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Regulação da expressão gênica em procariotos

Priscila Rodrigues de Souza

RNA ou ptns. Níveis da regulação gênica A expressão gênica pode ser controlada em qualquer um dos vários pontos ao longo da via molecular do DNA até a proteína. Em organismos eucarióticos multicelulares. que. Regulação da Expressão Gênica em Procariotos Muitos genes bacterianos que têm funções correlatas são aglomerados e estão sob o controle de um único promotor. mas apenas um subgrupo de genes é expresso em cada tipo de célula. devemos distinguir entre as sequências de DNA que são transcritas e as sequências de DNA que regulam a expressão de outras sequências. Em bactérias. interagem com outras sequências e afetam a transcrição ou tradução dessas sequências.processamento do mRNA. expressão de enzimas necessárias para metabolização de açucares somente quando estes estão disponíveis no meio). os produtos de genes regulatórios são proteínas de ligação ao DNA. nas bactérias. O óperon regula a expressão dos genes estruturais controlando a transcrição. . Genes e elementos regulatórios Ao considerarmos a regulação gênica tanto em procariotos quanto em eucariotos. incluindo a estrutura do gene. Os elementos regulatórios são comuns tanto em bactérias quanto em em células eucarióticas. Em muitos casos. transcrição. é geralmente o nível mais importante de regulação gênica. Um grupo de genes estruturais que são trancritos juntos é chamado de um óperon. Os genes estruturais codificam proteínas que são utilizadas no metabolismo ou biossíntese. tradução e modificações pós traducionais. em que todas as células contêm a mesma informação genética. ligando e desligando genes em resposta a mudanças ambientais. mais tem um papel na regulação de genes. a regulação gênica causa a diferenciação celular. a regulação gênica mantém a flexibilidade interna. ou que tem um papel estrutural na célula. Princípio da economia – expressão apenas de genes essenciais ao estado fisiológico atual da célula (p.ex. estabilidade do RNA.Existe um balanço entre a quantidade e tipos de produtos sintetizados (taxa de síntese) e a quantidade e tipos de produtos gênicos degradados (taxa de degradação). Esses genes em geral são transcritos juntos em um único mRNA.. Os genes regulatórios são genes cujo produto. Encontraremos também elementos regulatórios que são sequências de DNA que não são transcritas. e grande parte da regulação gênica ocorrem pela ação de ptns produzidas por genes regulatórios que reconhecem elementos regulatórios e ligam-se à eles.

Como o operador se superpõe ao sítio promotor. um indutor. liga-se ao repressor. Um gene regulador ajuda a controlar a transcrição de genes estruturais do óperon. Quando o indutor está ausente. Os óperons induzíveis são aqueles nos quais a transcrição está normalmente desligada(não está ocorrendo). estimulando a transcrição. Controle positivo e negativo: óperons repressíveis e induzíveis No controle negativo. A ligação do indutor altera a forma do repressor.Estrutura do Óperon É constituído por um grupo de genes ordenados lado a lado que codificam enzimas que trabalham numa via metabólica integrada. o . a ligação dessa proteína ao operador bloqueia fisicamente a ligação da RNA pol ao promotor e impede a transcrição. Os óperons também podem ser induzíveis ou repressíveis. Óperons induzíveis negativos Em um óperon com controle negativo no sítio operador. a proteína regulatória é um repressor: a liagação da proteína reguladora ao operador inibe a transcrição. ou ligá-la. O gene regulador tem seu próprio promotor que é transcrito em um curto mRNA . uma proteína regulatória. impedindo-o de se ligar ao DNA. ou desligá-la. controladas por um único promotor. Embora ele afete o funcionamento do óperon. o gene regulador não é considerado parte do óperon. liga-se ao DNA. No controle positivo. Essa proteína pode se ligar a uma região do DNA chamada de operador. e afeta a ocorrência da transcrição. a proteína regulatória é um ativador. que é traduzido em uma pequena proteína. algo deve acontecer para induzir a transcrição. Os óperons repressíveis são aqueles nos quais a transcrição está normalmente ligada (está ocorrendo). chamada de repressor. Em um opero induzível negativo. a transcrição e tradução do gene regulador produzem um repressor ativo que prontamente se liga ao operador. algo deve ocorrer para reprimir a transcrição. inibindo a transcrição. A transcrição é ligada quando uma pequena molécula.

