B i o i n f o r ma t i c s Ne e d s A s s e s s me n t a n dS u p p o r t f o r C l i n i c a l a n dT r a n s l a t i o n a l S c i e n c e R e s e a r c h

R o l a n d oGa r c i a Mi l i a n, Ha n n a hF . No r t o n, Mi c h e l e R . T e n n a n t, J e n n i f e r A . L y o n, C e c i l i a E . B o t e r o
1 1 1 , 2 1 1

1 He a l t hS c i e n c e C e n t e r L i b r a r i e s , U n i v e r s i t yo f F l o r i d a 2 U n i v e r s i t yo f F l o r i d a Ge n e t i c s I n s t i t u t e

I NT R ODU C T I ON

R E S U L T S DE MOGR A P HI C S T R A I NI NG

T r a n s l a t i o n a l b i o i n f o r ma t i c s i s r a p i d l yd e v e l o p i n g wi t ht h e e n h a n c e me n t a n ds p e c i a l i z a t i o no f e x i s t i n g a n dn e wb i o i n f o r ma t i c s t o o l s a n dt e c h n i q u e s . T h e u s e o f t h e s e r e s o u r c e s a l l o ws mo r e e c i e n t mi n i n ga n d a n a l y s i s o f t h e d i v e r s e r a wb i o l o g i c a l d a t a s t o r e di n d a t a b a s e s a n dr e p o s i t o r i e s , t h u s a c c e l e r a t i n gt h e t r a n s l a t i o no f b e n c hs c i e n c e r e s u l t s i n t oi n t e r v e n t i o n s a t t h e b e d s i d e . I no r d e r t od e t e r mi n e t h e b i o i n f o r ma t i c s s u p p o r t n e e d s , i nt e r ms o f r e s o u r c e s / t o o l s , a n dt r a i n i n g , o f r e s e a r c h e r s a l i a t e d wi t ht h e U n i v e r s i t yo f F l o r i d a C l i n i c a l a n d T r a n s l a t i o n a l S c i e n c e I n s t i t u t e ( U F C T S I ) , l i b r a r i a n s a t t h e He a l t hS c i e n c e C e n t e r L i b r a r y( HS C L ) d e v e l o p e da mu l t i mo d a l n e e d s a s s e s s me n t .

Ot h e r s i n c l u d e d : s o me o n e t oc a l l wh e ns t u c k , a n di nc l a s s r o o ma t t h e C o l l e g e o f V e t e r i n a r y Me d i c i n e

Ot h e r s i n c l u d e d : Me t a b o l o mi c s d a t a mi n i n g , T a r g i t , Ma p I T , d a t a b a s e s e a r c h i n g ; p o p u l a t i o ns t a t i s t i c s , i n d i v i d u a l p a t i e n t l e v e l d a t a , S A S , E S R I , A R C , a n dGI S .

Ot h e r s i n c l u d e d : NMR' o mi c s , A R C , a n dGI S

S U MMA R YOFC ONC L U S I ONS ME T HODS

On l i n e A s s e s s me n t o f 1 4 q u e s t i o n s . De v e l o p e di nc o l l a b o r a t i o nwi t hDr . Da v i dL . Os t e r b u r , C o u n t wa yL i b r a r yo f Me d i c i n e , Ha r v a r d Me d i c a l S c h o o l , a n dDr . Wi l l i a m G. F a r me r i e , A s s i s t a n t Di r e c t o r o f I n t e r d i s c i p l i n a r yC e n t e r f o r B i o t e c h n o l o g yR e s e a r c h , U n i v e r s i t yo f F l o r i d a . S e n t t oo v e r 8 0 0 i n v e s t i g a t o r s a l i a t e dwi t hU F s C l i n i c a l a n dT r a n s l a t i o n a l S c i e n c e I n s t i t u t e ( C T S I ) .

Ot h e r s i n c l u d e d : Nu t r i t i o nMe d i c i n e , C l i n i c a l E p i d e mi o l o g ya n dHe a l t hS e r v i c e s R e s e a r c h , P h y s i o l o g y , S o c i a l S c i e n c e s , P a i nR e s e a r c h , P a t h o p h y s i o l o g y , He a l t hOu t c o me s R e s e a r c h , I mmu n o l o g y , P r o t o c o l De v e l o p me n t , E v o l u t i o n a r y B i o l o g y , P h e n o t y p i n g , E p i d e mi o l o g y , P o p u l a t i o n He a l t h , a n dHe a l t hE q u i t y .

T h i s s t u d yn o t o n l yi d e n t i e s U F C T S I r e s e a r c h e r s n e e d s i nt e r ms o f b i o i n f o r ma t i c s s u p p o r t ( e . g . c o mme r c i a l s o f t wa r e l i c e n s i n g ) b u t a l s o p r o v i d e s t h e b a s i s f o r r a t i o n a l d e s i g no f l e a r n i n gs t r a t e g i e s . Ne x t s t e p s i n c l u d e : p e r f o r mi n gi n t e r v i e ws a n df o c u s e dd i s c u s s i o n s wi t h r e s e a r c h e r s r e g a r d i n gb i o i n f o r ma t i c s i n f o r ma t i o nn e e d s , f o l l o we db y t h e u t i l i z a t i o no f t h o s e r e s u l t s t od e v e l o pmo r e e e c t i v e t r a i n i n g c o u r s e s . AF a c u l t yE n h a n c e me n t Op p o r t u n i t yp r o j e c t h a s b e e n f u n d e d , f a c i l i t a t i n ga d v a n c e dt r a i n i n gi nt h e u s e o f b i o i n f o r ma t i c s t o o l s b e y o n dNC B I ( e . g . I P A , Ge n e Go , P a r t e kGe n o mi c s S u i t e , C L CMa i n Wo r k b e n c h ) f o r t h e HS C Ll i b r a r i a n s . A C K NOWL E DGE ME NT T h i s p r o j e c t h a s b e e nf u n d e di np a r t wi t hf e d e r a l f u n d s f r o mt h e Na t i o n a l L i b r a r yo f Me d i c i n e , Na t i o n a l I n s t i t u t e s o f He a l t h , u n d e r C o n t r a c t # HHS N2 7 6 2 0 1 1 0 0 0 0 4 C .