIS DE AMINOCIDOS, NUCLETIDOS Y MOLCULAS RELACIONADAS

1. Metabolismo del nitrgeno: a. Describa el ciclo del nitrgeno: el aire est formado en 4/5 partes por N 2, pero pocas especies lo pueden convertir a formas utilizables para otros organismos. El primer paso del ciclo del nitrgeno consiste en la fijacin o reduccin del nitrgeno atmosfrico por parte de bacterias fijadoras de nitrgeno para proporcionar amonio o amonaco. Algunas bacterias utilizan el NH4+ y lo convierten en NO2- o bien NO3mediante un proceso de nitrificacin. El NH4+ formado es incorporado a las plantas y luego ingerido por los animales. El grupo de bacterias encargadas del ciclo del nitrgeno mediante oxidacin anaerobia son denominadas anamox b. Por qu es crucial para el mantenimiento de la vida en el planeta el uso cuidadoso del nitrgeno? Porque las rutas biosintticas de los aminocidos y los nucletidos necesitan nitrgeno. Adems los compuestos solubles de nitrgeno se escasean rpidamente en el entorno natural. c. Qu biomolculas utilizan nitrgeno para ensamblarse? Aminocidos, nucletidos, protenas. d. Cmo se llama el complejo que fija nitrgeno? el complejo de la nitrogenasa En qu organismos se encuentra dicho complejo? Algunas bacterias y arqueobacterias (cianobacterias, Azobacter). e. Cmo se incorpora el amonio en las biomleculas de mamferos? los animales utilizan a las plantas como fuente de aminocidos, tanto esenciales como no esenciales para fabricar sus protenas; previamente las plantas haban incorporado el amonaco a los aminocidos. f. Explique el papel del glutamato y glutamina, as como indique cules son las enzimas principales en el proceso: el glutamato y la glutamina son los dos aminocidos que determinan la entrada de NH4+ en las biomolculas. El NH4+ se incorpora al glutamato mediante la glutamina sintetasa que cataliza la reaccin del glutamato y el NH4+ para dar glutamina. En bacterias y en plantas el glutamato se produce a travs de la glutamina en una reaccin catalizada por la glutamato sintasa. g. Explique por qu la glutamina sintasa es el punto primario de regulacin en el metabolismo del nitrgeno. Qu aminocidos de los reguladores de esta enzima sirven como indicadores del status general del metabolismo de aminocidos en la clula? porque es el punto de entrada del nitrgeno reducido en todos los organismos. Est regulado alostricamente y por modificacin covalente al mismo tiempo. La alanina, glicina y seis productos finales del metabolismo de la glutamina son inhibidores alostricos del enzima. 2. Biosintesis de Aminoacidos: a. Indique cules son los precursores metablicos de los aminocidos, ordenndolos en familias. Todos los aminocidos proceden de intermediarios de la gluclisis, del ciclo del pacido ctrico o de la ruta de las pentosas fosfato. Familias biosintticas de aa segn sus precursores metablicos Alfa Cetoglutarato Piruvato Glutamato Alanina Glutamina Valina Prolina Leucina Arginina Isoleucina 3-Fosfoglicerato Fosfoenolpiruvato y eritrosa fosfato

4-

Serina Glicina Cistena Oxalacetato Aspartato Asparagina Metionina Treonina Lisina

Triptfano Fenilalanina Tirosina Ribosa 5 fosfato Histidina

b. Explique cmo entra el nitrgeno a las vas de sntesis de aminocidos.

Cules son los intermediarios portadores del nitrgeno? El nitrgeno entra en estas vas a travs del Glutamato y la Glutamina.

c. Cul es el origen del intermediario 5-fosforibosil-1-pirofosfato (PRPP)?

