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UNIVERSIDAD AUTÓNOMA CHAPINGO DEPARTAMENTO DE ENSEÑANZA, INVESTIGACIÓN Y SERVICIO EN AGROECOLOGÍA

I. IDENTIFICACIÓN CURRICULAR 1.1. Datos Generales Nombre de la Materia: Unidad Académica: Programa Educativo: Nivel Educativo: Línea Curricular: Carácter: Tipo: Prerrequisitos: Nombre del Profesor: Ciclo escolar: Año: Semestre: Horas Clase-Semana: Duración Total Modalidad Espacio Docente: Ecología Microbiana DEIS en Agroecología Ingeniería en Agroecología Licenciatura Medio Ambiente Obligatoria Teórica – Práctica Introducción a la Agroecología, Edafología y Fertilidad del Suelo, Ecología Básica, Procesos Fisiológicos MC Langen Corlay Chee 2008-2009 5º Segundo Teoría: 4 Práctica: 3 126 h Curso Aula, Laboratorio y Campo

1.2 Resumen Didáctico El curso se imparte a alumnos del 5º año de la carrera de Ingeniería en Agroecología y tiene como objetivo ofrecer las bases teóricas de la Ecología Microbiana y su aplicación en el aprovechamiento integral de los recursos sin deteriorarlos. Se relaciona verticalmente con asignaturas cursadas con anterioridad, como Química Inorgánica, Química Orgánica, Biología Celular, Bioquímica, Física, Introducción a la Agroecología, Edafología y Fertilidad del Suelo, Ecología Básica, Procesos Fisiológicos, Agrometeorología, Tecnologías Alternativas, etc.; en forma horizontal con Dinámica de Poblaciones, Manejo Agroecológico de Cultivos y Ecofisiología. También se relaciona verticalmente con Interacciones Ecológicas, Sistemas Agrosilvopastoriles, Recursos Genéticos, Manejo del Suelo y del Agua, Sistemas de Producción en Zonas Áridas y Sistemas de Producción de Zonas Tropicales, materias cursadas posteriormente. Adicionalmente se relaciona con las asignaturas optativas Manejo de Áreas Protegidas, Control Biológico, Evaluación de Proyectos Agropecuarios e Impacto Ambiental, Impacto Ecológico de la Agricultura y del Manejo del Agua, Policultivos, etc. Ecología Microbiana es una asignatura teórico-práctica, cuyas primeras dos terceras partes son de formación básica y la última, es integradora. Se desarrolla a través de clases programadas en aula, prácticas en laboratorio, invernadero y campo, acompañadas de trabajos de investigación, en la medida de lo posible, se utilizan métodos activos de enseñanza. Los materiales que requiere son: libros, artículos científicos, videos, memorias de eventos científicos, entre otros. La parte teórica se desarrolla en el aula y se imparte en dos sesiones con duración de 2 h a la semana. Empleando pizarrón, acetatos, diapositivas y videocintas, en forma de conferencia y seminario, se exponen y analizan aspectos relacionados con la Ecología Microbiana. La parte práctica se imparte en 3 h a la semana en el laboratorio “Alfredo Echegaray Alemán”, invernadero y campo, donde –con la supervisión del profesor- se experimentan diversas técnicas para la identificación macro y microscópica, así como el cultivo de los microorganismos presentes en diferentes agroecosistemas; además se evalúa su efecto en cultivos agrícolas con los que establecen simbiosis mutualísticas y su aplicación como indicadores de inocuidad. La temática de los trabajos de investigación a desarrollar y exponer por los estudiantes en un seminario, es definida en función de los intereses propios de los educandos. El nivel de aprovechamiento de conocimientos y adquisición de habilidades, se evalúa mediante tres exámenes parciales, un examen global, reportes de prácticas, así como de la exposición oral y escrita del trabajo de investigación. Por su carácter integrador, el curso reviste importancia en la formación de profesionales que habrán de trabajar en un país como el nuestro, de gran diversidad ambiental y social, en donde hasta el momento existen políticas