significando que a transcrição ocorre normalmente e deve ser desligada. que quando presente. Geralmente o produto de uma via metabólica é o correpressor. ou repremida. A proteína reguladora nesse tipo de óperon também é um repressor mas é produzida em uma forma inativa que não pode por si só ligar-se ao operador. Os óperons repressíveis geralmente controlam proteínas que fazem biossíntese de moléculas tais como aminoácidos. induz a síntese de enzimas que participarão de sua metabolização as enzimas só são sintetizadas apenas quando seu substrato estiver presente Óperons repressíveis negativos Alguns óperons com controle negativo são repressíveis. a RNA pol prontamente liga-se ao promotor e ocorre a transcrição dos genes estruturais.repressor liga-se ao operador e os genes estruturais são transcritos. Como nenhum repressor está ligado ao operador. Para desligar a transcrição uma pequena molécula chamada correpressor liga-se ao repressor e o torna apto a se ligar ao operador. Geralmente o indutor é um substrato. pois os óperons são normalmente desligados quando há quantidades adequadas dos produtos. .

O controle positivo pode ser induzível ou repressível. Em um óperon induzível positivo. a transcrição está normalmente desligada. Um óperon positivo também pode ser repressível. tornando o regulador ativo. A transcrição é inibida quando uma molécula torna-se ligada ao ativador e torna-o incapaz de se ligar ao DNA. . uma proteína regulatória é um ativador: ela se liga ao DNA(geralmente em outro sítio que não o operador) e estimula a transcrição. a transcrição normalmente ocorre e tem que ser reprimida. o indutor deve ser ser o precursor da reação controlada pelo óperon de modo que as enzimas necessárias só sejam sintetizadas quando um substrato para essa reação estiver presente.Controlole Positivo Com o controle positivo. pois a proteína reguladora(um ativador) é produzida em uma forma inativa. Logicamente =. A transcrição ocorre quando um indutor se liga à proteína regulatória(ativador). Nesse caso a proteína reguladora é produzida em uma forma que prontamente se liga ao DNA e estimula a transcrição. de modo que a transcrição não é mais estimulada.

As enzimas de metabolização da galactose: β-galactosidase. parte dela é convertida em alolactose.. coli e têm um promotor comum( claro.coli A lactose é um dos principais carboidratos encontrados no leite.. é um óperon. pode ser metabolizado pela bactéria E. coli. e ocorre transcrição do genes estruturais do óperon e produção das enzimas que metabolizarão a lactose. que se liga ao repressor e faz com que este seja liberado do DNA. O óperon lac é um exemplo de um óperon induzível negativo.). dãããã.O Óperon lac de E. . que reside no tubo digestivo dos mamíferos. o repressor é inativado. então. Na presença de lactose. permease e transacetilase são codifcadas por genes adjacentes no óperon lac de E. quando a galactose está presente. a ligação da RNA pol não é mais bloqueada pelo repressor.

O triptofano liga-se ao repressor . O óperon trp contêm cinco genes estruturais que produzem os componentes de três enzimas. Quando os níveis de triptofano estão baixos. é um exmplo de óperon repressível negativo. a transcrição do óperon trp ocorre e mais trp é sintetizado. que sozinho não pode ligar-se ao operador. Quando o operador está ligado ao repressor. a transcrição do óperon é inibida e a síntese de trp não ocorre. que codifica um repressor. .O Óperon trp de E. Essas enzimas convertem corismato em triptofano. encontra-se o gene regulador. que é então é traduzido em enzimas que converte o corismato em triptofano. que controla a biossíntese do aminoácido triptofano. Assim quando os níveis de trp estão baixos. coli O óperon de triptofano(trp) em E. a RNA pol liga-se ao promotor e transcreve os cinco genes estruturais em um único mRNA. o que o torna capaz de se ligar no sítio operador. a RNA pol não pode ser ligar ao promotor e os genes estruturais do óperon não são transcritos. coli. A alguma distância do óperon trp. causando uma mudança conformacional no repressor. Quando os níveis de trp estão altons.

