Organizao do Genoma

Bibliografia: The Cell A Molecular Approach (Fourth Edition) Geoffrey M. Cooper & Robert E. Hausman. ASM Press & Sinauer Associates, Inc. 2007. (Disponvel para ser requisitado na Biblioteca do Dep. Cincias da Vida)

Alguns genomas foram j completamente sequenciados

Espcie Tamanho do genoma (1000s de pares de nucletidos por genoma haplide) 4639 4447 12069 ~142000 ~137000 ~3200000 Nmero de genes

Escherichia coli Mycobacterium tuberculosis Saccharomyces cerevisiae Arabidopsis thaliana Drosophila malanogaster Homo sapiens

4289 4402 ~6300 ~26000 ~14000 ~3000050000

Classificao do DNA eucariota

1. Genes que codificam protena ou RNA (~5%) Genes isolados Famlias de genes e pseudogenes Genes repetidos muitas vezes, que codificam rRNA, tRNA e histonas

2. DNA no codificante (>95% no genoma humano) Intres (embora sejam transcriptos para o pr-mRNA) Espaadores de DNA no classificados DNA repetitivo

1. Genes que codificam protena ou RNA

Genes isolados (2550% dos genes) Famlias de genes e pseudogenes
exemplo: Famlia de genes da globina Yb2 e Gg Ag Yb1 d b Locus da b -globina Cromossoma 11

Embrinica Pseudogene

Fetal

Adulto Pseudogene

Embrinica

Y1

Pseudogene

Fetal e Adulto

Locus da -globina Cromossoma 16

Genes repetidos muitas vezes que codificam rRNA, tRNA e histonas

O mesmo gene, repetido muitas vezes Funo: Garantir que o gene eficientemente transcrito exemplo: Na fase embrionria as clulas duplicam em ~24h e tm entre 5-10 milhes de ribossomas. Para produzir rRNA suficiente para este nmero de ribossomas so necessrias pelo menos 100 cpias do gene para rRNA por clula.

2. DNA no codificante DNA repetitivo- Repeties espalhadas de centenas de cpias de

uma sequncia DNA Satlite ou simple sequence repeats (~1-500 nucletidos) DNA Transposes Retrotransposes: -Sequncia curta (~100-300 nucletidos) SINEs (small interspersed elements); por exemplo, sequncias Alu -Sequncia longa (~1 a 4-6 kb) LINEs (long interspersed elements) -Retrovirus-like elements (2-10 kb)

2. DNA no codificante DNA repetitivo

DNA satlite ~10% do genoma da maioria dos eucariotas Satlites de DNA no so transcritos Alguns satlites de DNA tm um papel na estrutura dos cromossomas (centrmeros, telmeros) Sequncia repetida muito conservada entre indivduos; nmero de repeties varia entre indivduos (DNA fingerprinting)

DNA dos organitos celulares

DNA mitocondrial DNA dos cloroplastos (mitocndrias e cloroplastos contm tambm ribossomas e tRNA)

DNA mitocondrial
O contedo celular em DNA mitocondrial depende do nmero de mitocndrias Nos mamferos, o DNA mitocondrial herdado quase exclusivamente da me (99.99% no homem; a clula sexual masculina contribui pouco para o citoplasma do zigoto) Grandes semelhanas com o DNA da bactria Rickettsia prowazekii

DNA mitocondrial humano

DNA circular, de 16 569 pb Mltiplas cpias por organelo Codifica: - 2 tipos de rRNA (16S e 12S) - 22 tipos de tRNA (usados para traduzir mRNAs mitocondriais) - tem 13 sequncias que comeam com um codo ATG e que podem codificar peptdeos com mais de 50 aas (subunidades dos complexos multimrios da cadeia respiratria) A maioria das protenas mitocondriais so sintetizadas nos ribossomas citoplasmticos e exportadas para a mitocndria No contm intres

D loop

DNA intragnico 2000 Mb Genoma Humano 3200 Mb Genes e seqs. relacionadas 1200 Mb

Outras regies intergnicas 600 Mb Seqs. repetitivas 1400 Mb Seqs. relacionadas 1152 Mb Genes 48 Mb

Seqs. Reguladoras; miRNAs Microsatlites 90 Mb

Intres; UTRs Fragmentos de genes Pseudogenes