el análisis de las interrelaciones de los organismos y su influencia hacia los cultivos. adecuar y poner en marcha. biomasa y tipos de microorganismos edáficos 1.1.1. sistemas de producción en forma integral y eficiente de los recursos naturales para obtener una producción óptima y perdurable. Los horizontes y sus variantes en sistemas forestales. abonos. amén de su efecto sobre los cuerpos de agua y la atmósfera. el segundo es el flujo de energía 1. comparar y emplear los principios que rigen las relaciones de los microorganismos y el medio que les rodea. planta. aparición de resistencia en las plagas. Preparación y esterilización de materiales para el cultivo de microorganismos (3 h) 2 . Deducir las formas en las que los microorganismos satisfacen sus demandas de energía y nutrimentos.2. pastizales y agroecosistemas Práctica 1. 1. Coleópteros. salinidad edáfica. El perfil del suelo. Arácnidos y Ácaros 2. Colecta.3. pérdida de la fertilidad natural del suelo y acidificación debidas a la fertilización. Introducción (T = 4 h. Microbiota 2. actividad metabólica y utilidad para el agroecólogo.2. 2.1.2.2. persistencia de pesticidas no biodegradables. La comunidad del suelo (T = 20 h. dimensiones. Invertebrados no artrópodos. además podrá diseñar y desarrollar tecnologías alternativas para el aprovechamiento integral de los recursos. Métodos para cuantificar microorganismos Práctica 2. una vez que se reconoció que éstos. Protistas superiores: Algas. El ciclo de los elementos como uno de los dos mayores procesos funcionales de los ecosistemas.2.3. P = 13 h) Objetivos: Describir y clasificar los organismos de acuerdo con su morfología. De ahí que sea de suma importancia el conocimiento y estudio ecológico del sustrato agrícola y forestal. efectos perjudiciales de los pesticidas sobre organismos benéficos. Moluscos y Anélidos 2. Platelmintos. Isópteros. Insectos (Colémbolos. Macrobiota y mesobiota (fauna edáfica) 2. Protozoos y Hongos 2. traslado y conservación de muestras (suelo. Dípteros.2. el efecto de las técnicas de la agricultura moderna sobre los organismos del suelo y el impacto de éstos sobre la producción vegetal. a fin de que posteriormente se puedan diseñar. Analizar los fundamentos de las metodologías más frecuentemente empleadas para el estudio de los organismos del suelo y sus ventajas y desventajas. en armonía con la naturaleza. son algunos de los impactos ecológicos notables de la agricultura moderna. agua. inferir.3.de desarrollo económico que. consumidores y descomponedores. no son adecuadas a todos y cada uno de esos ambientes naturales y sociales. ESTRUCTURA DEL PROGRAMA DE ESTUDIO Presentación En el Siglo XX. Bacterias y Cianobacterias 2. a principios de los 60’s surgió el término Ecología Microbiana para describir las relaciones ecológicas de los microorganismos. Himenópteros).1. El suelo como ecosistema. Los componentes abióticos: fracción mineral.1. el Ingeniero en Agroecología será capaz de regular. Miriápodos. a pesar de sus dimensiones. son capaces de realizar diversas funciones que modifican su entorno. Los organismos del suelo en relación con la estructura del ecosistema. etc) con fines microbiológicos (3 h) 2. Objetivos El propósito del curso es describir. P = 6 h) Objetivos: Establecer la importancia de la Ecología Microbiana.4. Virus 2. Protistas inferiores: Arqueobacterias. efluentes. La degradación y pérdida de suelos debido a los sistemas de cultivo intensivos. agua y atmósfera del suelo 1. Con conocimientos de Ecología Microbiana. en su mayoría.2. optimizar y explotar la actividad microbiana. Número. materia orgánica. Artrópodos. Asquelmintos (Nemátodos y Rotíferos). Contenido 1. Ubicar el ecosistema suelo con relación a otros ecosistemas y clasificar los organismos en productores. Los organismos del suelo en relación con su función en el ecosistema.1. etc. Caracterización morfológica de microorganismos de diferentes ecosistemas. II. toxicidad iónica para las plantas y dispersión de enfermedades debido a la irrigación.