como uma importante maquinaria de regulação da expressão gênica em células animais. vegetais e de fungos. com o passar dos anos.Regulação gênica em eucariotos O chamado RNA de interferência (RNAi) foi descoberto em petúnias. Acabou sendo descrito. relativamente por acaso. .

fatores de crescimento. audiovisuais.) – alguns genes de plantas só se expressam na presença de luz. Alguns genes respondem a estímulos externos (ambientais. de acordo com as exigências particulares de cada estágio do ciclo de vida. etc. • Estão em funcionamento. e • Nunca funcionarão num determinado tipo celular. a regulação gênica causa a diferenciação celular. Hormônios. Em eucariotos há genes que: • Já funcionaram. olfativos. mas apenas um subgrupo de genes é expresso em cada tipo de célula. em que todas as células contêm a mesma informação genética. Regulações temporais: eucariotos ligam e desligam seus genes em diferentes estágios do desenvolvimento. e que atualmente não funcionam mais. . Ritmos biológicos: determinados por regulação de genes através ciclos de expressão determinados por estímulos (ciclo circadiano).Em organismos eucarióticos multicelulares. • Ainda irão funcionar. e outras moléculas regulatórias: causam mudanças na expressão gênica de células localizadas à distância.

para que o DNA seja mais acessível à maquinaria de transcrição. Essas modificações podem causar ativação ou repressão da transcrição. . Para que um gene seja transcrito.Mudanças na estrutura da cromatina afetam a expressão dos genes Um tipo de controle gênico nas células eucarióticas é feito pela modificação da estrutura do gene. os fatores de transcrição. ativadores e RNA pol devem se ligar ao DNA. De um modo geral. que é a adição de grupos acetila(CH3CO) a proteínas histonas pelas enzimas acetiltransferases. Outro tipo de modificação é a acetilação. Modificações de histonas Um tipo de modificação de histona é a adição de grupos metila às caudas das proteínas histonas. ao redor dos quais o DNA helicoidal enrola-se para criar a cromatina.no núcleo. A acetilação das histonas geralmente ativam a transcrição. essa estrutura da cromatina reprime a expressão gênica. dependendo dos aminoácidos em particular na cauda de histona que são metilados. as proteínas histonas associam-se para formar octâmeros. Por isso a estrutura da cromatina muda antes da transcrição.

Metilação do DNA (adição de radicais metil (-CH3)) Outra mudança na estrutura da cromatina associada à transcrição é a metilação de bases citosina. permitindo que os fatores de transcrição se liguem a promotores e iniciem a transcrição. Essas proteínas são chamadas de complexos de remodelamento de cromatina. A metilação também está associada à repressão gênica em longo prazo tal como no cromossomo X inativado de fêmeas de mamíferos. as regiões ricas em sequências CpG estão em geral metiladas.. Quando os genes não estão sendo transcritos. O DNA intensamente metilado está associado à repressão da transcrição. A metilação da citosina no DNA é uma forma distinta da metilação de proteínas histonas.. Elas se ligam diretamente a sítios particulares no DNA e reposicionam os nucleossomos. assim duas citosinas metiladas ficam diagonalmente opostas uma à outra em filamentos opostos: ..mas os grupos metila são removidos antes do início da transcrição.... enquanto o DNA transcricionalmente ativo é geralmente não metilado. . . GC.. já mencionada. que produzem 5-metilcitosina.CG..Remodelamento da cromatina Alguns fatores de transcrição e outras proteínas regulatórias alteram a estrutura da cromatina sem alterar diretamente a estrutura química das histonas. A metilação do DNA é mais comum em bases citosina adjacentes a guaninas(CpG).

