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EXPRESION GENETICA: SINTESIS DE RNA Y DE PROTEINAS

EL DOGMA CENTRAL El primer paso en la sntesis de protenas, es la sntesis de una molcula de RNA, especifica para cada gen, usando para ello como molde un segmento de una de las dos cadenas del DNA y posteriormente esta molcula RNA es traducida para formar protenas; a esto se le conoce como Dogma Central.

El dogma central indica el flujo de la informacin gentica, a partir de la informacin localizada en estas molculas de doble hlice, esto mediante dos mecanismos: la trascripcin ( sntesis de molculas de RNA usando genes de DNA como molde) y la traduccin (sntesis de protenas a travs de la lectura del RNA mensajero).

Tipos de RNA
Existen tres clases de RNA que estn directamente relacionados con la produccin de protenas. 1. RNA mensajero; estos llevan una copia del mensaje codificado que ser traducido a protena 2. RNA de transferencia: son usadas para proveer de los aminocidos correspondientes a cada uno de los codones contenidos en el RNAm. 3. RNA ribosomal: los cuales constituyen el aparato de la polimerizacin de aminocidos hacia la produccin de una cadena polipeptdica.

El papel de cada uno de estos tipos es diferente. El RNAm posee una cada triple de nucletidos dentro de la regin codificante cada regin codifica a un aminocido correspondiente a una protena codificada. La estructura del RNAt es solo reconocido por una enzima la cual es encargada de llevar a cabo la unin de este con un aminocido especfico para producir el amoniacil-RNAt, el cual es la estructura acarreadora que es usada para la sntesis de aminocidos y controla el apareamiento o complementariedad de las pares de bases. El RNAr juega el papel estructural de la molcula de RNA proveyendo del marco de trabajo con el que la protenas ribosomales forman un complejo ribonucleoproteico. TRANSCRIPCION Es un proceso enzimtico mediado por la enzima RNA polimerasa que siempre ocurre, al igual que la replicacin del DNA, en direccin 5 a 3, y normalmente solo una de las dos cadenas del DNA se transcribe en una de RNA.

La trascripcin involucra la sntesis de una cadena de RNA representando una cadena del DNA dplex, esta cadena tiene por caracterstica que es idntica en secuencia con una de las cadenas del DNA, la cual se llama cadena codificante. La cadena de RNA complementaria con la cadena del DNA sirve como molde para su sntesis se le conoce como cadena templado. La transcripcin comienza cuando la RNA polimerasa se une con el promotor, el cual se encuentra cercano al punto de inicio, a partir del cual la RNA

polimerasa se mueve a lo largo del templado, sintetizando el RNA, hasta localizarse en una secuencia terminadora de la transcripcin llamada terminador. Las secuencias son convencionalmente

escritas de tal forma que la transcripcin procede en la direccin de izquierda a derecha, lo que conlleva a que la direccin de la cadena sea en direccin 5->3, las

posiciones de las base se enumeran a partir del punto inicial con el valor +1; los cuales se incrementan corriente abajo con valores positivos y corriente arriba con valores negativos. El producto inmediato de la transcripcin se llama transcrito primario, el cual deber contener un RNA extendido desde el promotor hasta el terminador. La transcripcin primario generalmente es inestable. La transcripcin es la primera etapa en la expresin gentica y la principal en que esta puede ser controlada. Existen protenas reguladoras, las cuales van a determinar cuando un gen en particular ser transcrito, para muchos genes es controlada a nivel gentico, aunque para muchos otros existen etapas subsecuentes que controlan los niveles de expresin. Proceso de la transcripcin. Este puede ser dividido en tres etapas; Iniciacin: el reconocimiento del templado comienza con la unin de la RNA polimerasa a la regin denominada promotor constituida por una cadena de DNA dplex para formar lo que se conoce como el complejo cerrado. Una vez ocurrido, las cadenas del DNA son separadas para dar lugar a la formacin de complejo abierto que constituye la disponibilidad de la cadena molde del DNA, para la interaccin por apareamiento de bases con los ribonucletidos, necesaria para la sntesis de RNA.L a enzima permanece anclada en la cadena mientras seta sintetiza una RNA de aproximadamente 9 nucletidos, esta fase

termina cuando la enzima procede a extender la cadena de RNA y se desplaza del promotor. Elongacin: durante la fase de elongacin la RNA polimerasa se mueve a lo largo del DNA y extiende el crecimiento de la cadena de RNA. Cuando la enzimas se desplaza, este va enrollado la hlice del DNA para exponer un nuevo segmento de