Cul cree usted que es su papel en la sntesis de aminocidos y nucletidos? Se sintetiza a partir de la ribosa-5-fosfato, procedente de la ruta de las pentosas fosfato en una reaccin catalizada por la ribosa fosfato pirofosfoquinasa. d. Explique cul es el papel del corismato en la sntesis de triptfano, fenilalanina y tirosina. El corismato es el primer punto de ramificacin de la va, con una rama que conduce al triptfano y otra a la fenilalanina y a la tirosina. En la rama del triptfano, el corismato se convierte en antranilato que se condensa con el PRPP. Para la fenilalanina y la tirosina el intermediario comn es el prefenato con la transaminacin con glutamato. e. Qu aminocido comparte su va biosinttica y produce intermediarios para la sntesis de purinas? Cmo se llama dicho intermediario? La glicina es el precursor importante de las purinas. Y el primer intermediario con un anillo purnico completo es el inosinato (IMP). f. Explique cules son los dos mecanismos de regulacin en la biosntesis de aminocidos. La regulacin alostrica en la sntesis de aminocidos ocurre por retroalimentacin negativa en dos procesos: inhibicin concertada, en donde el producto final de una va inhibe el primer enzima de otra va o retroinhibicin secuencial, en donde el producto final de la va inhibe su propia sntesis en varios de los pasos. 3. Molculas derivadas de aminocidos: a. Mencione al menos 9 molculas, diferentes de protenas, derivadas de aminocidos. porfirinas, fosfocreatina, glutatin, lignina, auxina, taninos, alcaloides, morfinas, dopaminas, adrenalina, noradrenalina, serotonina, histamina, espermina, espermidina. b. Explique el papel de la glicina como precursor de porfirinas. En eucariotas el precursor principal de las porfirinas es la glicina, que reacciona con el succinil CoA en el primer paso de la va para dar -amino-- cetoadipato, se descarboxila para dar - aminolevulinato, dos molculas de este compuesto se condensan para formar porfobilingeno, que forma protoporfirina a travs de una serie de reacciones enzimticas. c. Cmo se producen los pigmentos biliares? La ferroporfirina de la hemoglobina es liberada en el bazo por los eritrocitos muertos. En el primer paso de la ruta el grupo hemo se convierte en biliverdina por la accin de la hemo oxigenasa. Esta se convierte en bilirrubina por la biliverdina reductasa. La bilirrubina viaja por el torrente sanguneo con la albmina srica y en el hgado se transforma en el pigmento

biliar bilirrubina diglucurnido, el cual es soluble y da lugar a la formacin de otros pigmentos. d. Cules son los precursores de fosfocreatina y creatina? Glicina, arginina y la metionina es el dador del grupo metilo. e. Qu son las aminas biolgicas? Indique el nombre de los neurotransmisores que se derivan de aminocidos tirosina, glutamato, histidina, triptfano y metionina. Las aminas biolgicas son neurotransmisores importantes que se forman a partir de aminocidos mediante rutas sencillas, como por ejemplo la descarboxilacin de aminocidos. - Aminocidos y neutrotransmisores que derivan: Tirosina: familia de catecolaminas como, dopamina, noradrenalina y adrenalina Glutamato: - aminobutirato (GABA) Histidina: histamina Triptfano: serotonina Metionina: espermina y espermidina f. Cul aminocido es el precursor del xido ntrico? Cules son las funciones de este compuesto? Aminocido precursor: arginina.

Funciones: importante mensajero biolgico g. Elabore un cuadro de neurotransmisores, donde incluya precursor, el neurotransmisor y las funciones ms importantes, e incluya enfermedades
precursor tirosina glutamato histidina neurotransmisor dopamina - aminobutirato histamina funciones Relacionadas con los cambios de presin sanguinea inhibidor Potente vasodilatador, respuesta alrgica, estimula secrecin acida del estomago Empaquetamiento de ADN Enfermedades insuficiencia Parkinson, sobreproduccin esquizofrenia Epilepsia por da

Metionina, ornitina

espermina espermidina

que pueden originarse de su insuficiencia 4. Biosntesis y degradacin de nucletidos: a. Mencione las diferentes funciones que tienen los nucletidos en el cuerpo humano. Tienen una amplia variedad de funciones, son precursores del ADN y del ARN, ATP y GTP principales trasportadores de la energa qumica, componentes de los cofactores NAD, FAD, S-adenosilmetionina y Coenzima A, as como de intermediarios biosintticos activados como UDP-glucosa y CDP-diacilglicerol. Algunos nucletidos como el cAMP y el cGMP actan como segundos mensajeros celulares. b. Cules son las dos vas que permiten la obtencin de nucletidos? Las rutas de Novo y las rutas de recuperacin. c. Cules son los precursores elementales en las vas biosintticas de nucletidos? Aminocidos, ribosa 5-fosfato , CO2 y NH3 d. En qu consisten las vas de reciclaje de los nucletidos? En reciclar las bases libres y los nucletidos liberados de la degradacin de los cidos nucleicos. e. Qu funcin tiene el orotato en la formacin de pirimidinas? El anillo de pirimidina se sintetiza como OROTATO unido a ribosa fosfato y a continuacin se convierte en los nucletidos de pirimidina comunes que se usan para la sntesis de los cidos nucleicos.