oxidantes de S.2. Cuantificación de algas. Factores que afectan a la comunidad microbiana del suelo (T = 16 h. almidón. fungicidas. Meso y microfauna de suelo y enmiendas orgánicas (4 h) Práctica 5. etc. así como el manejo del suelo determinan la abundancia y actividad de los organismos del suelo. P = 4 h) Objetivos: Explicar la forma en que los factores: humedad. Interacciones positivas: comensalismo.2.2. Composición química y microbiana de la rizósfera.1. Desnitrificación 4. protocooperación y mutualismo.3. iniciación y 3 .2. Propagación. nematicidas. Impregnación.1.3. hemicelulosas.3.1.3. semilla y plántula. encalado.1. Manejo agrícola del suelo: preparación del terreno.1. disponibilidad de nutrimentos. bacterias heterotróficas aerobias. factores que influyen su formación. proteolítica. Comprensión de la relación R/S 3. 3. radiaciones. fertilización. Bioquímica de la descomposición de celulosa. Producción de metano 4. Purificación.2.2. Factores físicos y químicos 3. solubilizadora de fosfatos. la presencia de otras poblaciones. Fijación simbiótica: simbiosis leguminosas-Rhizobium. Fijación del nitrógeno 4. Ciclo del Nitrógeno 4.3. hongos y microorganismos con diferente capacidad metabólica (celulolítica.3. 4.2. Evaluación de inoculantes fijadores de N2 en el desarrollo de leguminosas y gramíneas (actividades extraclase en campo y laboratorio durante 8 semanas). agua o efluentes (6 h) 3. Fuentes y composición química de materiales orgánicos.5. amilolítica. Actividades microbianas de importancia agroecológica (T = 28 h.2.3. 4. Micorrizas ectotróficas. vermicompostas. Fotosíntesis 4. sustancias pécticas.2. Ciclo del Fósforo 4. etc) (5 h) 4.1.2. Efectos de las raíces sobre los microorganismos. Ciclo del Carbono 4. algas verdes y cianobacterias. Coliformes fecales y Salmonella como indicadores de Buenas Prácticas Agrícolas en suelo y sustrato. quitina. P = 27 h) Objetivos: Discutir el papel de la actividad microbiana en el reciclado de los nutrimentos para determinar su función en la producción agrícola. agua de riego. compostas. temperatura.2. aireación. Simbiosis Micorrízicas 4. Micorrizas de plantas forestales: estructura y desarrollo. potencial osmótico. Solubilización 4. pH. Fijación asimbiótica: bacterias. 4. Inocuidad Alimentaria y Buenas Prácticas Agrícolas Práctica 4.4.2. simbiosis actinomicetosno leguminosas.4.1. agua residual tratada. actinomicetos.3. parasitismo y depredación 3. Factores que afectan su degradación.2. fisiología y ecología.1. Inmovilización 4.3.3. estiércoles. Práctica 6. agua estanque peces. Interacciones negativas: competencia. con el fin de que posteriormente se puedan diseñar y desarrollar sistemas de producción en forma integral y eficiente de los recursos naturales para obtener una producción óptima y perdurable. nitrificantes. Biofertilizantes (LEDA. amensalismo.2.2. Fijación no biológica Práctica 7. Nitrificación 4.1.1.2.2.5. metales pesados. aplicación de insecticidas. proteínas.1. etc.1. Producción de inoculantes fijadores de N2 para leguminosas y gramíneas (Aislamiento. Óxido-Reducción 4. Rizósfera: Alteración del medio microbiano por las raíces de las plantas. Descomposición de los materiales orgánicos. SEDA. Micorrizas endotróficas.5.3. líquenes. Procesos de descomposición (mineralización y humificación). Maduración) Práctica 8. Mineralización 4. Inmovilización 4.2.3. 4. etc) en suelo. riego. Amonificación 4.3. Diferencia con las ectotróficas: el hongo.1. Características e importancia de las sustancias húmicas. lignina. Cuantificación de la mineralización del carbono. Enmiendas orgánicas en la actividad microbiana del suelo (6 h) 4. Interacciones microbianas.Práctica 3. Mineralización 4.4.1.2. 4.