que são elementos regulatórios que estão distante dos genes cuja transcrição ele estimula. assim como os acentuadores*. As ptns ativadoras ligam-se a sequências consenso no promotor regulador(ou acentuador*) fazendo contato com uma proteína que faz parte do aparato de transcrição basal chamada mediador. mas se o repressor ocupa esse sítio. também têm atividade de acetiltransferases e assim estimulam a transcrição. independem de posição e orientação. Mecanismos de regulação gênica por RNA de interferência(siRNA) A expressão de vários genes eucarióticos é controlada pelo RNA de interferência. Pequenos RNA de interferência e microRNA regulam a expressão gênica por pelo menos 4 mecanismos distintos: 1-clivagem do mRNA. 3-silenciamento transcricional ou 4.degradação do mRNA. por meio das proteínas coativadoras. bem como fatores gerais de transcrição. para regular a taxa de transcrição .Regulação do início da transcrição por fatores de transcrição e proteínas ativadoras transcricionais. o início da transcrição. é a interferência direta com a montagem do aparato de transcrição basal. 2-inibição da tradução. Clivagem do mRNA . Um terceiro mecanismo. inibindo a transcrição. os silenciadores. As proteínas ativadoras transcricionais estimulam e estabilizam o aparato de transcrição basal no promotor cerne. Os ativadores podem interagir diretamente com o aparato de transcrição basal ou indiretamente. Algumas proteínas regulatórias atuam como repressores. não há ativação. Alguns ativadores e coativadores. Alternativamente. * proteínas ativadoras se ligam a acentuadores. a transcrição é ativada. um repressor pode se ligar a sítios perto de um sítio ativador e impedir que o ativador faça contato com o aparato de transcrição basal. também conhecido como RNA de silenciamento e silenciamento gênico pós-transcricional. bloqueando assim. Esses repressores podem competir com ativadores por sítios de ligação ao DNA: quando um sítio é ocupado por um ativador. Esses repressores ligam-se a sequências no promotor regulador ou a sequências distantes chamadas silenciadores.

Após a clivagem. e a tradução é mais eficientemente inibida quando vários miRNA estão ligados ao mRNA. Essa clivagem às vezes é chamada de “slicer activity”. . Inibição da tradução Alguns miRNA regulam genes inibindo a tradução de seus mRNA complementares. Muitos mRNA têm sítios de ligação ao Mirna. Assim.Um complexo proteico chamado RISC que contém um siRNA (e alguns que contêm um miRNA) fazem par com moléculas de mRNA e cortam o mRNA próximo à metade do siRNA ligado.tais como as etapas que causam término prematuro. mas algumas pesquisas sugerem que ele pode inibir tanto a etapa de iniciação da tradução e etapas após o início da tradução. a presença de siRNA e Mirna aumenta a taxa na qual os mRNA são quebrados e diminui a quantidade de proteínas produzida. o mRNA é mais degradado. O mecanismo exato pelo qual os miRNA reprimem a tradução ainda não é conhecido.

genes diferentes são ligados e desligados em épocas específicas. O componente siRNA de um RITS então se liga à sua sequência complementar no DNA ou na molécula de RNA no processo de reprimir a transcrição atraindo enzimas me metilam a cauda das proteínas histonas. como por exemplo os olhos . Mutações nos genes homeóticos fazem com que partes do corpo apareçam nos segmentos errados. que é análogo ao RISC. Os produtos dos genes homeóticos ativam outros genes que codificam as características específicas de cada seguimento do plano corporal. que normalmente surgem no plano da cabeça. A adição de grupos metila às histonas faz com que elas se liguem ao DNA mais fortemente. Os mRNAs maternos armazenados nos ovócitos sob uma forma inativa (caudas poli-A curtas). Controle da expressão durante o início do desenvolvimento: Nenhum mRNA é produzido durante os estágios iniciais do desenvolvimento . O controle do desenvolvimento por RNA de interferência Grande parte do desenvolvimento dos eucariontes multicelulares é regulação gênica.As funções celulares são especificadas pelo mRNA materno sintetizado durante a maturação do ovócito primário.após a fertilização. restringindo o acesso de proteínas e enzimas necessárias para fazer a transcrição. animais e humanos. Esses siRNA combinam-se com proteínas para formar um complexo chamado RITS(de silenciamento transcricinal de RNA). . As pesquisas agora demonstram que as moléculas de miRNA são fatores fundamentais no controle do desenvolvimento de plantas. os mRNA são ativados pela poliadenilação citoplasmática. Genes homeóticos: genes que expressam fatores de trasncrição determinantes do plano corporal básico do organismo em desenvolvimento.Silenciamento transcricional Outros siRNA silenciam a transcrição alterando a estrutura da cromatina.