templado en cadena sencilla. En esta fase los nucletidos se unen de forma covalentemente y forman un hibrido RNA-DNA en la regin desenrollada. Pasando la regin de desenrollamiento el DNA nuevamente es enrollado para restablecer su estructura y la cadena de RNA emerge como una cadena sencilla. Esta fase involucra el movimiento dela burbuja de la trascripcin debido a la disrupcin de la estructura del DNA , en la cadena templado de la regin de desenrollamiento y es apareada con la cadena del RNA naciente en el punto de crecimiento Terminacin: esta involucra el reconocimiento de un punto en la regin en el que ya no es posible adicionar ms bases a la cadena de RNA. La secuencia o regin del DNA requerido para estas reacciones es definida como terminador. Para que la terminacin se lleve a cabo es necesario acabar con los enlaces fosfo-diester y el complejo de transcripcin se desintegrara cuando la ltima cadena de RNA es adicionada la burbuja de trascripcin colapsa y el hibrido RENA-DNA es desintegrado, entonces el DNA adquiere su estado dplex, la enzima y el RNA son liberados. RNA polimerasa bacteriana Solo un tipo de RNA polimerasa es el responsable de la sntesis de todo RNAm, RNAt y RNAr en una ebucateria. La enzima completa es tambin conocida como holoenzimas en E. coli tiene una masa molecular de aproximadamente 465kDa y esta constituida de subunidades proteicas, como se muestra en el dibujo de la derecha.

Las subunidades y son codificadas por los genes rpoB y rpoC, respectivamente, estas constituyen el centro cataltico, ya que el se entrecruzan el templado de DNA el producto de RNA y los ribonucletidos. La subunidad es requerida para el ensamblaje del ncleo de la enzima, As como para la afinidad por el promotor y la interaccin de la RNA polimerasa con algunos factores reguladores. La haloenzima puede ser separada en dos componentes, el ncleo de la enzima y el factor sigma. El factor sigma garantiza que la RNA polimerasa bacteriana se una de manera estable al DNA solo en la regin del promotor, este factor es liberado cuando la cadena de RNA contiene 8-9 bases, dejando al ncleo de la RNA polimerasa proseguir a la etapa de elongacin. Cuando el factor sigma se une al ncleo de la enzima introduce cambios estructurales que influyen en la afinidad de la RNA polimerasa por el DNA, reduciendo drsticamente la capacidad de unin a sitios del DNA La asociacin con el factor sigma cambia la iniciacin de la trascripcin Se puede describir los estados de la trascripcin en trminos de las interacciones entre las diferentes formas del RNA polimerasa y el templado de DNA. a) La holoenzima-promotor reacciona formando el complejo binario cerrado, por que el DNA permanece como cadena dplex. Debido a que es reversible y es usualmente descrito con una constante de equilibrio kB b) El complejo cerrado es convertido a un complejo abierto, por la separacin de una region corta del DNA donde ocurre la unin de la enzima, la conversin es irreversible, tal reaccin es descrita por la constante de proporcionalidad k2 y el factor sigma esta involucrado en la reaccin de la apertura del DNA. c) La siguiente estapa es la incorporacin de los dos primeros nucleotidos, donde un enlace fosfodiester es formado entre estos. Estos genera un complejo ternario que contiene RNA,DNA y la enzima. La formacin de este es descrito por una ki. por esto es posible adicionar ms nucletidos sin existir movimiento de la enzima para que pueda ir arriba de 9 bases. Despus de adicionada la probabilidad de que la enzima sea liberada

representa la iniciacin abortiva del RNA, esto usualmente ocurre para generar una serie de oligonucletidos muy cortos. d) Cuando la iniciacin sucede el factor sigma ya no es tan necesario y entonces la enzima realiza la transicin hacia la elongacin.

Cmo la RNA polimerasa encuentra las secuencias promotoras? Este fenmeno puede ser explicado en acuerdo a lo ocurrido en la difusin, en donde la RNA polimersa probablemenre se une al azar a sitios en el ADN cambindose entonces hacia otras secuencias. En primer instancia hay que tomar en cuenta que eiste un exceso de la RNA polimersa como complejo cerrados perdidos y en consecuencia hay muy pocas molculas libres.

La RNA polimersa encuentra promotores dentro del contexto del genoma, suponiendo que un promotor es reducido a aproximadamente 60pb como entonces esta distinguir esta pequea region de una tan grande como 4x106 pb que constituyen el genoma de E. coli.

Cmo el factor sigma controla la unin al DNA? El factor sigma favorece a la estabilizacin del complejo ternario en el sitio del promotor, dirigiendo la reaccin irreversible hacia la formacin de un complejo abierto. El factor sigma posee dominios que reconocen los promotores en el DNA. Como un polipeptido independiente, el este factor no se une al DNA, pero cuando forma la holoenzima forma un complejo fuerte de capacidad de unin

en donde si8gma contacta con el DNA en la region 5 al punto inicial de la trascripcin, un cambio en la conformacin del factor son las responsables de esta unin. La regin N terminal del factor sigma libre suprime la actividad de unin con el DNA, sin embrago cuando esta inhibicin es liberada ests es capaz de unirse especficamente a la secuencia del promotor.