f. Cules son los precursores comunes en las vas biosintticas (sntesis de novo) de purinas y pirimidinas? Cul es su contribucin estructural? Los precursores comunes son: foforribosil pirofosfato (PRPP), que mantiene la estructura de la ribosa en el nucletido sintetizado. En cada va un aminocido es un precursor importante: la glicina para las purinas y el aspartato para las piridiminas. Glutamina fuente importante de grupos amino. Aspartato se utiliza dos veces como fuente de grupo amino en las rutas de las purinas. g. Explique cul es la funcin del folato (en forma de tetrahidrofolato o formiltetrahidrofolato) en la biosntesis de nucletidos y cidos nucleicos Dador de grupos monocarbonados, en los pasos 3 y 10 de la sntesis de novo de nucletidos de purina, la forma formiltetrahidrofolato dona el grupo formilo liberando tetrahidrofolato. h. Qu es el inosinato y cul es su funcin?

i.

Cul es la funcin del aspartato en la sntesis de AMP?

j.

Cul es la funcin de Gln en la formacin de GMP?

k. Cmo funciona la inhibicin por retroalimentacin en la biosntesis de purinas? Y de pirimidinas?

l. Qu papel juegan el aspartato, el PRPP y el carbamil fosfato en la sntesis de pirimidinas? De dnde proviene el carbamil fosfato?

m.

Explique qu productos finales se producen de la degradacin de purinas y de las pirimidinas. En la degradacin de purinas se produce: - Adenilatoadenosinainosina por la adenosina desaminasa - Inosina se hidrolizahipoxantina y D-ribosa - Hipoxantina se oxidaxantina y acido urico por la xantina oxidasa El catabolismo del GMP produce acido urico como producto final. GMP hidrolizaguanosina, la cual se descompone guanina libre, que la hidrolisis de su grupo amino xantinaacido urico por la xantina oxidasa. n. Explique el defecto gentico que da origen a defectos serios en el sistema immune por falta de desarrollo apropiado de linfocitos T y B. Se denomina deficiencia de adenosina desaminasa (ADA), que causa una elevacin de niveles de dATP que provoca un dficit general de otros dNTP en los linfocitos T. Las personas con esta enfermedad carecen de un sistema inmunitario eficiente. o. Explique brevemente como se reciclan las purinas y pirimidinas por medio de las vas de recuperacin. Cul es su importancia? Qu informacin acerca de la importancia de estas vas provee el sndrome de Lesch Nyhan? - la reaccin por la adenosina fosforribosiltransferasa es uno de los primeros pasos por los que se recuperan las bases puricas y pirimidinas, la cual consiste en que la adenina libre + PRPPrespectivo nucletido de adenina. - Otra reaccin que se da es por la hipoxantina-guanina-fosforribosiltransferasa, en la cual la desaminacion de adenina guanina libre + hipoxantina libre. Estas rutas son importantes debido a que se pueden sintetizar de nuevo nucletidos por la presencia de bases puricas y pirimidinicas libres a causa de la degradacin de nucletidos. Una carencia en la enzima que cataliza la segunda reaccin descrita provoca el sndrome de Lesch-Nyhan, que es una enfermedad gentica que se da mayormente en nios varones y causa retraso mental, mala coordinacin, tendencias compulsivas autodestructivas. p. A qu se le llama gota? Mencione el tratamiento de eleccin. La gota es una enfermedad de las articulaciones, causada por una concentracin elevada de acido urico en la sangre y en los tejidos. Se caracteriza por una inflamacin en las articulaciones, desarrollo de artritis debido a una deposicin anormal de cristales de urato sdico. Esta enfermedad se puede tratar con alopurinol, que es un inhibidor de la xantina oxidasa (cataliza purinaacido urico), y es sustrato de la xantina oxidasa, que convierte el alopurinol en oxipurinol (aloxantina).

q.

Mencione sobre qu enzima actan los siguientes agentes quimioteraputicos: azaserina, acivicina, fluorouracil, metrotexato, aminopterina. Por qu se usan en el tratamiento del cncer? - la azaserina y la acivicina son anlogos de la glutamina, las cuales inhibien la glutamina amidotransferasa. La azaserina actua a travs de un mecanismo enzimtico y la acivicina es un buen agente quimioteraputico anticancergeno. - El fluorouracilo es un inhibidor enzimtico que actua sobre la timidilato sintasa. - El metotrexato anlogo del folato es un inhibidor que actua sobre la dihidrofolato reductasa. - La aminopterina actua de forma similar que el metotrexato. r. Mecanismo de accin del antibitico trimethoprim. El trimetoprim es un antibitico que se une mas eficientemente y rpido a la dihidrofolato reductasa bacteriana que a la de los mamferos, y se utiliza para tratar infecciones urinarias y del odo medio.