White. Práctica 10. Marcel Dekker. Introducción a la microbiología del suelo. no habrá reposición de prácticas. México. Madrid. 2001. y Madigan. M. México. New York. Ciclo del Azufre 4.. uses and nodulation. invernadero y campo.. Biología de los microorganismos. Cambridge University Press. Reducción 4. 4ª Ed. J.5. Alani. Bibliografía básica Alexander. R. Discusión o Análisis de los Resultados. México.. Ecología microbiana y Microbiología ambiental.. 1998.1. No se tendrá calificación de reporte de práctica por inasistencia a alguna de ellas y dado que el costo de las mismas es alto. A. El 40% restante corresponde a la fase práctica del curso. Conclusiones y Referencias Consultadas.3. Madigan. Hulasare. Oxidación 4. adicionalmente. Resultados.2. Trillas. Transferencia del carbono del hospedero al hongo en ectomicorrizas. N. Ferrera-Cerrato. 1997. G.4.desarrollo de la infección 4. 1999. Purificación. R. K. 1994. B. participación en clase y actividades de investigación extra-clase (ensayos y seminario). Movimiento de nutrimentos en endomicorrizas 4. Journal of Stored Products Research 35: 297-305. Bartha. diapositivas y videos. Allen. and Parker. The University of Wisconsin Press. R.5. 1987. Madison. R. Evaluación La parte teórica representa 60% del curso y se evaluará a través de 4 exámenes (3 parciales y uno final acumulativo). and Allen. Prentice-Hall Hispanoamericana. Brock. R. Brock Biología de los microorganismos. K. U. M. R. Principles of Microbiology. D. Elsevier Applied Science. 2nd ed. Propagación y Aplicación (actividades extraclase en campo y laboratorio durante 8 semanas). desempeño y reporte individual de prácticas. Ciclos de otros elementos Metodología La asignatura se impartirá a través de conferencias dictadas por el profesor responsable con apoyo de acetatos.. Cambridge. Prentice-Hall Hispanoamericana. Manual de agromicrobiología. la cual será socializada con sus compañeros de grupo a través de un Seminario. USA. Killham. Mycotoxin formation in hulless barley during granary storage at 15 and 19% moisture content. Metting.4. Soil Ecology.5. T. A source book of characteristics. Martinko.T. D.. D. Jr. New York.4. opcionalmente se contará con la participación de investigadores invitados. Intercambio de nutrimentos en micorrizas. London.M. la cual se evaluará con asistencia.. D.. México. K. Mineralización 4. los estudiantes realizarán una investigación teórico-práctica de corta duración. R. Jayas. Inc. p 986. D. D. 4 . para acrecentar la apropiación del conocimiento en la materia. F.3. AGT editores. Materiales y Métodos.3. México. WCB/McGraw-Hill. Los conocimientos teóricos se reforzarán mediante actividades prácticas a desarrollar en laboratorio.3. 1986..4. Atlas. (Ed). Producción y efecto de inoculantes Práctica 9. F. Preparación y evaluación de inoculantes con solubilizadores de fósforo (6 h) 4. 1980. Efecto de ectomicorrizas sobre el transporte de nutrimentos. Inoculantes micorrícicos: Aislamiento. Adicionalmente. W.4. D. México. Aspectos sobre la función protectora de ectomicorrizas frente a patógenos 4. la calificación mínima aprobatoria es de 66/100. Soil Microbial Ecology: applications in agricullture and environmental management. organizados en equipos de tres integrantes. Smith. O. F. 1981. S. Perspectives in biotechnology and applied microbiology.4. constará de Introducción.3.K. Éste se realizará al final del curso. 1993. M. N. I. Prentice Hall. Bibliografía complementaria Abramson. quienes compartirán sus experiencias en la ecología microbiana. S. T. y Atlas. U. 1993..4. El estudiante debe aprobar ambas partes para que puedan promediarse sus respectivas calificaciones. E. El reporte se redactará en máximo 15 cuartillas y tendrá un formato tipo artículo científico. The leguminosae. and Marquardt. Inmovilización 4. J. España.5. D. M.5. Otras funciones reguladoras de las micorrizas.

E. U. B. S. H. A. 1999. E. M. R. B. H. and Truelove. and F. A. Oxon. y M. D. Springer-Verlag. y Massol-Deyá A. 6a. Blackwell Scientific Publications. 1982. 1994.. Microbiología. México. 4ª Ed. Richards. Lynch. 1999. Kunz. H. Microbial ecology. Paul. D. Madrid. 1987. G.. Vance. F. Madigan. Read y M. Stinner. U. Texas. Indian Journal of Agricultural Sciences 69(2): 73-83. Bland. John Wiley & Sons. Clark. y B. Elsevier. and Lesage-Meessen. 1989. USA. New York. Microbiología química: introducción a la fisiología microbiana. Ecology of soil organisms. H.htm) Hablemos de Insectos (http://www. 1998. 1983. Javaid. (http://www. (Ed). Academic Press. Edward S. Marcel Dekker. F. In: Carlson. México. J. C. J. M. Poole (Eds. Biosynthesis and biodegradation of cellulose. España. 1999. W. Métodos para la valoración de recursos que intervienen en la producción agrícola. 1986.K.. B. A. Microbiología. Microbial technology.uaemex.) 1986. Peppler. T. Y. Kjøller y L. Microbial communities in soil. Soil Protozoa. Spresen (Eds. Symbiotic nitrogen fixation technology. B. Trends in Biotechnology 17(7): 282-289. 1985. the Netherlands. México Sasson. Academic Press.A review. Kenya. Hegde. 1978.. Fitter. Dordrecht. W. M. Asther. T. Rose. USA. D. Ed. Darbyshire J. Dwivedi.. México Pelczar. Soil microbiology and biochemistry.Bergersen. Soil Biotechnology. U. 1995. 1991. Longman. Biological interactions in soil. 1993. 1979. 1988. y Chan. Zaragoza.. M.edu/biology/profs/massol/manual/) Ecología Microbiana (http://imb. Marcel Dekker. Nematodes in soil ecosystems.K. J. Academic Press. I. A conceptual approach.... U. Journal of Sustainable Agriculture 13(4): 5-21. Hussain. San Diego. USA. Austin. J. México. Blackwell Scientific Publications.edu/insects_sp/) Micorrizas http://redalyc.uprm.. 1987. El ateneo. USA. F. A. A. McGraw-Hill. USA.K.K. Wageningen Agricultural University.. D. 1984. Microbiología e inmunología. H. Lomascolo. Ferrera-Cerrato. (Ed). V. 1971. I. Plants microbes and animals. Amsterdam. (Ed. C. Acribia. Chr. Manejo ecológico del suelo. N. 1994. L. Methods for evaluating biological nitrogen fixation. 5 . B. Francia. production and energy flow. 5a. U. M. Wageningen. Blackwell Scientific Publications. L. 1979. A. Bockstaller. S. J. The interactions between termite activity. Methods of study in quantitative soil ecology: population. agricultural practices and soil characteristics in Kisii District. México. Pelczar. Alhambra. Las biotecnologías: desafíos y promesas.. Rothfield. The rhizosphere.. y R. Phillipson. Argentina. University of Texas Press. Reid. F. U. Jilani. S. Oxford. 1977. Oxford. Haigler. Kooyman. Basidiomycetes as new biotechnological tools to generate natural aromatic flavours for the food industry. 1980. D. USA. 1994.K. Universidad de Puerto Rico. Stentelaire. 1999.. New York. Primavesi. la agricultura en regiones tropicales.es/formacion/docencia/ecomicro/menu. Oxford.usal. P.revistaecosistemas. A. London. Jensen. CAB International. Oxford. F. G. American Journal of Alternative Agriculture 14(1): 30-36. Ed. 1984. W. 1982. Sadowsky y C. and Sudhakara Babu. CECSA.pdf. P. Elkan. A. C. S. C. Natural antimicrobial systems and food preservation. L. México. J. Prentice-Hall Hispanoamericana. M. Ecological interactions in soil. New York.. C. G. D. Advances in Applied Microbiology. S. and N. U. and Van der Werf. 1999. F. Buenos Aires. New York. P. V.. D. Elementos de microbiología. Curl. Symbiotic Nitrogen Fixation. H. Inc. Usher (Eds). 2002. Academic Press. Girardin. Onck. Manual de Laboratorios: Ecología de Microorganismos. Montecillo. Inc. J. Lynch. 1983. 1989.A.. 1980. F. A. R. the Netherlands. K. J. H. Dillon.uiuc. Fuentes de información en internet Revista Ecosistemas (http://www. R. L. Neidleman. M.. L. M.mx/redalyc/pdf/339/33932104. Indicators: Tools to evaluate the environmental impacts of farming systems. CAB International.E. Méx. 1984. Microbiogical factors in crop productivity.. and Haq. Graham P. (Ed. Wallingford.urbanext. U. Colegio de Postgraduados. McGraw-Hill. H. España. 1980.net) Fuentes F. 3ª Ed. Kluwer Academic Publishers. Nitrogen fixation. Brock. USA. Parr. (Ed). Freckman. Agromicrobiología: elemento útil en la agricultura sustentable. Paris. J. Atkinson. K. Agricultural Systems 60: 157-167. The biology of crop productivity. J. T. Berlín. Gray. The Netherlands. A. E. San Diego. Blackwell Scientific Publications. M.).K. London. Microbiología. A. Cal.. New York.). México. Heinemann Educational Books. A. Brill. Cultivo de microorganismos para la producción de alimentos. Rice and wheat production in Pakistan with effective microorganisms. S. 1986. Elsevier. Brown. Interamericana.). The microbiology of terrestrial ecosystems. 1987. D. J. García Cassaleth. Revista Temas Agrarios 3(5-6): 45-51. UNESCO. Biofertilizers for cereal production in India . D. Toward integrated assessment in agriculture.

mx/Portals/0/Publicaciones%20y%20Noticias/Revistas/Avance%20y%20perspectiva/sepoct02/ 1%20XOXONOSTLE.http://www.cinvestav.shtml.socbot.org. http://www.com/micorhize/espagnol/index.soil-fertility.pdf 6 .mx/publicaciones/boletin/contenido80S/MonroyAta%20et%20al%202007%20(BSBMS80%2049-57).pdf) http://www.